Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25159 LG6 14953239 14958922 PREDICTED: biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   fatty acid biosynthetic process, fatty acid biosynthetic process, fatty acid biosynthetic process, fatty acid biosynthetic process
Cellular Component   located in   chloroplast, chloroplast, chloroplast, chloroplast, chloroplast
Molecular Function   enables   protein binding, protein binding, protein binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 14953287 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 14953545 downstream_gene_variant
G/T 14953579 downstream_gene_variant
A/T 14953620 downstream_gene_variant
C/T 14953632 downstream_gene_variant
T/A 14953634 downstream_gene_variant
G/A 14953636 downstream_gene_variant
T/G 14953716 downstream_gene_variant
C/T 14954255 downstream_gene_variant
G/A 14954433 downstream_gene_variant
C/T 14955272 intron_variant
T/C 14955648 intron_variant
T/A 14956006 intron_variant
T/G 14956013 intron_variant
G/A 14956069 intron_variant
T/A 14956693 intron_variant
A/G 14956868 splice_region_variant&intron_variant
T/A 14956903 intron_variant
T/C 14957095 intron_variant
G/A 14957202 intron_variant
C/G 14957205 intron_variant
T/A 14957399 intron_variant
C/T 14957402 intron_variant
T/C 14957419 intron_variant
A/T 14957435 intron_variant
G/A 14957788 missense_variant p.Ala137Thr
A/G 14957838 synonymous_variant p.Ser153Ser
G/A 14958111 downstream_gene_variant
T/G 14958448 downstream_gene_variant
A/T 14958478 downstream_gene_variant
T/A 14958813 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25159.1
MASCSLGSPNIKVLNLYFSGKNVGLSKQVGTRSWRRQSLQYTGLVMSRQTDRLLASSNDPSSEIQTIKRSEEGSEEIKSSDLTSQLIPNFNEVEFLVTKLCDTSSIGELELKLAGFHLHVVRDLTKKSKALPPPIPASVSVNNAIEAPKTNGSVSTTSLAISKPISPVEPISSPGSIQKFLERAADEGLVIIQSPKVGFFRRSRTIKGKRAPPSCKEKQRVEEGQVICYIEQLGGQVPIESDVSGEVIKILRKDGDPVGYGDALVAILPSFPGIKKLQ*


CDS Sequence:
>Vu_25159.1
ATGGCTTCATGTAGCTTAGGTAGCCCAAATATTAAAGTATTGAACTTGTACTTTAGTGGAAAAAATGTTGGCCTTTCAAAACAAGTTGGTACAAGAAGCTGGAGAAGGCAGTCATTGCAGTACACTGGTTTGGTTATGTCACGACAGACAGATAGGCTTTTAGCATCATCCAATGATCCATCGTCAGAGATCCAGACTATTAAAAGGTCGGAAGAAGGTTCTGAAGAGATTAAATCTTCAGATTTGACAAGTCAGCTTATTCCCAATTTTAACGAGGTGGAATTCCTAGTCACAAAATTATGTGACACAAGTTCAATTGGGGAGTTAGAATTAAAACTTGCTGGGTTTCACCTGCATGTTGTGAGGGATTTGACTAAAAAAAGTAAAGCTCTACCTCCTCCTATTCCTGCTTCTGTAAGTGTAAATAATGCCATAGAAGCGCCTAAAACAAACGGATCAGTTTCTACAACTTCACTGGCCATCTCAAAGCCTATAAGCCCGGTAGAACCGATATCCTCTCCAGGATCTATCCAGAAATTCCTTGAAAGAGCTGCTGATGAAGGCTTGGTAATAATTCAGTCCCCAAAGGTGGGTTTCTTTAGGAGATCACGAACAATAAAGGGGAAGCGTGCTCCACCATCATGTAAAGAGAAACAAAGGGTTGAGGAAGGGCAAGTGATTTGTTACATTGAACAACTGGGTGGTCAGGTGCCAATTGAGTCTGATGTGTCAGGAGAGGTTATCAAGATACTGCGAAAGGATGGAGATCCTGTTGGATATGGTGACGCTCTTGTTGCAATATTGCCATCATTTCCAGGAATAAAGAAGCTTCAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_25159::LG6:14951239-14953239(+)
AATTCTTTCATGGAAGACACACTCATAAAGTTTTCAAGTATCTATTCAAAGATAACTCTATTAATTATTCCCTAATCTAAATTTTCTTAATACTAAGAGAATTTATGATCACTTTCTTATTACAATCAAGCAAACATATGCTCCGATTGATGGTCAAAATAAAGAAAAAAATAGTGTAAGTTATTATCATAATTTATTTTAATTTGTTGTTATTATAATATCATTGCGGGGCGCACATATAATGTTCTCAATATTTTTATCATATTATGTAATATTTAAATAATTGATACATAAAGTTATTTTAATAATGAAAATTTAAACAAGTCATATTTTTAATAATTGAACTTTTTAAAAAAATTATCGAGAATTTAATATTTTCAAAGTTCATATGTAAATTTGTAGGTAAATGTATTTTCTTAAAATTCTTCAATAATTTTGCCTTGTTAGTGGAATGGATGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTACTAAATCTAACAAAAATTTTATTATAAATTAATTAGATACAAATGATGAAACAAATAATAGGAGAATGATGAAAGAAGAAGAATGAGAGAAAGAGGAGCCGGAGGTGGTGGAAACAAATTAAACAAAGATATATAGACAAGACAATGATAACGACTAAGGAAGAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAATTAAATTATGATATTTATCAATAAATTTTTACTAAAAGTTGGAATTAATTGTAAATAGATTTTGTTGATAATAATTACTAATAAATATATTTCAATAAATTTTAATTATTAATTATAAATAGATTTTGATGATAATTAATATATATTTTTCTGTTGATAAAATTTACTGATAAATATTCTACTAATAAATTTTTAATTATCAATAAATCGTTATTAATTTTATTTACCAATAATTTTTTATAAATATTGATAAATTTTAATCATTCATAATTTTTTTGCAGTAAAAGTTGTGTAAAAGAAATTCAAAAATTAAAATTATGGATGATTAAAACTAAGGAAATTAAATTAAAAAATATATAAAATATGGACAGAAATTACCATTAAGCAAAATATTTAAATGGGAGAGAGGAGAAATAATTCTGATGGCCTAAACGGGTATTGAAAATTATAATATAGTAACATATGTTTTAATATTTAATGTTTATTTCAGTTATGAAAATTTAAATTTCAAATTTTAGCGAATTTCATTTTCTTATACTAATTTTACAGTGCATATTACTTCTACTCTACTCAAATAATTATTTTTTTTATATTTACAACATAAACGGTAAAACATCCCAACAATTAATTATTTGACTAAGTAATTAAAATTATCATTTTATTTTTAATTCAAAATTATTTCATTATAATATCATGACTAAAGTTATAAATCTAAAACTGAAGTGTAATAAGATATTAAATGTGCTGAATAAAAAAGTTTTTTTTAAAATAATTTTACATACAAATTAAAGAAAAATACCACCAAAGTGAGGTCGGTCTCATAAAACTGAACTCTCCAGAATTAATGTGGACAAAGAAAGGTTAAATTAAAACTCATAATCAATTAATAAATAATAAATGAATCAATATCACATTAAAAGTGGAGATACGTTAGTTAATAACGGATCGAAGTTTTGAATTTTTTTCTTAAAATGTATATTCACTAAAAAAAAAATACCCAAATAAACTCGTTTTAATTTAAATTTTTAAATTAAACCTATTTATTACTCACGTGTTAAACACTATCATTCGAATTTCTTTTCTTCCTTTTTTTTTTCTAATTTTCAAAAACATTGAAAAAATCAGACTTAAACTCAGTAAAATCAGGCCAGAAATTCACTCCAGGCCAGCCAAACAATAAATTAATAATTCTCAACTTAAATAATAAATTGATCTAGCTTGATAAATAAATAGGTTTTTTTGAGTAAAAAAAATATATAAATAGTTTTATATTTTAGGAGAAAATCTAAGTTTAATAGAAACGGAAATAGAAATAGCATCCTTAAAAAATCCAGCTGT


Gene Sequence:
>Vu_25159(+)
TAACCGTCAATCCTCATTCATTCCATGTTGGTATTGGTGTTGTTGTTCATGTTGGTGTCTCTCTTCTCTTCTCATTCTTTTGTAGTCTTATATGCTTTCACTCTCTCAACTCTCAAGTGACACAACAATTTTCTCTTCTCTTTTTCACCTTCTTTACTTCCCAACCCTTTTACCCTTTTTCCAGACACTTTCCGCTCCACGCTTCCAATGGCTTCATGTGAGTTTTCCTTCTCTTTATTTTCTATCCATTCCATTACAGATTACAATTGCTGCTTCAAAGAGGAGCCTTTTCCATGATTTTATGTTTTTCTTGTGATTTGTTTTGCAATATCGTTAGTGGGGTTGAAACGAAAGTGGAATGTGATTTTATATTTGAGACGAAGTTTTCGGTAACATGGTAGATGCTCGTTTAGTGATGTTATATTTGCTTTGTACTGAGTACTGAGAATCTGCTGTATTTTTAATCTGATGGGTCAATCGTATGGTAATCTACTTTACTCATCCCACCGACTTTTCAATGCTGTGGGTATCGGATTGTTTATAAATTCGTAATTGCTGCAGTCTTCACTATGACGTCGTTTCAATTATTTTGTACAATGTAATTTTGTAATGATTTTTTGAACCAAATATTGTACTTGTCTTTGAAACTCTGTTTATGGGTTCTTGCCTTTTGAGTTTGTTTTGTTCATGTCCATTGTAAGATATATTACCTCCTGTTTCAATATATAAGCCAAGAAAAAGTAATTCACATCAATTAAGAAATGGTGTTAGTAGTATTTAATTGATATAGTTTCATTTACGAAAGTGATTTTTTTCGTAATCTAAACTTTGTAAAATTTGATATCAAGAATAGAAGAGTTATTATTCTCAATTAAATGAAGGCATCTTAGAAATAGTCTCATCTTTTCCTTTAATTTGTGAGCCTACTGGTTAACTGTTGTTCCTTCAAGTGAGGATTATGTATGGGCTTGCTGTTCTAAGCCTCAAAGATGGACTACTAGTGGAATAAATTGACACAAATATGAATGATTTCTGAGAAACAAACATAGGTCACAACGAGTGTGAATGAAAAGAATACATGTCTCCCCCTCTAGCAGTTTTATGTGTAAAATATAATCACGATTGAGTGTTGAAAATGGTACTTTTTCAGCCCAAGATCATGTCTATTGTGCTCTGTTCTTTGTAATCTTTGCCGAAGTTCCATTATATAGTGTAGGAATCTATTTGAAATTTCTATTATTTTGTTTCTTCTTTATTATTTTTCTCTTTGATTTCATCAATGTATTTTTTATTGTGATTTTTTTTCCTACTAATCGGAGCATCATTTACATGTGCATTTGACAAACTTTTTAACATTTCAAAGAAACTTTTCCATTATTCTTCAATCATTTTCTGTTGTCTTGACATATTGGATACTTAGTATGCAAATTATGAAAGAGTTTGGTGTTTCTTTCAAGACTACTAAATGGTTATGTACCCCCTCAGAAAGTGGTTATCATGTCATAAGTTCTATCACAGGTAGCTTAGGTAGCCCAAATATTAAAGTATTGAACTTGTACTTTAGTGGAAAAAATGTTGGCCTTTCAAAACAAGTTGGTACAAGAAGCTGGAGAAGGCAGTCATTGCAGTACACTGGTTTGGTTATGTCACGACAGACAGATAGGCTTTTAGCATCATCCAATGATCCATCGTCAGAGATCCAGAGTAAGTTCTTCTATTTTTCGATTTTGTACGTACTTTTTGTCATATAGGCTATACAAAAGCGGTCATTACTTTATTTCTCAATTTCTAAGCCTATTAAATTTCTTACCATCAATGATTTCTAGTGGATCCAATGCATTATCTCTGTCCAATTTAGGATTCTGTTAGTAATCTAGTGAGTTTTGGCTTGCATATTGATGTCATACTATGTGTGCATGATATAGCACACACATTCAGATCTTGTTATTTCTGTTTTGAGAAAGAATCATTCATGTGTTTTAACCCAGATGCTTAAGCTTTTAGGGTAGTCGTTTCAAGACATGGTATTAAAGCCTATGTTGCAAGTGGTTTAGAGTTCAATATTAGCTGCTACTCCAGTTCTTCTAAAAAAATTTTAATTTTAACACACTATGAGTCTTTGCATTGACCAGTGTTCAAAGGGCACAGGACTCTTGGGTGGGAGGATGTGATGGATATAAAGCCATTCTTGTGCTTCAATCTAAAGCTTAAGCTTTTGGAATAATTGGTTGATGACAACTTCATTATATGAAAAAACCTTATATTTAAATAGATTGCATAACAAATAAGTGTTTTATTAATTTATTTTTTATTTGAGGAAAGAAGTAATTAAACCATATTGGATATGTTTGTATAAATTCAAAAGTTATATTATTGGAATTGATACTATAGATCATACTTAATTATTTATATACTTGACAATTTAAAATATTTTGCATGGAAAATATTTAATTTAGGTTTAGTATTTAATTTTTTTTAGTAGTTAAAGAATGAGTAGACTACGTTCATATCATATAGGTGACTGTTCAAGAGCTTAGTTCATACTTGAAATTCTATGGTAATTTACTCCCATATACATTTATTTTATGAAAATACATCAGTTTTACAATTACAAACAAACCTTGAAGTTGAGTTTCCTTTATTTATTATTGCTTTCAACCGAAAATATTAATGTGCTTGTAATATAGAATAGAGTTAACTCTATTTTAGTCCTCAAAGATGCATGTTCAAGAGTTTAGTTCATACTTGAAATTCTATTGTAATTTACTCCCATATACATTTATTTTATGAAAATACATCAGTTTTACAATTACAAACAAACCTTGAAGTTGAGTTTCCTTTATTTATTATTGCTTTCAACCGAAAATATTAATGTGCTTGTAATATAGAATAGGGTTAACTCTATTTTAGTCCTCAAAGATGCATGTGACATCCATTTATCCTTCAAATAAACCTGATATCATTTTATTTTCTTGATCAAAGTGAAAGCAAATTGACCTTCCATAAGAGTTTATATCAATTTAGTCCCTCCATCATAGAAATTAGTGTTGATAAAGTCTTTCACTTTTGTGATGCACAAACAGAAGGCAACTTTGATGTCACTTTTCGCAGCGTATAGACTATATTAGCATCAACTTTGATAGGAACTTAGGTATTATGGGGTGTCGAAGTTCCACAGGAGTAGTTTAAAATACTCGGTGGAGTATTTAAGTATTTGGTTCTCCCCCTCTTAAATAGTTAGGTTTTGGGTGAGTTCCCCAACTGCTTGGGTACTTACATATCATATGAATACAAGGAATATGGACACTATGGAGGAACTTGTACTGTTCTTTGTTGTAAAATTTTCATAAATGTATCTTTTATAGGATTTTTTTAAACATACGATTGTACATTTTGTAATCTGATTCACTTTTCTGACTTTACTTATTGTGTAAAAGCTATAAAACTATTGATTTGAAGTTTCTCACAGTGGCAAACACTATTAACTTGATATTTGTACCATTGTCTGGCTTCTATGACATACTTTAAATGATTACATCACAGCTATTAAAAGGTCGGAAGAAGGTTCTGAAGAGATTAAATCTTCAGATTTGACAAGTCAGCTTATTCCCAATTTTAACGAGGTTAGTACTTGGAAAATCCCATTGTTTATTCATCTATTTGTTTTTTCATTTTTGCAGGGAGAAGAATCTATAAAACAGATCCAAATTTGTGATGATTCTATTGTGCTGCTTTCATCTATTACCTTATTTGTTTGTTAGTCAATATTTGAGTAAGCTGTTCCATATTTATAAAACCATTTTATGTATCTAAACCTTTATGTGCTCTGGTATGTTGTGTAAAATTGGCCAGTATATTTTAGTCTAAAATTGGCCATTGCTTAGCTTGAAATGTGGCTCTACATTAGGTTCTGGACCTTAAGCTCTTTCTGATTAAACTGACAAAGCACAGGTCAAAATAAAAGTACAGTTTGTGTCCAAGCTTATGAACCTATCAAATGTTTAGCATCCTAGCTCCCGAGGCTTGACCTACATCCCAGCTTTCATTTATTACAGAAATTTGTGTGGATACTTCTATGATTTTCTTTACTTGGAAGTGTTAAATAATCATTTTAATCTTTAAGTTCTGAAGTTTTCCCAGTTAGAAAAACTTGTCTTTTATGACACTTGAAAAGAGATTTTGTCACATCGTAATGCACTAGTCTATTTTCTACGTTTATTCTTCATGAATGAAAAATTTGAAGTCGTGTATATGTATGGACATTCTTTGCAGGTGGAATTCCTAGTCACAAAATTATGTGACACAAGTTCAATTGGGGAGTTAGAATTAAAAGTAAGTACAATGAAGTTGAATTTATATGTCTTCATTAGCACAATATTACTCCAATTCTCTCTCATAATTGCATTTGATATAGACTTGCTTCTTATTGTTGTTTCTTCTCTTCGTTGTCATCTGCCCAAATTCCAAATGGTATCAGCTTGCTGGGTTTCACCTGCATGTTGTGAGGGATTTGACTAAAAAAAGTAAAGCTCTACCTCCTCCTATTCCTGCTTCTGTAAGTGTAAATAATGCCATAGAAGCGCCTAAAACAAACGGATCAGTTTCTACAACTTCACTGGCCATCTCAAAGCCTATAAGCCCGGTAGAACCGATATCCTCTCCAGGATCTATCCAGAAATTCCTTGAAAGAGCTGCTGATGAAGGCTTGGTAATAATTCAGTCCCCAAAGGTAAGAATCTGAAACTCGTACTTCATATTTTACAAACCTTACATAATGTTCTCTAAAACCGTAAGCAGGTGGGTTTCTTTAGGAGATCACGAACAATAAAGGGGAAGCGTGCTCCACCATCATGTAAAGAGGTACAGTTTTTGGCATCTTTTCTCTTTTCCTTTTATTCGGGAAATCTCGTTATACACCATGTGAGACTACCCAGAAACATACAACTTGTAAAATTTATGATCACAACACAATTGCAATATTTTGAAAACATGGCTAGCAGTTTCCTAGTAGGGCAACATCAGAAAAACTGTTTTTTTTTTTTGGCGTGGTGTTCTCATGAAGTACTGTGCCAATTAACAGAAACAAAGGGTTGAGGAAGGGCAAGTGATTTGTTACATTGAACAACTGGGTGGTCAGGTGCCAATTGAGGTTTGTGTCGTGACTCTCTTCCAAGTCATTCTGTGACTTCTCATGTTTATGATTTGATGTTGATAAGGGGCAAATGACTGTAATATGATGAGTGCTAATCATTGCTATGACTTTCAATGTTTGCAGTCTGATGTGTCAGGAGAGGTTATCAAGATACTGCGAAAGGATGGAGGTTAGTTTCTCCGATCAATTTAATTTAATTTTTCTAAAGACCAGACTGGTATTGTGTTGTGTGTGACTCTTATTTTTGGTCTTTCACAGATCCTGTTGGATATGGTGACGCTCTTGTTGCAATATTGCCATCATTTCCAGGAATAAAGAAGCTTCAATAGGTTGAAATTTTGAAAAAAGACATTCTTGCAAACGATGCTGTAATTTACCAATGCGAATGCTTCATTACTGTTTTACTTCCTGTGGTCCATAGCTTGTTTATTTTTACTGTTAGTTTTCCATAGCAGAGACAAAGGTAAACTAAAACAACCTTGTTTTCTCATACTTTTCTGTTTCTGTTAGTGGATTTCTCATCTTCTCGCTC