Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36973 LG11 31269915 31273274 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 31269921 missense_variant p.Met736Ile
G/A 31269978 synonymous_variant p.Asn717Asn
A/G 31269993 synonymous_variant p.Val712Val
C/A 31270083 missense_variant p.Trp682Cys
C/T 31270107 synonymous_variant p.Val674Val
A/C 31270195 missense_variant p.Val645Gly
C/A 31270199 missense_variant p.Val644Leu
C/T 31270251 synonymous_variant p.Glu626Glu
T/A 31270653 upstream_gene_variant
G/T 31270654 upstream_gene_variant
G/C 31270674 upstream_gene_variant
A/T 31270683 upstream_gene_variant
G/A 31271211 upstream_gene_variant
T/G 31271212 upstream_gene_variant
A/C 31271576 upstream_gene_variant
T/G 31271579 upstream_gene_variant
T/C 31271693 upstream_gene_variant
T/C,* 31271762 missense_variant p.His314Arg
T/G 31272014 missense_variant p.Asn230Thr
A/G 31272069 intron_variant
A/T 31272078 intron_variant
A/T 31272091 intron_variant
C/A 31272208 missense_variant p.Val198Leu
A/T 31272214 stop_lost p.Ter196Lysext*?
T/G 31272220 missense_variant p.Ile194Leu
G/A 31272222 missense_variant p.Ser193Leu
A/T 31272223 missense_variant p.Ser193Thr
A/G 31272235 stop_lost p.Ter189Glnext*?
G/A 31272468 intron_variant
A/G 31272814 intron_variant
A/G 31272815 intron_variant
C/T 31272880 intron_variant
T/A 31273070 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36973.1
MFSKTPTPVVIGRDSTVIAVSGGRHSNGAVKWAVEHLLKKNSSCILLHVRTRTMLNPDNTNTNDAPKSGRPPTEEELHQFFLPFRGFCARKGISTKELVLHDLDVTSALIAFVDDNCISTLVVGAATSSWGSILRRFNKDDVSATLAKSLPDTCSLYVISKGKVQHIRPSGHHGHHHHHQHVEAPPAKSIKDIVNFLESDPLEQPHKDLNINQIAFEDIERKLIKDAVKHQSNNKLWEYLREETDSPKGPIEYPPSQNSSANNTPGNSDSTGQSLGPSLTNRLNENQKIVLNAHHSRTNSHHSIRNISHHSRTNSHHCGNNSYHCGNNSSLKDQVNFDMQMRKLKLELQKTAEMYGMACKEAVLATQKAMEIEKYRQEKECDMEEAKLAQSKMTMESTEMSKQLVKMGSQKRKEVELKAKNEEEETIKAFQEALYNNIPYRRYTIEDIDAATNKFDNALKIGEGGYGPVFKGLLDHTTVAIKAMKPDLAYAEKQFQQEVMVLSTIRHPNMVLLLGACPEFGCLVYEYMVNGSLEDRLLKRDNSPPIPWKTRFKIASEIATGLLFLHQTKPEPLVHRDLKPANILLDKNYVSKISDVGLARLVPPIVADQTTQYRLTGAAGTFCYIDPEYQQTGLLGVKSDVYSLGVVLLQIITGKSPMGLSHLVEKALLSNTLSEVLDPSVTNWPIEATSSYAKLALKCCELRKRDRPDLGTVVLPELNRISRLWDDENIYPLRNYHMA*


CDS Sequence:
>Vu_36973.1
ATGTTTTCCAAAACTCCAACACCTGTTGTAATCGGAAGAGACAGCACCGTGATCGCAGTAAGCGGAGGTCGACATAGCAATGGTGCTGTCAAATGGGCTGTGGAACACCTCCTAAAGAAGAACTCCTCATGCATCCTTCTTCATGTTCGAACTAGGACCATGCTTAACCCTGATAATACTAATACTAATGATGCACCCAAAAGTGGTCGTCCACCAACTGAAGAAGAGTTGCACCAGTTCTTTCTTCCCTTTAGAGGATTTTGTGCCAGAAAAGGGATATCAACAAAGGAATTGGTCTTGCACGACCTTGATGTTACAAGTGCACTCATTGCTTTCGTTGATGACAATTGTATCAGCACCCTAGTTGTTGGTGCTGCTACTTCTTCCTGGGGTTCTATTCTAAGGAGATTTAATAAAGACGATGTGTCAGCCACTTTAGCAAAATCCTTACCTGATACATGCAGTTTATATGTTATATCAAAAGGAAAAGTACAGCATATTCGACCTTCAGGTCATCATGGTCATCATCATCATCATCAACATGTTGAAGCCCCACCAGCTAAATCTATAAAAGATATAGTCAATTTCTTAGAAAGTGATCCATTGGAGCAGCCACACAAAGATCTCAACATTAACCAAATAGCTTTTGAAGATATAGAGAGGAAACTAATCAAAGATGCAGTAAAACACCAATCTAATAATAAACTTTGGGAATATTTACGTGAAGAAACAGATTCACCAAAAGGTCCAATTGAGTACCCTCCATCACAAAATTCATCTGCAAATAATACTCCTGGAAATAGTGACAGCACGGGGCAATCACTTGGTCCTTCTTTGACAAATAGGTTAAATGAAAACCAAAAAATTGTTCTAAACGCACACCATTCTAGGACCAATTCACACCATTCTATTAGGAACATTTCACACCATTCTAGGACCAATTCACACCATTGTGGGAACAATTCTTACCATTGTGGGAACAATTCTTCTTTGAAAGATCAAGTAAACTTTGATATGCAGATGAGGAAATTGAAATTAGAACTACAAAAAACTGCAGAGATGTATGGTATGGCTTGCAAAGAAGCTGTTCTAGCTACACAAAAGGCAATGGAGATTGAAAAGTATAGACAAGAGAAGGAATGCGATATGGAGGAAGCAAAGCTTGCTCAATCCAAAATGACTATGGAGTCAACAGAAATGTCAAAACAACTGGTAAAAATGGGGTCTCAGAAGAGAAAGGAAGTCGAATTAAAAGCCAAAAATGAGGAAGAAGAGACGATTAAAGCATTTCAAGAAGCTCTATATAACAATATTCCCTACAGAAGATATACAATTGAAGATATTGATGCTGCAACCAATAAATTCGATAATGCTTTAAAAATTGGTGAAGGTGGATATGGTCCTGTCTTTAAAGGACTTCTTGATCACACTACTGTTGCTATTAAGGCTATGAAACCGGATTTAGCCTATGCAGAAAAACAATTTCAACAGGAGGTCATGGTTTTAAGCACCATAAGACATCCAAACATGGTGCTTCTCTTAGGAGCATGTCCAGAATTTGGTTGTCTTGTGTACGAGTATATGGTAAATGGAAGCTTAGAAGATCGTCTGCTTAAAAGAGATAACAGTCCTCCAATCCCATGGAAAACGCGTTTCAAAATAGCATCTGAGATTGCCACTGGCCTTCTTTTTCTTCATCAGACAAAGCCAGAACCCCTGGTGCATCGTGACTTGAAACCAGCAAACATTCTTTTAGACAAAAACTATGTTAGCAAGATTAGTGATGTTGGTTTGGCACGACTAGTGCCTCCTATAGTGGCTGATCAAACCACACAATATCGTTTAACTGGTGCAGCTGGAACATTTTGTTATATCGATCCTGAGTATCAACAAACAGGATTGTTGGGTGTGAAATCAGACGTATATTCATTAGGAGTGGTGTTGCTACAAATCATTACAGGAAAATCTCCAATGGGGTTGTCACACTTGGTTGAGAAGGCTCTTCTGTCAAACACTTTAAGTGAGGTGCTTGATCCAAGTGTTACAAACTGGCCAATAGAAGCGACTTCATCATACGCTAAGTTGGCCTTAAAGTGTTGCGAGTTGAGAAAACGTGATAGACCAGACCTTGGTACTGTTGTTTTGCCAGAGTTAAACAGAATATCGAGGTTGTGGGACGATGAAAACATATATCCCCTCAGAAATTATCACATGGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36973::LG11:31273274-31275274(-)
CATCATCCTCCAACTCTTGCTCCAAGGGAACCTCCTCAACAACATCTGCTCCCATCCAAGTGGATAATCATCGCAAAGGTAAACATACACAAGCAGCACACAACAAAGAAGCAAGGGTGAGCTAGATAAACAAGCAGTAATCATATAGTTCAATCAATAAATATCATCGTGCTTAGCTACATATAAAGAACAATCAAGGCATGCCACTTTAAACCATGACTCAACCACTCACACGACTCATCCGGATTGGTATAACTATCGAACTATTGGTCGTCTTTGCACTTGCGTAGTTCACTTGGCACTCCCCAATACTATGTAAGGTAAATCCCCATTTGTCTATGTCTAAACTCTAAGACTATAGACGAGAACCTCCCTCTACTCTCACCACTTACACTGCTCTCCTCTATTTGAGGATGAACAGTGCTTCGAGTGTAGGGATAGACATACCAGTTCAAAACTCCATACAGTTATACAGAACAACAACAACACCCCACACATCACTTTCAATCATCTTACCCACACATCACTTTCAATCATCTTATCCTGAGGTGTCCACTTCATACTCAATTACAATTTCCTTCTTTGGATTTTATTATTAACTTTATGAAATCTCTTTGTAGTCTTTTGCTTAAAGTGATTATTGCAGTTATTTAGATAATTTGGAGGATGATGGTATATTTCATAATCCAATTGTGTTTCCTTAGGAGTAATGGTTAGAAAGTAATATTATCTCTTATTTTTCGGTGTTCAAATTTTTCAATATTGAAACTAGGAAATGTATGGTGATTTTGTTTATGCACTTAATTAATATGACACAGATTCATATGCTAATTGAGGTGGATATTGATGGTCCAACTAGGGGTTGTTCTAGTTTGACTTCATGTGCTAGTACTTTTAGAGGAAGTCGAGGTGAATATGTGAGTAGTTTTTTAACTTTTTTAAATATAAAACTTATGATTACACAAAGTTAATGGGGCTATTTGTGCTATGGAGCATGCTTGTAGACAGGGTTTTCATAGGCTTTGGATAGAAAATGATTTTTCTTTAGTATGTCATGTTTTTTTTATCTAGGAGTGGTTCCTTGAGTCTTAGAGGAAAATGACATCAGTGCTTATATTTTTTTACATATATGTAGTTCAAAATTTTTCACGTTTTTCGTGAAGGAAATCATTTTGTTTATAAGTTAGCTAACTTAACTCTCATTCACATACAGAGAACAATATAAGTAGTTTAATTCTTTTTACCTACATGTATTTATTTAGATTTTTTTATATTAGGTATTTGTCTATGTTTCTCGAAGTATAATTTTTATCATGAGTTTGACGTGGTTTCTAATGCTTTGTATTCTTTCATTTTATTTTTCTATTTTAATAAATTTTTCTATGATGGGAAATGATTGATGAACTTTAAAATTGATAATAATACCTAAGATAATCTTATTTAAAAAGTCTCAAACTAACAATTCTGTAATCTATAAAATTTAAAAGAATCTCTACAAATAAAATAAAATAAAACATTTATAAATATGTAGAAACATTCAAGTAAACTGGTGAAAGTGATAAAATAAAGAGTTGTGACTCTTTACACTAAAAAAAGGACATAACATACTCGTTTGACACTCTAAAATAATTTAACTATTTTTATATTATTTTTTTAATTTTGTAACAAGCATAATAAAATGTTTTCGTCGCCATGATTATGTAACATTCTAATTTTGGCTACATGTTGATAACTTCAAACTAATATTTGTTTTTTAAATCTTATCTAAATTTATAAATAACATTGACAACCAACGTTAAAACTAAACTTAGGCACATTACATGCAGACACAAGGATTGCTAAAAATGGAACTCCAACTAATACTACAGTTCCCACCAGATCATGGTAGTTCGCTTTATAAAACAAGAAACTTTACGAGAACATAATAACCTCGTTCCTTGTGTCTCAAATAATCTAGTTTCTTCAATAATCCATTCCAACGCGAGGCACCATTACCGATC


Gene Sequence:
>Vu_36973(-)
ATGTTTTCCAAAACTCCAACACCTGTTGTAATCGGAAGAGACAGCACCGTGATCGCAGTAAGCGGAGGTCGACATAGCAATGGTGCTGTCAAATGGGCTGTGGAACACCTCCTAAAGAAGAACTCCTCATGCATCCTTCTTCATGTTCGAACTAGGACCATGCTTAACCGTAGGTACCTTCTCCTTAGCCTTTTTAATTTTTCAACCTTAGAAAATATGCACTTTTCACATATAATTCTGATACACAGAATTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTATTTTTACTTTAAACAAAGTCTAAAGGTAGGTTTCTTTTGTTGGAAGTCCCATGTAGTAGAAATAAAACAAATTTAAAATATATAAGTGCATGTAAATCTCATTTTACAAATTGATGTTGTGAGTTAAGTTAGACTAAAGTCCAATTCAGCATGTTTATCATCACTTATGTACAATGACTTTTGAAATTTGGTTTCTGCAGCTGATAATACTAATACTAATGATGCACCCAAAAGTGGTCGTCCACCAACTGAAGAAGAGTTGCACCAGTTCTTTCTTCCCTTTAGAGGATTTTGTGCCAGAAAAGGGGTGTGTGACGTGTATTTCAGTGTATCTTGTATCAACTTGTGTATCATATATAATTACTATTATGGATGTTGATCATTTCAGATATCAACAAAGGAATTGGTCTTGCACGACCTTGATGTTACAAGTGCACTCATTGCTTTCGTTGATGACAATTGTATCAGCACCCTAGTTGTTGGTGCTGCTACTTCTTCCTGGGGTTCTATTCTAAGGTAATTTATTCTCTCACACGAACATTCACATGCAAATATTAGCAATTTTTGTATTGAATTTTATGGTTTTTGTGTGGTTTATTACAGGAGATTTAATAAAGACGATGTGTCAGCCACTTTAGCAAAATCCTTACCTGATACATGCAGTTTATATGTTATATCAAAAGGAAAAGTACAGCATATTCGACCTTCAGGTCATCATGGTCATCATCATCATCATCAACATGTTGAAGCCCCACCAGCTAAATCTATAAAAGATATAGTCAATTTCTTAGAAAGTGATCCATTGGAGCAGCCACACAAAGATCTCAACATTAACCAAATAGCTTTTGAAGATATAGAGAGGTATGCTTTCAGCCTTAAATCATAATTCAAGTTATTGGAAGCTTTATGACTTTATTACAGTATTGATTTGTTTATATGTTCTTGCTTGAATATACAGGAAACTAATCAAAGATGCAGTAAAACACCAATCTAATAATAAACTTTGGGAATATTTACGTGAAGAAACAGATTCACCAAAAGGTCCAATTGAGTACCCTCCATCACAAAATTCATCTGCAAATAATACTCCTGGAAATAGTGACAGCACGGGGCAATCACTTGGTCCTTCTTTGACAAATAGGTTAAATGAAAACCAAAAAATTGTTCTAAACGCACACCATTCTAGGACCAATTCACACCATTCTATTAGGAACATTTCACACCATTCTAGGACCAATTCACACCATTGTGGGAACAATTCTTACCATTGTGGGAACAATTCTTCTTTGAAAGATCAAGTAAGTGTTTTATTGTCTAAAGTAGGAAAATATCAATTTTTTCACATGGTTTAGCATTTAAGAAAGTTAAAAAAATACATGATTTCACAATCATAATAAGAACCAAGTTTGCATGCACATGTATCAATTTCAAAACTAACACATGATATAAAGCTTGAGGCTAGATTAACTTAACCTATATGCTTTACTCCCTACTTTAATCATTTGAAAGTTTTTAAGCATAATTGGCAAAAATTACATATCTTTTTTAAATTGCAGGTAAACTTTGATATGCAGATGAGGAAATTGAAATTAGAACTACAAAAAACTGCAGAGATGTATGGTATGGCTTGCAAAGAAGCTGTTCTAGCTACACAAAAGGTAAATTCATGTTATGACTTTTTGTTTAATGCGACGACACATTATTACACTCTTTTTAACCGTATATGGTTCTAGTTATTGCCTATTAAACATGTTATTAACTATTGCTTTTGTCAATGTTAAAACACAACTACTTTTTGTATACAAATTATACACATGTAGTTTGAGATCATGTAATGAATTCTTGTCATCCAATGTTGTTTATAATAATAAAAAAAACTGTCCAATCAGGCAATGGAGATTGAAAAGTATAGACAAGAGAAGGAATGCGATATGGAGGAAGCAAAGCTTGCTCAATCCAAAATGACTATGGAGTCAACAGAAATGTCAAAACAACTGGTAAAAATGGGGTCTCAGAAGAGAAAGGAAGTCGAATTAAAAGCCAAAAATGAGGAAGAAGAGACGATTAAAGCATTTCAAGAAGCTCTATATAACAATATTCCCTACAGAAGATATACAATTGAAGATATTGATGCTGCAACCAATAAATTCGATAATGCTTTAAAAATTGGTGAAGGTGGATATGGTCCTGTCTTTAAAGGACTTCTTGATCACACTACTGTTGCTATTAAGGCTATGAAACCGGATTTAGCCTATGCAGAAAAACAATTTCAACAGGAGGTAATAAAATTGTAGTTTTCTTTTTACAGCAATGTTTGCTTAAACCATGCCACAAGTATTTAACATGAACAATTTTCATGCAGGTCATGGTTTTAAGCACCATAAGACATCCAAACATGGTGCTTCTCTTAGGAGCATGTCCAGAATTTGGTTGTCTTGTGTACGAGTATATGGTAAATGGAAGCTTAGAAGATCGTCTGCTTAAAAGAGATAACAGTCCTCCAATCCCATGGAAAACGCGTTTCAAAATAGCATCTGAGATTGCCACTGGCCTTCTTTTTCTTCATCAGACAAAGCCAGAACCCCTGGTGCATCGTGACTTGAAACCAGCAAACATTCTTTTAGACAAAAACTATGTTAGCAAGATTAGTGATGTTGGTTTGGCACGACTAGTGCCTCCTATAGTGGCTGATCAAACCACACAATATCGTTTAACTGGTGCAGCTGGAACATTTTGTTATATCGATCCTGAGTATCAACAAACAGGATTGTTGGGTGTGAAATCAGACGTATATTCATTAGGAGTGGTGTTGCTACAAATCATTACAGGAAAATCTCCAATGGGGTTGTCACACTTGGTTGAGAAGGCTCTTCTGTCAAACACTTTAAGTGAGGTGCTTGATCCAAGTGTTACAAACTGGCCAATAGAAGCGACTTCATCATACGCTAAGTTGGCCTTAAAGTGTTGCGAGTTGAGAAAACGTGATAGACCAGACCTTGGTACTGTTGTTTTGCCAGAGTTAAACAGAATATCGAGGTTGTGGGACGATGAAAACATATATCCCCTCAGAAATTATCACATGGCTTGA