Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10067 LG2 40178864 40189099 PREDICTED: protein disulfide-isomerase-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   "B 09123 Folding   sorting and degradation"
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 40179186 upstream_gene_variant
A/C 40179190 upstream_gene_variant
T/C 40179200 upstream_gene_variant
T/C 40179201 upstream_gene_variant
A/C 40179204 upstream_gene_variant
T/C 40179317 upstream_gene_variant
T/A 40182045 intron_variant
T/A 40183509 intron_variant
C/T 40183695 intron_variant
G/A 40183758 intron_variant
T/A 40183933 intron_variant
T/C 40184053 intron_variant
C/G 40184163 intron_variant
A/T 40184198 intron_variant
A/T 40184302 intron_variant
C/T 40184950 intron_variant
A/T 40184985 intron_variant
G/A 40185072 missense_variant p.Leu312Phe
T/C 40185201 intron_variant
C/T 40185342 missense_variant p.Gly273Arg
T/A 40185373 synonymous_variant p.Ile262Ile
A/G 40185460 intron_variant
A/G 40185490 intron_variant
T/A 40185498 intron_variant
A/G 40185504 intron_variant
A/T 40185564 intron_variant
T/G 40185766 intron_variant
T/C 40185789 intron_variant
A/T 40185856 intron_variant
T/A 40185886 intron_variant
G/T 40185949 intron_variant
T/C 40185973 intron_variant
T/A 40186041 intron_variant
C/A 40186065 intron_variant
A/G 40186126 intron_variant
C/G 40186147 intron_variant
A/G 40186163 intron_variant
G/A 40186206 missense_variant p.Ser253Phe
C/T 40186257 missense_variant p.Gly236Glu
C/A 40186318 intron_variant
T/C 40186331 intron_variant
G/A 40186362 synonymous_variant p.Asp224Asp
A/T 40186365 missense_variant p.Phe223Leu
A/T 40186511 missense_variant p.Phe175Ile
T/G 40186557 intron_variant
T/C 40186595 intron_variant
C/T 40186706 missense_variant p.Gly135Asp
T/C 40186936 intron_variant
G/C 40186939 intron_variant
T/A 40187000 synonymous_variant p.Ala66Ala
C/G 40187100 intron_variant
C/T 40187185 intron_variant
C/T 40187263 intron_variant
A/G 40187400 intron_variant
C/T 40187929 intron_variant
G/C 40187935 intron_variant
A/T 40187983 intron_variant
T/A 40187989 intron_variant
A/G 40188153 intron_variant
A/T 40188163 intron_variant
G/T 40188325 intron_variant
A/C 40188336 intron_variant
G/C 40188755 intron_variant
A/T 40188978 missense_variant p.Val41Asp
G/A 40189015 missense_variant p.His29Tyr
C/A 40189084 missense_variant p.Ala6Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10067.1
MAGKIAICSSGLVFLFFLLLAPPSQISAHESETQEFVLTLVHSNFSDTVKKHNLIVVVFYAPRCDRSKKLAPEYEKAASILSSYDPPVVLAKIDADDEKNKDLATEFEVRAYPTIRILRNGGKNVQEYKGPREADGIAEYLKKQSGPASAEIKSVDDATAVIGEDKVAIVGVFPKFSGEEFDNFTALSEKLRADYDFGHTLNAKHLPRGESSVAGPIVRLFKPFDELFVDFQDFHVGALEKFVEESSVPVVTVSNSAETFKSKYRETAEQYRQPGVSFLVGDVRSTTGSFQYFGVREDQVPLILVQRNDGKKFLKPNLEPDQISTWFKAYKDGNIAPYFKSEPIPEANNEPVKVVVGDSLQDIVFNSGKNVLLEFYSPWCIYCTELAPTLEEVAVSYQSDADVIIAKLDGVANDISSDSFEAKRYPTVYFRSASGKISKYSGNRTKEDIIEFIEKNRDKHAHQEQAKGDKEKGKDEL*


CDS Sequence:
>Vu_10067.1
ATGGCTGGTAAAATTGCGATTTGTTCGTCAGGGTTAGTGTTTTTGTTCTTTCTCCTTCTGGCACCCCCTTCTCAAATCTCTGCTCACGAATCGGAGACTCAGGAGTTCGTTCTCACATTGGTTCACTCCAACTTTTCCGACACCGTCAAGAAGCATAATCTAATCGTTGTCGTGTTCTACGCACCAAGGTGTGACCGCAGTAAGAAGCTTGCACCGGAGTATGAAAAAGCTGCTTCTATTCTGAGTAGTTATGATCCACCGGTTGTTTTGGCTAAAATTGACGCGGATGATGAGAAGAACAAAGACCTTGCAACAGAATTTGAAGTTAGGGCTTACCCAACAATTAGGATCCTGAGAAATGGGGGAAAGAATGTTCAAGAATACAAAGGTCCCCGTGAAGCAGATGGCATCGCTGAGTATCTGAAGAAACAAAGTGGTCCTGCTTCAGCTGAAATTAAATCTGTAGATGATGCTACCGCAGTTATTGGTGAAGATAAAGTTGCTATTGTTGGAGTGTTTCCGAAATTTTCTGGGGAGGAGTTTGATAACTTCACTGCGTTATCAGAAAAGTTGCGTGCTGACTATGACTTTGGTCACACTCTGAATGCCAAACACCTTCCAAGAGGAGAATCATCAGTTGCTGGGCCCATAGTAAGGTTATTCAAGCCATTTGACGAACTTTTTGTTGACTTTCAGGATTTTCATGTGGGAGCTCTAGAGAAATTTGTCGAAGAATCTAGTGTGCCTGTTGTGACTGTCTCTAACAGTGCTGAAACTTTCAAATCAAAATACCGAGAAACTGCCGAGCAATATAGACAACCGGGTGTAAGCTTTCTGGTGGGAGATGTCAGGTCTACTACAGGTTCTTTCCAGTATTTCGGAGTGAGGGAAGACCAAGTACCTCTAATTTTGGTACAACGTAATGATGGGAAGAAATTTCTTAAACCCAATTTGGAACCTGATCAAATTTCAACTTGGTTCAAGGCATACAAGGATGGAAATATTGCACCATATTTTAAGTCCGAACCTATTCCTGAAGCTAACAACGAACCTGTTAAAGTGGTAGTTGGGGACAGTCTCCAGGACATAGTCTTCAACTCTGGGAAGAATGTTCTGCTGGAGTTTTATTCTCCCTGGTGTATTTATTGCACAGAGTTGGCTCCAACATTGGAGGAAGTTGCTGTCTCATATCAAAGTGATGCTGATGTTATTATTGCAAAACTGGATGGAGTTGCCAACGATATCTCAAGTGATTCCTTTGAAGCCAAACGTTATCCAACAGTGTACTTCAGGTCAGCAAGTGGAAAGATATCAAAATACAGTGGCAATAGGACCAAGGAAGACATCATAGAATTCATCGAAAAGAATCGGGATAAACATGCTCATCAAGAACAAGCAAAGGGTGACAAAGAAAAAGGAAAAGATGAGCTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_10067::LG2:40189099-40191099(-)
AAGAATCAGATGCAGATTCTGTGGAACGATTTTTCAGATATTTTTCAGATTTGCTTACAGATTTTCCCATTTATTTATATTAATATCTATTGATCCTACTATTTAAAAATTCATTCTTTATAAAGTTAATTTCACGTATTCATGAAAAGAAAGAAATCATTACTTAATTGGTCATAGAATAAAAGTTCCATGGTTACTTATACTTTTAAAAAGTACAAACTTCACATCATCTTGCAAAACACTTAAAATTAAGATCAATAATTAAGATTAGCTTCTACATGCCAATTATAGAGTTTTAATAACACCTTATTAAAACTACATACTCGACTCTCACGCTTCTGTTGTCTTATAAAAAGAATTTATTTCTCCTCTTCCTCAATCTTATTATGATCTCTTTTCCTTTTTCTCAGTTTTGTACATACTTATCTTTTTACGCTTACTCTCTTTTTATTTATAGTTCAATAAATCCTTTTTATTTTATTCATTTTAAATTAAAATATATTATAACTTACATGTAACTTCTTAGATGATGCTTCTTACAATCTCTCAATAAGTTTTTTTAAAAAAACATAAATGCTACATTTCATATCTTTTATTTTTAAGCTTATTTTATTTCAAGTGAAGACCTTTACTTCCTACACCCTCATTTATAATTTCTTTCAAGTGTAGACCTTTACTTCCTACACTCCCATTTATAATTTATGCGCCTAAAAAAACAAAAGGGTAAAAGACATTTATTTCTCATAAACCTTTCTCGGGTCTTAAAGAATAAATAAATAACATGTTTGCACTTATATTAACAGAATAAATAAATAACATAAAACTTTATGTTCTATTCAAGACTAAAACACGTGACCACTTAGCCTATCTGAGAGTTCTCACCAACTAAGCTACACAATACCTTATGATAACATGCAACTTTCATTAAAACTTACTCAAGTTTTATTACAACATTATTCATAAGTCTTATATTTTATCGACTCTTACATAAAGTAGTATAGATAATCAACATTTTACTGTAATTAAGTTAATTATGTCCAACCCTAGTTGCTATGTGTATAACCACATCTTAATAAGCGTGTATCCATATCGCCGTGTAAAAACACATATGTAACTTTGTTTATTACATTGACGAATGTTTAACATAGTTTAGTCACAAAGATAAATTATGTATATGCATTAGTAAAGTTTAAAATATATTTTTAAAATACAACTCTAATTATTAAGGTGTAATTGTGTCAGGACCACATCCAGAAGACTTAAAACACTTAGTTTGAACTCATCAAACGACCACATGAAGAAACTAGAAGAAAAGATTCATGTAAGTGTAAAAGTAGTCAAATTTTTATTCAACCAGTTCAACTCTTATTATGATTGAAAAATAACGTTGGGAGTCCCACATTGACTAAAAATAAAATCAAATTATAATATATAAGTGGAGTGCAAAGTTTACCTTACAAGTCTGTTTTATAAAATTAAATTAAACTTAAAACCATTTTCTAATAATTATTAGACTATCCATTAATTTTTACTCTCACACACTTCTTCTTGCTTCTTAATGAATTAATTTTTAATTTTCATAATTTATCATTCTCTTTTTTCCCTTACCCTACCTTTATATTATTATTAAAATAAACTCAAAACTTATTTATTAAAAAATATGCTTAATTATATTATTTTCCTAAAAAGAATAATAAAATTACAAAAAAAAAAAGCACGCTCGTCCGTGGTAGGCATGGGCTAGTTTTAAATATTATTAAACACCAAAACTGTCCAAGAAAAAAGAATGTGAAAGTGTAAATTGGTGACGTGACAGATCGAGCCACGTAAGAGAAAGCGCTAGCGTGGCGACACTAGGTTCAATATCGTGTGCATGGAGTCAAAACCAAAATTCAAATTGTTTTGCTAAACAACACTGCACCTGTTTCCCGGGTTACAAAACCCGTGAATACTGAGAAGCTCAACAAATTTTCAGATATTCTTCTTCTTCAGAGAAGACT


Gene Sequence:
>Vu_10067(-)
ATGGCTGGTAAAATTGCGATTTGTTCGTCAGGGTTAGTGTTTTTGTTCTTTCTCCTTCTGGCACCCCCTTCTCAAATCTCTGCTCACGAATCGGAGACTCAGGAGTTCGTTCTCACATTGGTTCACTCCAACTTTTCCGACACCGTCAAGAAGCATAATCTAATCGTTGTCGTGTTCTACGCACCAAGGTATGTTTCGATTCTGCTCTTCTTCGTGGTTCAATTCTACATGTCTTTGTCCGTGTTTGAATCCAAGAAAATCTGATCCGTCCAAAGAGTAGAAAACTTTGATGACAGTTTGAAATGCATTTCAATAGAGGAAAAATGGCAAGAAAAATCAGAAGCCGTAAATAACACTGTCCATTTGCCTCCAACGAAATATTTTATTAAGTAAGGTTAGTTAACTTTTAAGTAACTCACTTAAATTTTAAACCTTCAATAAAAACGAATTTTTAATAAATAATTAGTTAAAAATATTCTCACTTAAATTTTAATTAAACCTATTAAATAATATCTAAATAAGATTTCAATCGCTTTTTATTAGAAAAGAAAAGCTATGCACTAAAGTAATTTTAGTGCTTGAAAGAAACTTTTAGTGATATTATTCAATGCATATTATCATGATTTTGCTATTTTTATGTAAAAATGTGTGCATGCAATGTGTGTTTTTTGAATTAGTTTTGAGACTTAGACATTGAAAAAATACAAAAACACGTTTCCCGCACTCTAATGCCTTCGATAAATTGGATTGATTTGGAATGCTCTTTTTCCCCCTCTCTTTAGAAAGAATGTTTTCCCCAACATTCGTTTTTAAAGTATTTAAAAAAACAATTATTTATTTTGAAGAAAATAGTCATCAAATAAAAAACAAGTTAAAAAGGTTAAAATGATCTCTCCTTTCCCATCTCTCTCCATATATAAAATAAATAATATATTTTAAAAAAATCTAAAATAAAGTATGTCAACATTTTTATTCATTTACTTATGCTATCATTTAATTGTTCCCATAAATACTTATATACACTTGACGAAAGTATACACAGAAAGTTCTAGTTGTTCCAGTTCATAAAAAGGATAAGAAAAGTTTGAGATTACAAGAGATTAATTTATAATTTTTTAAATCATTTCTATTAATTTTACCTGATTCGGTTAAATCAATATAAAACTCATCGCATATTTTTTCGTATTAATTTTCTTAAATATTTTAAAACAGTAATTTATACTTATAATTTATGTTTATATTTTTATCCTTCTAATAAAATGTTTTAGTTGTATGTTTTAGTTCGTTGTTTGTCCCTTAAAAAAAAACGCCTATGCATCCCGAACAAAGCAAAATCAAGATTGTTATAGGTTAGGGATTAAAAAGATACTTAATTCTAAAATACTTTTTACTGATTTTAAATTAAAAATCACTAAAAATTTAAATTATAAAAGTGAATTCTATGTAATTATTTTATTTATATAATATAATGTAATAATACGTTATATAATTTAACTATTTATCTAAATGGTGAAATTAGTTTAACTTAAAAAATAGTTTTGTAATTAGTTTAACTTAAAAATAGTTTTTTTGTCTTAATTATTTCAATTAACATTACTATAGTAAATTGTGAAAACAGAAATTGATCAGTTAAAAAAATAAAGGCAACAATATTTTTGAGAGAATAAAATCAAATATAACTCATTTTAGTATTGTCCACTGAAGGCAGTGGCATTAACATGTATAAGAAAATCAGCAGTATCAGCTTGCAGCAATGACTAGGACTTTGTGTAGTACATTTTGATGGAACAATTTTGAAAAGGTTTTGAGAATTTGATAGGCATTTATTTTCACTTTGTAGCAGATCTTACTTTTGCTAACAACCTCTTAGAATTTCGTGTGTGTATATATAACTGAGGTTCATAAGTAACTCTGGTATTCGTGTAGTTCTAATGTTGTAATCGTTTTGTGTATTCAGTTCAACAATCAGTGCTAGACTAGCATTTTTAATCATTTAGTCGAAATTTGTGTTTTAGCGGGAAGTTTTGTTGTATTTGATTTAGGTCAAAATCGATTCGGCTTTTATATGAATTTTATTTTTCATTTCCAGGTGTGACCGCAGTAAGAAGCTTGCACCGGAGGTGATTTTGTATACATTTAGTTTTTGGGTTTCCTTTTATCCTAAGATTATGGAAATGCTGATTTTCTAGTATCTTTGTTTCTGCAGTATGAAAAAGCTGCTTCTATTCTGAGTAGTTATGATCCACCGGTTGTTTTGGCTAAAATTGACGCGGATGATGAGAAGAACAAAGACCTTGCAACAGAATTTGAAGTTAGGGCTTACCCAACAATTAGGATCCTGAGAAATGGGGGAAAGAATGTTCAAGAATACAAAGGTCCCCGTGAAGCAGATGGCATCGCTGAGTATCTGAAGAAACAAAGTGGTCCTGCTTCAGCTGAAATTAAATCTGTAGATGATGCTACCGCAGTTATTGGTGAAGATAAAGTTGCTATTGTGAGTAACCAATCGTTTCATTTTTTGCTTTATTTTAAGTCAGTTGGTATGTAATAATATTTTCCTACGTGTTCAGGTTGGAGTGTTTCCGAAATTTTCTGGGGAGGAGTTTGATAACTTCACTGCGTTATCAGAAAAGTTGCGTGCTGACTATGACTTTGGTCACACTCTGAATGCCAAACACCTTCCAAGAGGAGAATCATCAGTTGCTGGGCCCATAGTAAGGTTATTCAAGCCATTTGACGAACTTTTTGTTGACTTTCAGGTAGTGTTGATTTTTGTGGATTGATTGTTCAATCTTATTTTGGTCTCTAGCAACTATCTCCTTCCTTCAGGATTTTCATGTGGGAGCTCTAGAGAAATTTGTCGAAGAATCTAGTGTGCCTGTTGTGACTGTCTCTAACAGTGATCTGAGAAATCACCCTTTTATTGCCAAATTCTTTTAATAGTCCCAATACGAAGGTAATAAGCTGTCCAAGTCAATTTTGTTCTTTCAATATCGAGCCAGAGAATTCGTTATTAATCAATAATCATACTATTGGAAGATGTATTTCATATTTGTCAAGTCCCACCATGTTGCCTATGATGCACTATAGCGGAGCAGAGTGGCCTGGGCGCTATGGGATTCAAATAGTAGAGTGATTCTCAATAGCTGTCTTTGCAATCCCTATAGAGGCATTTTGTGTGCTATATAGCTGCGCTGCTAGGACATAAAACTTAAAAAAATCATTTTTACTTGTGTCAAGGGTTTATTTTGGTTGAAAGTGTGATTTCTCCCTCATTCTCTAATGCTTTTTTATGCAGTAACATAATAAGACTATTTTTTCCTTGACCATTTCACAAAACTTTTCCTTCCTTGAGTACTTGTATATATTGTATAAATTTTTTTAGTTTGTATTATATATTGTAATATTGTATATAAATAATTAAAATAGTAGCCATCCCGCTTCCTGCTATGGGGTTTTTGCTGCTGGCTTATACGCATCTCTATCTGAGATCATAACTATGAGCCCCATTTTCCGTTAGTGTCCTCCCAATCAGTCTACCATTCTGAACGTGATACAATTTTCCTAAGTGTGCTTACTTTCACCCATTTGATGTTCTAAAATATTTATTATTTCCTTTGTTTCGCTTGTCTCCCCCATTATATGATGTGTTCAAGTCATAATATTGGTAGGTAATGTTGTTTATCAACTTCATTGCTGAAGGTGCTGAAACTTTCAAATCAAAATACCGAGAAACTGCCGAGCAATATAGACAACCGGGTGTAAGCTTTCTGGTGGGAGATGTCAGGTCTACTACAGGTTCTTTCCAGGTTTGTATCAAAACATGTTAAACATTCTGCAGTTTAGCGTGCATTAAATCAAGGTATCTTAAATCAAAATACTCAAAGTGTAACGTTCTATAGTTGTTCTCTTCTGTGCTTAATATCAATATTTGACATTTTGTATGGATTGTCTTCCACAGTATTTCGGAGTGAGGGAAGACCAAGTACCTCTAATTTTGGTACAACGTAATGATGGGAAGAAATTTCTTAAACCCAATTTGGAACCTGATCAAATTTCAACTTGGTTCAAGGCATACAAGGTTATTCTTATTTCTCTTGGTAGCTTTTGCTTTTGCCTGATTTAATCTGCGATCTTCTTTGTAGTTGTGGTGGACTCTTTAATTTGAAATAATATCATCGAGGCTGTCATTTGTATGGAAAATATAAAATTTTATCATTTTTTTAACATTTCAGGATGGAAATATTGCACCATATTTTAAGTCCGAACCTATTCCTGAAGCTAACAACGAACCTGTTAAAGTGGTAGTTGGGGACAGTCTCCAGGACATAGTCTTCAACTCTGGGAAGAATGGTATACTTTACCGTTTCTATTTGGTTTTATACCACATATTATGAGTTGGGTTTTGGTATTCCCTGTGCTTGCAAAAAAAAAAAAATCACATTTCTAATGTTCTTTGCGTGTGAAAGAGCATTATATTTCAGTCCAATTTAGATGATTGGATAATGTATCTCTCGTGTTTTTGTAATACCGACCTTCACATGAAGCTGATAGATATGATTTTACCACATTTCTAGGACGTAATGATGTTCTCTTTATAAATGTTTGATGTGAACCTGTTACTATCATCAAAGTAGTAAATTATAAAGGAACCTCTCTTCCTTTATGAAATTGAAAAAAAGTTTAAGAAAAATTGATGAAACTAGTTTCATAAAAAAGCTAAAGATGTTATGTTAGCAATAAATGTGGGCATCAAATAGCCAATGCTCTCTCAACTTGTGACAATACTAATTTTTTTGGAATTGAACTTCTGATGACTGTAAGTAGCTGGTCGATTGTGGCCAGGCCAGCCACATTTACTGCTTAGTGATGTATATTGTGGCTCTCTACATCTTTGTATATTATTGATGTGTTAAATCGCTGAGAAAGTTGTGTAGTGTATTGATGTTCCTATACAAGATTAGACTGCTGATGATCATATAATTAAACCTGTTTTCTTC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