Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_37201 LG11 33331980 33333773 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 33332225 synonymous_variant p.His82His
A/G 33332226 missense_variant p.Ile83Val
T/A 33332389 intron_variant
G/T 33332820 upstream_gene_variant
T/G,* 33332989 upstream_gene_variant
A/T 33333052 upstream_gene_variant
A/T 33333055 upstream_gene_variant
T/G 33333158 upstream_gene_variant
G/T 33333716 synonymous_variant p.Thr233Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37201.1
MNDNFGCTSNDGVLFEEMMWLNSAGQGCDSSNNEVACMEVKEEHSKCCWRKRGVEKHQELEAKGREKKGTKRARTSSEIEYHIISERKRRQDIAEKFIALSATIPGLKKIDKVSILGEAIKYMRQLQQRIAVLEKASNNNSVKPFIIAKSHLCSASCSANSDIEVLPEVEASGLENEVLIRIYCEKRKDILLNLMTLLKGVHLSVTSSSVLPFGNSLLNIIIVARMSEEYNLTVTDLVKTLKQNLFVFYEV*


CDS Sequence:
>Vu_37201.1
ATGAATGACAACTTTGGGTGCACCAGCAATGACGGTGTACTCTTTGAAGAGATGATGTGGTTGAATAGTGCTGGGCAGGGATGTGATAGCTCCAATAACGAGGTAGCATGTATGGAGGTAAAAGAGGAACATTCAAAGTGTTGTTGGCGTAAAAGGGGTGTCGAGAAGCATCAAGAGTTGGAGGCAAAGGGAAGGGAGAAGAAAGGAACAAAAAGGGCAAGAACTTCTTCTGAGATAGAATATCACATCATCTCTGAGAGAAAAAGGAGACAGGATATAGCAGAGAAATTCATAGCACTCTCAGCTACCATACCTGGCTTGAAGAAGATAGACAAGGTATCAATCCTTGGGGAAGCCATAAAGTACATGCGACAACTTCAACAACGCATAGCAGTGTTGGAAAAAGCGAGCAACAATAACAGTGTAAAGCCGTTTATCATAGCCAAATCACACCTTTGTTCAGCATCATGTTCAGCAAATTCTGACATTGAAGTGCTCCCTGAAGTTGAAGCAAGTGGGTTAGAGAATGAAGTGCTGATTAGAATCTACTGTGAGAAACGAAAGGATATCTTGCTAAACCTAATGACCCTTCTAAAAGGTGTTCATCTCTCAGTAACCAGTAGCAGCGTATTGCCATTTGGAAACTCTCTTCTCAACATCATCATTGTTGCTCGGATGAGTGAGGAGTACAACTTGACGGTGACTGATTTGGTTAAGACGTTGAAGCAGAATCTTTTCGTGTTTTATGAGGTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_37201::LG11:33329980-33331980(+)
TGCAAATAAATTCTTTCCGTCAATTTCATCAAACGGCGTTAATGAATGTGTGACGTGGCCTTACACGTGTCAATACTGTCCTCAGGCCACGTCACACATTCATTAACGCGTTTGATGAAATTGACGGAAATGATTTATTTGCATCAAATTAACAAAAATAAGGACCCAATTGAGACGCCAAAAAATAAAGGAACCTATTTCAAATTCTGAACAAAAATAGGGACCTATTGAGACATTAAACCGGACATCTATTACTTTCTCATTCTTTAGGTATTTCTTCAGAGATACTATCACAACATTTTAGTATCATCTGCATATTATATGTGATTAGTTCAAAATTACTTCACAATCAATAATAATAATTATAAATATTGACATAGACTAATCATAAAATGACACGTAAATGATATTAAAATGTTATAAAAAAATGTTGTCAAAATATCATTATCTTTCTCTCATATGATAATCCACTTTCATAATATATATAATAAGTTATATTAAAAATTGAAATTAAAAAATGAAATCAACATAATTAAAATATTACTCTTTAAAATATTTAAATAAATATTTATTTTATTTAATATTTTTTAAATAATCACTTATATATAAATAAAAGAATGAAAGATTAAGGATGTTTCAACCGTGTACAATACCGATAAAAACGTAAAAGATGAAAAAAATTTAAACTTATGAATACTGTATCTTATTTTCAACATACAAAACTAACAAACAACACTCAAACGTTCCACAAGACAAAACACAATTGTGATACTTATGATTTTTACATATCAAAATATTAAAAAAATATATATTTAAACAATTGTATTGTAAGAAATATATTTAACATTCTATATCTACCATACAATATATCTGTAAAAAATTGATGTCCAACAAATTTTCGTAAATCATCTTTTCCACCTGAATCAACAATCGAAATTTTCTTTTTTAAGTGCTTGTTTCTCATGATTCCAAGACATAGCTAATCTTTGTAATTAGTTTGCTTAAAAATCTTAACAACAAAAACAACATATAACATATGTGATGACAATAAGGATTAGAATGAAAGATAATAACATATGAGACCTTTATTTTTATCTCACTTCTAAACTAATATAGGACAAATTAAATACATGTTTTTGGACATAGACACCAATAAGAGTATGAAAATTTTTCTCTTTGATATTTTATTTCTCAACCATGGCCAAACTTTTGACTTTGTTGTCCAAAAATTTTCTCATGATCTCTTTGTTCGTTTCTAAACACAGTAGAACTCGTATGGTCCTATATATTACAGTTTAACGGTTTAACTTAGTAATATCCACCCTTATACTTTCCGGTTTGTTTGTGAAAAGTAATTTTTAATCCTTAAGAAATATGAAAAGAATATCGATAGCGAATTGTGAATCAACTATACAAGACATCGATCGACGTCTTTTTTATTCAAAATTTTAAAATAATGAATTAATGAATCTTTCATTTTTATATACTGCTCTACTTTCTCGTTTGTGGAACTCGTACTTGTTTATTTATTTATTTTTTTTTTATCCATGAAAGTTAAAAAACTATACACGTACTCTTCTACTGTACGTACTCTTATACTGTGTACCACGTCTTACGTTATGTTATGTCCCAAGTCCCAACCTGCCAAACAGCTTTTTCCTCCGTCGACAACTCAGAGTCCTTTACCCTATTATTAGATGCTCCATCATCCAACGGTTCACATCCAGTATTATCTCTCACTGCACATTATCTTCACTTTAATACATCTTTATCATAACCATCCATTTAAAATAAATCCATAAAATATATGGTAGGTTTTCAAGCATTAATTCTAGAAGCACCAAGAAAAAACACAACCACATGCTCTCACGATGGAGGACTCGTGGCAAAACTGGCTCTCTCATTTGGTAATCACTCATCGTTTCATAAGATGTTGTTTGTTCAGACTTGGATCGATCGTTGTGTAGCCAATTAACCTGTTTATTTGTGTTGAAAGGGAA


Gene Sequence:
>Vu_37201(+)
ATGAATGACAACTTTGGGTGCACCAGCAATGACGGTGTACTCTTTGAAGAGATGATGTGGTTGAATAGTGCTGGGCAGGGATGTGATAGCTCCAATAACGAGGTAGCATGTATGGAGGTAAAAGAGGAACATTCAAAGTGTTGTTGGCGTAAAAGGGGTGTCGAGAAGCATCAAGAGTTGGAGGCAAAGGGAAGGGAGAAGAAAGGAACAAAAAGGGCAAGAACTTCTTCTGAGATAGAATATCACATCATCTCTGAGAGAAAAAGGAGACAGGATATAGCAGAGAAATTCATAGCACTCTCAGCTACCATACCTGGCTTGAAGAAGGTATCTATTTATATTTTTATTTTTTATCGATATATAGTCAGTATTATTTTGTTTCTTAGTGAGAGAAGTTGAACTTGTGATCTTTCTTAACTTTTCTTATAATCCTTGATAGCTTTCAAATATCAGTGAGAAAGTTCAACCTTCCTTCATTTTCCTTTCTAATTTTTATCACTGAATTAATCTCATACCTCCATGTATCTATCTATATATCTATGTTATTCAATCTTTATCCATGGTGTATACCTTCTCTTATAACATTAGTCATGGCACAAACTTTGATTTATGTTTTAATTTGTTAGTCTGAGATTGGAGTTATGAACTTCAGAGTGTCCAACACACTGACACAGTGTGTAAAGGGCATGAATTATACTAATTATCTAAACTATCACCTTTTGAGAACCATATTGAATCTTGCATGTGTTTTCTTTCTTAAAATATATATGTAAATATATTTTGTTACTGTATTTTAGCTAATTATATATTAAGAATTACTTTTCTAAATATATGTCTTAAGATTATTGTATTTGTTTCAAATCAGGAAATAAGATCAAATGAGGAAAATATTCTTAACATGATATCATAATCAGGTTATAGTTTATTTTAGCAAAATTTATGTGGATACATTGTTTCACTTATTATCGAACCACTAGTATCATTTCTTAATATTTAGTCTTATGCACGATATATATATATATATATATATATTAGATTAAGAGATTTGTTGAAAGTCTCACATCAATTAGTTATAAAACTAATTTATAGTATATAAGTGGATACAAACCTTACTCTTAAATTTGTTTTCTGAAATTAAGTTAGGTTTAAAATACTCATCAATCAGACCTAACACAAATTACCTCAATACTAGCTATTTTATATGTCTAAAGATTTTAATAGTTATTATAAGCTACTTTTTGAAAGCTGGTTTTTGACTCTCGGGGGTAAAAATATGCATTGTTAAAACATAGATAGACAAGGTATCAATCCTTGGGGAAGCCATAAAGTACATGCGACAACTTCAACAACGCATAGCAGTGTTGGAAAAAGCGAGCAACAATAACAGTGTAAAGCCGTTTATCATAGCCAAATCACACCTTTGTTCAGCATCATGTTCAGCAAATTCTGACATTGAAGTGCTCCCTGAAGTTGAAGCAAGTGGGTTAGAGAATGAAGTGCTGATTAGAATCTACTGTGAGAAACGAAAGGATATCTTGCTAAACCTAATGACCCTTCTAAAAGGTGTTCATCTCTCAGTAACCAGTAGCAGCGTATTGCCATTTGGAAACTCTCTTCTCAACATCATCATTGTTGCTCGGGTAAGCCATTTGATTTCTGTCGTAGGATCCACAATATCATAATTTGAAATTATAAATAATGACTGTGATGCAGATGAGTGAGGAGTACAACTTGACGGTGACTGATTTGGTTAAGACGTTGAAGCAGAATCTTTTCGTGTTTTATGAGGTGTAA