Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10359 LG2 44101124 44107045 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 44101301 missense_variant p.Pro58Ser
C/T 44101309 missense_variant p.Arg55Gln
G/A 44101953 upstream_gene_variant
A/T 44101958 upstream_gene_variant
G/T 44102035 intron_variant
C/A 44102450 intron_variant
C/A 44102547 downstream_gene_variant
A/G 44102584 downstream_gene_variant
T/A 44102612 downstream_gene_variant
C/T 44102613 downstream_gene_variant
A/T 44102861 downstream_gene_variant
G/A 44103088 downstream_gene_variant
A/C 44103131 downstream_gene_variant
T/A 44103415 downstream_gene_variant
A/G 44103622 downstream_gene_variant
A/G 44103651 downstream_gene_variant
C/G 44103653 downstream_gene_variant
T/C 44103825 downstream_gene_variant
T/A 44104266 downstream_gene_variant
C/A 44104273 downstream_gene_variant
G/A 44104670 downstream_gene_variant
T/C 44104727 downstream_gene_variant
A/G 44104782 downstream_gene_variant
T/A 44104876 downstream_gene_variant
T/G 44104886 downstream_gene_variant
G/C 44104910 downstream_gene_variant
A/T 44105086 downstream_gene_variant
C/G 44105550 downstream_gene_variant
G/A 44105559 downstream_gene_variant
G/T 44106388 downstream_gene_variant
A/G 44106537 downstream_gene_variant
T/A 44106592 downstream_gene_variant
A/G 44106600 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10359.1
SLTAFHMP*FPHIFSHWGLAKDCQWGS*ILQ*CSHRWWCPWEVDRGISYLVEETLRPLPWQLLQPFSVD**VSWLFPDLAVESLQVKYEVSCSFYI*HGFLFKEG*GKWTGSNNV*I


CDS Sequence:
>Vu_10359.1
TCACTTACAGCGTTCCATATGCCTTAATTTCCACACATATTCAGTCATTGGGGCTTGGCCAAGGATTGTCAATGGGGGTCCTAAATCTTGCAATAGTGTTCCCACAGATGGTGGTGTCCCTGGGAAGTGGACCGTGGGATCAGCTATTTGGTGGAGGAAACTCTCCGGCCTTTGCCGTGGCAGCTGTTGCAGCCCTTCTCAGTGGATTAATAAGTATCTTGGCTATTCCCCGACCTGGCGGTCGAAAGTCTACAAGTCAAGTATGAGGTATCATGTTCTTTCTACATTTGACACGGATTTCTTTTCAAAGAGGGATGAGGAAAATGGACAGGTAGCAATAATGTGTAAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_10359::LG2:44107045-44109045(-)
AGCATCATTAGTCACCAGGGAGGGTAGCCAACCACGTCTACCTAACCCTTGTCTCCTCCACTTACCGAAGACTATATTCTGTAAGTATATCCAGAACAACTGCTAGATACTAGAAAGACCACTCAAGGTGGCTTAGAAGTTCTTGTCAAATGGAAACATCTTCTAGATATTGAGAATGGTTGGGAATCTATTGCCTGCATTCATAAAGAATTTCTAGAATTTCACCTTGAGGTCAAGGTGAATCTTCATGGAGGGGTATTGATAAGTTTGATACAGTTTACAAAAGAAGAAAAAAAGAAAGTAGTTAGTACAGTTGTAATTACGAAACTGTAACAGACTATTATAAATAGTCTTATTAGGAGGTGAGCAGGAAATTTTTTTGGGGCTTTTGGAGGAAAAGGGGAACTAGGAGAGTTAGGGCCCTCTCGAAAGACCTTTGTTTTCTGCTATACTTTGTTAATAAAACATTCAAGAATCTGTCTTGGTATTTTCTGTAACTCTGGGTGTTCTATCAAAATTGCTAATGTTTATTTCTACACGGATGATTATCTGCTTGATATGTACTTCTGAATAGAGTTCTCACTTAAATTAAAAGGACATGTTTTTATCTTTTTATTTTGATTACATCTTGCCTGAATGGTTTCTGCAAATGTGGCCTTCAATGTCTGAATAAAACCCCTTAACCTCCACCTCAAAAAAGAACGAAAAATATACAGCAAGAGTATATCTTATCTATATTTTAATTTATTTTAAATTTAAAATATTAGTGATAAAACAAGAAAACAATACGTTGACTGCTTCTATATTTTGTTTATGTATCTTTGAAATGTTAGGCAAGGATCACCGAAGGACACGTGTTGCAAATGCTTATTTCTCCCTGTTTATGGCTATTGGTAATATTCTTGGATATGCAGCTGGATCATACAGTGGTTGGTACAAGGTCTTTGCTTTCACCATGACCCCTGCATGCAATATTAGTTGTGCAAATCTCAAGTCTGCTTTCTATCTTGATATTGGTTTCATCGCTGTCACCACTTATATAAGCATCATGGCAGCTCATGAAGTACCTCTGAGTTCTAGTGGGGCACAACCTGTTGAAGCAGCAGCAGGGGAATCGGGTGCTGCTGGAGAAGCTTTTCTGTGGGAGCTATTCGGGACAGTCAGATATTTTTCAACCCCAGTATGGACAATACTGTCCGCTACTGCCTTAACTTGGATTGGGTGGTTTCCATTTCTCCTTTTTGATACTGATTGGATGGGCCGAGAGATTTATGGTGGTGAACCAAATGAAGGCCCTAATTATGATACTGGAGTTAGAATGGGGGCAATGGGCTTATTGCTTAATTCAGTTGTTCTTGGAATAACGTCTGTACTCATGGAGAGGTTATGCAGGAAGCGGGGGGCTGGGTTTGTGTGGGGAATCTCAAATATCTTGATGGCTGTCTGCTTTATTGCAATGCTTATTGTAACCTATCTGGCAAATAGAATTGGCTATATAGGCAAAGAACTACCACCAACTGGCATTGTGATTGCTGCATTGACAATCTTTACCGTTCTTGGGTTTCCACTTGCAGTAAGTTGCTCTATTTCCTGCTAAAAGCATTTTGTTTGTTCTTTTTTCTACCAATATTGAAGGCACCCTTTCTGTCTCCCTTGTTCCTTAAAACAAAAACTCAAATTCTGTCTTTTTGCATGGTTTCAGTGACTCATCATATAAAGTATCTTAATTCATTTGATTTTGTCTGCATGATCTCTTTAGCTCAAACTGGCTTCTGTTCTCCTATGTACCTTAACATAAACAGTACTATTATGTCTCCTAGAGTGTCTTGACTCAAGCTTGGCAGCAGTTTTACCACAAACTGGCATTTTCTATCTCGAGAATCAAGACATGTCAAAATTTAAAATTTGGACATTACCCCATTAATTGTGCATGATTTTGCCAATATATTATTTGAGAGTTCTGTGTAAGTTAATCTGGCTTCATGGATCAATTATTTCAG


Gene Sequence:
>Vu_10359(-)
ATCACTTACAGCGTTCCATATGCCTTAATTTCCACACATATTCAGTCATTGGGGCTTGGCCAAGGTGAGCAGGGTTGATAGCTCATTCTTTCTTGTGAGTATATTATTGTATTTTATGGCTACTTATATTAACTGTTAGTATTTCCAGGATTGTCAATGGGGGTCCTAAATCTTGCAATAGTGTTCCCACAGGTATTACTTTTTGAATTATCCCCTATTTCTTGTTTCTTTTGTTGGATGGGGTGAGGTGGGAGGTTGAGAACCAAAGGAAGTTCTTTGCAATTGCTTGTTTGGCATTCCCAGTAGATTTTGTGAAGAAGAATCTTTCTACTTAAAATGTAACTCAACTTCACAAAATTAATTTGTAAAGTGAAATTTGCATTCATATGTATCCTATAATTTGGCTATATCTTTAGTCAATGTGAGATTTCCAACAAAAAAGAAATCAAACTAACAATCAACAAAGAGAAATTAAGAAATGTGGTTGAATTTGTAAATCAGTTTACCATTATAGAGTATTATTATAAAAGTCAGTGAACCTCTGTTGCAGAACACATGGTTATAAAGACAGAGGAGCACTACATTATATTACAGTTATTCATTTGAACAAACTACAGCTGTCAGCTGTTTACTTCTAACTAATAACTGACAACTGTTCCATGTGTTTAGTCTTTGGATGTAAAACATGATTGTGCATTGAATTTCCAGCACTGAGTGATCATATTAAATAATCAGAGTGCCACAAGGAATTGCTTGCTAAGTGAGTCGAGTTTGAATCCATAATAGAGCAGTAGTAGCAGAAGCAAGGCTCGTGTATAGCTTTTGTGCTTGACCAGCTGAACCAGTTAGTTTTCTTGACAATCAAGAATGCCGTACCATAAGTTGATCTTCTATCATCAGGAGATGTAGTCCAATCAGCATCTGTTTTGAGAGTTTAGAACCAGAAATCATAGGAGAAAAAATGGAATTTGTTCTAGCATATTTGTCTTGGCTAGCAGATCCTTTATATAATATGTTTGTGTCAAGAGTGCCATTGGGCTGTGGGTGTACTTCAGTAAAATGATCCAAGGCCCCTACTGTTTGAGTGAAAAAACAGAGTTTATGAATAAGATGTTTAATCAAGAAAGTATAGTTTCTAGTTAATCATATAATTAATTTTAGGACCTCTAACGGACTCGGAAGAAATTTGCCAAATGATTGTTAGAGTTGACAAAACACCAAATTTGAAGCAATATGCAAGGAAGTTTAATTCTCCGAGCGACTGCTTGAAGAAAATAGTTTACACGAGGTCGAATCCATGATTCAATACTCTCCTATTACATTGGCTGGGAACAACATTTTGTTTCTTTCCTAGGAAGTTAAGTTATTTCCAATAAGAATGTAGTATTGGGAAGTAGATACCTTTTTAGTTAGAGAACCTATTGAATTCTCATCCAAATGTCTCACAACTCAATAGATAGTAAGGTATTATTGCCTGCAGATATACCTGTCATTTGAAATTACTTAGATACTCTTAATTATATCTAAAAGGTTGGTCTAATTTAATGTATGATTCAATTTTTTTTAGTATAAATGCATTTGCCAAATCAGTTATTTTTAATGTAAACATGTTTCAATTCTTTTATTGTTGTTTAAAAATTTGTATTGTAAAAAATATAGATGAATACTTGCAAATATTCATTAATAATTGTGGTTACTCACTTAACGCTTACTCGTGTGGGTATGGGTTGGGTACATGAAGAATTTCCATCCAACGATGTGGGTGATGACTGTTACTAGTCGTTTTTGTCTTGTCCTATTACCATTCCTACTTGGAGCTCCTTTTATACATTTCAATATACGAATGAGAGAATTCCAATGCCCTTCACAAGGACAGTTAAGAAATTTATTCACAATCTGTGAAGAAGTTGTTTCCTCCCAAATATTCATCACATCTGTCCTTTGAAAAAAGGCAATACTTATCTTTGACTTGTGCTACATCTATCCCCAAGAAGTGATGGTGTCCACCAAGATCTATTGAAGTCACAAAGACCGTGAGCTTTTCTCTAATACGCAGCCATAAGCAACAGCAACAACATCATTCTTTCCTTTTTATTAAAAAAAATGCAGCCATAAGACCTTAAAGGTGGCAAAGGCAAATGATACATATGAAGAATTGGAAAACACCATAAAGGCACTGAATATTAGTGGTGCGAAGAATTTGTGCTTATTTCCAAACTCATTCACTAGTCACTTGAGCACGAAAAATCTACTTAAAAATGGGTGAAATGGTGAATTTTAGAATGCTACATAACTACAGATCAATCTTGTTCCAACAAAAATTATCAGCCTCCAGGATAGAATCAATTTCCACAGTTAGGTGATCAACATTGTCTCGACCCTTAGCTGAAGCTTGATGTCAGAAATCCAAGTGTCATAGTTGGTTCCATCCAGCTTGTCGAAAAAGGGACTGGGAAGGGTACATTTGGAGAAAATAGGAGGATAAACCTTGGGAGTTGGGAGTGGTAGAAGACACCACCATGGGTGACGACCTAAAATATGGAAACAACCTGTAATAATAAGAAAAAAGAAAGTTAGAGCCCCTATAATGGGCCAAGAAAGTACCGAACAAGGTAGAGCACAGTGGGAAACATTGATAAGAGTTGGAAAGAGTGGTAGACAGTGGGCACAAGAACCCAAGGCCAAAACATGTCAAAGCTAAAAAAAAGAGTATGAAAGCACAACTCGGGAAACTAAAGAGACGATGTTTTTGTCTATATAGGATTGAGTCACGAACACAAAATAATCCTTCTTGTGACATATGGTTGAGGCAAGAAGCATACCCCGCCTTAAGTTGGGATGAATGTAAGTTTTTTCTTATAGGAAAGAGGAAAAGCTATATACACTAAATACATTAATATTTATGAAAAAATTGTAGGCAGTAAGCAAGAATTATGGAATTACTTTTCCCTTCTGTTCCGTCTTTTTATCTCCTCAGTATTGAGTCTTCCCTTTGTTCCTTTTTTAACAACAGCAACAACTTTTACTTTTATCTCAAACCTTGAGTTGCATCAGTTGCCTTATAATTCGTGCGAGTGAGGAAAGCTGATATATCCTTCACTGTAGTAAGAAACATACATATGTCATTGATGTTGGACTCCGTGAAGAAAACGTCTGATTCTCCTTGGCCTTTTCAAGGATGTGAGAAAGACACCCCTTTCCCTTGAGATAGGTTAGAACAAGATGGGACCATTTGAGAAAGTTTTCCTATGAAGCTCTAAAGTCTTAGAGTTCAGTCTTTTTATGAAAAACTGAAATCTTATTCTGTTGATTTTGGATCAGACATCATGGAAATACGAATTAACAACCTACTGTCTAATGAGTGATTTTACATAGAGAAAATTGCAGTGAAGGTTATTATGATGAAACTGTAGCAATTAAGATTGCACACTCCTGAAGAATGGCAATGGATGGCAATGAAGGTCGTAAGTGGTAAAATAGAGACCTGGACACCAGGAAAAAACCTAGAGCTATGATACCATGTGAAAATTTGTGTAGGAAGTAAGCAATGATTATGGAATTACTTTTCTTGATATCAGATAGAAATAATACGTGGGTGTTTAACGAAAAATGAAGTCCTAAGAAAAGGAAATAAACCTCTTCAAACAAAGGAAATAAATCTCCTGAAATAAAGACACTCTAAATCGGGAGCAAAGCTACCAAATAAACTCCTAATCCAAATCCTTTAATTTTAGGGATTTCTTACAAACAAATCTGTAGTTATTATTCAATCAATCTATGCTTATTGTGCAGTAAACGCGAAATATTTACACCCATATTTCAACAATATTTAAATGAAGAAATATGATAATCCTAATTAGTGGTCCACATCACATGGTTTTCCTTGGGCCAAACTCATCTCCATGGGATCAACTTGTAAGGTGGGAGTTTCCTAAATCCTTATAAGTTATTGGTAATCGCTATCTATTGAAAACGTGAAAATTGAGATTTTTTCCAATATGTCCATTATAACCTGCACTATTGAGCTTGATAGGTAGACGATATGGTAGATAACCCAACTTTAAAAACTAGTTCATGAGGTGAGGCCCATGCGAGTTACTCCCTCTACTTATATACATTATGACTATATTACTAGTCAATGGTGGTATCATTAACTCCAAAAAATTGCTCCGATAGATAGTGGATCCACCGAGATGAGGTAGGGTTGTTTCTTGTTAACCTTTAAATACCATGTTGAGAAGAGAGAAAGCAAGACACAAGATTAAGAAAATAATTGCCTAATTACTATAACTGTATAAATCCTAGAATTGCTTAATTACCATAATTAAAATATCTTCAATATCTAATAGTCTATAAAACTATATCGAGTTAAATCTCACAAGTGGTCCTGAGTCACAGTACCCTCACAATTTCTCATCACTTGATAAAATGAGATTTGTAAATGAATAATCAATTAATTGATGTTGATACATGTATTCGGATACCATTAATAGCAACGGGCAGTACAATTATAGTCTGATCCCGTACGGTGAACTTCCTTAACTATACATAATTTATAGTACTCTCCCAAGGTATTTTGCTGAGTAAAACTAAGAGGGCAGTAATTTTCGTGCTGGGGCCATCAATTGAGATGTCTTTTGACTAAGAATAACAATTTTTGGCATGGGAACTGAGAAAAGTTTAGAGAGTTGAGACATTCCTGATACAAGTGTCAAGATATGTCTGATACATGGGTCCTTTTTAAAGGTTTCCATGTATGTTTTAACTTTTAATTTGGTCAACTTATTCCCACCTTTCATCTGCACAGTGTAAGACAATTAAAAGCTGTCCATTATTACTAGAGTACAATAAGAAATATAATTCAAATAGGCACAAAAATAAACCATCTGTATAAAACAATAGAAATAATCTCCAATTCCTTGGCATATCTCTGGAGAAGATTTCATTAAATAAATCATGACCTGAGCACTCAAGGTTGGTCCTTGGAGATTTGTTTCACA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