Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_37012 LG11 31636398 31637932 PREDICTED: LOB domain-containing protein 22
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 31636583 synonymous_variant p.Asp62Asp
T/C 31637177 synonymous_variant p.Asp260Asp
G/T 31637261 downstream_gene_variant
T/A 31637312 downstream_gene_variant
A/G 31637351 downstream_gene_variant
G/A 31637493 downstream_gene_variant
G/T 31637570 downstream_gene_variant
T/C 31637602 downstream_gene_variant
T/C 31637616 downstream_gene_variant
G/T 31637641 downstream_gene_variant
T/C 31637657 downstream_gene_variant
C/T 31637666 downstream_gene_variant
A/G 31637857 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37012.1
MNNNNNNTSTITTTNTNTNTKTNNRISSTRNGNSTTQACAACKYQRRKCAPDCILAPYFPHDRQRQFLNAHKLFGVSNITKIIKVVSPRDKDQAMRTIIYQSDMRASDPVGGCYRYIVDLQTQIEYCRAELDLVLQQLAMFRAQAQHQNQHQYQHQHGIYAPNSVNVTVNGDGEVLNADPMGLYGQPQYQCLQPHQQEQYVMMHENGSQNFNGATPLQEQMNTWAVQNTAVSLSSLSLQGQSSNVSDEYDHKAVIDIDSDERSELGFESEELVHRSDESVLFKIDDAVIKAEGDCMQQAQDHDLKGYSVFVVKSLQQSYMRS*


CDS Sequence:
>Vu_37012.1
ATGAACAACAATAACAACAACACCAGCACCATTACAACCACCAACACCAACACCAACACCAAAACCAACAACAGAATCTCCTCTACAAGAAATGGCAACAGCACCACTCAGGCTTGCGCTGCATGCAAGTACCAACGCAGAAAGTGTGCACCCGACTGCATTCTCGCACCGTATTTCCCTCACGATCGACAGCGCCAGTTCCTCAACGCTCACAAGTTGTTCGGAGTAAGCAACATCACCAAAATCATTAAGGTTGTCAGCCCTCGCGACAAGGACCAAGCCATGCGTACCATAATCTACCAATCCGACATGCGTGCCTCGGACCCTGTCGGAGGCTGCTACAGGTACATTGTCGACCTGCAGACTCAGATTGAGTACTGCCGAGCCGAGCTGGACCTCGTCCTTCAGCAACTCGCCATGTTTCGAGCTCAGGCTCAGCACCAGAATCAGCACCAGTATCAGCACCAGCACGGTATCTATGCTCCCAACAGCGTTAACGTCACCGTCAATGGAGATGGTGAGGTTTTGAACGCCGACCCGATGGGGCTGTACGGCCAGCCACAGTATCAGTGTCTGCAGCCGCACCAACAGGAGCAGTATGTTATGATGCATGAAAATGGAAGCCAGAACTTCAACGGCGCCACCCCTTTGCAGGAACAGATGAACACGTGGGCTGTGCAGAACACTGCTGTGTCGCTTTCTTCGTTGTCGTTGCAAGGACAGAGTAGTAATGTTAGCGATGAATACGATCACAAGGCCGTCATTGACATTGATTCTGATGAGAGAAGTGAGTTAGGGTTCGAGTCTGAAGAATTAGTCCATCGCAGTGATGAATCAGTGTTGTTTAAGATAGATGATGCAGTAATAAAAGCTGAGGGTGACTGCATGCAACAAGCTCAAGATCATGATTTGAAAGGATATTCCGTTTTTGTGGTTAAGAGTTTGCAGCAGTCTTATATGCGCAGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_37012::LG11:31634398-31636398(+)
TGGTTCAATATTTATTATTTTAACTTTTTGTGACCTTAACTTTTGATCTTATATTACAGATGTAGATGTGAGTGTTGTAATTCTCCATTCTCATTCGGATTATTTATGTTCAACCTTGGAGATTTAAGCCTGTGCATGAATTTATAATTTAATAGATATTCTGCAAGTTCCGTGTCAAGTTTTGGCCCATGGATGTCAAAGTTTGTATCCATGAAACAAGGTGATTCTGACAATTTGGAGCAATGAGGAATGTAATGTTAATGATATATGATACAAAATTGGTTGCCTCCTATTGGTGCCGTTTATCTATAATGTTGAATACATAATGTCATTCATTACACTGAGAATAATTGTCTGAAGAACATTGAAAAGTGAAATCTAAAATGCAGTTTTCGCAACTGTTTATACGTATCACAAGGGTGCTTTATGATATGTTTCTTAAATGATGCAAAGTTTTGAAATCCTTATTTGTGAATTGGTAGTTCTGATGCGCCAATACAAAAATTAGAGATAATTTCTAAGTAATTTGTGCATCAGCATGAGATCATTACCCATATTGCGTTCAAATACTGATAGAATCTATAATATATAAGTGGTTATATAACAGGAAAATAACTACTATTATTTTATTGATCTCCTGCTTGTTAATATTAAAACATATAATCTCCTACTGGTTAACATTGAAATATTTAAATACGTGCTTTTGTAATGTAAATTTTACATAAACTTTTAAGATCTTTTTTTTTAATATGTAATTCCAATTTTAATAACAATATTTTTGCATCAATTATTAAAAAAAATTATTTTAATATCTGTACCGAAGTAAAGTTGTTGACGCAAAAACCATTAAACAATTGAAGAATTGTTAACATTTTATTTATTTATTTAAATTTATCAAATTAACGTAACTTTTAAAAGAGAATAATTTTATTTAAACTATAATTTTTGGTTAATATATTTGATTTTAGATTTTTTTTTAATTATATTAATGTTTTAGGTTCAATTTTATTTCAATTATTTTACTAGTGGAAATATATACATGTGTGTCCATTTTTTGATAATAAAAATGTTATTAAATTTATAGATAGCATATTTCCAAAAAGTAATTACAAAAAAAAGCAGTTACAAAATTCAAAAAGTTAAATAATTAATAAAATAACTTTATATAATTTATTATTATTATTATATCAGCAACATATACAAATTTGATATTTAAAAACTTTATAGGATGCAAAAATGTATATTACCCAACATGATAGCCCATAAACGAAGATGAGAAAAACGAACATAATTAATAAATTTTATCGTTTAAGATTTTCGATTGAGAATAATCTATGAATTGGATTCATATTCACTGTTATTATATCTGAGTAATTTAAAGATTTTTATATCTAATTTTGATATTTTTTTCATTATTCTGGCAGAGAGATGACTGAAAATTGGAGAGTAAAAAAGCTAACTATACGATGACACGTTAGTCGTTAAATTTGTATAATTAGATTGACGGAGTTTGAGCCACTGATATATCAGAAATAATACTCGAAAATTGTCCGAATGAATCGCTCTCTGTTGTTGAAACGGCATAACGATATGAAGATGATGTAATAATTAATTAACTTAATACTTTTGACTTGGCTTTCAAATACACATCGTCTTCCCAAAAAAGGCAAAAACAGCATAAATAATATGATATGAAACTATTTTTAGGGCATAATCCAATAATAAGAGTTGCAGTAGTTCTGATAATGATAGAAAGAGAAGTTGGAAGAAAAGGGAAAAAATAGAAGGAAAGATCCAAAAATAACACTTGGCAAAAGGGAAACGGTTAGTGTATGAATTATATCTATCTGTCATTCCTTTCATTTCTCTCCATCTCCCATTGTTCTGATCAAACAAAGCCGAGAAAATAAGGGAAGAGAAATCCTTTTTCTGAGCACCTTCCCCGCCGGAGATGCAGCCGAAATCTCACACCCCTTTTTTTCTTCCTCCCCAAAAGGCCA


Gene Sequence:
>Vu_37012(+)
ATGAACAACAATAACAACAACACCAGCACCATTACAACCACCAACACCAACACCAACACCAAAACCAACAACAGAATCTCCTCTACAAGAAATGGCAACAGCACCACTCAGGCTTGCGCTGCATGCAAGTACCAACGCAGAAAGTGTGCACCCGACTGCATTCTCGCACCGTATTTCCCTCACGATCGACAGCGCCAGTTCCTCAACGCTCACAAGTTGTTCGGAGTAAGCAACATCACCAAAATCATTAAGGTTGTCAGCCCTCGCGACAAGGACCAAGCCATGCGTACCATAATCTACCAATCCGACATGCGTGCCTCGGACCCTGTCGGAGGCTGCTACAGGTACATTGTCGACCTGCAGACTCAGATTGAGTACTGCCGAGCCGAGCTGGACCTCGTCCTTCAGCAACTCGCCATGTTTCGAGCTCAGGCTCAGCACCAGAATCAGCACCAGTATCAGCACCAGCACGGTATCTATGCTCCCAACAGCGTTAACGTCACCGTCAATGGAGATGGTGAGGTTTTGAACGCCGACCCGATGGGGCTGTACGGCCAGCCACAGTATCAGTGTCTGCAGCCGCACCAACAGGAGCAGTATGTTATGATGCATGAAAATGGAAGCCAGAACTTCAACGGCGCCACCCCTTTGCAGGAACAGATGAACACGTGGGCTGTGCAGAACACTGCTGTGTCGCTTTCTTCGTTGTCGTTGCAAGGACAGAGTAGTAATGTTAGCGATGAATACGATCACAAGGCCGTCATTGACATTGATTCTGATGAGAGAAGTGAGTTAGGGTTCGAGTCTGAAGAATTAGTCCATCGCAGGTTTGTCTATCAGTAGTACATATCTGTGTTCACATTGTGATTTCAAAGGGCTATATCAGATTACAATTACGTTGGAATTTCATTTACTTAATGCTTGGATAATATCGTTTTCATTCACATATTTATATAACTAATGTCTGATTAAGTGTAACTGCATGATTTTTGTTTGAATGCATGCATCTGCTAACATTTAAGGAGCATTTCTGCAATGGGATTTTTCTTGTCTTGGGTTTGTCATGGTTCCTTTGTTCAAAGATTAAGATTGCTTGCAGTAATGTAAAATCATAGGTCCTGGAGATTTCTCAGATTTTGTATTGGAATTGTTTTAATAAGAGGTCTGCAATGGCATAAATTCGATGACAGAAGTGAATAACTGCTAAATACTTATGATTATAGTTGTTTAATTATGTCTGTGAGGGATGAAACATAACATGAATGTTGCTGATTTGAATGATTTTGCAGTGATGAATCAGTGTTGTTTAAGATAGATGATGCAGTAATAAAAGCTGAGGGTGACTGCATGCAACAAGCTCAAGATCATGATTTGAAAGGTGCAGCAACATCGTTTAGCCTCACAAATTGTACTTGCTGATGAGTGTTAATTAGCATAGATTGTAGAAGTTGCTGCCTCCACATATCATTTTGTTGGCATTAGGATATTCCGTTTTTGTGGTTAAGAGTTTGCAGCAGTCTTATATGCGCAGCTAG