Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36961 LG11 31124292 31128548 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
G/*,T 31124465 5_prime_UTR_variant
G/T 31124469 5_prime_UTR_variant
T/G 31124603 5_prime_UTR_variant
A/G 31124608 5_prime_UTR_variant
C/T 31124613 5_prime_UTR_variant
C/T 31124917 5_prime_UTR_variant
A/G 31124959 5_prime_UTR_variant
G/T 31125348 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 31125456 5_prime_UTR_variant
G/A 31125480 5_prime_UTR_variant
T/C 31125484 5_prime_UTR_variant
A/G 31125497 5_prime_UTR_variant
A/G 31125652 5_prime_UTR_variant
G/A 31125810 synonymous_variant p.Pro50Pro
T/A 31125942 intron_variant
C/T 31125983 intron_variant
G/A 31126000 intron_variant
A/T 31126055 intron_variant
A/G 31126146 intron_variant
A/G 31126181 intron_variant
G/T 31126222 intron_variant
T/C 31126257 intron_variant
G/T 31126647 upstream_gene_variant
T/A 31126693 upstream_gene_variant
G/T 31126694 upstream_gene_variant
G/C 31126786 upstream_gene_variant
C/T 31126795 upstream_gene_variant
G/C 31126834 upstream_gene_variant
C/A 31126869 upstream_gene_variant
G/A 31126899 upstream_gene_variant
G/A 31126950 upstream_gene_variant
C/T 31126961 upstream_gene_variant
G/C 31127052 upstream_gene_variant
T/A 31127112 upstream_gene_variant
A/G 31127312 upstream_gene_variant
A/T 31127425 upstream_gene_variant
T/C 31127446 upstream_gene_variant
C/T 31127900 splice_region_variant&intron_variant
T/A 31127928 missense_variant p.Leu226Gln
T/A 31128002 missense_variant p.Ser251Thr
C/T 31128132 missense_variant p.Ser294Phe
T/A 31128145 missense_variant p.Asn298Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36961.1
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>Vu_36961.2
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CDS Sequence:
>Vu_36961.1
ATGAAGAACTTAAATGAAAAAGGCTCTGGTTCTACCCATTTAACAGCTCCTTATGCTCTTGGATGCTCGTCATGGGGGGCTTCCTCTGAATCTGATGTTCAACAATCATCCATGTCCAGAGGTTTGACCTTGAAAATGGGTGTTCTGCCGCAGCAAGGCCGTAAGACTAAGCCATTGAATTTTCATTATCAAGACCGAGATTCTTCTTCATCTCAATCAACTGGTCAGTCTTATCCGGAAGTTGGTTCAGCGCAATCAGGTCAATTTTCAGTTCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTTGTTCGACACTTAACACAGCTGGGAGAAAGAGTATAGAAGGTGTAATCAGGTCATCTGTTCGTGGTCAGGATTTTACCTTACCTCCTTCACAAATGTGTCACAACCAGCCACTTGCTCATACTGCATTCCATCTTGCTGAGCCATGCTTTAGTGGCCTACTAGCTTCTCCATATGGCCCACAACCTAATATTCATCCTGCTCAGCTGATAGGAATGCCTACGGCTAGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCTATATTTGTGAATGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGGCGCAGACAATACCGGGCAAAACTTGAATCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAACCATATCTTCACGAGTCTCGCCATCTACATGCATTGAAGAGAGCCAGAGGTTCTGGTGGTCGCTTCTTGAATACAAAAAAGAATGAAGAGTCTAAACCCTCTTCACAAAACCATGACATAGATGTTTCGAGGTGTACTCATTTGAATCTGAGGGGAAACATGTCAGAATCTAAGGCTCGTCAGTTGAACTACAGAGATGGTGCTTCCACAGCCACCTGTTCAGATATTTCTAGTGCATCTAATAGTGGTGATCTCTTCCAGCAACATCAACCTGACATTAGATTATGTGGTTACCCTTCTCATATAGGAAGGAACATGCAGGGTTACTCTGCTGATATCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAAACCAGCGTCGTCTATCAGTCCTTATGTGA

>Vu_36961.2
ATGAAGAACTTAAATGAAAAAGGCTCTGGTTCTACCCATTTAACAGCTCCTTATGCTCTTGGATGCTCGTCATGGGGGGCTTCCTCTGAATCTGATGTTCAACAATCATCCATGTCCAGAGGTTTGACCTTGAAAATGGGTGTTCTGCCGCAGCAAGGCCGTAAGACTAAGCCATTGAATTTTCATTATCAAGACCGAGATTCTTCTTCATCTCAATCAACTGGTCAGTCTTATCCGGAAGTTGGTTCAGCGCAATCAGGTCAATTTTCAGTTCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTTGTTCGACACTTAACACAGCTGGGAGAAAGAGTATAGAAGGTGTAATCAGGTCATCTGTTCGTGGTCAGGATTTTACCTTACCTCCTTCACAAATGTGTCACAACCAGCCACTTGCTCATACTGCATTCCATCTTGCTGAGCCATGCTTTAGTGGCCTACTAGCTTCTCCATATGGCCCACAACCTAATATTCATCCTGCTCAGCTGATAGGAATGCCTACGGCTAGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCTATATTTGTGAATGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGGCGCAGACAATACCGGGCAAAACTTGAATCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAACCATATCTTCACGAGTCTCGCCATCTACATGCATTGAAGAGAGCCAGAGGTTCTGGTGGTCGCTTCTTGAATACAAAAAAGAATGAAGAGTCTAAACCCTCTTCACAAAACCATGACATAGATGTTTCGAGGTGTACTCATTTGAATCTGAGGGGAAACATGTCAGAATCTAAGGCTCGTCAGTTGAACTACAGAGATGGTGCTTCCACAGCCACCTGTTCAGATATTTCTAGTGCATCTAATAGTGGTGATCTCTTCCAGCAACATCAACCTGACATTAGATTATGTGGTTACCCTTCTCATATAGGAAGGAACATGCAGGGTTACTCTGCTGATATCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAAACCAGCGTCGTCTATCAGTCCTTATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36961::LG11:31122292-31124292(+)
AAATAAAAAAAATGTTAAATAAATATAAAAGAATTATATATATTAAAATATTTTTTTCTAAATAAAACTATATTTAAATTCTTCTTAGTAGTTACAACAAAATCCAATCACATTCATATAAATATATATAAATTAAATACCGTACCAATATATTTCCTTATACAAATCATTAAAAAAGTTAAAATTATACTAAAATATATTTACTTACAAAAGTCAAAACTATATTTAATCTTCAAACTCTTTAAATATATAACATAATATCATAAAAGTAATTATTTTTTTAACTGAAAAAGAGAGTTCAAACTGTGTTTGAAAGAGATACAGTTTTAAAATAAAACAAGAATCAATGTGTACTTTTTTATTTATAAACTTTTAAATTAGTAATAATTTCTAATTAATCCGTGGAAACATTTGCACGACTTTTACCAAGTTTCAAGTTTTCATTCTTCTCAATAACTTTGATAATAACAAGAATACACAACCAACTAGTATTAATAAGAAGAAAAATAGACGTTATAATACGCATGTCAAACAGATTTAATTCATTTTATTATAGTTTTTGAAACTATAAACACAATTTATATAGTCTAATTTTATAAATATTTATTTTAGCACTTGATATATAGAAAACGTTTTACTCTACTTATTGTTTTTATTTTCATTTGGCGTGAAAAAATAATAAATTTTACCGAAAAAATTCATAATTTTTTCTATTGTTATTTTTATTTTTTGATAACATAACATCAAGCATAAATAGATAAATATGTTAAACAATTAACTTAAATTAAAGTTAATTTACAGTGATATCATTTCAAAATTAATTTTTATAAATTTGATTTAAAGTTTAAATTTCAGATTTTAAGACCGTACTATCATATTCATTCAAAAAATATTGTTTTTTTCATATTATTATTAATGTTTTGTTTGTTTGAATTTATTCTCATGTGGATGGAGATTGAGAAGATATAAAAGTGAATTTTTTTATGTTCGTTTGAAATTATATGAGGGTGATGTTGGATGAAAAAATAGAATTATTTATTTTTTCTCATCTCTCGTGTTAGAAAAGATAGAAAGAAAATTGGTTAGTTTTATTATATTACCTTACAGTTTTTTAATAACAATAATAATAATATAATTTTTTCATATGTAAAAATTTAATTTTTATTTTTTCTCTTATAAATCTTTTTACAATTATATAAATTAACAATTATAATTTTATATTACTTTTATTACAAAAAATATTTTAATAATTTTTACTTTTTATTAATTAAACAATTTTTTTATTTGTAATTAAATTATACACTAATATTCACTAATTTTATTTTTAAATTTAATTTCACTTATTTCTGAATTATTTAAAATAAAAGATAATAAATTTATTCTCAAATTTCTTCACATATATTTGGTCACTCAAATTTTATAAAGTAAAAACATCCTAAAAGTTTAATTCAAAATAAAATAATAGCAATAAAAAATTTGAAAATGAGAAGCACTAAATCATTTAAAAAAAGTTGATAATTTTAAGAAGAGGGGAAGAGTGGTTAATTTTATATTCCTTTTTCTTCTTCTTCTTCCATTGATCCCTGTAAAAGAGGTAAAAATTCAGTATCAGTTCATGAAAATCCATGAAAGATAAGAAGAAGGGAAAGACAGTGTAAAAGAAAGTAAAAGAGGAGCGCGTGAAGAATGAAGGAGGTGGAGTGCATTTAAGAAGCACACAGAAGTCTATGAGTAGGAGGCATCACAGTCTGATATGAAGTTGAAACTTGAAGCCCTAATATTTAAAACCAAACCCCAAATCCCTATGCAAATTTCAACGTACCACTACGCGACAATGTTCAATTGCAGCCCTTCAATATTTAATTATTACTTTCTAAAACCCTTTTATTCAGATTAGGATGTGATCATATTCACATCGTCATATGTCAATGTCACATAGAAAAAAGGTTACTTCATCAATGGATTTTTTTCATGGGTACCCTTTTTCTTTTCTCCCTTTA


Gene Sequence:
>Vu_36961(+)
AACGTTAATGATAATAAAATATTATTTTTTGATAATGGAGAATTGAGAAAGCTGGTGCTGTAGCCTGTGGAAGGTGAGTGGTGAGAGAGTACACTTTGAGTCTTGAAATTGAACTTAATTGACTGTGTTAATGCAGAGATAGAAAGATAGATACATATAGATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGTTCATAGTTTTTCAAGTCTGTGACTTTGTACTTTAAAGAGATCAACACAAGCAAAGGGTGATGAAGTGGAGGAGTGTGAGACAATAGTGGGGTACCACTTTCAGTTTCAGCTTCTGTTTCAGATTGAGAGTTTCTTCTTAGCTTTTAAGTACATACATATGTACATGCACAGCTTTTGGTTAGTACCATTTTCTTGTTCCTCGTCACTTTACTGATTTTTCGAGGTGTCTTTCTCTCTTTTTACTATTCCTTCCTGTACATCTGCCTTCATTCTCTTTTTCCATTCCTGTTAATTTATGTTTTTTTGGAAAAAAGTATTTTTTTTTCTGGCATGGTAGTGAATCTGAGGTTGGTCTTAGATAGAGGATTTCTTGTTATGTGTAAGGCAGAGACAGGCTTGTGTTTGCTGATGGATGATAAGTTATTGTTGTTTTTGGCAATGACTTTGTTTCTTGTTTCTGTGAATATTCTGGGAATTAACCATTTATGCAGAAGCTTTTCAATTTTGGTATGCTTTTTATGCTGTTAAAAGTCTTCAAAAGAAACAGTTCCTTTTCTTCCCACTCCTCACTTTTCTTTTTTCTTTTCCTATATTCACAAATTCATTTAACCGTTCACATGCAATCTATCTGTCTATTTTGTTTGGTTGGATTGCTTTGTAAAGATTGTGAAAATGTAGAAGATTCCTAGACTAATACTTTTTAAAGAAATTTGTTAACTTTCTTATTATTGGTATATCTTTATCAGTGGGTGAAACCCACAAAGGGAACTTCTTGCTTTCGATGACGTACCATACATTGTTAAATCTTTAGGAGTTTCTGCATGGCATTTCATATTGTCTAATTACTTTGCTTCTAAGTCTGTTTACGGAAAGATGATGTCTTTCTCTTCCCTACATCTTTTTTCCAGTACGTGAGTTTATTTTCTGGATACACACATGCCACAAACTGACATGCAAAGATGGCTGCTTTTTCTCATACACAAACCATAAGTTGTTTTAGAATTGTAGCTACTTCAACCTTTTTGCCTTGTTTTCTTCTGCATGTATGAATGGAAATGTTCATTAATAGTTGATGTTTGTTGGGAAAAAGGCCATAGTCCAATCCTGGTTTTTAGATAATGGTTTATTCTCTGTTTGAAGGTAAACACTCTAAACAAGGCTTGATCCATTGAGGAAAACAATGAAGAACTTAAATGAAAAAGGCTCTGGTTCTACCCATTTAACAGCTCCTTATGCTCTTGGATGCTCGTCATGGGGGGCTTCCTCTGAATCTGATGTTCAACAATCATCCATGTCCAGAGGTTTGACCTTGAAAATGGGTGTTCTGCCGCAGCAAGGCCGTAAGACTAAGCCATTGAATTTTCATTATCAAGACCGAGATTCTTCTTCATCTCAATCAACTGGTCAGTCTTATCCGGAAGTTGGTTCAGCGCAATCAGGTACTTGTAATAAAACTTAGTCTTTTTCTGTTGTATGTCTGATTGTTCTAATCGATTCTTTTTCATTGTTCTATACCCGTGTTTTACCCTGCAGTGAAGTAATGAAGAGAACCTGAAATCTTTATAGTAAAGAAAAAAATGAAGTAATACCAATTTGTGCTTGTGATGTTGCTGTTAAGTTATATCTCCTGATCACTTAGCATTTAACAATGATAGCCATACATGTATTGCATTTTCTTTTTGCTTCCAAAAATTAGAGTTAACCTTAGTCCTTAGATTGTTTAGTGCATGTTTGGTTTAAAGCTCTAGAAGTACTTTTTGTGTTATCAGAAAACACTTTTTGCTTAATGGATGTTGGTAAATACTTGCTGTAGGTCAATTTTCAGTTCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTTGTTCGACACTTAACACAGCTGGGAGAAAGAGTATAGAAGGTGTAATCAGGTCATCTGTTCGTGGTCAGGATTTTACCTTACCTCCTTCACAAATGTGTCACAACCAGCCACTTGTAAGTTGATGTATGATTGTATCTCAGTGGACTGATATTGTTTGCAAATCTCTTTTCTTATAATTTGCTTTTCAGGCTCATACTGCATTCCATCTTGCTGAGCCATGCTTTAGTGGCCTACTAGCTTCTCCATATGGCCCACAACCTAATGTAAGATATTGGAATTTATTCATTTTTTTTTTCACTATTTTCTTATTCTTGTCAGCTTGTCTTCAGCACAGTGAGTTAAAGATTTATCATTCAAACAAATTGATAAAATAACTGTATGAGTATGAGTGGCATCAGGTTATGGTGTATCTGGAAAGTACTTTGTTTAGATCTGGTGTACTGAGTTTTTCACTTTGTAATTGCTCCACTCTGTGATTTCTGATTTTGTTATGATGTTGACTTAGAAATAGGTTAAAGGTCTTTCGGGAAAGCATGCTGCCCTTATTATTAGCAGTTTTAATTTGATTGGAAGCTTTCTGAGAGACTTTTGGATATATGTTACTATAAGTAGATGCTATTGTGGTTGATTCCTGTATTAATGCCATCATTATGCATATTTAAATGAATCACCAATAGTGCCTTTATTTTACTTATTATTATACGTCCTTGAGAATCTTTTCAGCAATCATCTATGCTTAATTAGTTTTTACTATTTGTTGTGCCACTGTTAGCTTGCCAACCTTACAGATTCTCATAGTTCATAAAGTATGCTTATGAAGAATCTTTTCGGTTTAAAAATGTTTCTTTGCTCTCCTTTGCACCTCATTTGTTCTTATTCTTTCATCCTTTGTATTATTATTTACTAAAGCACTTTTTTATTATGGTGGAGAGCTTGTTTCTTATCTTTGACTCAAGGTATTCTTTATTTTATAGACTTAACAATCTGACATGCATTCTTTACCAGACAGCATGGTTACTCTTGCTAAACTTTATGCTGAGTTGTTGGAAAAAGAAATTGAGCCTTCTATGGATAATCAAGCTTTTGAGTATTTGGATTCTCTTATGACGTGTTCATTCTTTATTTTAATTAAATGACCTAACACAGTTACATAATGCCTTCAAACTTCCATCATGTTAGTAACACTAAGACATTATGTGCATTTCTATAATCTAAACCATGCTATCAAAATATGGCCAGATTCATCCTGCTCAGCTGATAGGAATGCCTACGGCTAGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCTATATTTGTGAATGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGGCGCAGACAATACCGGGCAAAACTTGAATCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAAGTAAGTGCACTTCTGCATTTTAGAAATGCTGTAAAATCACTCTTTAACACAAGTGTTTGATAAAACTTAAAAGAGTGATTTTACAGCATTTCTCATACTTCTCTTTTGTTTCCTTTTCCTTCTAAGTTCAACTTCTCTCCTTAACGTTACCATGTTTGTTTTTCAGCCATATCTTCACGAGTCTCGCCATCTACATGCATTGAAGAGAGCCAGAGGTTCTGGTGGTCGCTTCTTGAATACAAAAAAGAATGAAGAGTCTAAACCCTCTTCACAAAACCATGACATAGATGTTTCGAGGTGTACTCATTTGAATCTGAGGGGAAACATGTCAGAATCTAAGGCTCGTCAGTTGAACTACAGAGATGGTGCTTCCACAGCCACCTGTTCAGATATTTCTAGTGCATCTAATAGTGGTGATCTCTTCCAGCAACATCAACCTGACATTAGATTATGTGGTTACCCTTCTCATATAGGAAGGAACATGCAGGGTTACTCTGCTGATATCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAAACCAGCGTCGTCTATCAGTCCTTATGTGACACACCAGTAAGTTATTTTCCAGCATTCTGTTGGAGAAGACAATTGTCTGTGTTCCATAGGGAAGTCATCCTTGGCTCATATATTACTATGTGTACTGGTTGTCCTAGATCATGGCTTTGAACCTTTGCTAGATTTCAATTATCATATATTGTTGCCCTGAAAATGTTTGGGCAGAGAAGCACATTTGATGTTTCTTTGTGTTGATGTCACATTAGAAAATTTCATTTTGACTTGTGTTTTGATTGTGGTACC