Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_15480	LG4	8450011	8456445	hypothetical protein LR48	Map

Annotations

category		relationship type		keyword
Pathway		B 09182 Protein families: genetic information processing		C 03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]

No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15480.1

MSQQGQIPINPMVPPQNPMAAMQVPMPMHMQMQMPMPLPMQMQMPLPMPLQIPFSIHDAAASSGKRRRDDEAPGTAAATEQSAAKRAKGQDVIFRIVVPSRQIGKVIGKEGCRIQRIREDTKATIKIADAIARHEERVIIISSKDNDEKVTDAEKALEQIAHLILKEDDSSLDLSKVAAGHVAANTIRLLIAGSQAGGLIGMSGQNIEKLRDSSGASITVLAPNQLPLCASAHESDRVVQLSGDLPSVMKALDEIGCQLRENPPRQVISISPTYNYAAIRPSQPYLDPTSVDYVTFEMLISETMVGGLIGRCGSNISRIRNESGAMIKVYGGKGEQKHRQIQFGGSAQQSKLLEIKQHDARLRPVLDE*

CDS Sequence:
>Vu_15480.1

Promoter Sequence:
>Vu_15480::LG4:8448011-8450011(+)

TCATAAAAGAAATACTTGCCCACAATGTCCAGGACCAAGTCAGCAACCTGAAAGTCAGCCAACTACAGGATCAAGTCAGGAACAAGAAAGCCAGCCAACTACTGGACCAAGTCAGCAACCACCAAGCCAGCCAACTACACCAGGACTTTAAAAGTTATTCAGAACACTAAGATGTATTTTGACAAGTTTAACTTAAGTTTAGCTTTTGTTTGGTACAGCCCAGTATTGGCTCCTTTGTAAACATTGACATGTAGTTTGAACTTCATTTTGAATTGGGTATTTTGTAAGCTGTGATACCAAATTGGATGATTATAATCAGAATCTCAATGACAATTTCTCTTTTGGATGTGCATTTGATTTCCAATTTCAGAATTGGATGATTATTCAGAACTGTGATACCAAATTGGATGATTATTATCATGTCATTATTAATGATGTTCATTCCATGTGCATGTGATTACAAGGACATTTTTCTTTGTTGTGATGTATACTCATGTTACAAGTACTCATCTTTGACAACAAGGACTAAATGTAACTTACCTTGATATTTGTCAATGAGGACTACATGTCACTTACCTAAATGTTATGTGATTACAATAAAGTTTTTGATTTGGTGTTGCTTTTGTCCAGAGCACATTCACAATCCATAAATTTATTGGACGTTCAATGAGGATGACACATCACTTTCTCATTTTACTGTCATTTCAATCTAAAGTTCAGTTACTTTATCTTCTATATATCAAACAAAATGTACATTTAAACAATAAATTCAGATGCACAAATTCAGATTTCTCATTGATTTGAAAACATCATATTACAATATGGCCAAAGTGCTCTTCACAATAATTGACTACTACAACACATCATGGACTTTTAAATAAAATACAAAGAAGGATGATGTTAATCAACCCCATAAAACATAGCATCCAAATCAACATCTTCTCCTTTCTCTGAAAACCCATCACAGATTTCTCCAAGCTATTAATCTTCCTCCTTTGTCTAACAATAGTACTGCCACCATCATCTACATTATCTTCAATACACCATTTAAAGAAGTTGCATCCTTTAAGTTCTTCATTTCTTGTCCGCTGTTAAAGTATTCACTTCATTAAAATTTCATTAATAACCAGAACAATTTATCACAAAAATTAAACAACAAACTTTGTAATTAGGGCAGCCCCAGAATTGCTTCCCCTCATTCTTAATTGTTTTTGCCACTCTCAACACAACAACCTTCCCACAATGGCATATTTGCCTTCCAAGGAATCCTCTGGATGTACCACCACGAGAGCTCCCCCATGAGCAAGACGAACATCCTTGATTCAAAGACATTGACACAAGAAGGAACCCCAAAACGAGACAACCACGAACCACGAACCACTTCGCCAACCAACTGTCAACGACGAAACACCAACTCGCGAAACACGAAGCACAACTCTATTGCCAACAGACAACACTAACATTCAAATGCTAAAGAATAATAAAAGAAAGAGAACAAGACAAATTTGAAGAAGAACACCCACTATACCGTGTTCGCAACACAAAGGAGAAGACCCTAATTGGTTTTATTTATGCCCAAAATCAGATTCCCCCAAATTATAAAACCCTAACTTAATATAGGGTTCATATTCTTTGTTACTCCCTTACACGTCATTATTTACAAAATCAATACAATGACACGTTTTACATAACTAGTACTATATCATTAATATATTAACTTCGTTTGTTGATACTTAACTGAAGGAATAAATTAGAGGCAAATTTATTCCAAACACTTTTAAAAATGTGGACAAAATTGAAATTAGACAACCAGTGGAGACCAAGAGGGTGTTAAACCTACTTTTAATTTAGAATGTTTATCTCGACGCTGTTCATGCTAACTTAAACCAAGGGTAACTTGGTAATTCATGTAACAAAACCCTATATTTTGCTTCCCAAGAAAAGCTGTTTCTCTTTCCTACTCCGATTATTGGATTCTTCGAGAGAAGAAGTAGCAGCGA

Gene Sequence:

>Vu_15480(+)

ATGTCGCAGCAAGGTCAAATTCCGATAAACCCCATGGTTCCTCCGCAGAACCCTATGGCTGCCATGCAGGTTCCCATGCCCATGCACATGCAGATGCAGATGCCCATGCCATTACCCATGCAGATGCAGATGCCTCTCCCCATGCCGCTCCAGATTCCCTTCTCCATCCACGACGCTGCCGCCTCCTCCGGTAAGCGCCGTCGCGATGACGAGGCTCCCGGAACCGCTGCCGCGACGGAGCAGTCTGCGGCGAAGCGCGCCAAGGGACAGGACGTTATATTCAGGATCGTCGTGCCCTCGCGCCAGATCGGCAAGGTCATCGGGAAGGAGGGGTGCCGCATACAGAGGATTCGAGAAGACACCAAAGCAACCATCAAAATCGCTGACGCTATCGCCGTAAGTCCTTTTATTCGTTCACTCGTTGAATCAATCTGTGTGGTAGCATAGAGCGACAACAAATTAGGGGATTTCACTTTTGGGGTTTTAAATGTAAATCCACATATTCGGTAGAACTGATCTACGAGAGTGAGTTGAATTGAAATTTTAATAGCCTATTTCTGTACTAAGGAGTTTTGTGGATTTTAATAGACAGTGTACGATTTTTTTAGTTTGAACTTTAATGGATTTATATCTGTAGAACTATATGGTTTCGAAATTACCATAGTTGATAAGAAAATATAAAGTTTTCGAGAAGAAAGTAAAATCAATACATTTTTTCATAGCTAAATGGTTTTAGCTTTCAACGTTCACCAATACTTGCTCTACATGCCTTAACATCTTTTCGTGTCGGTTCCTGAGTTTGAACAAAATTAGGATATTTTGTTATATAGTAATATTGAAGATTACAATTAGTTTATTGGGTCAATTGAAAACTCATGAAAACAACATTCTTCGCAATAGAAGTTATTAAGAGAGTCTATACTGTCTTCAACAAAGAGAGTTTTGTTACCCTCCTTTGAAAACCTGACAATACTAATTGAATACCACAATACTTGTTTATATGAGTTGTTAGTGTTTTATTTGGGGCTTGTTGATGTTTTCATTTTATGGTGTATGTTTGATGGCTGAGAAACTGCTTGAGTAAAAAAGAAAACAAAACTGTTCTTCTGAATTGAATTGTTGTATTATAATAATACAACAATACACTAATTCTTGCATCTGATTTGGGGTTTGTGGTACATTAGTGCTTTTTTTTTTTGTTTCTGGCATCCATTTAGGGTGTGTATGGAAAGCCATTACACTGCCATTGACGGACCTTTTACGCATTTCACTGCAAAAGTGTAGGAGGGAAGGGCTGGAATGTTCAACTTGATTGATATGCGGAAAAAATTTACTACGCTGAGAGAAAAAAACGGGATGACTACTTTGGGTAGAGGTATTTTCAGTATATAATTTTTTTGGAGCTTGTTAGGAGTTAAATTTCTGAATTAAGATAGTGGTACTGTGATAGGCGAAATTGCTTCTTCATTTTTAGTTGCTATTCAGTTGTTGTAACAAACGGGCGTTGCTTGGTGTGTGGATGAAACATTCTACCCTTTGGTTGGATTGTAATCTGAGGCAGTTGATATCTCAGCTACAAATCTTTTCACGAAAGTTTGAAGTGTGATGCTGCCTTGTATTTTAAAATTTGATGTATGTCCACTCTTGACTGCAAAGCCTACAACGATATAATGATTATTGCACTGGAGTTTTATTTTCAAAATGATAACTACTATGTAACTGTTACATACACTTCACCCTCACCCTTTCCTCCTTCTTGGTTCGGAATCTTTATAAAGTGTCACTGTTCCTACTAGAAAAACAATGAAAAATCTTGCCCTATTCATAGCATCCTGTACTCTGATCTGTTTTAAAAAAAAGGTAGAAATCCTAGTCAAACCCTCATTCTAACTGTGCCATTGATAACCATCACAATCAACTTGCCGTTTAGAAATTTGGTCTCGAGTAATTCTTTGGTGACTCTATCATCAGTAGTGTATTGCTAGTGCAACTCCTCTTGTTGGAAAGGTCATATAAAATTGGAAGGTTGCAATGGTTTTTATTCACTTAAAAACTACAATTTTTATTTTAAATCCTATAGTTTTTATTCTACTCAAACTATATTTTATTGAAATATATTTTAGTCTCTCATTATATATTTTCTGTTATGTAATGGATTGGATATTGGATAGAAAACAAATCACAACCACTTGCTATAATAGTCTGTTTTATGCTACACTGTCACTTGTCAGTTTATGCTACGTCATCACTCAAAGCAATAAATGTACCAGCTAAATGAATCCCAATAAATCAGGAATCATGTAGAAGAAAAACACATTAGGTCCCAAATCAAAATTCTCTAAGTTTTAAGATTTCTTAAAGATATTTACAATTATTCTTATATTTAGGAAAACATAAAAAGAATAAAAAAAAGCTGTTACCCAAATAAATATTGTTTCCATGTTTTACAAGTCATTCAACAACCATGGAGATTTTGTAGCTCTGCATTACGCAGGCAGAGTCAACTAGGGATGGTATGAAGGGAGCAAGTGTGGCCTTGCCCCACCTCCTTATTTTATTAAGAAAATTATCGTACGTACAAACACAAGTTTTTATATAAAAATATTGTAGTCTTGTAATTCGTAAATACAATTATGCATTTCAAAGTTGATCGACTCTTGCCCCTAGATGTGTTCTTTACCCTCAACTGTGTTCTTTGCGTCAATCACAAGCTCCACAGTCAGCTGCCCGCGGCTGTTTTTTTAGTATCTTTTTGTCAGTGGTTAATTGAAGTCTGTTTATTGCATTATAGCATACTGAATAACTCTACATTTTCTGGTAAGGACTTTGTTTGACCCTGACAGTACTGTCAATTATTTCTCGCCGGGGATGCCAGGCCTTTGTTTGCTCTTGTCAAAACTGTTTTTGTCACGATTCTAAAAGGGAAAGTGCTTTTTGTATTATTATTTATTATTTTCAGCAGAAACCACCATGTTAAAGGCATAGGTGATATGTAAATTATTTTCCCCACACTAGTCTTTCCTTCAAGGATCCAAAAAAAAATCCATATCTTATCTGAACATTGTATTTTCAGCTGTGTTAAATGCTATAAACTTCATTCAGGTTTGCCGATTATTAGTGAGGGTTAATGTATATTGGTTGAAGTGCTTAAATTTGCATTTAAAATAAATATGTTCAGTCATTATTCAGGTTAATTGGTGTTTTACCAAATCCAATCTAATGTTTTCCTTTCGGGCAGAGACATGAAGAGCGAGTTATCATTATTAGTTCTAAGGATAATGATGAAAAGGTTACTGATGCAGAGAAAGCTCTTGAGCAAATAGCACATTTAATTTTAAAGGTAAGATGGTCCTGATTGAATTTTTTGGCTCACATGCTTTCTCTGTAATATGCTTGATCTGACTAGAGCTTTGAATTTTGTTATGATTTTTATTGCTGATTATGTTCTTATTGTGTTTCATAATTTATTATAAAAACCAGGGTGGGCGCTGTTTAATTTTTATTTTAAAATAATATGGTTTATTGTTTGTCTAGCTTTGAAAATTGAATTACTAAGGCTTGAATTGTGTAACTCGAATTTACCCGTGCCGCTATCCCTTTTAGTTTTAGAAAAAAATTGGAACATTTTTGCAGATGTTTGAACACATAGAAAGAAGTTGAAATATGTAACATTGTTCTGGAGCATCCTTGGAAGGTATTCAACAAAATATACAGAAGAACACTGAATGCTTTATCTGTAAAATACTTTAACACGCCAAGCCAAATATTCATTTATTTTTGTAGTGAGTTAATGTAACATGATATTTTTATATACCTTGTCACTGTATATGCCTATATGCTATATCGTTAGTATAAATTGCTGCACCCCCCTGTATGGTATTATTTTGAAAACAATACATGTCCTGCATCCGTGCATCATGATTTAAAACACGTTGTTATGCTTGATAATTATAAACTCAGTTAGGGGTCTTGCCCTGCATATCCTGTACTTCTGATACGTATTTGGCCACTTTAGTTTTTTCCACTTTTGAGATTATCATGTATTATGTTAATATTCATGTAGCCCTGTTGGGTCTTACTTCATTTTGTCAATGCTATTGAGAGGCGCTGATAATGCTTCCATATAACAGGAAGATGATAGCAGTCTTGATTTGTCAAAAGTTGCAGCAGGACATGTGGCTGCCAATACAATTAGACTTTTGATTGCTGGGTCCCAGGCAGGTGGATTAATTGGGATGTCTGGTCAAAACATTGAGAAATTGAGGGACTCTTCCGGTGCCTCGATTACTGTTCTTGCACCAAATCAGTTACCTTTATGTGCTTCTGCCCACGAATCTGACAGAGTAGTGCAGGTGATATGTCTAAAATAATGCTTATCAATTCTTGCAACAAAGAATTTTGGTTTTCGGGAACACTTTTATCAGTGACTCAGTGTCACTTTGCCTTCACCATATATTTTGACTTGGATATTTTAACCATGATGGCAAGGAATTTTAGTTTGTTCTTTGAAATTTCATGTACTGTTAAGATTACAGATGGACCAACATAATATGAATGTTATTATTTGTTATTAATTTTCCGAAGATAATGCTTGCATGATGTTGAATGACCTGCTCTTCTGTGTATCAGGTTTTAATATGTTCATGTTTAAGTCATAGTTCTAAATTCTATTCACATGTATCAAGTAGCATGAAGATGATTTGAGGATTGAATTATGCATTTTTTTATGCTGCTTCAAAAATACTTTGGAAACCTGGATTGTAATCTTCACTCTTGTTGAAATTAGTTATCAGGAGATCTTCCTTCGGTAATGAAGGCTTTGGACGAGATAGGTTGTCAACTAAGGTGTGCTGGTGAACTTCTGTTGTATATTAATTTTGAACCTGATTCTAATTACTGTTGAAAATTAGTTTGTCATTTTGCCTAACCTATATATGAACTCAAATTGTGCACAGGGAAAACCCACCAAGACAAGTGATTTCAATTAGTCCAACATACAA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