Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_37076 LG11 32336826 32342794 PREDICTED: lysM domain receptor-like kinase 3 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 32337148 missense_variant p.Arg108Lys
T/G 32337156 missense_variant p.Cys111Gly
G/A 32337159 missense_variant p.Gly112Ser
G/C 32337401 intron_variant
T/G 32337405 intron_variant
T/A 32337410 intron_variant
C/A 32337434 intron_variant
T/G 32337449 intron_variant
A/T 32337457 intron_variant
A/T 32337587 intron_variant
G/T 32337644 intron_variant
C/T 32337877 intron_variant
G/T 32338075 intron_variant
G/A 32338490 intron_variant
C/A 32338861 upstream_gene_variant
T/A 32339302 upstream_gene_variant
T/A 32339408 upstream_gene_variant
A/C 32339417 upstream_gene_variant
C/A 32339722 missense_variant p.Pro395Thr
C/A 32339732 stop_gained&splice_region_variant p.Ser398*
G/T 32339787 upstream_gene_variant
T/A 32340227 upstream_gene_variant
T/A 32340321 upstream_gene_variant
G/C 32340412 upstream_gene_variant
T/C 32340447 upstream_gene_variant
G/A 32340545 upstream_gene_variant
T/A 32340549 upstream_gene_variant
T/A 32340570 upstream_gene_variant
T/G 32340601 upstream_gene_variant
G/C 32340602 upstream_gene_variant
T/C 32340743 upstream_gene_variant
T/A 32340804 upstream_gene_variant
G/A 32341116 upstream_gene_variant
A/C 32341287 splice_region_variant&synonymous_variant p.Pro515Pro
C/A 32341342 upstream_gene_variant
T/G 32341349 upstream_gene_variant
A/T 32341557 upstream_gene_variant
T/G 32341586 upstream_gene_variant
A/G 32341628 upstream_gene_variant
G/A 32341898 upstream_gene_variant
A/G 32341955 upstream_gene_variant
T/A 32341958 upstream_gene_variant
C/A 32342048 upstream_gene_variant
A/G 32342260 upstream_gene_variant
A/C 32342508 upstream_gene_variant
A/T 32342517 upstream_gene_variant
A/G 32342638 synonymous_variant p.Thr603Thr
C/A 32342770 missense_variant p.Phe647Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37076.1
MNCTDTGRVCTSFIAFKPEPNQTLALIQSMFDVLPGDITVEGNAWGYVFIRKNCSCAAGIKKYLSNTTFTVKSNEGLVYDVVMSAYDGLAVLPNTTRRARNGAVVSLRLFCGCSSGLWNYLVSYVMRDGDSIESLASRFGVSMDSIESVNGISNLDNVTVGSLYYIPLDSVSVEDVLDLGVMSLCASAYCSFLKVWIGCLRVNVEEYHIFYAANVNLSEILSLIPGDPYPLNNTAPPVPVPAPSFDNFSADQVDHKAHVPYVWIIGGLGVGLILIVLTVILCVCMRSSNCFADDARTNEKDAEGKISHKFHILRNPSFFCGSGRYICGKHVEQKQTDAESSNHTITIPKASTLGPDVFEMDKPVVFTYEEIFSTSDGFSDSNLLGHGTYGSVYYSLLRDQVELIGYAASHEELFLVYEYAQKGSLRSHLHDPQSKGHSPLSWIMRVQIALDAARGLEYIHEHTKAHYVHRDIKTSNILLDASFRAKISDFGLAKLVGKANEGEISTTKVVGTYGYLAPEYLSEGLATTKSDVYAFGVVLFEIISGKEAIIRSEGTTTKNPERRSLASIMLGVLRNSPDSMSMSSLRDYIDPNMMDLYPHDCVFKLATLAKQCVDEDPILRPDMRQVVISLSQILLSSVEWEATLAGNSQVFSGLVQGR*


CDS Sequence:
>Vu_37076.1
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Promoter Sequence:
>Vu_37076::LG11:32334826-32336826(+)
TTTTTTAAAAAGTAGATATATTAATGAAGAATAAAAAATATATTTATTTTTTAAAAATAATAAAAGAGAAACTATGTAAAAAAAAACACTCAAATTCAATTCTTTTTATATATTCTGAAATATGATATTAATCGCCAAATTGTTCAATTAAAAAAATCTTAAGATTTAAATAATTACAAAAATGGAAATTTTTATATTATTTCTTTAAAATTTGTTTACATTTTTATCAAAAAGGAAATAATTAAAAATTAAGATTTAATTCATTAATTCTATCAATATCAGTGACAGTATATATAAATTTGAATTGAAGTAAATTATTTTAATTCTATATTAATCAATAGTTACTATCTATAATCACTAAGTTGAATCGAAGGGGGTGATTATGGTGGTGGGGTATACTTACTGATGCAGAGCCCACCACTGTTTCATCTTCCACTAAATGCTGCCATGCTTTTTCTGGCATTCCCTCGTTAATGGAGACACCCACACTTTTTCTTCACTTCAATTGCACTTCAACACAATATAACTCCTGCATCATCTTTATTATAAATATTCCTCAATTTCAAATTATTTTTCTTTTTTCTAAAAAATATTAATATTATAAATTAATCTTCAAACTCAATTTCTAAAACAATTTAAATGTATAAATTTATGGTCAGAATCATACGATGTCCATGCTGCCTCTGTTTGTGTCGGTTTTGGCGAGTCAAACAAGACAAGGTCAACGAGGAGTTGAGTCTCCGATGATTTGAGAATTCCTCCTCGGCGAGGTTTTGTTTTGATCACATCGGACAACCCTTTTGGGTGGCCCCACTTCTCAAACTGTCCTTTTCCTTTTGCCTATTGCCAGCTATTTCCTCTATTGTGCCTTCACCTTTCCGTAACCATACTTTTTGTTTCCCATATTACCCTCAAGCATTAAAATATCATACCCTTTACCAAACAAGACTTTTGTCTACGGGCCATCACTTCCAATTTTGTACAAATGTTTAGTTAACACTTTCTTAAAAAAATAATATAAATATATTTCAAATTAAATTCATAATATAGATATTGGGAGGTTTATTGTTTTTTTACAATAACTATTATTTTAAAAACTAATTTTTAATTGATTGATATTGTTATTTTAAATGATTAAAAACTAAATTAATGTGGGCTTACCTAATTAAGTAAGAGAGATTTTGAAGTAATTGATGAGTGTGATTGAAAAAAAGACATATTAGTGAAAATATAAATGTACTTGCTTTCAATTGGGGAAATCCATATAAGGGAGGGGTGAAAATGTCAAAAGAGAAATGTGTGTTGAAGACAATGGAGTCTGCCAGGTGAGGTGGGTGGGTCTGAAAGTTCTCTCTTTGCAGGTCGCTTTCTCTTTTACAGTGTTCAGTAAGAGATTTACCAGTTACCACAACCAAGCAATGCAGCATTAGCCATTCCGATTCCAATCACATACGAACACATTGCAATTACAAAAATGCTCTCTTTAGACTCTCTTCATTCACTTTTTCTTCTTCCCTTCAGCTTCAAACCCCCCTAACTACTACCATTTCCACCTTTTTCTTTCCCGCACTTAACCCATCTTCCATTCACTGATCTCTCTTAACTACTATTCCTCAACACGGATATTTTTCCTATTTATATTTTGTCATCTTTCATCAAATTGTTAGAAAGGACCAAAAACAAGTTCTTCTGTCATCTAAGCTGGAGCATCAAAATCCCATCACTTTGCTTTCTTGTTTCTGCACAGTCTGGATTTTCCTTTCCTTTTTCCCAACTGAATTTGTACTTGGTTGTACTATTCTCCTTTAAACTCAGATCAAGTTGCTTTCTTTCTCTGGATCAAGCTCGCTATTTGCTTCATTTTCATTGACCCTTTTGCTCTAAATACCCGTCACTTAAATATTACCAGTCAATGATGATTCTCGTGAGAAAACCCCATTTGGGGTTGCTTCTCTTTCTTATCCACCTTCACTTCAGCTCCTGTTACTCCACAGAACCTA


Gene Sequence:
>Vu_37076(+)
ATGAACTGTACGGACACAGGTCGCGTTTGCACTTCTTTCATTGCCTTCAAGCCTGAGCCAAACCAAACGCTTGCTCTGATTCAGAGCATGTTTGATGTGTTGCCTGGTGACATCACAGTTGAAGGCAATGCGTGGGGTTACGTGTTCATAAGGAAGAATTGTTCTTGTGCTGCGGGTATCAAGAAATACTTGTCCAATACCACGTTCACTGTGAAATCCAATGAGGGATTAGTGTATGACGTGGTGATGAGTGCCTATGATGGCCTTGCTGTCCTTCCCAACACAACCAGGAGGGCCAGGAATGGTGCTGTTGTCTCTCTGAGGTTGTTTTGTGGCTGCTCCAGTGGACTCTGGAACTATTTGGTCAGTTATGTGATGAGAGACGGGGATAGTATTGAGTCCTTGGCAAGCAGGTTTGGGGTTAGCATGGATAGCATTGAGAGTGTGAATGGCATTAGTAATCTGGATAATGTCACAGTTGGTTCGCTTTATTACATACCACTTGATTCTGGTTAGTCTTTCCTTGCAATCTTCCTCAATCATTGTCTTGTAATCTTTTGGAACCAGTTTCTTCCGAAGTGTTTTAGAAAAAAACGAATCTGACTTTCCAATAAGCTAATGAGTAAGTTAAAATAAAATAAAAAACAATTAGAAAAACTATACGAAAGATGTTCTACAAATTAGCTCATGTATAAGCTAATTTTAGACAAGTTAATTTCATTTTTTTTCTTATTTTTCTTTTTGAAAGGAACTTACGAAAAATTTTGTCCAAATATACCTTATGTATTAATATTAAAGTGTGTGTTTATAGCTTGAGAGGGCCTTATTTTGGTTATCTTCAGTTTCGGTTGAGGATGTTTTAGACTTAGGTGTTATGTCGCTCTGTGCATCTGCTTACTGTTCATTTCTGAAAGTCTGGATAGGATGTCTGAGGTGGGGCTGTTGAGGGTTTTGTAGTTGGGATTTGGGAAAAAAGTGGTTGGATATGACAGCGATTTTGAGAATTGTAATGTTAAGGTCTTCTTAAGTCACTTAAATAGAAAAATATACTCTATCAAAATAAAATAGAATTTCAGGATAGGTTATAATTTACAAAGCAGCTGGCAAATGAAAGATGATATGTACATTCAATGAGCTGATTATGAATTGATAGTGATTTCATTGACGTAGTTGGGAATTGGTAAAATTCTTGGTTTGGTATGACTGGTGGCTGGTGGCATTTAATGTGTTAAGAAAATCGTGCGTGTGCGGGAAATACCTACTACTATCAATTGCTTAAATGTTGGAAGAATTGTTTATTTTTCATGCATTGGTTACTTTGACTGTTTGAGGAAATAGATTGGAGGGGTTACGGAGTACATTTAAACAGATTTTTCTTTGCATCTTCTCTTTTACCTGAACACAGTTGCATTCTGTTTCCAAACGAGATTGATTTAATATTAAATCAAGTTGTAAAGTGTTTGTTATCTTGGTAGCAGATTGTTGATAAAGAGTGTTTATGGTAGTTTCTTCATGCAGAGTGAATGTTGAAGAATATCATATTTTCTATGCTGCTAATGTCAATCTGTCTGAGATCTTGAGCTTAAGTCAAGGAATGTTATCTCTGGATATATATTAGTTTCCTTTGGTTTAGGATAAATATGGTCGGTTTCTTTGAGGTGGTGGAAGTTGCATTTCTGTAATACAGTTTAGTTGGGAGAATAATATGCACGGGATGACCTTTTTTATTGAATGGCCTAGCTGAAATTGATGATTCAAATATTTGCCTATATTCACTGCTTCAATGTTTTACGTGCAATGGATTTGTGTATATTCCTTTACCAATTGTATTAGTGAAGTGCTATAGTATTAGGCAGTATTGAATACTTACCATTTCAATGGTTGCAGTTCCTGGTGATCCTTATCCCCTGAATAATACTGCTCCACCAGTTCCTGTTCCTGCTCCATCCTTTGATAATTTTTCAGGTATTAATCAACATATGTTGTAGAAAGGAAAATATCTTTCTCTTGAGCTTGTAGTTTGTCCGTCATGTCCCCTACCAAATACTACGCACTTAATTTATTTAATTAATTTAATTTTTTGGTTACAGCTGATCAAGTTGACCACAAGGCTCATGTACCCTACGTATGGATCATTGGGGGCTTAGGAGTTGGTCTAATTCTAATTGTATTAACTGTGATTCTCTGTGTTTGTATGAGATCATCAAATTGTTTTGCTGATGATGCCAGAACTAATGAGAAAGATGCCGAGGGCAAAATTTCTCATAAATTCCATATTCTAAGGAACCCAAGTTTTTTTTGTGGTTCTGGAAGGTACATATGTGGCAAGCATGTTGAACAGAAGCAAACAGATGCTGAATCCAGCAATCACACGATTACCATTCCAAAAGCCTCAAGTAACTACCTACGTACTGATTTCTCAAGTGTTTATTGTTCCTATTGATATCTGAAAACTTTGCTTATATAACCTGCATTCTTTTTCATTCTGGCTGGCAAGTTGATTTTAAATTGCATTGTGGTTTTCTGACATTATGATGAAAAGTAAGAAGCATTATTAACAACTTGTGTGAGTTAACTCTCCCTTGGTTTTAAATTTTGAATATTATTCATTTATATGTTCTTGGATGGCATGAATACATGCAATTCTTTCAACTTATATGTATACCTGTTGGGTTCTATCATACATCTGTGTACTGCCAATATTAATGATTTGTCCGTTCAAATTGGAATGAATGGATAATGATATGCTCATTACTATTGCAGCTCTTGGGCCTGATGTATTTGAAATGGATAAGCCTGTTGTCTTTACATATGAAGAGATTTTCTCCACATCTGATGGTTTCTCTGACTCAAATCTACTTGGACATGGAACATACGGTTCTGTTTATTATAGCCTCCTTCGTGATCAGGTTTGGGGTCATATACTTCAGGAGTTGAAGTTTATGATATACAGTGGGTTTTGTTTTTTCTCAGACCAATTTTACTTGAATCCTTGCAGGAAGTTGCTATTAAAAGAATGACTGCTACTAAAACAAAAGAATTTTTGTCAGAGATGAAAGTTTTGTGCAAGGTTCATCATGCTAATCTGGTAATTTCCTTTCTAACTATCCAATCAAAATACATTATATGATTTGACTTTGGATTCAATTGCATAGCACATTTCAAAAGCCTGAGTTGTACTTTTGATTGTATTGTCAAGGTAGAATTGATTGGTTATGCAGCTAGTCACGAGGAGCTTTTCTTAGTTTATGAATATGCTCAGAAGGGTTCACTTAGAAGCCATTTGCATGATCCTCAAAGTAAGGGTAAGATTATGCATCTATGCTCTGGTCTGTAGAATATTAATCACCACTGTCTGTATGGACTCGTGCTTTTACATTTAGATTTTAAGTTTCTGAAAATTTAATGGAATGCTTTCCTCAGTACTATTGGAAATTAACTGCTTGCAGCATTTTGCCTGGTTATTGTGATGAGACGTGCAATAATAAAGTAACATGAGATTTTCTTTTTCCTAATTGGTTTAAGGGGTTTAATCTCATTCCAGCATTAACTTTGAAACCTAAATAGTTTTTTAGACTGGATTTGTGTTATTTTCATCTTTTCCATTGTGTACCTAACTGTTATTTGATATTTTGTTGTAACAATTCAGAAAGTTGATAGCGAAAGAATGGCATTTGTGCTTAACCACCACCTTATGACCAATTTTAAACTCAAGGAACGCCATTCTTTTTTCAATCTGATGCCTTTATCCGACTTTTCCACTATATAGAGATTGTGTTCAGGGTTTGTCCAACCCAGTCAGCGGACTACCATTTTTAACTATTAGCAATTGATTATTTTCAATATCTTTTGTTTGGAGACGTTGCAGCCTTTTAAGCAGATTCAGATACTAAGTTGATACTTCAAGTGGCAGCTAGTTGCTGTTTCTCTATGATGCAATTTTGTGTGTGTTGAAATACATGAATGAAAACAGTAGAGTGAGTTCTTACAAAATTCTTATGTTATTCAAAGAAGGGGCTTGAATTGGTGTCAAGACTGCCAAATTTCCATGTATTATTGTATGAACAAGTTTAAGCTATGCTTTTATGGTTTATTTTCATTTTTTATGCTGCTTACAGGTCATTCCCCACTTTCTTGGATCATGAGGGTGCAAATTGCGCTTGATGCTGCCAGGGGCCTTGAATACATACACGAGCACACAAAAGCTCATTATGTACACCGTGATATCAAGACCAGTAACATATTACTTGATGCTTCTTTTAGAGCAAAGGTAATAAAAATGTATACACTGCTACACTATTTTAATTTCAAAATGTTTCACATTTCTTGGTTGTCGTTTGTCTTAGATCTCTTTTGTCTTCTCTAGATTTCAGATTTTGGGTTAGCAAAACTTGTTGGGAAAGCAAATGAGGGAGAAATTTCAACTACCAAAGTTGTTGGTACATATGGATATCTTGCCCCAGAGTAAGTAATATCACTACAAACTTTTTTTTTCACTCATTCTTCCTGCATAAAACAATATTTTTTTATTTCTTATATTTTGCAGATATTTGAGTGAGGGTCTTGCGACAACTAAAAGTGATGTCTATGCATTTGGTGTTGTCCTTTTTGAGATTATATCAGGAAAGGAGGCCATCATTCGATCTGAAGGCACAACAACAAAAAATCCTGAAAGGCGTTCATTGGCATCTATAGTAAGTTCTACTGAAAGTAGTTCTGCCTGGCTTTACCATAGATTTTTAAGGTGTAATGTAAGTAACTTTAGCAGTAATGATATCATCTTATCTCCAATAATATTTAATATTCAGAATGTCAGTAGGACTTGATATAACTAGATTGTATTCCCCAGCACCTTGCCCCAAAAATAAATAAAAAAGTCCTGAGCAATATATGCAATATAATATTTGAAATTTATAAATTATAAGAAAAGTGATTCATGTTATTAACTAATCTGCAATTACTTACTATGTCAACCTACTGAGATGGTTGAGTTGTTCTCT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