Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_32823	LG9	26718629	26718889	hypothetical protein LR48	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
A/G	26718693	missense_variant	p.Glu22Gly

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32823.1

MSKGPSWSDQWGNGGFGSDHYEDEKVKKSSGSNKKMAAGMDKAKAAAIVGADKAKTAAVVGAQKVKSGTSAGIKWVKNQYQKRTSK*

CDS Sequence:
>Vu_32823.1

ATGAGCAAGGGACCAAGTTGGTCTGACCAATGGGGGAATGGAGGGTTTGGCAGTGACCACTATGAGGATGAGAAAGTGAAGAAGAGCAGTGGAAGCAACAAGAAGATGGCTGCTGGTATGGACAAGGCCAAAGCTGCAGCAATTGTGGGTGCTGACAAGGCTAAAACTGCTGCTGTAGTGGGTGCCCAGAAGGTGAAGAGTGGAACTTCTGCTGGAATCAAATGGGTCAAGAATCAGTACCAGAAAAGGACTTCCAAGTGA

Promoter Sequence:
>Vu_32823::LG9:26716629-26718629(+)

AGTGTTATTTTATATCAATTTCAATATATATATATATATATATATATTTTTTTTATGTAAAGATTTGATGAGACTTATACTCTTAATAATATTTTATTTAATTATTGACAAAAATATTTTCAAAAATAAAAGAATAATTTTTTAATCTTGCAATATGGTATCCTAGTTAAAATCCTCATTCTTTTTATGCTATGCCTTCTAAATTAAATGTCATCAATGAGCATTAAATAATTGTTGGAGTATCACTCCAAATCAATAATACACTTAATGGAACAATGAATAACAACAAAACAACATATTTTATAAAACCAAATCCTCATCAATTAAAAAAATCATTATTTTACATTTTTAAATTAAAATCTTAAATATCATCATGTAAAATTTAATTAAAAAATTATATTAAATATATTTTTAGTATACGAATTTTGACACGCAAAATTAAAATTTATCATAATGTTATATTTTTATTCAAAACTTTAAAAATAGATAATATATTTTTTAATTAAATTATATTAAATTTTTTTAATATATAAAACGCGTTTTCCACATATGAAAATGTCGTATTAATAATAACATAAAACTCAAATAAAAATATATCAAATAATATTAACAAGGATATTACCTGAAATTTGATACTTTGCAAAAAAAATTAAAAATTAAATTAAAAACCTATTAAAATTTGATGTCAAAGTCAAAATTCATGCAAAGATATTTAACCCAAAAAATTTCAATTGGAAGAAGTGAAAAGAAAAGTCAATTGTTTTGGCTGCTGAGCACAACTGTAGAAAGATAGAACAAGAAACAAAACAGAGATTGGTAAAAAAAAGTGAAAAACTAAGTATAAATATAAATATTAAAGAGGGCTTCCATTCATAATCTTGTCCTTCACTTCGCCATTCCATCAAAACCAAAGGGTTGGTCTCATTCGACCCCACCATAGCTGTTCCATACTCTCTGCCTTCAAATCACAAAGGTACTCGCTTTTTCTATCTCTATTAACATTTCTCTCTGTCTCTACATGCATGAGAAAACAAATTATAAAATACCCCCATTAACCTTAATTGGTTCAGGCATAAGTTTTTTCAAGAAATTTTCAACCCAATAAACATGTTGAGTGTTTTCTTGTTTTTTGATTCATAACTTGATCTATGTGCGATCTCATGCTTATTGGGCATCCGAATGAATTTGGGTTGATAAATTCTTCAATCCTTTGCTTGGAATTTCTGGAGAGATCTTGTGTGAAAGTAAGATTTTGATGTACCCTTTGTTTGATTCTTCTCATCAATTCGTGGCCTCCGAATTATTTTTCTTTTCTCGTGTTAAAAAGTTGAATAATGGTATTGAATATGTGTCACGATCCATGCAAACGGGTGGACTTAGCATTAATTTGACTGAGGTAGACTTGGATTAAGATGCAATTTTGTCTTTTCCCCCCTTTTGCCCTTTTATATTCCTCTCTTAATTTCCTTCTTCAATTCAGTCTTTGATCCGATTCGTGATTAGAATCAGAGTGTTTTTGGGTTAGCAATTGTCAAATTAATTTTGTAATTTGTTTCTAGCTAGAATTGGTTTTTGAGGGAAGTGATTCCTGTTTACATTAGTATAAGAAAAAGTATGAAAGAACTGTAATCGAATTGATTCTAGAACACTGGGTCTGAGTCGGACTGAATTTGATCTCCTTAAGTTCTTATTTTGAGTTTGTGTCAGAGGTAACTGGTAAAATTCCTCAGTGAAAATCATTCTTCAATGAGACTGATAGATATTTTGTGCCAATATCAGATGGTTATAAGAAAAGAGTTGATTCTAGAATTAAGTTAGCTAGATTTGTTTCAACTCAATCAATTCTAGACCAGAATCAAATTATTTAATGTGATGTCGAACATGTAAACATTTACTTAAAATCTGGTGGCAAGGTTGGTATTTCAATGTGATTTTGGATGATTCAACATGCAACAACACAAATTATAATGAATTGAAATGTTTTGAAGGCTAAAAGAAAA

Gene Sequence:

>Vu_32823(+)