Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_37109 LG11 32633545 32638529 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein GLABRA 2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 32633692 intron_variant
G/T 32634947 intron_variant
T/A 32635821 upstream_gene_variant
A/G 32635822 upstream_gene_variant
T/C 32636972 upstream_gene_variant
T/A 32637535 missense_variant p.Leu526His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37109.1
MGVNMSNTPPHTKDLSEEDFDGEGAHEEDDDENNDDGDRSKKRKRKYHRHTVEQIREMEALFKESPHPDEKQRQQLSQQLGLAPRQVKFWFQNRRTQIKAIQERHENSLLKTELDKLKEENKAMREIISKSCCPNCGMVTAAIDASMSIEEKQLLIENVKLKAEVEKLRATLGKCSPTSPASSAGHDEEENRSSLDFYNGVFGLEKSRIMEIVNRATEELIKMANMGEPLWVRSVETSREILNYDEYVKEFAVKNSSSDKPKTFIEASRDSEVVFMDLPHLLQTFLDVNQWKEMFPCLISKAATVDVICNGEGSNRNGAVQLMFAELQMLTPMVPTREVYFVRCCKQLSDEQWAIIDVSIDKVEHNIDASLEKCRKRPSGCIIEDKSNGHCKHLECQKSTIHTLYRTIVNSGLAFGARHWITTLQLQCERLVFNMATNVPTKDSTGVATLAGRKSILKLAQRMTWSFCHAIGASSFHTWTKFTSKTGEDIRISSRKNLNDPGEPLGVILSAVSSAWLPVSPNALFDFLRDEARRSEWDMMSCGGSVQSIANLAKGKGRGNAVNIHKIESTENSVWVLQDSCTSGYESMVAYALVDFAGLQSVLTGCDSSNLTILPSGFSILPDGVEGRPLVIRSKQDEKGTEGGSLFTMLFQMLVNASPTAKLTMESVESATNLVSCTLRNIRTSLQCEDG*


CDS Sequence:
>Vu_37109.1
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Promoter Sequence:
>Vu_37109::LG11:32631545-32633545(+)
TTAGTGTCCAGTGTCCACTTTTCTGACTTTCATTCTGATCTAGTACAATTCCAACACACAGGTTTATCTTATTTAATATTTTTTTAATGCATGCAAAAAATATTAAATATATATTTATACCCTAATTTTTTTACTGAAAATATTTATTACTTTATCAGGTCTTACATACAATACACTTGTAATTAATTCATGTGTATTGAAAAAAGGTTAAATATGTTTTTAGTCCTTAAATTATTGGTCGTTTCTGCTTTTCGTCCCTCATTCAAAGTAAGATACAATTTGGTCTTCATTTTTTTCGAAACATTCGTTTTAATCCTCGAAAACTAAACACTGTTTAAAAATTTGGTCCTCATTTAGCAATAAATGAGGACTAAAACCAAAATTCCGAGGACTAAAATTAACGTTTCGAAAAGAATGAGGACCAAATTGTACCTTACTTTGAAAGAGGGACGAAAACCAAAAACGACCAATAATTTAGGGACTAAAAACATATTTAACCCTTAAAAAAAAAATCAGTTAATTTAAAGTAGCATTAAATTTATTTCTAACTGCAGCAGTACTTTCTTTAAGGTTATCTTTAAATAATTAATATGTGAAACGAGAACAGTAGACTTTTACCTTTTAAAACAAAACATTTTAATTCTCTGATCTTTGTGACTGATGAAAAAGAAAAAAATAATTACATCTATAGACTAAAATGATTAAATATTTTAATAAAATAATTAATGTAATAATTTATTAGAAGAAATTACTTACGAAAATGACAGAGAAAATTAAATAACGTGTCTGTTTATATAATAACAGAGTCAATGCTTTTTTTACCATGCATAAAATAATAACTTATATTTTTAAAGTAATAACTTTTATTACACAACTTATACTTTTATTTTCCTATAAATTAAATGTCTATATATATGTTAAAAATATGGAAAAGAACTTTTCCTTCATAAAACTATAATTTATTGTTCGAAATATGAATTTTAAATTATGTTGGAAAAAGTAACAGTATATATATTATCAAACCATAAATTTATGTTAAAATTAATTAAAAAAATAAAAATATTTATAATATCATCACACTATATTAAACTAAAAATTGATATGTAGCATAATTATTTGAGTGTTTTAATCTCTAAAGAATAAATATTTAACACACTTATTAATTAGTATTTAATTACAACACAAGGAAATTATATTAACACTGTTTTGGTACACTATTATTCATTCAAAGTATATGATTTTTTTTATAACAACTAATTTAAAACACATATGCAAATCATTTCCGATTAATTGTCATTAAATATTTATATATTAATGCCTATTAAACTCTTTATCTAAATTCATCGAGATCGATTAATAAAATATTAAATTTATCAGTAATAATGAAAAATTAATTTTTATTAAATATACTAACAAATTAAATAATTTAAACAGTATCTATATTTTACATCACTAAAATTTCAAAGAATAACGCAACACAATAAATTGACCTTCATTGAATTTTATTAAAAATAATACAAAAATTAAATAACTTAAATTCTAGATATAATGACTTTATTAAAATTTCAAGAAATAATTTCCACACAATAAAATAGACTTATTGATTTACCATTTCTACATCTAGCCATTAAATAATTAAATACTTACGCATTAAGTTTTATTAGGAAATACTGATAAAATTAATTACACATACTATATTAATGACAACACTATAAATTCTAGAAACAATTCTATACAATAAACTCTTATTTCATTAAATACTATTTTGTGTAATAAATATCTCTCTATTTTCACACAATTTGTTCTGACAGTCTGTTTTTATATTTATTTGAAAAGAATAATAAGAGCGTGCAACATGAGAAAGAGTCCTTAAAACCAAACATCATTTTCACCCATTCACAGAGAAAAAAAAAAAAAACAGCATTCGCCATTTTCGCTCCTTAAAAAAACATCATCAAGAACACCGAAAGCACAGAAAGCACAGTAAACGTGTTTGCCAA


Gene Sequence:
>Vu_37109(+)
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