Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33584 LG9 46099611 46101020 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03041 Spliceosome [BR:ko03041]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 46100521 missense_variant p.Leu167Ser
T/C 46100686 missense_variant p.Gln112Arg
G/A 46100700 synonymous_variant p.Leu107Leu
A/G,* 46100739 synonymous_variant p.Leu94Leu
A/G 46100757 synonymous_variant p.Leu88Leu
T/C 46100843 missense_variant p.Thr60Ala
C/T 46100966 missense_variant p.Glu19Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33584.1
MAALKITLTPPLEAENALETSLREAFESQITSLRPPFSLAIPSPDQYTLLNRAILHGVLTEPQFAKTHIKHLHAIVTDGYATFVTLLLGLVNHLYPKLLASVKTQLLWLTDQTVCVLGIGYDAVLISLLRQIVGADCSDGNLWLCFKLVTLFLEHWGRLLEDSPHVLSFALYTFLRVLTDHCRGGSVEKLETLKRLEIHLCVKIMREEFHLCLKIGRDFIRLLQDLVHVPKFRAMLKDIVFNPCVFNVVGFQFKDVAQIYSTRTSSRYSLLRINPDMETQLRFLLTSIKLGHQKRHQVWFAKKFLNEPDKEFVIIDIVRFICCAHHPPNEIIQSDIVPRWALIGWLLTSCRRNDVVANVKLALFYDWLFFDERVDTIMNIEPAVLLMVHSIPKYVDITHALLEFLLHLVDSYDVERKSVLVKGVSSAFQLLVRKGVIRSLDVLISCPALHPALKERLKRLLACGKLESS*


CDS Sequence:
>Vu_33584.1
ATGGCGGCGTTGAAGATAACACTGACTCCACCTTTGGAAGCAGAAAACGCATTAGAAACGTCGCTGAGGGAAGCTTTTGAGTCTCAGATAACATCTCTGAGACCCCCTTTCTCCTTAGCCATTCCAAGCCCCGACCAATACACCCTCCTCAACCGTGCCATCCTTCACGGCGTTTTAACGGAACCCCAATTCGCCAAAACCCACATCAAACACTTGCACGCCATCGTCACCGACGGCTACGCCACCTTCGTCACCCTCCTCCTTGGCCTCGTCAACCACCTTTACCCCAAACTCCTCGCATCCGTCAAAACGCAGCTACTCTGGCTCACTGATCAAACGGTGTGCGTTTTGGGTATCGGCTACGACGCCGTTTTGATCTCCCTTTTGCGCCAAATCGTCGGCGCCGATTGCAGCGATGGAAACTTGTGGCTCTGCTTCAAGTTGGTCACCCTCTTTCTGGAACACTGGGGCCGCTTATTAGAAGACTCGCCCCACGTTTTGTCGTTCGCGTTGTACACGTTTCTTAGGGTTTTAACAGATCATTGTAGGGGTGGTAGCGTTGAAAAGTTGGAGACTTTGAAGCGGTTGGAGATTCATCTGTGCGTGAAGATAATGAGAGAGGAGTTTCACTTGTGTTTGAAAATTGGGAGGGATTTTATTCGCTTGTTGCAGGATTTGGTTCATGTTCCCAAGTTTAGGGCTATGTTGAAAGACATTGTGTTTAATCCGTGTGTGTTTAATGTTGTGGGGTTTCAGTTTAAGGATGTTGCTCAGATTTACTCCACCAGGACTTCCAGCAGGTATTCTCTGCTGAGGATCAATCCTGACATGGAGACCCAATTGAGGTTTTTGCTTACAAGCATAAAGTTGGGGCATCAGAAGAGGCATCAGGTTTGGTTTGCGAAGAAGTTTTTGAATGAGCCTGATAAAGAGTTTGTTATAATTGATATTGTGAGGTTCATATGTTGTGCGCACCACCCTCCAAATGAGATCATTCAGTCTGATATCGTTCCTAGGTGGGCGCTTATTGGTTGGCTTTTGACCTCTTGTAGGAGGAACGATGTTGTGGCTAATGTGAAACTGGCTTTGTTTTATGACTGGCTCTTTTTCGATGAAAGGGTGGATACCATTATGAACATTGAGCCTGCGGTTCTGCTCATGGTGCATTCTATTCCAAAGTATGTTGACATTACTCATGCTCTTCTTGAGTTCTTATTGCATCTTGTGGACAGTTATGATGTAGAAAGGAAGAGTGTCTTGGTTAAAGGTGTGTCATCGGCTTTTCAGTTGCTTGTGCGCAAAGGTGTCATTCGGTCACTTGATGTCTTGATTTCTTGTCCTGCTCTTCACCCTGCTTTGAAAGAGAGGCTGAAAAGGTTATTAGCATGTGGAAAGCTTGAAAGCTCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_33584::LG9:46101020-46103020(-)
CAGCCTCCCTCAAACTCATCAGTCCTATAGTTAACCACGGCTAAAGCCAACCGCTTAACTCGGACTTGGGGGGCATAATGTATAGTATAAAATATTAACCGAGTGGTTACAAACAACCAACCGGATATTCAGGTAATCTGTTTATATCTTATTCTGTTTATATTTTATTGGGCTTATATCAGCTCAGGATCCATGAGGTAAATTATAAATACAAAGCCAGGACCAAAAGCCAGGCACGTTCCACTTACTCTACATGACTCTCAAATACTCAATAGTGATAACCATTCACTAAATATTCAACCAAGAGCCGAGGCTCTTCAAATCACACGCCTAACTTGGGCGTCGGAGTACCTTTTGCAGGTACATCCCCCTCGTCAAGAAGGAGACCGATCGGTTTGCGCCAACACCGATCGGCCAACAGGAGGAGTTTGGAAGCGAGCGAGCGGCCCAGACGCGTCAGCAGGTTAGTCTCTCGGTCCCTAAAAGTATCTACCGAAACAATCTGTATTTATTATTTTTATTATAATCATTTAAAACATACACAATATAAACATTAAATTTAAGTTTAATTTAATTTTATCTTGTCTTTAATTTTACATTAATATATATAAATATTTAATGCAAAATTAAATGTGAATAAATAATCACATAATGAATAGAAAGATGGTTTTCTATTATGATATACTTCATGATGTATCATTTAGAAACTGAGATTAAATATAACTTAAATATATTTTTCTTTTTTATCTCCAATATATTTTCAAAATTACGCACCGCTTCCATTTAACAAAATTACGCACCGCTTCCAGGAACTCCGCACCAGCAATAGTCGGTAACGTATAGCCCATGCACTGCCCGCACAGGATTGTTCACTGCCACGTGTCCCGTCTCTGTCCGTGCCTTTATTACTTATTTATGACCCTCATCATCACGTCCTGTGCATTCTTCCATAAGATTGTGGACCGGACTCTTCGAACTATTATAAAAAGGTTTAATCATTCACTAAGTTCCTATTTTCGCATGGAATCTCAATTTCGTCCCTTTCTTTCTGAAAATATTAATTGGGTCCCAATTTTATGAAAATTGCAACAAATCGATCCTTTCCGTTAAATAGTGTCAAACGGCGTTAAAAAAATTTATGAGTGGATGCTGAGATGACGAACGAACGCTCGTCCACCAGCGAACGAACGCTCGTTCACCAGCGAACGAACGCTCGTCCACCAGCGAACGAACGCTCGTCGACCACCGAACGAACGGTCGTCCAGTGTGGAACGAACGGTCGTCCAGCAGTAAGAGGTCCACGAGCGTTCGTTCGCTGGTGGACGAGCGTTCGTTCGCTGGTGGACGAGCGTTCGTTCGTCATCACAGCATCCACTCATCAATTTTTTTAACGCCGTCCAGCCAATTTAACGGAAAGGATCGATTTGTTGCAATTTTCATAAAATTGGGACCCAATTGATATTTTCAGAAAGAAAGGGACGAAATTGAGATTCCATGCGAAAATAGGGACTTAGTGAATGATTAAATCTTATAAAAATTAACAACAGAATAAATTCAGTTTTCTAATAATACACTTTTACCTTGACACAGATGTAAAGATAAAATGATAATAAAAATATAAAATTTAATATTTTTCTAAAAAGAAAAAGTAATTAAAAATAATATTAAATGAATTAAAAAATTTAAGTGTATCAAAAGATTTTTTTTCTTAATATTCATTTTAAAGATTATAATAATAATAAAATATACAAAAAAAATCAAATTTTACACCCTCAGTAGTTAAGAAAAATGTAAATTTACAAATCATTTAGTAGTTTTTCTTCTTAATATTTGGATATGATTTTTCAGATTTCTTTTCTATTTAGTTTCTATTCTATTTAAAAGAGTCGATATAATTTTTTCATTTGAATTAGTACTTACACAATATAAAAGTTGATTTAAGCCATAAATTTATACTGTGATTAAAATTCAAATGAGGTGTGTCTCTCCTCCGTGCTTCA


Gene Sequence:
>Vu_33584(-)
ATGGCGGCGTTGAAGATAACACTGACTCCACCTTTGGAAGCAGAAAACGCATTAGAAACGTCGCTGAGGGAAGCTTTTGAGTCTCAGATAACATCTCTGAGACCCCCTTTCTCCTTAGCCATTCCAAGCCCCGACCAATACACCCTCCTCAACCGTGCCATCCTTCACGGCGTTTTAACGGAACCCCAATTCGCCAAAACCCACATCAAACACTTGCACGCCATCGTCACCGACGGCTACGCCACCTTCGTCACCCTCCTCCTTGGCCTCGTCAACCACCTTTACCCCAAACTCCTCGCATCCGTCAAAACGCAGCTACTCTGGCTCACTGATCAAACGGTGTGCGTTTTGGGTATCGGCTACGACGCCGTTTTGATCTCCCTTTTGCGCCAAATCGTCGGCGCCGATTGCAGCGATGGAAACTTGTGGCTCTGCTTCAAGTTGGTCACCCTCTTTCTGGAACACTGGGGCCGCTTATTAGAAGACTCGCCCCACGTTTTGTCGTTCGCGTTGTACACGTTTCTTAGGGTTTTAACAGATCATTGTAGGGGTGGTAGCGTTGAAAAGTTGGAGACTTTGAAGCGGTTGGAGATTCATCTGTGCGTGAAGATAATGAGAGAGGAGTTTCACTTGTGTTTGAAAATTGGGAGGGATTTTATTCGCTTGTTGCAGGATTTGGTTCATGTTCCCAAGTTTAGGGCTATGTTGAAAGACATTGTGTTTAATCCGTGTGTGTTTAATGTTGTGGGGTTTCAGTTTAAGGATGTTGCTCAGATTTACTCCACCAGGACTTCCAGCAGGTATTCTCTGCTGAGGATCAATCCTGACATGGAGACCCAATTGAGGTTTTTGCTTACAAGCATAAAGTTGGGGCATCAGAAGAGGCATCAGGTTTGGTTTGCGAAGAAGTTTTTGAATGAGCCTGATAAAGAGTTTGTTATAATTGATATTGTGAGGTTCATATGTTGTGCGCACCACCCTCCAAATGAGATCATTCAGTCTGATATCGTTCCTAGGTGGGCGCTTATTGGTTGGCTTTTGACCTCTTGTAGGAGGAACGATGTTGTGGCTAATGTGAAACTGGCTTTGTTTTATGACTGGCTCTTTTTCGATGAAAGGGTGGATACCATTATGAACATTGAGCCTGCGGTTCTGCTCATGGTGCATTCTATTCCAAAGTATGTTGACATTACTCATGCTCTTCTTGAGTTCTTATTGCATCTTGTGGACAGTTATGATGTAGAAAGGAAGAGTGTCTTGGTTAAAGGTGTGTCATCGGCTTTTCAGTTGCTTGTGCGCAAAGGTGTCATTCGGTCACTTGATGTCTTGATTTCTTGTCCTGCTCTTCACCCTGCTTTGAAAGAGAGGCTGAAAAGGTTATTAGCATGTGGAAAGCTTGAAAGCTCTTGA