Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_37116 LG11 32659956 32665360 PREDICTED: proline-rich receptor-like protein kinase PERK15 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 32659988 3_prime_UTR_variant
G/A 32660001 3_prime_UTR_variant
A/G 32660049 3_prime_UTR_variant
C/A 32660204 3_prime_UTR_variant
C/A 32660237 3_prime_UTR_variant
A/G 32660262 3_prime_UTR_variant
G/C 32660285 3_prime_UTR_variant
T/A 32660482 3_prime_UTR_variant
C/A 32661013 missense_variant p.Gly552Val
C/A 32661015 missense_variant p.Leu551Phe
C/A 32661044 stop_gained p.Gly542*
G/A 32661084 synonymous_variant p.Ser528Ser
C/T 32661299 upstream_gene_variant
A/C 32661318 upstream_gene_variant
T/C 32661416 upstream_gene_variant
A/G 32661421 upstream_gene_variant
A/G 32661892 upstream_gene_variant
A/G 32661935 upstream_gene_variant
G/A 32662018 upstream_gene_variant
A/G 32662664 upstream_gene_variant
T/A 32662680 splice_region_variant&intron_variant
C/T 32662682 splice_donor_variant&intron_variant
T/C 32662782 synonymous_variant p.Ser376Ser
A/C 32662848 upstream_gene_variant
C/A 32662880 upstream_gene_variant
T/C 32662993 missense_variant p.His350Arg
G/A 32662994 missense_variant p.His350Tyr
A/C 32663125 upstream_gene_variant
G/A 32663505 synonymous_variant p.Asp284Asp
C/T 32663531 upstream_gene_variant
T/C 32663896 synonymous_variant p.Leu276Leu
A/T 32663899 synonymous_variant p.Thr275Thr
T/A 32664031 missense_variant p.Gln231His
T/A 32664093 stop_gained p.Lys211*
A/G 32664402 intron_variant
C/G 32664441 intron_variant
T/C 32664562 intron_variant
A/T 32664578 intron_variant
G/T 32664591 intron_variant
T/C 32664606 intron_variant
C/G 32664614 intron_variant
C/T 32664617 intron_variant
A/T 32664959 synonymous_variant p.Val83Val
T/C 32665222 5_prime_UTR_variant
C/T 32665232 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37116.1
MSSPSPAETPSGTNFTTSPPPPPPDETPLVPNATVSPPPPPDITSAAASPPPPLAAAPSSLSGGGLSPATLSGIIIGAVLGAVGMLIVGGVFFCVYRNWKKKRSQNNYSQPSQPKVDMAGVSPTPDGKVGLSKPTPGGLGNQKLSSSGLPTPTVNSSGTASSWGSEKVKPSPGISLALSQSSFTHDELVMATDGFSYSNLLGQGGFGYVHKGVLPNGKIVAVKQLKSESRQGEREFHAEVDVISRVHHRHLVSLVGYCISDNQKMLVYEYVPNNTLEFHLHGKDRPPMDWSTRMKIAIGSAKGLAYLHEDCNPKIIHRDIKASNILIDDSFEAKVADFGLAKFSSDTETHVSTRVMGTFGYMAPEYAASGKLTEKSDVFSFGVVLLELITGRKPVDKTHPFLDDSMVEWARPLLSQAFENGNFDGLLDPKLQKNYNHDEMIRMAACAASCVRHSARLRPRMSQVVRALEGNISLEDLNEGSAPGHSRVFGSFEGSSYDSVQYSEDMKNFRKLALESQEQGISEYSGPSSDYGRHPSVSTSSGQQNTQEIELGERER*


CDS Sequence:
>Vu_37116.1
ATGTCGTCTCCGTCGCCGGCGGAGACTCCTTCCGGCACGAACTTCACTACCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGATGAAACACCTCTCGTACCTAATGCCACTGTCTCCCCTCCTCCGCCTCCCGACATCACCAGTGCCGCCGCTAGTCCTCCTCCGCCGTTAGCCGCAGCTCCGTCGAGTCTCAGTGGCGGCGGGTTGTCGCCGGCTACATTGAGTGGAATAATTATAGGAGCCGTGTTAGGTGCAGTTGGTATGCTTATAGTTGGGGGCGTTTTCTTTTGCGTCTATAGGAATTGGAAAAAGAAGAGAAGCCAGAACAACTACTCTCAACCGTCCCAACCGAAAGTTGACATGGCTGGTGTTTCTCCAACGCCAGATGGAAAAGTAGGCTTGTCCAAGCCTACTCCAGGGGGTTTAGGGAATCAGAAACTGTCATCCTCTGGTCTCCCCACACCCACTGTCAATTCCTCAGGCACTGCAAGTAGTTGGGGTTCCGAGAAGGTGAAGCCTTCACCTGGCATTTCCTTGGCGCTATCTCAAAGCAGTTTTACACACGATGAATTAGTTATGGCAACGGATGGATTCTCCTACTCAAATCTTCTTGGTCAAGGTGGTTTTGGCTATGTCCACAAAGGAGTTCTCCCAAATGGGAAAATTGTTGCAGTCAAGCAGTTGAAATCTGAGAGTAGACAAGGGGAGCGTGAGTTCCATGCAGAAGTCGATGTCATTAGCCGTGTGCATCACAGACACCTTGTTTCCCTTGTTGGTTACTGCATATCAGACAACCAGAAGATGCTTGTCTACGAGTATGTGCCAAATAATACTCTAGAATTTCATTTGCATGGAAAAGACAGACCACCTATGGACTGGTCAACAAGGATGAAGATTGCTATAGGATCTGCAAAAGGATTGGCATATCTGCATGAAGACTGTAATCCCAAAATCATACACCGAGACATCAAGGCATCTAACATTCTTATTGATGATAGCTTTGAGGCTAAGGTTGCAGATTTTGGACTTGCAAAGTTTTCATCAGACACAGAAACACATGTTTCTACTCGAGTGATGGGAACTTTTGGATACATGGCTCCAGAATATGCTGCTAGTGGGAAACTAACAGAAAAGTCAGATGTTTTCTCCTTTGGTGTTGTGCTGTTGGAGTTGATTACTGGACGGAAACCCGTTGATAAAACTCATCCCTTCTTAGATGACAGCATGGTTGAATGGGCTAGGCCTTTACTCTCTCAAGCGTTTGAGAATGGAAACTTTGATGGACTTCTTGATCCAAAGTTGCAGAAAAATTACAATCATGATGAGATGATTCGAATGGCCGCTTGTGCTGCAAGTTGTGTGCGCCATTCAGCCAGGCTTCGGCCTCGAATGAGCCAGGTTGTTCGAGCTCTGGAAGGAAATATTTCTCTAGAAGATCTAAATGAGGGGAGTGCTCCTGGACACAGCAGAGTTTTTGGTTCCTTTGAGGGTTCTAGCTATGACAGCGTCCAATACAGTGAGGACATGAAGAACTTCAGGAAGCTGGCACTGGAAAGCCAAGAGCAAGGTATTAGTGAGTACAGTGGTCCCAGCAGTGATTACGGTCGACATCCATCTGTCTCTACCAGTTCGGGACAGCAAAATACGCAGGAAATTGAATTGGGGGAACGTGAACGGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_37116::LG11:32665360-32667360(-)
TTTCATATTTAATTATTCAATCAAAAAATAATTTCACGTGAGTCTTCATTTGAATATTTTATAAAATTACTAATCTACTAAAAAATACTTATTAAAAAAATTAGGTAAATTAGTGAGTCAATCCAACTCACTGCAAATTTAAAATTGACCGGTTGAAATTTTAATTTTTTTTAATCTATTCCAGTTTAAATTTGTAGTAGGCTAAGTGATTAAGGGATTTTTTACAACAGAAATAAACTTTAAAAAAAGAGGTAAATAATAAGAGAATTAGTGAAAAGGAAAAAGAAATTGTGATACATAATAAAAGAATGTATATAGAAACATGACTGACACAAATTTTCAAACGATTGACAACATATAAAAAAATGTTATACCTCCCAAAAAAAAACACAGTATAGAAAAAGTCATCTTAAAAAGATAAAACAAAAACAAAATTTATCTAAATATCAACATTTTATATTAAAATAAAATAAAATACAAGAACACTTATAATTAAAATGGTTATTGTATGCATGGATAGAGTTCTAATCATAAACATCTCTGTAGAGTTAACATTATTAAGAAAATCCACTGTTAATTTTTTTACTAAAATTTCCATTCAATTATTACTATAAAGGGTTTTAGATCTCTTATTTAATATTTATGAGATAATATAAGTATTTATTACATTACTTAGTTATAAATTCAAATATTCTATTAACATGGTTGATTCTGTAATGGTTTTTGCGTATTTTTTATTTATCACTTATTTAAAAAATTACCATGCATAGACATTATTATTTTTATATTAACATGATTTTAATGACTGCATTAATACAGAAAGTTTATAAATACACAAACCATTATTATTTATTTTTAAATAAATGTAATAACGTATTTTTATAACAAGCTTAATCAAGCAGTTCCCACCACATTGTAACCAAATAAATACAAAATAATAATAATAATAATAGTAATAATAATAATGGCAAGTTTTGGTATAACCTTTAATATAATTAGTTTAAAATTAATAAAATTATCATACATCATGTGTGATTGTATATCAATGTAGAATTGTTCACTTTTTTCTTTTTTTTTCGTGAAATATAAAATTATTTTTATACAGTGAAACAAAAATGACAATTTGCAGAATGTGGCAAGTGTACAAAGTTTTTTCTCTCAGAATCCTAAAATTGCATTATACACTTTCTGATAATGTTCATTATTTTGTTTGTAAAAAAAAATTGAACTTATATATTAGGTTTCTTGAAAAGGGAAAATTTTATAGGGGTTATAAATTATGATGTGGCGTATACGTTAGCTTGTATGCAGTTATGACGGAAATGCACCACGAACCTTCTTTTGCTTCAAAACATTGTATCTTGTTATTTTTAGATATTTTTATTTAAATTTAGTAAATCTCAACCTAAAAAATGAAATAAATAACAAATAATGTACTAAAATTATTTGTAAGTTTTAATTATAATACAGAATTAGAAAACCGTGTTCAAGCTTCATGACATAAAAAGAGTAACTACAATGAAATAGGTAGATCCGATGTAAATAATTAAAAAAAATATATTAATGAAATACTGAAATACATTACATTATACTAATTATAATAAATACTGAAATAATAAAATATAAATAATAAAAGTGTATATTATAGAGTCAAGGATCAAATTAACAAGTCTTTTGACCTCAGATGAAACGGTGGATTTATTGGTAGAACCAGAGAGTTGAATACTGCGTATTTATACGTATTTATTGTTAGAGCACGTGCGATGCGGATTCATTCCTCTCTTTTTCCGACCATTTACTTTTATATATTTATATATATTAGGTTCCCGCTAAAGACAGGGATTGACTGGTGTGGGAAGTTGGAGCAAAACGCAAGAGGAAGCAAGTGAAACGACGGTAGAATCAGAGTATCGGGTTGGTGGTTTATTTTGCACACGCTATGAAAAGTAGTGAGGGAGTGCGAAGTAGAAGAAGTAGCTATCATCATCACATTAGGGACC


Gene Sequence:
>Vu_37116(-)
ACATCACACAATACACACACTACACACACCACATTCCTCTTTATCCCTAAAAGAAAAAAATAAACCGTGATGATGCAAAGTTTTCAATCCTATACTTTTTGTTTTTAATCGAAACCCTTGCTCTCACCGTAGCGTCGGAAAACTTCGTCGTCGATGTCGTCTCCGTCGCCGGCGGAGACTCCTTCCGGCACGAACTTCACTACCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGATGAAACACCTCTCGTACCTAATGCCACTGTCTCCCCTCCTCCGCCTCCCGACATCACCAGTGCCGCCGCTAGTCCTCCTCCGCCGTTAGCCGCAGCTCCGTCGAGTCTCAGTGGCGGCGGGTTGTCGCCGGCTACATTGAGTGGAATAATTATAGGAGCCGTGTTAGGTGCAGTTGGTATGCTTATAGTTGGGGGCGTTTTCTTTTGCGTCTATAGGAATTGGAAAAAGAAGAGAAGCCAGAACAACTACTCTCAACCGTCCCAACCGAAAGGTAAGGTCGCATGTTTGTAAAATTGGATTACAAAATTGATTTCGTTTGAAAATGATTTTTAAATGAAATTATTTAAGTTTGACTGCTTTTATTGTAAAAATAGTTTATTAGTGAAAAGTTCGTCACGTTAGCCGTTATTTCAACTGATTTTTTAACGATGGATTATGAATATCAGGACATGAGATTAATTAACTTCGGTTTATTGCTTATTATTAATGCCGTGAGAATCTTAGTAAATGTGCCGGTGGTACTCGTACATTCTGTGATGTGCTTTCTTTTTAGGTATCAACTAAGTGTCGAGGTTTATTGTGTTTGGAAGTTCGTTTTAAATTCTGTTTGATGGTTTGCTGCACGCATTGGTTTTGTTTATTGCTTATCTCTGATTATAAAAAGGTATACGCAGTGTGGTTGAGTTTTGTTGTAATTTGTGTGTAAAACTGGCAAAAAATTGAACTGGAATTGATTTTGGTGTCAATGTCTCCAGTTGACATGGCTGGTGTTTCTCCAACGCCAGATGGAAAAGTAGGCTTGTCCAAGCCTACTCCAGGGGGTTTAGGGAATCAGAAACTGTCATCCTCTGGTCTCCCCACACCCACTGTCAATTCCTCAGGCACTGCAAGTAGTTGGGGTTCCGAGAAGGTGAAGCCTTCACCTGGCATTTCCTTGGCGCTATCTCAAAGCAGTTTTACACACGATGAATTAGTTATGGCAACGGATGGATTCTCCTACTCAAATCTTCTTGGTCAAGGTGGTTTTGGCTATGTCCACAAAGGAGTTCTCCCAAATGGGAAAATTGTTGCAGTCAAGCAGTTGAAATCTGAGAGTAGACAAGGGGAGCGTGAGTTCCATGCAGAAGTCGATGTCATTAGCCGTGTGCATCACAGACACCTTGTTTCCCTTGTTGGTTACTGCATATCAGACAACCAGAAGATGCTTGTCTACGAGTATGTGCCAAATAATACTCTAGAATTTCATTTGCATGGTAAGATCTGTCAGCTCATTTAGGATGCAAATTCAATTTAACTATTGTTTTCTGAGATATGATGTGCAGATTCTTTGTTGTAAATGTTTTAAAGTTTTGTAGAGCATAATATTTGCATGCAATACACAGTTAGTTGCTTCATACTTTCGTGTACAAAAGTATGGCTTTTATTTTAATTCACATATTGGTTTTACGTGTGAAATATATCATATTATCAACATTTTTTTAACAATGAAAAATTTGACCTGGTGTGGTTAGTAGTTAAGTAATGAGGATTCCACTGTCTCTCTGCGGAAGTTTGATAATTTAATTCTTATCGCACAAGTATGATGCTGTAGTTCTAAATGAGTCATGAATATCATACCAGGAAAAGACAGACCACCTATGGACTGGTCAACAAGGATGAAGATTGCTATAGGATCTGCAAAAGGATTGGCATATCTGCATGAAGACTGTGAGTTTAATGTTAATAAATTATGTACTCTGCAAAAGAACTGGCAATGTTTTTACTTCATGATGTTAGTTTTGAAATTGACATTTTTAATCTCATGTCATTTTAGGTAATCCCAAAATCATACACCGAGACATCAAGGCATCTAACATTCTTATTGATGATAGCTTTGAGGCTAAGGTAAATTTATAACTTTTTTATCCTGCAATCCTGGATATATAGGGCAATGCAACAGACAACACTACAGAAAATAAGTGAATTAAGTGGTGTATCTTGAAATGGTTAAATGAACCAAAAAGGCTATAGAAATGTTCATGTTGACATTTAATATCTGTGTACATCATCTGCGACTCTGCATATAGAATAATGATTCATAATCTTTCGCTCAGGTTGCAGATTTTGGACTTGCAAAGTTTTCATCAGACACAGAAACACATGTTTCTACTCGAGTGATGGGAACTTTTGGGTTAGATTCATCATGCGTATTTCTTGAATCTAATTTTGAAATACTTTTATTGGGCAGTATGTTTCATGGATTTTATTTTTCCGTTTTTCTATTAATTATATCTTACTGAAACTCTAAATTCATTTAATTCAGATACATGGCTCCAGAATATGCTGCTAGTGGGAAACTAACAGAAAAGTCAGATGTTTTCTCCTTTGGTGTTGTGCTGTTGGAGTTGATTACTGGACGGAAACCCGTTGATAAAACTCATCCCTTCTTAGATGACAGCATGGTTGAATGGGTATGTTGTATTCATTATTTCGTTGATGTTTCTATTTTGATCAATATGCATAACTAAGGACAACTCGGTATTTATGGTACTACGGAATGTGCACCTTTGGCATCTTTTCTTATTGGGTGGTGATGTTTTGACCCCCACCAAAAAAAAACCCACTTGACAACTCAAAATAATAATATTTTAATCATATTTATTTTATTTTTTAACTTTAAATTCTAACACATTATATTACTAAAATGGATTGGGTGTTTTTTTTGAGGTGTCAAACTATTATTTTCTTTCAGTATTTTTGGGTCAGTTAATGAATTTTCCCGAGCATGAAAACATTTATAGAAGAGTGCGTGTGATCAGTAACTCGCATTCTAATGTTGTATTTGCTTTTAAACTTTTTCTCAAATTACAATCTTGAACTTTTAACCTTTTTTTTTCAGTTAAATGAGTAGATATTGTTCAAAAACCATATTTCTTTCGGTGTTTTAAAAATTTGGAAAGCCATGTATCTTGTCCTATGGAGATCAGTTTTGGAGCTAAATTATGTGGTGTACTTGAAAAATCAATAAAATCTTATGACCTCTTATCTTGTAATTATGTCTGCTCGGATTGGTTTTAAATTGGTCATAATAACTTGTTTTAGATACCAACGGTATTGATCGGTCTGGGATGAAGCCGATTGTAGTTTGCAACCATGTCAAATTACTTGCAAGAAATTCTGGTTTTGCTTAAATTAACGATGAAATAATATCTGGGATATTCTGCAACAGTTAGCTGACAGTCTTATGTTGACAATCCTCCCTCAAAACATCTTGTACTGAAGCATTGTGTGTGTTTTTTTTTATCAGCAAAACATCCTGTACTGAAGCATTGTGTGTGTTTTTTTTTATCAGCAAAACATCCTGTACTGAAGCATTTTTGTGTAAATTACAGGCTAGGCCTTTACTCTCTCAAGCGTTTGAGAATGGAAACTTTGATGGACTTCTTGATCCAAAGTTGCAGAAAAATTACAATCATGATGAGATGATTCGAATGGCCGCTTGTGCTGCAAGTTGTGTGCGCCATTCAGCCAGGCTTCGGCCTCGAATGAGCCAGGTGAGTTGGTTGATTCTTAAGATATGTTTGAGAATAAAAAATGTCTTTTGTTTTTATAATCAAATTGCTTTGGTTATTGTCTCTGACAAGGGTATGTAGTAAAATGCCTCCCTGAAAGGCATTCGCCTGCTTCTCTTGGCAAAAAAAAGTCCAGTGTTGTGTTAAAACATATTAAAAATTAAAAAGTATTGTCAGGATATTTGATTTACTGGTTGATGATTTTTTGAAGTTTAGAAATTCGTGACCAACTCTGAGCTTTGGCAAACTGAGATCTGGCGTGTTCTTACCTCTGACAATGATGAAATTAATGACACTGAGCAGGTTGTTCGAGCTCTGGAAGGAAATATTTCTCTAGAAGATCTAAATGAGGGGAGTGCTCCTGGACACAGCAGAGTTTTTGGTTCCTTTGAGGGTTCTAGCTATGACAGCGTCCAATACAGTGAGGACATGAAGAACTTCAGGAAGCTGGCACTGGAAAGCCAAGAGCAAGGTATTAGTGAGTACAGTGGTCCCAGCAGTGATTACGGTCGACATCCATCTGTCTCTACCAGTTCGGGACAGCAAAATACGCAGGAAATTGAATTGGGGGAACGTGAACGGTAGCAACCATGACTCTGCGACAAGCTCTCGATTGATGATTCCCACGTCTTTCAAAATTGCTCTTCAGACATCAGTTTGCTTGTGCACACCCATGAGACTGGTACAGGTACATATAATGTCGGTATATTTTACAGGCCCATATATTAATTGGCTTGCACACGATGAATAGCAGTTAGAGCTGTCTTTCTTTTTTTTCCCGGTGATTTTCACGGTCTAACTTTTTTCCCTCGTACAATTCCTGAATTATTTGATACACCTGAAGCTTTGTAAAGCTTGATTCATTTGTTCGATGCTAACATTTGTTCTAACTGGGAAAGCCTGACATTGGGACTTATGTTGAGGATGTGGGTATTTTGTACTTATTTGGTGAGCTTTGTGATAATGCATTCTATGATTCTTCGCCTGGTGCTTAAAGCTTGTAGCTACTCAGTTTTATTGTTTGCACTGGGAGGGTCACAAGGAACACTGGTCTTTTTACCACCAAAGAGAACCCTGTGTAGCAATCTTGGTGCAACCAAAGTACTTTTATGTTTTCTGGTCTCTTGATTTTGTGGTGCGCTCAACCTCAAACCAAGAGTAGTAACAATTTTACTCTTTCGCTTGCTTTCAAGAGAGTTAAATCCATGTTTTCATGGGTGTATGAAGACAAAATCATTTTGTTTGTATGAAGATGCTTTTGTGATGCGCTAAATTTAGTTGGACAAAAAGTTGACGCTTTTACTAAAACTTGATCTGCTTGGTTACAGGATAAAAAAACATTTTGGCCTTTGGAAGGTGAAATAAAAGTAAATTGAGGAAATATGGCAAAGGGCAGTGTAGTTGTCGTTTACTAGATAAGTTTTTTTTTTCTTGTTCAATTTGCTGTAATAAAATAAAATTGAGAAGACATTTGAAAGTGCTAATTTGTTAAAAAGAAATGTACTTTCGTACGTTTCTTCTTGTCTTTCCTCTTGGGTGGACAATAAACCTGCAAATTATAGATGCACATAATGATTGTGCTGCTTTCTGGTTTAAACATACTATTTTCTGAGGTACGTTTTAAGC