Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25030 LG6 13794716 13800023 PREDICTED: protein HOTHEAD
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   embryo sac development, fatty acid omega-oxidation, cell-cell signaling, fatty acid omega-oxidation, fatty acid omega-oxidation
Cellular Component   located in   extracellular region, extracellular region, extracellular region
Molecular Function   enables   flavin adenine dinucleotide binding, oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors, flavin adenine dinucleotide binding, flavin adenine dinucleotide binding, flavin adenine dinucleotide binding, mandelonitrile lyase activity
Pathway   B 09103 Lipid metabolism   "C 00073 Cutin
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 13795085 missense_variant p.Pro475Ser
C/A 13795227 missense_variant p.Lys427Asn
T/A 13795276 missense_variant p.Glu411Val
T/C 13795300 missense_variant p.Lys403Arg
T/C 13795314 synonymous_variant p.Ser398Ser
T/A 13795457 splice_region_variant&intron_variant
G/A 13795511 intron_variant
A/G 13795560 stop_lost p.Ter352Argext*?
G/T 13795564 synonymous_variant p.Val350Val
A/G 13795620 stop_lost p.Ter332Glnext*?
C/T 13795782 missense_variant p.Ala278Thr
G/A 13795971 intron_variant
C/G 13796320 synonymous_variant p.Gly128Gly
A/C 13796379 intron_variant
C/T 13796382 intron_variant
C/T 13796427 intron_variant
T/G 13796521 intron_variant
C/T 13796603 intron_variant
T/A 13796650 intron_variant
T/C 13796666 intron_variant
A/T 13796686 intron_variant
A/G 13796736 intron_variant
C/T 13796752 intron_variant
G/T 13796918 intron_variant
T/C 13797038 intron_variant
G/T 13797043 intron_variant
A/T 13797076 intron_variant
A/T,G 13797079 intron_variant
A/T 13797121 intron_variant
A/C 13797123 intron_variant
G/A 13797418 intron_variant
T/A 13797424 intron_variant
T/C 13797430 intron_variant
T/C 13797434 intron_variant
A/T 13797539 intron_variant
A/T 13797546 intron_variant
G/T 13797549 intron_variant
T/C,* 13797552 intron_variant
A/T 13797693 intron_variant
A/G 13797712 intron_variant
A/T 13797745 intron_variant
C/T 13797764 intron_variant
A/T 13797856 intron_variant
A/C 13797924 intron_variant
T/A 13797928 intron_variant
C/A 13797973 intron_variant
A/T 13797982 intron_variant
G/T 13798026 intron_variant
A/G 13798183 intron_variant
A/C 13798268 intron_variant
A/C 13798377 intron_variant
A/G 13798448 intron_variant
A/G,* 13798453 intron_variant
A/G 13798508 intron_variant
T/C 13798579 intron_variant
G/T 13798709 intron_variant
C/T 13798799 intron_variant
A/T 13798823 intron_variant
A/G 13799118 intron_variant
G/T 13799352 intron_variant
A/T 13799523 intron_variant
T/C 13799582 intron_variant
A/T 13799641 intron_variant
A/T 13799670 synonymous_variant p.Ala118Ala
T/A 13799761 missense_variant p.Gln88Leu
C/G 13799953 missense_variant p.Trp24Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25030.1
MVAGKQNWNGEYPFIRRGSSLGRWDNGGYDYIIVGGGTAGCPLAATLSKKFKVLVLERGGVPFNNPNVTFLRNFHITLADTSPTSASQYFISTDGVLNARGRVLGGGSSINAGFYTRANPRFIRKVGWDTKLVNESYPWVEKQVVHRPKFSHWQRAVRDGLLDAGVSPFNGFTYDHKYGTKVGGTIFDRFGRRHTAAELLASGNPKKLTVLVHATVQKIVFDTTGKKPKAIGVIFKDENGKQHQAFLGTGRKSEVIVSSGAIGTPQLLLLSGIGPREELQKFNIPVVLHNEFVGKGMADNPMNTIFVPSKRPVQQSLIETVGITNLGVYIETSCGFGQSKDSIHCHHGILSAEIGQLSTIPPKQRSREAVEAFVKSKKDIPIEAFRGGFILSKVASPWSTGELKLINTNVEENPAVTFNYFSHPHDLKRCVEGIRLAIKVVQSQHVTNYTMCDRQSAEKMLNISVQANINLIPKHPNDTKSLEQFCRDSVITIWHYHGGCHVGKVVNSEYKVLGVDRLRVVDGSTFSESPGTNPQATVMMMGRYMGLKILRDRLGKLGDI*


CDS Sequence:
>Vu_25030.1
ATGGTTGCAGGTAAGCAGAATTGGAATGGTGAGTACCCATTTATCAGGAGAGGAAGTTCATTGGGGCGTTGGGACAATGGTGGTTATGACTATATAATAGTGGGAGGTGGCACTGCAGGGTGTCCATTGGCTGCAACGCTGTCTAAGAAATTCAAAGTTCTGGTGCTTGAAAGAGGAGGAGTCCCTTTCAACAACCCCAATGTGACATTTCTGCGAAACTTTCACATAACTTTGGCAGACACTTCACCAACTTCGGCTTCTCAGTACTTCATTTCAACAGACGGAGTGCTGAATGCAAGAGGAAGGGTTTTGGGAGGTGGCAGTTCCATTAACGCTGGCTTCTACACTCGAGCTAACCCTAGATTTATAAGGAAGGTGGGGTGGGATACAAAGCTAGTGAACGAGTCTTATCCTTGGGTGGAGAAGCAGGTTGTTCATCGTCCAAAGTTTTCACATTGGCAGAGAGCAGTCAGGGACGGGCTTCTAGATGCTGGTGTGTCACCTTTTAATGGATTCACCTATGATCATAAGTATGGAACCAAAGTTGGTGGAACCATTTTTGACAGATTTGGCCGCCGCCACACCGCTGCTGAGTTGCTCGCTTCTGGGAATCCTAAGAAACTTACTGTCCTCGTCCATGCCACTGTCCAAAAGATTGTTTTTGATACAACAGGAAAGAAACCAAAAGCCATTGGGGTTATTTTCAAGGATGAAAATGGAAAGCAGCATCAGGCATTTCTGGGAACTGGGAGGAAGAGTGAAGTGATTGTGTCTAGTGGGGCAATTGGCACTCCTCAATTGCTACTGCTCAGTGGAATTGGCCCCAGAGAAGAGCTTCAGAAATTCAACATCCCTGTAGTGCTTCACAATGAATTTGTCGGTAAAGGCATGGCTGATAACCCCATGAACACAATTTTCGTTCCTTCCAAGAGACCAGTTCAGCAGTCACTCATAGAAACTGTCGGTATAACCAATCTGGGTGTGTACATTGAGACTAGTTGTGGCTTTGGTCAGTCCAAAGACAGCATTCACTGTCACCATGGTATCTTGTCAGCTGAGATTGGGCAGCTGTCGACAATTCCACCAAAGCAAAGATCACGAGAAGCTGTTGAGGCCTTTGTGAAGAGCAAGAAAGACATACCAATCGAAGCATTCAGGGGAGGGTTCATACTGTCAAAAGTTGCGAGTCCTTGGTCAACAGGTGAACTGAAGTTGATAAACACCAACGTGGAGGAGAACCCTGCTGTTACCTTCAACTATTTCAGCCACCCTCATGATCTTAAGCGCTGCGTGGAGGGTATCCGCTTAGCCATAAAGGTTGTTCAGTCACAGCACGTCACAAACTACACTATGTGTGACAGACAAAGCGCAGAGAAAATGTTGAACATCAGTGTGCAGGCAAATATCAACCTCATACCCAAACATCCCAATGACACAAAGTCACTGGAACAGTTTTGTAGAGACTCTGTGATCACTATTTGGCACTACCATGGTGGGTGCCATGTGGGGAAAGTAGTAAACTCTGAGTATAAGGTTCTTGGTGTTGACAGACTCCGTGTGGTAGATGGCTCCACATTTTCTGAGTCCCCAGGAACCAATCCTCAAGCCACTGTCATGATGATGGGCAGGTACATGGGACTGAAGATTCTAAGAGACAGGTTGGGGAAATTGGGTGATATTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_25030::LG6:13800023-13802023(-)
AATGGGTCATTCATTGTTCCTCTTCGGCTCCTATTGTCTTGATCTATTACCAGTCAACTGATAAACAGAACCAACCACCAATAACACAGGCAATCATCACCATAATAAATTTTTCTCTTCAAAGTATGCGCGGGAGATACATTTTGGAGGAAAACCGGTTTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGTAGAGCAGAGAATCAGTACCATTATATATTAATGACTTTTTTAACAACAGTCATTATTTCACTAGTTCGTGTGTTTAAAATGTACCAATCATATAGATAAACGATTGTAAAAAAAATTATTAAAAAAATATTATTCTTTGCATTTTCTTTCTCATTCTTTAATTGTCGTTTTATGATTTTGGTATATGGTTAACTTTAATTTTTCGTCTTTAAATTCCAAGCTGAATAGGTGAATTATACTCCAATCTCAAATCATTTGTATGTATTTAATAAGTTATTATATTAAAGTCTTAAGTTCGCAAGTGAATACAATTTCTTACTTTCTTGTTTTTATCATTGCATCTATAAATTTTAAAATAAATTTTTAATAAAAATTAATCTAATTATAATTCAAAAGACTAAAAAATTGTTAGATGCATTTTACTTGTAAACATGTCGAATTTGTAATGTTAATGTCTAATAATAGCCTTATGTGTCAGTTTATTGAGAAACTGATCGATTTGCAAAAATTTAGAATAGAAAATGACTGAGCTTCAACGTTCTTTTACGTTGATCATCCGGTCATACCTAAAATATGCTTGTTAATTCTAAATTTACTAAATCAGTAATTTTAACGCCAATGTTTAAATTCAGATTATGATATCTGTGAAATTTCTAAATGATTTTCATGATGGTAATAAAGTAAAATTAAAGAAGCAATGAAAAGAAAAGAAGAGCATGAATGGAGAGAGAGAATTTTCGTATATTTGGTAGAATATTAAATATGGAGCTTTATTGGTGGTGCCGGTGAGTGAGCTGGCTTGTTATAAAAGTGGTGGATAAGTTTGCAGAGGTAGCCAAATCCAACGGTCAGATTCTTCCCAAACCTTCACCTTCGTTTCCTCATTAAATGCCTTATTCAGATGCTGTTTCACCCTTTCTCAACAAGCACGGGAAACTTACATTCATTGCTATTAACTGCTATCTTTCATTGCTACTATTTACTTCTTTCTAAAACAAATTTTCATCACTTTATTATTCTAATGTTTTTCTATTAGTAAAAAATTAAACCCTTCAAAATAAACCGATGATATATAGAAAGTGGTGTTTCTTATATTTAATACATTTTCAATATATTTTTTAGAAGGAGAAAATATTCTGCTTTAATTCATAAAACATTAGTTAACATTCTCTTAAAAATACGTGTGTTTAAAGAACAGATCAGTGGGGACATTTGAGAATATTTATATGGTGCACATGCACACAGAAGAGAAGGCCAACCAGAGCCAGCCACTCAGAGGTTGAAGAAGCTGCTTTTCTCAGACTCCATGGCGTCCATTGGTGCACTCAAATTCTTCCTTTACTTACTTCCATGTCTCCTCAACTATCTACCTCATTCTCAAGGTTTATTCCATCTAATCATATATATATATATATACTCAACAACACCTTCTATATATCTATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCTATCTTTGGTGTGCACTTTCTAAATCCTATTCTGACATTCACACAAACCAATCTCAAACACAATGTTCTGTAATATACAGTCAATGATTCGTGTATTTCACTGGGTCAGAATGTGATGTAATAGACAAAATGTTTACTTTCCTAGTACATAAAAAAACAGCTTCTGTTATGTTTTATGATGATAAAACACAACACAATACAATAATACATACAACCTTTTATCTTCACTGTTCTTTTTATGGTCGAGAAATGTTGTTGAAGATGAAAATGT


Gene Sequence:
>Vu_25030(-)
ATGGTTGCAGGTAAGCAGAATTGGAATGGTGAGTACCCATTTATCAGGAGAGGAAGTTCATTGGGGCGTTGGGACAATGGTGGTTATGACTATATAATAGTGGGAGGTGGCACTGCAGGGTGTCCATTGGCTGCAACGCTGTCTAAGAAATTCAAAGTTCTGGTGCTTGAAAGAGGAGGAGTCCCTTTCAACAACCCCAATGTGACATTTCTGCGAAACTTTCACATAACTTTGGCAGACACTTCACCAACTTCGGCTTCTCAGTACTTCATTTCAACAGACGGAGTGCTGAATGCAAGAGGAAGGGTTTTGGGAGGTGGCAGTTCCATTAACGCTGGCTTCTACACTCGAGCTAACCCTAGGTAACACCAACCTTCTTCTCTCATCAATTTTCTCCTCTTTAGTATGTTAAATTCCAATGTGAATAATTTTTTAGGGTATAGTTTCTGTAGCGATTTCAAAATTTAAGAGCCTATATAGTTTTCTGATTTGAAAAAAAATTTCTAATTTATCTTAATTAAAATATTTTTCTATATTTTGTAAAATAAGGATAAAATTATATTTTATATTGATTTGATACACATTATAAAGTAAAAAATGATCATAAAAAATTTTGTGTGAAATTTCTCAATTTTATAACCATTTATAATAGAAGTTGTCATTTCAACGTCCCCTTATTTGAGGAAAAATTCAGTCCACTTGGAACGTAATGTAAATGTTATTGCATTTACTCTCGGATTAAAAAAAGTACATTAAAACAATCAAAATTTAATATGGTAGATTAATTATAATTGAGGAAATTAATTTTCGCTTTAAAATATGATACATACTATTGGAATTAACAGATATAAATCCATTATTTTTTAAAGTTTTATCATAGAGTTGATAAAAGTAAATGATTATTCTCTAGATAAATTAATTGAAACAAAAATTAAATTGCCATGCTAACTTACTACTATGATGAGAACAAAATTTACCTGTTGAAAATCATTTTATTGTTACAAATATGGTACATTTACAAGGTGAATATTATACATTCAATATGATAAATTAAAGGTGTATATCAATTTCTTCTTACAAGTCGATATTATTAACCCATGAAGGCCAAAGGCATTCATTTGATCATTGTTAAAAATAAAAATTATAAATTTATGTCATATAATTATATGTAGATTGTATTAATTTTATAAATAAATAAATTATTATAAGACTATTTAAATAAATGGCGTACATTTATCGTTTAATATTAATGGACCTTTTAAATGTGATTAAATGATTAAAGTTTATAATTCTTATTTTTTACTATAAAAAGTTCTTGCTTTAAAAGTACTTAATGTACTCTATTAATATAGATTGGTAATATTTGTACTAATACTTTAATAATCAATAAATGAAATAACATTGATGAGATTTGTCTAACAATCATTATTTTCTGTAATATGTCACAATTTTTTTAGTATTATTACCAGTTGTCTGCTTCCAACCATCAAGTACAGCATTTTAAATCCAATTGTGTGTTTACTTGCAAACATCATTTTATTCAAAACTTCAATAACGTGTGTGCTTTTTTTCTCTTCTTTCATTATCATTATTAGATGTTGTTGTTGATTATTGTTTCCCAAAGAAATTGTGTGTCGGGTTAAACATTATGTACACCCACCCACCAAAAAACAAAGGCACAGAACTATACAGTATTAATTCCAAGTTTCCTATTTAATTGAATAATGGATTAAAGTAAAAGCAAATGTCAATAATTATATGATTTACTCGTTAGTAACATTTGCTTTCACATTAATTATTATTCAAAAACTTACTTTTGAGTTAAATTTAAATTTCTTAATCTAACATAATATAGATATATTTACTTATAGCTTAACCTATTTCTAAAAAAAAAACACTTATTTTAGAAAAACTAGATATATTAATTGGTATTTCTTAAATGGGTTTGAGGCTTATGTGTGATCTAAGCAGAATGACAATGATATAAAAGACTGCGTCTAATTTGACAAAATTCCAACTTGATGAATTAAATGCTTTTGTGTGTACCTTGGTAGCCCTATTTTATGCAATGTAAGTTGTTAGGTGAGAGTGTCAGATTTTAAGAAAAGGAAGGGATGAAAAGAGACCACACACAAAACAGAACATTGAATATATTGTAGGGTAGTTTTTTGTTTTGGTAAAAATCATTATAGGTGCTTGTTCCTTGGAATAGCCATTGAATTCACATGTTGCAAAATGACCATTACACTGATTCATTTAGTTTTTTATTTATTAGTGTTGCTATTTGATGTTTACATGGACCAGTCAATGTTATTCAACATCCTGAGAGATAAACTGACAAATATAGAATATAAATAAGTACATAAATACCATACTGAAAAATATTTTTATATGCTCTCTATAAAATTTTAATGGTAGATTGGGCTTTTCAAATTCAAAAAATTAACCAATTTAATTTTAATTATTTTAACATACTATTCACTTTTTAATATGTAAATCAAAATAATCTTATTAAACTTAATCGTTAAACCCTTTTACTAATATATGACATGAATGGGTGTTATAAAGTTATTTAATTTTAGAAAATTTAAAAATTAAAATTTAACTTTCACAAAGTTGTATATCTGTAAAACCATAAGAGCAAATTTAATTTTAAGCCAAATGTTAATATTGTATTTTTATGATATAGAAATGTTATGTAGCATTACTACTGTTTGTCATAATTTGGAAATATGCATTAGTTTGTTACTATTTATTACCGCTTTGAAAATTCAAAGAATTTTTCTCATTACATAATATGTAGTAAATATTTTAAAATGAATAAAACTTTAATTGCAAGAAAGAATTGGGTAAAAAGTTTTTTAATAAATATTTTATATAATTTATTTATTCCTATTTTATCTTTTCTTTTTTTGTCTATATCCATCTAAATAACATATTTCTTTTTTTTTTGTATTCTTTTTATTTTCCACTGATATATCGTTAATTTACTTATGATCCAAACAAACTAGTTAAAAAAATAAACAATTCTTTTAATAAATATATAAACAATCTTTATATTTATTTTTCAAAAAACTAAAGTAAAAATTGTATTAAATTATTTTCCTTCAGTTGATAATAAGTATTGTTTACAAAGATTAAAAGAATCTAAAAGCCCAATATTTTTTAATAGCTCTAAAATCCTAAAATAATATATACTATAAAATTAAATTATGTTAACAAACCATTAAAAAATGTTTATTAAAAACTAATTTATAAGGAGAAGGACGATGTTAAAAAGATAATAATGGTTTTAAATTATGAAACAATAATTATTAATAAAATAAACTTAAACAACTCTTATTTTCGGAATGAATAAAATATTTAACAAGCAAATTTATATGCAAGACTCTTGTTTCAAATAAGTAAATGTGATCATCCGCTCACTAGATTGACATTGTACAAGGCAATTATAAAAGTGATAATAAAATATTATCGAATACGCTTTTATCAGTTTCTCTATATTGAATAAAATTACGTGAATGTGACTTCTAAGTTAATGAATTTTAAATTTTCAGGACACTTAACTAATAAATAAAACGTGTTTAAAAAAGACTGTCTTAAATTATCCGAAACAAGAAAAGATATGCTACATAGATAGTGTGTAGTATGAAACATGTTTTGTTTCTTTTTTTTCTGCAGATTTATAAGGAAGGTGGGGTGGGATACAAAGCTAGTGAACGAGTCTTATCCTTGGGTGGAGAAGCAGGTTGTTCATCGTCCAAAGTTTTCACATTGGCAGAGAGCAGTCAGGGACGGGCTTCTAGATGCTGGTGTGTCACCTTTTAATGGATTCACCTATGATCATAAGTATGGAACCAAAGTTGGTGGAACCATTTTTGACAGATTTGGCCGCCGCCACACCGCTGCTGAGTTGCTCGCTTCTGGGAATCCTAAGAAACTTACTGTCCTCGTCCATGCCACTGTCCAAAAGATTGTTTTTGATACAACAGGTATGATATGATCAATATGTAAGAAACATTTTTAATGAATATATACTAGCCTAAAATCACCGTCTCATGACTGAAAAATGGTGATGCAGGAAAGAAACCAAAAGCCATTGGGGTTATTTTCAAGGATGAAAATGGAAAGCAGCATCAGGCATTTCTGGGAACTGGGAGGAAGAGTGAAGTGATTGTGTCTAGTGGGGCAATTGGCACTCCTCAATTGCTACTGCTCAGTGGAATTGGCCCCAGAGAAGAGCTTCAGAAATTCAACATCCCTGTAGTGCTTCACAATGAATTTGTCGGTAAAGGCATGGCTGATAACCCCATGAACACAATTTTCGTTCCTTCCAAGAGACCAGTTCAGCAGTCACTCATAGAAACTGTCGGTATAACCAATCTGGGTGTGTACATTGAGACTAGTTGTGGCTTTGGTCAGTCCAAAGACAGCATTCACTGTCACCATGGTATCTTGTCAGCTGAGGTATGCACTTTATTTGCTGCAAAATTACTTCTAATGTTAGAAACTCAGAGCACATTTGGTGTGTTATTGGAACTCATGCAATTACTTTTGAACATGATAAACCAGATTGGGCAGCTGTCGACAATTCCACCAAAGCAAAGATCACGAGAAGCTGTTGAGGCCTTTGTGAAGAGCAAGAAAGACATACCAATCGAAGCATTCAGGGGAGGGTTCATACTGTCAAAAGTTGCGAGTCCTTGGTCAACAGGTGAACTGAAGTTGATAAACACCAACGTGGAGGAGAACCCTGCTGTTACCTTCAACTATTTCAGCCACCCTCATGATCTTAAGCGCTGCGTGGAGGGTATCCGCTTAGCCATAAAGGTTGTTCAGTCACAGCACGTCACAAACTACACTATGTGTGACAGACAAAGCGCAGAGAAAATGTTGAACATCAGTGTGCAGGCAAATATCAACCTCATACCCAAACATCCCAATGACACAAAGTCACTGGAACAGTTTTGTAGAGACTCTGTGATCACTATTTGGCACTACCATGGTGGGTGCCATGTGGGGAAAGTAGTAAACTCTGAGTATAAGGTTCTTGGTGTTGACAGACTCCGTGTGGTAGATGGCTCCACATTTTCTGAGTCCCCAGGAACCAATCCTCAAGCCACTGTCATGATGATGGGCAGGTATGTAACACTACACAGAATAATGTACATTTTTTTAATTAACGTCTCATTATGGAATTTATGGTGTCAATTCACCTTATATATGCTAATAATATGTTCATATTTGCAACAGGTACATGGGACTGAAGATTCTAAGAGACAGGTTGGGGAAATTGGGTGATATTTAA