Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33811 LG9 51946168 51947664 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 51946402 intron_variant
A/T 51946431 intron_variant
G/A 51946592 downstream_gene_variant
T/C 51946655 downstream_gene_variant
T/C,* 51946663 downstream_gene_variant
A/G 51946983 downstream_gene_variant
G/A 51946991 downstream_gene_variant
T/A 51947028 downstream_gene_variant
G/T 51947075 downstream_gene_variant
A/T 51947076 downstream_gene_variant
G/A 51947112 downstream_gene_variant
A/T 51947208 downstream_gene_variant
G/C 51947396 downstream_gene_variant
T/C 51947427 downstream_gene_variant
T/C 51947518 synonymous_variant p.Leu47Leu
A/G 51947542 missense_variant p.Thr55Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33811.1
MDLWNLANARVSKCSRRRVIDEGGVLGGEEVEVEGLEECVAGVGGALEDADVVATGEGGGRHETTMLRGSDIAANTTQPQERIASPLKSNEAHL*


CDS Sequence:
>Vu_33811.1
ATGGATTTATGGAACCTGGCAAATGCACGAGTTTCGAAATGCAGCAGAAGAAGAGTTATAGATGAAGGAGGCGTGCTTGGAGGCGAGGAGGTTGAGGTAGAAGGTCTTGAGGAGTGTGTAGCAGGGGTCGGTGGTGCCTTGGAAGACGCAGACGTGGTAGCCACTGGCGAAGGAGGTGGAAGGCATGAAACAACAATGTTACGCGGGTCGGACATTGCAGCAAACACAACCCAACCACAGGAACGAATTGCCTCCCCTCTCAAGAGTAACGAAGCTCATCTCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_33811::LG9:51944168-51946168(+)
TACATATATTGAGTGATTCACCTATAAAGGTGATGAAATATCTCAAATTACTTACATAAAAATATTTGTATGAATTATTTCTATTAAATTTGAACTCCTTTTAGCCCCTTTTGTTTGGTTTGTATAATAGATTGTTTATCAATAGTCTTTATCAAATCTCTCACATTGTCATGTTGATCAACAGAACCTTGAATTCCAGCAAAAATGTTAGTCTTTATGAACATTACAAAGAGACAATTTCACATTTCCCACTTCTCATGAAGATCAATAGCATATGGAGTGTTGGTCTTAGTAATTATAAATGGTTTTGGCTTTCTAATAGTATAATCAATGTTCATCCAACCCAAATGAAAAATAACTCTCTCCTTCCAAAACTTATAATTATCCTTTTGTAATTTGGGAATACCACAACTGATATAAAAAATATTCACAAATTGCAAATTCATTATAATAATTTAAGGCTATAACAACATCATGTTTTACTGATACAAACATGTCTTAATAAATTAATCTAGTGACATAAAACTCTTTTGTGGACTAATGTCTTACACAATTAGACTCATATAACTAAATGATAAAACTATTAAACTACGTTCTTTTTCTTAATTTTTGTTGAAAATTTAAAAAATATAATCCAATATTTCATTCTAATTAATCATATTGATATATGCAAATTCTTCTGGATAAAATTTGATGATATCACATCACATATAATTAATTATAATTAATGTTTATTATGTGATTATAAAAATCAATAGATGTTATTTTTAATTCATTAGAATTATATCCACCATTTAAGTTAAATTAAAGTTTTTAATTAAATAAGTTAAATTTGACCATCAACTTCTTTTACAAGCGAAATTGAATAATCGAAAACTTAATTCGGATGTTATAATGATCATGTATGTAAACAGAAAAGTATATGTCAAAAACATGTGATTGGAGACACGTATTAATATGAAGGCATGTCTGAAGGAAAACAGCTATGATCTTATTGAGTTAAAATGATCAAATTGTAATTTAAAAATGCTATAAAAATATTATTTTTAATAAATTATAATTCTTTTTAACCAATAATAAAAATTGGTGTTGAAGACAGTACAATTACTATACTAAATAAAAGTATTTGATTTTTGTTTTGGGAAAGTATCTTGTGAGAAAGACTCCTCATTGAAACGCATTATGAGAAATTTGTGACCACAGTGGGTCCACATGAAAACCATGTTTAATTATTAACCAACATAATCGTAGGTGACAAACATAATAGTCGGCAATGTAAACTAAAAAATAAAAAGTACTCTCCTTTTTCGTTTTGTTATTATCAAAAGGTTTAACAGGTACTTGATCTCCATATGAAAAAAGTTTATTTAATATGATTTTTAATTTTTTAATTTTATTTAGATAAGTTAATATAATGTTTTGTTGAGTGAGTATAAGTATGATATGGAAAGTTTAATGGTTTCATATTATTCTTATAGATAATTTAAATATGACCATTAACCTAAAAGTATTATCTTTAACTAACTTAAAATCAAAACAAGTTGATAATATTACATGGCATTACAAATATTCAAGAACTTTTTTATTTTTAAATTCATCTTATATAACCCTCTCAAGACCATCAACATAAATATAACCAAAATAGCTACATTTCTATAACCCTTAACATAAATATAACAAAAATAACTGCATCAAACTTTTTTATATAAATTAAAATATAAAAATTGCATTAAATAAATCTCAAAAAAATGAAAAGAAAAATCTATTAATCTTATGAAAAAGAAGACTTATTTATGTCTGAAACAATCAGAAATGTTTTTAGAATTATTTGTTGTGTGACATATTAAGAAAATAAGGAATAAAAGCTGCAAAAGTTTATTTGATGCGTGTTGTTTCTGTTACTTAGGTGACGTGAGAGAGTGAGAGAGAGAAAAAGAGTTTGCAGTGTTGTTGTTGAAGTTGGATCTGCCAGATTTATCAAACATTGCATTACACTTTCA


Gene Sequence:
>Vu_33811(+)
ATGGATTTATGGAACCTGGCAAATGCACGAGTTTCGAAATGCAGCAGAAGAAGAGTTATAGTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCAGTACGCCAACAACAATCAATGATTCAGTAATCCTTTTATCTATTATATTCTTTTATATTCTCATATAATGTGAATCTATAATATAATATAACTTTTCTTTGTTTTATTATTATAATGATTCTCTTAAGTTTTTCTCATATTATTTTCAATTTTCAATTTATTTATTTATTTTTTAATTAATTTCATACCGTTTTCTCATATAATTTATATTGTAATAGTTTTTCAAATTTCAAAATATGTTGTTATTTTAAAATAATCAAATGTCAGTACAAAATAAAAAATATATTTTATCAATCAAAATTAACATAAAATTTAAGTAATAAATATAATATGTGATTACGCTATTGTCAATGCATGCGTGACTCAATAAAGTCAGGACATATATAATAAGAATTTATTATAGTATATTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTTATGTATTTTCAATATGAGAAAATGCTATATTAGAACTTATATAAAATGTGTATTGAATCAGATCCGAAGTTATTTTACTTTACTAATATCTAAATTATATAGAAAAATATATTAAATAGTAAAAGTTGATCAATGTATCTAAAGTTTAAATATACAAAATGAAAAAACAAATTTCTATATTACAAAAATATATATAATAAGTAGAAGGAATTTATGTTGTCAGAAGATATAATTTTAAGAAAGAGTTCATATAAACTTTTAGTTTAATTTAATGCACAGGTCTTTCAAAAATAAAATTAAGGTTTAATGTCTCCTTAAGTTCTTATTTTTTTTCAGAATTTTAAATAGATCTCTTTTTTTTTGACGTCTCAATTGGGTCTTTATTTTCGTAAAATTGAAGTAATTAGAGACCTTCCGTCAAATTGGACAAACGCCGTTTAAGTTTGGAGTACGTGACATAGTCAATGTATTATTTTAAATAATGTGGCAGTTTATACTTGATTAACGTGTATTTTATAATTTCTAAATTAAAAAATTAAGGGTAAATTGGGAAAAGGAAATTAAAGGCAGTGACTCTTTCTGCAATTGAGGAATGAAATTAGGGTTCCTGAGAGAAAGTTGAAGGAGGCGGAGCCGACGGAGGAGTTGAAGTTTGCCTTGGAGGATCTTCCAGCAAGCTGGTTGTCGAGGTCAGCGAGTGTTCTGAGATGTTGTTGCGGAAGAGCAGGATGAAGGAGGCGTGCTTGGAGGCGAGGAGGTTGAGGTAGAAGGTCTTGAGGAGTGTGTAGCAGGGGTCGGTGGTGCCTTGGAAGACGCAGACGTGGTAGCCACTGGCGAAGGAGGTGGAAGGCATGAAACAACAATGTTACGCGGGTCGGACATTGCAGCAAACACAACCCAACCACAGGAACGAATTGCCTCCCCTCTCAAGAGTAACGAAGCTCATCTCTAA