Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function
Vu_37435 scaffold_802 17746 21227 PREDICTED: receptor-like protein kinase

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 17793 synonymous_variant p.Ala16Ala
C/T 17827 missense_variant p.His28Tyr
G/T 17877 missense_variant p.Leu44Phe
C/G 17950 intron_variant
T/A 17989 intron_variant
A/G 18036 intron_variant
G/A 18045 intron_variant
C/A 18046 intron_variant
A/T 18076 intron_variant
A/T 18077 intron_variant
A/C 18086 intron_variant
T/C 18088 intron_variant
T/C 18755 missense_variant p.Ile211Thr
T/A 18841 missense_variant p.Leu240Ile
A/G 19694 intron_variant
C/T 19818 intron_variant
T/C 19856 intron_variant

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Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37435.1
MSGACGGPLQRRGTPARLGGGKGFELEHRDPCRDRKLGWGERVLQKLDMLGLPFTIVFLLTAAFAVLCSCGHAPLGCNEEERQALLRIKGSFKDPSSLSSWEGTSCCQWKGVGCNNLTGHVVKLDLRNPCYPLQGDFQPNCKFYDHVLEAQHVHPSILQLKYLSYLDLSGNRFHNTSIPAFIQTLQHLQFLYLSDSHFSGRIPYNLGNLTKLIVLDLSFNPLLYADDFYWISQLSSLQYLYMSDVNLDKAQNLLQSLNMLPSLLEIDLRNCGLDKLHTHQHISTTNLSRLQDLNLAENGLKTSFLDAFQNMTSIAVIDLSHNNLNSTPFWLETCANLDSLFLDSNALYGSLPSALQNLTSLVYLDLSQNKFDSVPGWLGELKGLQYLSLSDSKATANRLNGTIPLQLCQLSALQILDLSNNNLMGPIPHCIGNLTGMASKKNILTIPIGTQLSTFDDLYLWWQHISVWTSLPNKCSDDNLQRDDNEEKYQKEDKVEKLLFYFVIALGYFIGFWAVTGSLLLRRSWRLAYFQYIDESTRRIKVSLAIHLATFKERWTGIHEAE*


CDS Sequence:
>Vu_37435.1
ATGAGCGGCGCTTGCGGCGGGCCTCTTCAACGAAGAGGAACTCCGGCGAGGTTGGGAGGAGGTAAAGGTTTCGAATTGGAGCATCGAGATCCTTGTAGGGATCGTAAGCTCGGGTGGGGAGAGAGGGTTTTGCAGAAGCTAGACATGTTGGGGTTGCCTTTTACTATTGTTTTCCTCTTGACTGCAGCATTTGCGGTGTTATGTTCATGTGGCCATGCACCACTTGGTTGCAATGAAGAAGAAAGGCAAGCTCTTCTAAGGATCAAAGGAAGCTTCAAAGATCCTTCAAGCCTTTCATCTTGGGAAGGAACTAGTTGTTGCCAATGGAAAGGTGTAGGTTGCAATAATCTTACAGGCCATGTTGTCAAGCTAGATCTCAGAAATCCTTGTTATCCCTTACAAGGAGATTTTCAACCAAACTGTAAGTTTTACGATCATGTCCTTGAAGCTCAACATGTTCACCCTTCTATATTGCAGCTTAAATATCTAAGTTATTTAGATTTGAGTGGAAACAGATTTCACAATACTTCAATACCAGCGTTCATTCAAACGCTGCAGCATCTGCAATTCCTTTATCTCTCTGATAGTCATTTTAGTGGTAGGATCCCATACAATCTTGGGAATCTCACAAAATTGATCGTTCTTGATTTGAGCTTCAATCCTCTTTTGTATGCGGATGACTTCTACTGGATTTCTCAACTTTCATCCCTCCAATACCTTTACATGAGTGATGTGAATCTTGATAAAGCACAAAATTTGTTGCAGTCACTCAACATGCTTCCTTCTTTATTAGAAATAGATTTGAGAAATTGTGGACTTGATAAATTGCACACCCATCAACATATTAGCACCACAAACCTTTCCAGACTGCAAGACCTCAATCTAGCAGAAAATGGACTTAAGACTTCGTTTCTGGATGCTTTTCAAAATATGACTTCCATTGCAGTCATTGACCTTTCTCACAACAACCTGAATTCCACTCCCTTCTGGTTGGAAACCTGTGCTAACCTCGACAGTCTATTTCTTGATAGTAATGCTCTTTATGGCTCACTTCCATCTGCTTTGCAGAATCTGACTTCCCTGGTTTATCTCGACCTTTCACAAAACAAGTTTGATTCTGTTCCCGGGTGGTTAGGTGAGTTAAAGGGTCTTCAATATCTCAGTCTTTCAGATTCTAAGGCTACGGCAAACAGGTTGAATGGAACAATTCCTTTACAACTATGCCAACTTTCTGCACTGCAAATTTTGGATCTTTCAAACAACAACTTGATGGGTCCAATCCCTCATTGCATAGGAAATCTCACAGGTATGGCCTCAAAAAAGAATATTCTGACAATTCCCATAGGAACTCAATTATCAACCTTTGATGATCTTTATTTATGGTGGCAACACATTTCTGTGTGGACCTCCCTGCCAAATAAGTGTTCTGATGATAATTTGCAACGTGATGACAATGAAGAAAAATATCAGAAAGAGGATAAAGTAGAGAAATTGTTGTTTTACTTTGTCATTGCACTTGGTTATTTTATTGGATTTTGGGCTGTGACTGGAAGCTTGTTGTTGCGGAGAAGTTGGAGGCTTGCTTACTTCCAATATATTGATGAGTCTACACGCAGGATAAAAGTTTCCTTGGCAATACATTTAGCAACTTTTAAGGAAAGATGGACAGGAATCCATGAGGCTGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_37435::scaffold_802:15746-17746(+)
TGCACGTTTCTTAACCAAAACAGGAAGGAATTTTTTTTTTCTATAGCACTTTTATACTAAAAAAGCAAGGATTTTACGATAGTAACAACAGCCAAAACAACACAACAAACAACATGTTTTATACAGGATTTTTAACCCAATAGAAAGACTTTTATGGTGTAAAAACAGCAAGGAATTTACAGCATTATAATAGTTAATAGACAGACTTTTTGGCAGCAAATAACAAAGTTTTTATGGAGGTTTTACAGCAAAGGTTTCTGCAAAATTGTAGTATAAAACAACAACAATTTTCTGCAGCATTTTTACGTCAAAACAGCACCATTTTCTGCAGAATTTTATTCTAAAACAAAAACCATTTTTCTGCAGAATTTTATTTTAATATAGCAAACAGCACAGTGTTTTACATAGATTAATTTGTTAAATTTTTTTTTCAAACCTTAAATCCCCAAGTACTGATTGCAGGTTTGATATCCCTCTGCAAAATTGGTGGCTTTGATATCCCTATGCAAAATTATAGGTTGAACTCCATACTGCAAATAGGCCAACCCCTTTGCCACATCCAAGATTATGCTTTTCCTCTTAGGCCATCTCCATGATGCCTTTGCTTTACTTTCATCTAAAAAGTCTGAACATAGATAGCTTTGCCACAAGCTTTTCATAAAATTCCCCTCCTACCGTAGGTTTATTTAGGAATCCATTTTATCAAAAACCCAAGCAACACCATTGATTTTCTCAACAAAAACACATTTATAAATTATAACCACAATACTTTCTTGACTCTCAAAACTGCTCCTTTTGTGCACATATATTCAAACATAAAAGAGTAAACATCATCACTAATTACAAGCCATAATCAACTTTACTAATATACCTTCAAAGTACAAGGCTGCAATGAGAGATGAGGAAGGTAAGAAACAATGAAACATGCAAAATATATCATCAAAGATACCAAAATTCATCAAAAATCTGATGAGGCACAAACAACCTTTTCCGAATAAGGTAATAATAGTAAATTAAGTCTAACTTATCTCATAAAATTGGTTTGAAAAATAAAATATACTTTTAATCTATGTAAGAATTCCATCGCATCCCTCACAGATGAAACTATATATTTATGCAGTACCATAAGTTTAACAAAATTTACTATAATGAACTCTGATATGATATCTTAGTCACACAAAAAACCACATTCAAAATGAGATTTTTCGGTCCAAAATGTTTCCAGCAAACCAATGAAACACAAGATGAGGTTTGGTATTCACTCAAAATCATATCCAGCAAAGCCCATCACATAAAAAGAGGCAAAAGAATCACAATTTTTTTAGTGGCATCACAAACTATATTCATCACAAGGTGACTCAATAAATTACACACTAGAATCCGCAGTGATAGTAAAAGTGAAAAAACATGGCATGATAGCAATACTCTGCAACCTGCAAAAGATGCTCAGTCACTACCATCAACACTACCGTATTTGACATAACTATTACAATCATTTTCTAACACTGTAATCTATGTTATTTCTTTATCCCTCAAAGTTTGATATAATTAAAAGATATTAGAGGTTCTGTTTCGCACTCTAACCGGGTGGTGATCTTTCTTTATATAGGCACCTATCGTTTCAACGCTTGCTTCCCCGTCACGGCCACTCCCACCACAGCGCCGCCCACCACTCCGGCTACCGCCGCTGATCTCACCCCTCTCGCCGCCCGGTACAGTGCGCTGGTGCAGAGCCCCGCTGGAACGCTATTTCATACGTCGTCCGCGTCTCTTGCCGCCTCGATTCTGCTCTCGATTTCGGCGTAGAGTAACCCTAGTATCCCGACCCGGTTTCCCCAGACCCGACCCGAGTGTCCCGCCGCGTTCAGGACGCAGTTGATTTGGAGCTTCATTGTGTCCCCGGACTCGAAGGCCTTGACGCCCTCAACGAGTCCTGAGCCCGCACCGCCAACGGCTCCGGCCAGGTAGCCGCCGGTGTAGAAGGTGAGGTTCTCGCCCCA


Gene Sequence:
>Vu_37435(+)
ATGAGCGGCGCTTGCGGCGGGCCTCTTCAACGAAGAGGAACTCCGGCGAGGTTGGGAGGAGGTAAAGGTTTCGAATTGGAGCATCGAGATCCTTGTAGGGATCGTAAGCTCGGGTGGGGAGAGAGGGTTTTGCAGAAGCTAGGTTTTACAAATACAAAGTTGGTTCTCAAACCATAAAAAGTAATACTTTTTTTCATTCACAACCGAAACAAGAACGAAACCTTCTCCCCTTTTTACCCTCAATCAGAATGTAATTTTTTATTAAAAATATTAAGTCGACCGTGTCATATAAGTGTAATGCCACGTAGGCGTGTCACCGTATTACTACTCAAATTTTATTAATAAAATTGCCTGCTTTGACCACAAAAACCAAACTTCCACACTTTTGCTTTGACCACTTTACTAGTGGTGCCGAGTCATCAATATTTCAGTTTCCTGCTTTCAGAGTTTTATTTGATATTGTCGACTTTGTTGCTCATCGACAACTCTGTTCTTTGTATTCTGACACTCTTCTGCAGACATGTTGGGGTTGCCTTTTACTATTGTTTTCCTCTTGACTGCAGCATTTGCGGTGTTATGTTCATGTGGCCATGCACCACTTGGTTGCAATGAAGAAGAAAGGCAAGCTCTTCTAAGGATCAAAGGAAGCTTCAAAGATCCTTCAAGCCTTTCATCTTGGGAAGGAACTAGTTGTTGCCAATGGAAAGGTGTAGGTTGCAATAATCTTACAGGCCATGTTGTCAAGCTAGATCTCAGAAATCCTTGTTATCCCTTACAAGGAGATTTTCAACCAAACTGTAAGTTTTACGATCATGTCCTTGAAGCTCAACATGTTCACCCTTCTATATTGCAGCTTAAATATCTAAGTTATTTAGATTTGAGTGGAAACAGATTTCACAATACTTCAATACCAGCGTTCATTCAAACGCTGCAGCATCTGCAATTCCTTTATCTCTCTGATAGTCATTTTAGTGGTAGGATCCCATACAATCTTGGGAATCTCACAAAATTGATCGTTCTTGATTTGAGCTTCAATCCTCTTTTGTATGCGGATGACTTCTACTGGATTTCTCAACTTTCATCCCTCCAATACCTTTACATGAGTGATGTGAATCTTGATAAAGCACAAAATTTGTTGCAGTCACTCAACATGCTTCCTTCTTTATTAGAAATAGATTTGAGAAATTGTGGACTTGATAAATTGCACACCCATCAACATATTAGCACCACAAACCTTTCCAGACTGCAAGACCTCAATCTAGCAGAAAATGGACTTAAGACTTCGTTTCTGGATGCTTTTCAAAATATGACTTCCATTGCAGTCATTGACCTTTCTCACAACAACCTGAATTCCACTCCCTTCTGGTTGGAAACCTGTGCTAACCTCGACAGTCTATTTCTTGATAGTAATGCTCTTTATGGCTCACTTCCATCTGCTTTGCAGAATCTGACTTCCCTGGTTTATCTCGACCTTTCACAAAACAAGTTTGATTCTGTTCCCGGGTGGTTAGGTGAGTTAAAGGGTCTTCAATATCTCAGTCTTTCAGGTAATGATATAAATCATATTGAGGGATCTCTGGCATCTCTTCTGGGAAACTGTTGCCATCTTCAACAATTAAATATGTCAAGAAACAAAATTCAAAGTGATGCACTTGGAAACCATATAGAGTTTGAATGCATTAGGCACCATTTAATACTTTTGGATTTAAGTCACAACGAATGTAATGGTCATTTGCCAGCATGGTTGGAACAGCTTGAAAATCTAAGATCGTTGATTATGACTGACAGTAATTTGGAGGGATCACTTCCTTGTGATATATTAACAAAACTTGTCAATCTGGAGAATTTGGTGCTTTCCAACAATAACTTCACCGGTTCTCTTCCTGACTGTATCGGGGAACTTGTCAGTTTAAAGATTTTAATTCTTTCTTCCAATCATTTTGATGGGATCATTCCAAGGAGTTTAGTGCAACTTGTAAGCCTAACAGATTTAGATCTTTCCCGAAACTCTTTAAATGGTACCATTCCTCACAATATTGGTCAACTTCAAAATTTGTCGACCCTCTATCTTTCTGAAAATAAGTTACGGAAACATTCCTTTCAGTCTTAGTCAGCTTCTAAACCTTCAACTTAGACATATCCCTAAATCATTGGAGAATTTGGTGTCTGACATAAGATGGCCCAGGCAACTTGTCTACTTAAATCTCACCGATAATCGTATCAGCGGGTCACTTCCCCAAAATATTTCTGATAGCTTGCCCAATGTCGGTTACATGCTTCTTGGAAACAACCTTATAAGTGGTCCCATTCCAAACTCATTGTGCAGAATAGGCTCCTTGTACAATCTTGACCTTTCAGGAAACATGTTATTGGTGAAATTCCTAATTGTTGGAGTGTTACTCAAAACTCGGTGTCATAAATTTGGCATCCAACAATTATCGGTGTCATTCCTAGCTCTCTGGTAATCTACCCACGTTGGCATGGTTACATTTGAACAATAACAGCCTTCATGGGGGCTTTCCATCATCTTGAGAAATTTAAGTCAACTTTTAATTTTGATGTTGGAGATAATGATTTGTCTGGGATTATCCCTTCATGGATGGGGAATATCTTTTCCTCGATGCAGATTCTAAGGCTACGGCAAACAGGTTGAATGGAACAATTCCTTTACAACTATGCCAACTTTCTGCACTGCAAATTTTGGATCTTTCAAACAACAACTTGATGGGTCCAATCCCTCATTGCATAGGAAATCTCACAGGTATGGCCTCAAAAAAGAATATTCTGTAAATCAACCTACTAGAACTGTTGAATGGTATGAACAAGAGTTAGAGTGTCACAAAGGAAGAGAACTTGAGTATACAGAAATCTAAAACTGTGGTCACTTGGACTTGTCAAATAACAATTTGATTGGATCTATTCCAGAAGGAATAACATCACTTGGTGCATTGCTTAGCCTAAATCTATCACACAATCGTTTGTCAGGACATATCCAAAAGGATGGGACATGAAATCCTCGAATCTCTTGACCTCTCTCATGACCAACTTTCGGGTGCAATTTCAGAAAGCATAACTAGTTTAACTTGGTTAAGCCACTTAAATTTGTCCTACAACAACCTTTCAGGACAATTCCCATAGGAACTCAATTATCAACCTTTGATGATCTTTATTTATGGTGGCAACACATTTCTGTGTGGACCTCCCTGCCAAATAAGTGTTCTGATGATAATTTGCAACGTGATGACAATGAAGAAAAATATCAGAAAGAGGATAAAGTAGAGAAATTGTTGTTTTACTTTGTCATTGCACTTGGTTATTTTATTGGATTTTGGGCTGTGACTGGAAGCTTGTTGTTGCGGAGAAGTTGGAGGCTTGCTTACTTCCAATATATTGATGAGTCTACACGCAGGATAAAAGTTTCCTTGGCAATACATTTAGCAACTTTTAAGGAAAGATGGACAGGAATCCATGAGGCTGAGTGA