Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_37001 LG11 31546172 31547416 PREDICTED: transcription factor MYB21
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 31546243 missense_variant p.Lys24Asn
A/T 31546327 intron_variant
T/G 31546862 synonymous_variant p.Ser142Ser
G/A 31547053 missense_variant p.Arg206His
G/T 31547072 missense_variant p.Lys212Asn
A/C 31547073 missense_variant p.Lys213Gln
T/G 31547141 missense_variant p.His235Gln
A/G 31547185 missense_variant p.Gln250Arg
G/A 31547192 synonymous_variant p.Ser252Ser
A/T 31547196 stop_gained p.Arg254*
C/T 31547412 missense_variant p.Leu326Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_37001.1
MGHHSCCNKQKVKRGLWSPEEDEKLINYITTYGHGCWSSVPKLAGLQRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGSFSPQEAALIIELHSILGNRWAQIAKHLPGRTDNEVKNFWNSSIKKKLLSHDAVIPPLATFSDFHHSPITSMETFFPFTANPNLILNFHHFTDQLYLPTTPSPFLQAFDHNNDVKLGFNTYNADFLHIQNPALPETALPSSNPNEENQISKSDTTSDYVLDRFINPAALQQHEYLLVEEPLVPIVGENIEDNYVCSIPFSSTPQEQHETTAKFQCYPQDLAVAVNQLEYIDAFMSLLPSSTVSSTQKVPNPIIPSGWEP*


CDS Sequence:
>Vu_37001.1
ATGGGGCACCACTCTTGCTGCAACAAGCAGAAGGTCAAAAGAGGGCTTTGGTCACCTGAAGAGGATGAGAAACTCATCAACTACATCACAACTTACGGACATGGCTGCTGGAGTTCTGTCCCAAAACTTGCAGGCCTGCAAAGGTGTGGAAAGAGTTGCAGATTAAGATGGATAAATTATCTGAGACCTGATTTGAAACGTGGAAGCTTCTCTCCTCAAGAAGCAGCTCTCATTATTGAACTCCATAGCATTTTAGGGAACAGGTGGGCTCAGATAGCCAAGCACCTACCTGGAAGAACAGATAATGAGGTGAAAAACTTTTGGAATTCAAGCATAAAGAAGAAACTCCTTTCTCATGATGCTGTCATTCCTCCTTTAGCCACATTTTCTGATTTTCATCACAGCCCCATCACTTCCATGGAAACTTTCTTCCCTTTTACTGCAAACCCTAATCTCATCTTAAACTTCCACCATTTCACAGACCAGCTCTACCTTCCCACCACACCATCCCCATTCCTACAAGCTTTTGATCACAACAATGATGTCAAGTTAGGTTTCAACACTTACAATGCCGATTTCCTTCATATTCAGAATCCAGCACTACCAGAAACAGCACTACCGTCTTCCAACCCAAATGAAGAAAATCAAATCTCCAAAAGTGACACCACCTCGGACTATGTTCTTGACAGATTCATCAACCCAGCAGCATTGCAGCAACATGAATATCTCTTGGTAGAAGAACCCCTTGTGCCAATAGTCGGTGAGAACATTGAGGATAATTATGTTTGCAGCATCCCATTCTCATCCACTCCCCAAGAACAACACGAGACTACAGCAAAATTTCAGTGTTATCCACAAGATCTAGCTGTGGCAGTGAACCAATTAGAGTACATTGATGCCTTCATGTCATTGTTGCCATCTTCAACAGTTTCAAGCACCCAAAAAGTCCCAAACCCTATTATTCCCTCAGGATGGGAGCCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_37001::LG11:31544172-31546172(+)
TCTCAAAAACATTTTCTCTTTCCCTTTGCAGCCAAAATTTATTCAACTCCTCAACAATTCATCATTTTCAATGCAATAATTAGAGACAAAGAATAAACAATCAGAAATTAAAAAAAGAAAAATATAATTTTGTGTGGTATTTAAGTTTATGATGGAGTTTCTTAGTTTATTGAATTGGTCTTTTAAATTATAATTTTTCTACTTAATCCTAATAATAATTAATATTTTTATTGGAACTTTGATTATGGAAAGAAAAAGTTAACGATCTTTAATTTGATAGAAAGTATTCAGTTGTCGGAGATGTTCTTGACCCCTTCCAATAATACAATCTCATTCTTTGTCGACTTCTTTTAGCTATTTCGAAATTAATATCTTCACAACCCACTAATACACAACTATTTGATAATTAATTATATTTTTCTTAATTTTTAATTTAAAGTGTTAATATGTATTATTATATTATTAAAATGAAATTGTTAAGATGTTTTCTTCGTAAAGGTATCATATTACAAATTTTCTATATATTAAAAGCAAAATTATTGACCTGGTATGTAATCAACAAAATACATCAAAATTTACCATATATCCACAAATGGTAAGTAATATAATAGTAAATAAAAAAACATTAAAGGTGAAGTTAGTAGAAGCATATAGTTATTTTGAAAATTAACTGTAAGTCAAAGTTTCAATTTGAATAGAATGAGAAAGTAAAACATTATATAAAAATTAAAGACCTATTAATTCATTGTTTTAAAGTTTTGAATAAAGAATAGTGTCAATCACTTGTATCGTCAATTCATTAAGATAATATTTTACTATTAATTATTTTTGTTGTAAGATTCATTTTAATTTAGAAATAACAGTATTTGAGTATTGTTTTCTGTAAAATGTTTGTTTTCCTACTTTTATATTTTTCTTTATAAGGGAAATAAAATATTTAGATAAATGTTTTATTTTTTTATTTATGGTAAAAATAATGACACTTTTAGAGAAAAATACTATGATAAGGGAGATAATTGTACTTTTTCTGTCCTTTTAAACATGATATTTCAGTGTCATCTAATTTTCTTACTAGTAGCTAGTAATATTTGTCTTTCCGTAATTGTTTCTTTAAACACTGTAAATAGATACATTTACGTTCAACTACTTTTACTGGTTGATTTAAGAATTAAAAGTTTGTAAAATATATTTTGATACACATAAATTTTTTATATTTGTTTGATAATATTTTTTATATTTTATTTTTTTAAATATAAAATTTACTTTTTTATAATCCATATCTAAAAAGTTTCTCACATTTGTCACGAAAAAACAAAAAAAATATACATATATATATATATAAAAGATTTGAAAGCTTTTAATACAATGTTATATTATTTTTCTCATAATTATTCTCTTTATCTTTTTTATTGGTGGCAAGTATTTATCAGAAGTATTAATAAATAAATTTGAGGAGTGTAGTATAACGTGACACGCTTAAAACAAAGTAAGAGTTGCTTTGTGAACAAAACATCGTGAGTATATATGTTTATGTATTATGTATCGATGTGGGACCTGGCAACACATAGGGTCCTACCAACTGCATGTGTTACACGTGTACACCCCATTAACACCATCAACACAGTGAGCAATGAAGCATCCTTTATAAGACCTACAAGTTCTGCAGGGTGACATAGCAGCTTTTAGCTATTCTGCAACCATCTTACACCTTCTTCACTAAAATCACCATCTCAGAATACAGCCACTTCTGCTTCTGTGCTTCTGCATATCTGTGCTTCTGCTTCTGCTTCTTCTGCATCATATTGTTAATTTTCTCTGCTAAATATGCTCACATGCACCATTACTCTTCTCATCATAATTAATTCATGAGTGCAATCACTTTGTAAGTTTTGCCTAAAAGCTACACTCTAGAGACCTTCCTTTCTCCTCAATCTCATCCTTTCTTCTCAAAAACAACACAAAAATCTCCTACTGTTCTCCTTCTTGAATGTATTAGATAA


Gene Sequence:
>Vu_37001(+)
ATGGGGCACCACTCTTGCTGCAACAAGCAGAAGGTCAAAAGAGGGCTTTGGTCACCTGAAGAGGATGAGAAACTCATCAACTACATCACAACTTACGGACATGGCTGCTGGAGTTCTGTCCCAAAACTTGCAGGTGTATATATATGATATAATTGACAAGTCTACCACTTGTGTTAGTATTTTTTCCAGCACTTGTGTCTTGAAATTTTGAGTTTGTTTTTGTTTATGTTTGATGATGTTTTTAGGCCTGCAAAGGTGTGGAAAGAGTTGCAGATTAAGATGGATAAATTATCTGAGACCTGATTTGAAACGTGGAAGCTTCTCTCCTCAAGAAGCAGCTCTCATTATTGAACTCCATAGCATTTTAGGGAACAGGTATATAACCATTGCTAATCACATGCTCCTTTTTTCTTTCTTTACTTTTCTTTTTTGTTCTATTCATGTGCTTATCATCAACATTATTGTCAAAAGGGTGCTTTATTTATCTACTTTTTTCTCAACAAGACTGCACTTTTCGGGTACAGGTGGGCTCAGATAGCCAAGCACCTACCTGGAAGAACAGATAATGAGGTGAAAAACTTTTGGAATTCAAGCATAAAGAAGAAACTCCTTTCTCATGATGCTGTCATTCCTCCTTTAGCCACATTTTCTGATTTTCATCACAGCCCCATCACTTCCATGGAAACTTTCTTCCCTTTTACTGCAAACCCTAATCTCATCTTAAACTTCCACCATTTCACAGACCAGCTCTACCTTCCCACCACACCATCCCCATTCCTACAAGCTTTTGATCACAACAATGATGTCAAGTTAGGTTTCAACACTTACAATGCCGATTTCCTTCATATTCAGAATCCAGCACTACCAGAAACAGCACTACCGTCTTCCAACCCAAATGAAGAAAATCAAATCTCCAAAAGTGACACCACCTCGGACTATGTTCTTGACAGATTCATCAACCCAGCAGCATTGCAGCAACATGAATATCTCTTGGTAGAAGAACCCCTTGTGCCAATAGTCGGTGAGAACATTGAGGATAATTATGTTTGCAGCATCCCATTCTCATCCACTCCCCAAGAACAACACGAGACTACAGCAAAATTTCAGTGTTATCCACAAGATCTAGCTGTGGCAGTGAACCAATTAGAGTACATTGATGCCTTCATGTCATTGTTGCCATCTTCAACAGTTTCAAGCACCCAAAAAGTCCCAAACCCTATTATTCCCTCAGGATGGGAGCCTTGA