Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12738 LG3 19809441 19813709 PREDICTED: bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09104 Nucleotide metabolism   C 00240 Pyrimidine metabolism [PATH:ko00240]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 19809581 downstream_gene_variant
T/C 19809605 downstream_gene_variant
T/A 19809614 downstream_gene_variant
C/T 19809621 downstream_gene_variant
C/T 19809658 downstream_gene_variant
A/G 19809694 downstream_gene_variant
G/A 19809776 downstream_gene_variant
G/A 19809826 downstream_gene_variant
A/T 19809907 downstream_gene_variant
C/T 19810068 splice_donor_variant&intron_variant
A/G 19810112 missense_variant p.Val508Ala
A/T 19810234 downstream_gene_variant
G/T 19810236 downstream_gene_variant
T/C 19810251 downstream_gene_variant
C/T 19810264 splice_region_variant&intron_variant
G/A 19810385 downstream_gene_variant
C/A 19810495 downstream_gene_variant
C/A 19810607 downstream_gene_variant
C/T 19810683 downstream_gene_variant
A/G 19810753 downstream_gene_variant
A/G 19811176 splice_region_variant&intron_variant
A/G 19811361 downstream_gene_variant
T/C 19811514 downstream_gene_variant
A/T 19811523 downstream_gene_variant
T/C 19811563 downstream_gene_variant
A/G 19811575 downstream_gene_variant
A/T 19811579 downstream_gene_variant
A/T 19811622 downstream_gene_variant
C/T 19811742 downstream_gene_variant
T/C 19811808 downstream_gene_variant
C/A 19811841 downstream_gene_variant
A/G 19811844 downstream_gene_variant
T/A 19811860 downstream_gene_variant
A/G 19811866 downstream_gene_variant
C/A 19811877 downstream_gene_variant
C/T 19811908 downstream_gene_variant
T/C 19812087 downstream_gene_variant
G/C 19812218 downstream_gene_variant
C/T 19812288 downstream_gene_variant
A/G 19812307 downstream_gene_variant
A/G 19812369 downstream_gene_variant
A/G 19812381 downstream_gene_variant
A/G 19812383 downstream_gene_variant
G/T 19812390 downstream_gene_variant
A/T 19812490 downstream_gene_variant
G/C 19812669 missense_variant p.Leu291Val
G/T 19812672 missense_variant p.Pro290Thr
A/C 19812673 missense_variant p.Phe289Leu
T/A 19812677 missense_variant p.Asn288Ile
C/T 19812793 missense_variant p.Cys275Tyr
C/A 19813171 missense_variant&splice_region_variant p.Arg149Met
T/A 19813264 splice_region_variant&intron_variant
A/G 19813587 synonymous_variant p.Ile41Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12738.1
MASDSFVISNGNGNGNDNGKSEPPPRRTYQAVVIATRDMGISKDGKLPWTLPTDLKFFDEITTITSDPGKKNAVVMGRKTWESIPPEDRPLPGRLNVVLTRSGSFDIATAENVIICGSVSSAMELLAASPYCLSIEKVFLTGGGEIFREALNVPGCEAAHITEIEASIECDTFMPRVDTSQFQSWYSSFPLVEDNLRYSFNTYVRVRSSPAESLRQNADPVFDNGSDSLKFEVNEFSFLPKFIYERHEEFKYLSLVREIISEGTIKDDRTGTGTLSKFGCQMRFNLRRNFPLLTTKKVFWRGVVEELLWFISGSTSAKVLQEKGIHVWDGNASREYLDSIGLREREEGDLGPVYGFQWRHFGAKYTDMHADYSGQGFDQLLDVIDKIKHNPDDRRIILSAWNPSDLKLMALPPCHMFAQFYVANGELSCQMYQRSADMGLGVPFNIASYALLTCMIAHVCDLVPGDFSHVIGDAHVYRNHVRPLQEQLQNQPKPFPILKINPNKKDIDSFVATDFKLIGYDPHKKVHVSRGSRVI*


CDS Sequence:
>Vu_12738.1
ATGGCAAGTGATTCTTTTGTGATTTCCAATGGTAATGGCAATGGCAATGACAATGGCAAGTCAGAGCCTCCTCCACGGAGGACTTACCAAGCAGTAGTGATTGCCACCAGAGACATGGGCATTTCTAAGGATGGAAAATTGCCCTGGACGTTACCCACTGATCTCAAATTTTTTGATGAGATCACAACTATAACGTCTGATCCGGGGAAGAAGAATGCTGTTGTGATGGGTAGAAAAACATGGGAGAGTATCCCTCCTGAGGATAGGCCTCTTCCTGGTCGCCTTAACGTTGTTCTGACTCGCTCGGGTAGCTTTGATATTGCAACTGCAGAGAATGTTATAATATGTGGAAGTGTGTCTTCTGCTATGGAACTGTTGGCTGCTTCTCCGTACTGCCTGTCAATTGAGAAAGTATTTCTTACAGGAGGTGGTGAGATATTCAGAGAGGCTCTTAATGTACCTGGATGCGAAGCTGCTCATATTACAGAAATTGAGGCAAGCATTGAGTGTGATACTTTTATGCCTCGAGTTGATACCTCTCAATTTCAGTCATGGTATTCATCATTTCCTTTGGTGGAAGACAACCTCCGCTATTCTTTCAACACTTATGTGCGTGTAAGGAGTTCTCCGGCTGAGTCCCTACGTCAGAATGCTGATCCAGTTTTTGATAATGGTTCAGACTCTTTAAAATTCGAGGTCAATGAATTTTCTTTTCTTCCGAAGTTCATTTATGAGAGACATGAGGAATTTAAGTATCTAAGTTTGGTTCGAGAAATTATTTCTGAAGGCACAATTAAGGATGATAGGACAGGGACTGGTACCTTGTCGAAATTTGGCTGCCAGATGAGGTTTAATCTGCGCAGGAACTTTCCCCTTCTAACAACCAAGAAAGTATTTTGGCGAGGGGTTGTTGAGGAGCTTCTTTGGTTTATCAGCGGCTCAACAAGTGCCAAGGTGCTGCAAGAAAAAGGCATTCATGTCTGGGATGGCAATGCATCTAGAGAATACCTTGATAGCATTGGTTTGAGAGAAAGGGAGGAGGGTGACTTAGGACCTGTTTATGGGTTTCAGTGGAGGCACTTTGGAGCCAAGTATACTGACATGCATGCTGACTACTCTGGCCAAGGATTTGACCAGCTTCTGGATGTTATTGACAAGATAAAGCATAACCCTGATGATCGACGCATCATTCTTTCAGCTTGGAATCCATCTGATCTTAAATTGATGGCACTTCCCCCCTGTCACATGTTTGCGCAGTTTTACGTAGCAAATGGGGAATTATCGTGTCAAATGTATCAGCGATCTGCGGACATGGGCCTGGGGGTGCCATTTAATATTGCATCTTATGCTCTCTTGACATGCATGATTGCTCATGTTTGTGACCTTGTTCCGGGTGATTTTAGTCATGTTATCGGGGATGCACATGTTTACCGCAATCATGTGAGACCTCTTCAGGAACAGCTTCAGAATCAACCAAAACCTTTTCCGATTTTGAAGATAAACCCAAATAAGAAAGATATAGATTCCTTTGTTGCTACCGATTTCAAGCTCATAGGATATGACCCTCACAAGAAGGTCCACGTGTCTCGTGGCTCTAGGGTGATTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_12738::LG3:19813709-19815709(-)
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Gene Sequence:
>Vu_12738(-)
ATGGCAAGTGATTCTTTTGTGATTTCCAATGGTAATGGCAATGGCAATGACAATGGCAAGTCAGAGCCTCCTCCACGGAGGACTTACCAAGCAGTAGTGATTGCCACCAGAGACATGGGCATTTCTAAGGATGGAAAATTGCCCTGGACGTTACCCACTGATCTCAAATTTTTTGATGAGATCACAACTATAACGTCTGATCCGGGGAAGAAGAATGCTGTTGTGATGGGTAGAAAAACATGGGAGAGTATCCCTCCTGAGGATAGGCCTCTTCCTGGTCGCCTTAACGTTGTTCTGACTCGCTCGGGTAGCTTTGATATTGCAACTGCAGAGAATGTTATAATATGTGGAAGTGTGTCTTCTGCTATGGAACTGTTGGCTGCTTCTCCGTACTGCCTGTCAATTGAGAAAGTATTTCTTACAGGAGGTGGTGAGATATTCAGGTATATTTATATTGTAGTTACCTTCCTGCTTCTTTCCTTTTGTAATCATATTAAGTTTTTTTTTTTTTAACGGTGATAATTGTTATGTTCAGAGAGGCTCTTAATGTACCTGGATGCGAAGCTGCTCATATTACAGAAATTGAGGCAAGCATTGAGTGTGATACTTTTATGCCTCGAGTTGATACCTCTCAATTTCAGTCATGGTATTCATCATTTCCTTTGGTGGAAGACAACCTCCGCTATTCTTTCAACACTTATGTGCGTGTAAGGAGTTCTCCGGCTGAGTCCCTACGTCAGAATGCTGATCCAGTTTTTGATAATGGTTCAGACTCTTTAAAATTCGAGGTCAATGAATTTTCTTTTCTTCCGAAGTTCATTTATGAGAGACATGAGGAATTTAAGTATCTAAGTTTGGTTCGAGAAATTATTTCTGAAGGCACAATTAAGGATGATAGGACAGGGACTGGTACCTTGTCGAAATTTGGCTGCCAGGTAACATCTCGATTGCTCTGTTCAGCAGTTGCAATGATTTATATGTATGCTTACACCTTCTCTATAATTCCACAGATGAGGTTTAATCTGCGCAGGAACTTTCCCCTTCTAACAACCAAGGTATGTATGAATTTGTATAAACTACTGCGTATTAATTTCTTATTTTTTTGTTTCGTTTCCTTATGTTATTTTGATGTAATTGTTGTTTGTTTTGTCACTTTTAATGTTTATGAAGACTGAAGAAGAATATATATCGTATTTCATGATATAAAAGTTGACATGATTTCTTAATTTGGTTCCTAGAAAGTATTTTGGCGAGGGGTTGTTGAGGAGCTTCTTTGGTTTATCAGCGGCTCAACAAGTGCCAAGGTAATGATATCTGTACCAATCTTTTCCGCGCAGACGTGCATACATGCCCTTTTCTAGTTATGTTACTGTTCACGAAGTAGCTAGCACGAACCAAATATTGGGCAACTAAGTTGGTTTGCTTGATACTATTTTAGCTTGGTAAAGAATGGGGATAGACACATGGAAAGCTTTGGAGTCTCCTACCCAACTCATTATTCCCTGTTTTTTTTTTCAAATTTTTAATCGACTTATACATTGTTGTGTTGTGAATCAAAATGATATAACATGTTTGAATCCTTATTAATCTGTGCACTGATGACTAAAATATCAATACCTTTTATGTTCAACGATTTATTAGTGACTAAACGTCGTGATAAAGCCAGGCTTTCGAGAATTTGTAGGCTGGCTTTACATTAGTTGGCTCTAATTTTGATAATAAATGCCTATGTTCATGAAATTGGGGGCTTTACATTAGTTGACTCTAATTTTGATAATAAATCCGTATGTCCATAAAATTGGCATTATTGTGAATTAGGAAGTGAGTTTAAGGGGTAATTAATTTTTAAAAATCGATTTATAAGATGAGGATTGTCTCTATTTATATTTTGTAAATTGATCATATACTCAAGTTTTTTTTAATCTATTTGCAATGGTTAAAATATTATCATAGAACGGTTTCATGATGACATGATTAGCACCTGGATGTTGCATTATTAATATTGAATAATTTTACCAAAACACATGCCTCAATAATATAGCTTAATAGCTTCTGTTAACAATTTTTAGTTATTTTTCCAAACATAGTTAGAGTATAAAAAGCTGCTGAACCAAAATTCAATTAAATCACTGAGTTGCGTGAAGGCATATTAGTGGTTTACAAGAATGTCCGGTTCATTGGATACATCCAGAGTGAATTTTATTCTGAAATCATTTTATATTGACAGGTGCTGCAAGAAAAAGGCATTCATGTCTGGGATGGCAATGCATCTAGAGAATACCTTGATAGGCAAGCATGACCTACTAATTTTTGTTGGAACTACAATTTTTTCTTCTCCGTGCGTTTGTTAACTGGATTTACAATTTATATACAGCATTGGTTTGAGAGAAAGGGAGGAGGGTGACTTAGGACCTGTTTATGGGTTTCAGTGGAGGCACTTTGGAGCCAAGTAGGTGGATGTACCTTTATTTTATGTCATTAGGCATCATTTTGGTGGTCTTGCTTAGTTCCTTATTAATTTTCCATCTTACATTTTACAGGTATACTGACATGCATGCTGACTACTCTGGCCAAGGATTTGACCAGCTTCTGGATGTTATTGACAAGATAAAGCATAACCCTGATGATCGACGCATCATTCTTTCAGCTTGGAATCCATCTGATCTTAAATTGATGGCACTTCCCCCCTGTCACATGTTTGCGCAGGTCTGCAGCTATATTTGGGTCTATCTTGGAATAACTATCTCTTTCTCTCGTTCTCCTTTCATGAAGTTTTGTCAACAAAAAAATTTCTGCAGTTTTACGTAGCAAATGGGGAATTATCGTGTCAAATGTATCAGCGATCTGCGGACATGGGCCTGGGGGTGCCATTTAATATTGCATCTTATGCTCTCTTGACATGCATGATTGCTCATGTTTGTGGTAAGCAAATTATGTCAGTGTCATATACTTAAATTTGTTCTCAGACGTACATGGCATCTTAATTCCTTTTCATGATACAGATTCGTCATTATTTGATTTTAAATGACTTTAAGCTGATTAATGGGTTATGATTCACAAAGATTTTATATTATTATGATTAGCATACTTTTTGTATGGAATGGCAAAATAGTCCTTTTGGATGCCAATAATCAGATTCTCTGAAAAATTAGAATGCTCTTAAAAAGAAAGATATAGGTTTGGGTGTGTTCTGTTTCACCGTTTAAAGTTTGGGGGTGGCTCTGATGTATTTGGGTTGTAATCTTACGTAGAGAAATACAGCATTTATATTAAAATAAAATTGACATCAGATATTGGACTGATCTAACCATATCATATCCTGTTCTTGTCAGACCTTGTTCCGGGTGATTTTAGTCATGTTATCGGGGATGCACATGTTTACCGCAATCATGTGAGACCTCTTCAGGAACAGCTTCAGAATCAACCAAAACCTTTTCCGGTAGGTGTAAATGTTAAAAAAAACATTTGCTTAACGTAGATGCCCACAAAATAATAACAATTATGCACTCGTATAAACTGCCTTTTCCTTGTTGATTGCCTATACCTCAATTCAGATTTTGAAGATAAACCCAAATAAGAAAGATATAGATTCCTTTGTTGCTACCGATTTCAAGCTCATAGGATATGACCCTCACAAGAAGGTAGAAATGAAGATGGCTGTTTAAGGATCTTGTAAGATTCTCAAAACCCTGCTTCTATGCTTTCTGAAATGGGGCAAGTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATATTTGCTTGATTTTATTTATGTAAGGAATTTTTAAATTATCTGGTTGACATTTGCACCTGTGGCAAACAGAAAAAACTGCTGATTAGGATTCATATTCAGTAAAAATTCCGCTCTTCCAAAATTGATGTAAAAGTGGCTTTTCAAAATTGTTTATTACACGACATAAAAATTTTGAAAACCAATTTCACTAGTAATTTTCTGAATTTAAAGGCGCACACTGAAAATACGTTATTAATTTTTTTTTTCTCAAATTTACAGAGAATGCATAGGTAGTGTGCTGTACATTTTTTTAAAGCATAGTCACTTGATATGTGTTCCATATTTTGGTCATCAAACTAAAACATGGTATTTTCCTTGTTTCAGGTATAACCATAAAACCTATATATTAAATTTATGGACAAATAAAAGAATATCGCTGGATACACTTTAAGCTTTGCTTGTTACTACTGGGAATCCTTTAGGTCCACGTGTCTCGTGGCTCTAGGGTGATTTAG