Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_37202 LG11 33337621 33339683 PREDICTED: transcription factor bHLH18-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 33337688 missense_variant p.Pro12His
G/A 33337859 missense_variant p.Ala45Thr
A/G 33337961 missense_variant p.Thr79Ala
C/G 33337966 synonymous_variant p.Val80Val
C/T 33337978 synonymous_variant p.Arg84Arg
C/T 33338059 synonymous_variant p.Ser111Ser
C/T 33338083 synonymous_variant p.Leu119Leu
T/A 33338276 downstream_gene_variant
T/A 33338722 downstream_gene_variant
A/G 33338723 downstream_gene_variant
T/C 33338794 splice_region_variant&intron_variant
T/A 33338797 splice_region_variant&intron_variant
T/C 33339266 intron_variant
T/C 33339290 splice_region_variant&intron_variant
G/A 33339387 synonymous_variant p.Pro322Pro
A/G 33339550 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37202.1
MKEVSWQNDWHPQTEMDCQNEFFYDYDPINDDCDDFFTDIILQPAPPTPFSSESESDHSFRASKTVQTNSFLPSAAVNTVASKRSAPRTYILSFDSSTVVPATPEPSVPSSLLPAKRALHTQSPTTRPNQASKRTRTSSQTVDHIMAERKRRQELTERFIALSATIPGLNKTDKASVLRAAIDYVKQLKEKVDELEKQNRKSAAETVILVNKTDSNGNEDSTNSTETNSSMLPEMEARVLGKEVLIEIHCEKEYGVELKLLDHLENLHLCVTGSSVLPFGNSALCITITAQMDEEYEMTVNDLVKNLREVLSKSHLVSDSDPY*


CDS Sequence:
>Vu_37202.1
ATGAAGGAGGTTTCATGGCAGAATGATTGGCATCCTCAAACGGAAATGGATTGCCAGAACGAGTTCTTCTACGACTATGACCCTATCAACGATGACTGTGATGATTTCTTCACCGACATCATCCTCCAGCCGGCACCGCCCACGCCGTTCTCCTCCGAGAGCGAAAGCGATCACTCTTTTCGCGCTTCCAAGACCGTCCAAACCAATTCCTTCCTCCCCAGCGCCGCCGTTAACACCGTCGCTTCCAAACGCTCCGCTCCCCGGACTTACATTCTCTCCTTCGATAGCTCAACGGTGGTACCCGCCACACCCGAACCCTCCGTCCCTTCTTCCCTTTTACCCGCTAAACGGGCCCTCCACACTCAAAGCCCGACAACCAGGCCCAATCAAGCATCTAAGAGAACCCGAACCTCTTCTCAGACCGTCGATCACATAATGGCCGAGAGAAAGAGGAGGCAAGAACTCACCGAGAGATTCATAGCACTCTCAGCCACCATTCCCGGCTTGAACAAGACGGACAAGGCTTCGGTGCTTCGAGCAGCGATCGATTACGTGAAACAACTCAAAGAAAAGGTAGATGAACTGGAGAAGCAAAACAGAAAGAGTGCAGCAGAGACAGTAATATTGGTGAATAAAACCGACTCAAATGGAAATGAAGACAGCACCAACTCCACTGAAACGAACTCCAGCATGCTTCCTGAGATGGAAGCGAGAGTGTTGGGGAAGGAGGTGCTCATTGAGATCCACTGTGAGAAAGAATATGGTGTTGAGCTAAAATTATTAGACCATCTTGAAAATCTTCATCTCTGCGTAACCGGTAGCAGTGTTTTGCCATTTGGGAATTCCGCTCTCTGCATTACCATCACAGCTCAGATGGATGAGGAGTATGAGATGACAGTGAATGATCTGGTGAAAAACCTGAGAGAAGTTCTATCGAAGTCTCATTTGGTAAGTGACAGTGATCCGTACTAG


Promoter Sequence:
>Vu_37202::LG11:33335621-33337621(+)
ATATCTACAAACATGGATGTTTTTATATCCTTAATTCGGAGCACGATCCATTACAACAGTTTTATTTTTGACACTGTTTGAAAAACAAAAATGATTAACTAGTATTTTCTTTTCTTATATTTGAATTTATAAAATAATATATATTTTGAAAACGAATATTTGTGGATTTTATTTTTTAATTGCAGAGGATCCAGTTCCAATACGTCTCATATTTGATTTCTTCTGTAGGCACTAAAATTATGAAAACTCGCACGAGTACAGTTCTTCTGACATGCGCAATCATAATAACACCATGCATGGAATTCTGAATCATCATCACCTTGGATTCACAATTTATATTTATTTCATTTTATATTTAATTCTTGACTTAACAAAAATATGTATTAATGGAGTTTGAGTTTGACCTAATTAAGAACAGCATGAGCTTCACCCAGAGCTAACAGAAGCAGCAACACCTATTCTTATTGGTGTAATTAATGTTCGGAAAATGCTTATTTATTCTTTCTCTTCTTGCTGTTTATGATGTTATATATATATAACATTTATGAAGTTTATTTGTACCTTTCAAGTAGCAGGCCCATCACCCTGAGCTGCCATTGTTGACAATCAATGCTAGAAGAAAGGCATTTATGGTTTGATATGACAACATTTTCCATTAGGAAAATGACACTTGAACAACCATTTTTGACAACATTTAGACACGCGCACACGTGTCAAAATCTGAGTGGTCCATTTTTATTTAATTTTTCCAACTGGACCACTCAGATTTTGACACGTGTGCGCGTGTCTAAATGTTGTCAAAAATGGTTGTTCAAGTATCATTTTCCTTTCCATTATTTGAATTTTCCTGCATGAGAAAATCTTCATCTTCAATGCCTTTCAAAGAGATAATCTTCCTCACCAAACTCATTTTCACAAACACGGCATGTGCATACCTGTTCACCCTGACCGGAAAAAAATGAAAGTGTTTCCAAAATCTAAACTTTTAACAGTAATTTATAATGTACAAGTAAATCAAAATGATTTCAGATTATATCATCATCAGCAAAATTTTAAGACGTTTTTCGAATCAATCATAAATTTTATTAAGATAAATAATCTAAAGAAATTCCTTTCTCAACTAAAAATAAAACTAATTTAAAATACATAATTAAATAAAAATTTTACTTTATAAATCGCTTTTTGTGAGATTATATTAAATTTAAAACTCATTTACTAATAAAAACTATTTAAAATTAATTTTTTAATACATAATACTAAAGTTATAAGTTACAGTGTTAGCTAAATTTGGTTTTGTCAAATTTATTATTTCATTTGCTATTAGATATTTAAAATTAATTTATTAAAATAGAAAAAATGATTGTTTGTATTGAATGAAAAATACAAAATAGTTTACAAATATAATTAAATAAATTTTTGTACTTTCAAATTGGTCATTACTAACATAGTTATAGCTCTGAAAAAAAAATCAGTACTTTCTTATTCCATATTTAACAAACATATATTATTAATTTTAAATTAATGATATTAATATATATGATTATTCTAATCAAATATTTGTCTACGTGTCGACATACGAGTGTGAAAATTAGAATGTTTAACACTGTTAACCACCTAAACAATAAATTTGTAGTATTAAGTTAAATATTTATTAAAAATTTAAGTATAAAATATAGTTTAAACGTATTAATTTTAATATAAATAAACTCAGATATGGTAAAGAAAAGGAGAGCTAACATTGTGGAGATGTGAAAGTGGGCCTATACGACACTCTGGAGCGCACCACAGCGACCCATCATGAATGATCTCACATCTCAAAATCACTCATCCAACGACTCACATTTAAAATGCATGAAAAACGAGTATCATCTTGTCGCATCCTTACCTATCTTATATTATATCTACGTTACACGCAGTTCTGCCACCACAACACCACCGCTTCTCCTTTTTCTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTATCTCTTACCTG


Gene Sequence:
>Vu_37202(+)
GAGAAACATCTATTGTATTATTTCATCACTCCCATGAAGGAGGTTTCATGGCAGAATGATTGGCATCCTCAAACGGTAACTGCAACACCCACCGCCGTCAAATCTGGTTGATTTCTTATATTCAAAACTCATCGATCGTTTCGTGCAGGAAATGGATTGCCAGAACGAGTTCTTCTACGACTATGACCCTATCAACGATGACTGTGATGATTTCTTCACCGACATCATCCTCCAGCCGGCACCGCCCACGCCGTTCTCCTCCGAGAGCGAAAGCGATCACTCTTTTCGCGCTTCCAAGACCGTCCAAACCAATTCCTTCCTCCCCAGCGCCGCCGTTAACACCGTCGCTTCCAAACGCTCCGCTCCCCGGACTTACATTCTCTCCTTCGATAGCTCAACGGTGGTACCCGCCACACCCGAACCCTCCGTCCCTTCTTCCCTTTTACCCGCTAAACGGGCCCTCCACACTCAAAGCCCGACAACCAGGCCCAATCAAGCATCTAAGAGAACCCGAACCTCTTCTCAGACCGTCGATCACATAATGGCCGAGAGAAAGAGGAGGCAAGAACTCACCGAGAGATTCATAGCACTCTCAGCCACCATTCCCGGCTTGAACAAGGTACTCCAATTCATCGGCTCAATCTTCTGTTCTCGATTCGAATACAACATAAATTGAAGCTTGAACTCATTTTATAACCTAAATCAACTTCATACTTCACTACGATTAATTATCGATTGGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGATCTTGTCAATCGTGAAAGGAAGATTCATTGTCCGGGTCACCGACCTTTGCTATATTATATGATGTAAACTCGTTAATCTCTCACTAATTATTGTGCGTAGGAATTGACCTAGAAAAATCTTATATTGGAAACACCCATCTTCTTATTTTCGTTGGATTAGGTAATGAAAAGAGATATAAAGTTAAAAGATGGGAACTTGATTTAAAAAAGGCTGCCAAATTTTCCGCATGATTAGAGTTTGTGTGTATCTGTATCCTACAAGAATCACTTTTAGGTCAGCACTGAGCGATAACACGTGGTGGAGTGATGAAAGCACAAGATTACAAAAGAAAAGTTATAGTCATTATTAAAAGGAAAAAATAATGGAATTACTTATAGTATTGAAATTTCCATTTATAGACGGACAAGGCTTCGGTGCTTCGAGCAGCGATCGATTACGTGAAACAACTCAAAGAAAAGGTAGATGAACTGGAGAAGCAAAACAGAAAGAGTGCAGCAGAGACAGTAATATTGGTGAATAAAACCGACTCAAATGGAAATGAAGACAGCACCAACTCCACTGAAACGAACTCCAGCATGCTTCCTGAGATGGAAGCGAGAGTGTTGGGGAAGGAGGTGCTCATTGAGATCCACTGTGAGAAAGAATATGGTGTTGAGCTAAAATTATTAGACCATCTTGAAAATCTTCATCTCTGCGTAACCGGTAGCAGTGTTTTGCCATTTGGGAATTCCGCTCTCTGCATTACCATCACAGCTCAGGTATCTTATTATGCCTTAATCAAGTTTAATAATTCTATATCGACTAATCACTGTGATCTGATTCAATGAATCTATGGTTATTCTAAATTTGTAATGGTGTTAAATTTGTAACACTTTGGTGTTTGTTAAGTGCAGATGGATGAGGAGTATGAGATGACAGTGAATGATCTGGTGAAAAACCTGAGAGAAGTTCTATCGAAGTCTCATTTGGTAAGTGACAGTGATCCGTACTAGTGTATCAAACAAGGGGTTGTAGTGTGAAATTGGAAATTTTTTGTTTGTGGTGTTTATGATTTTGGTCGGCTTTCGTGTGGATTATATATCAATATGGCTTGGTTTGTCATGTATGATGTTGCTGTTTATAAAGACAGAAACAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGGAGAGTGATACGTTGTTTTTCAGTGAAATATGCTGAAAGAGAAGCACATGTAACAAGATGTACGACAACTCCTTTTTGATGTATGTTTGTCAAGCAGAAAAATATGTAATTTTTAATATTTTTTATGGT