Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36950 LG11 30979734 30983256 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 30979792 missense_variant p.Val20Ala
A/G 30979793 synonymous_variant p.Val20Val
C/A 30979822 missense_variant p.Ser30Tyr
G/A 30979919 synonymous_variant p.Glu62Glu
T/C 30980018 synonymous_variant p.Tyr95Tyr
C/A 30980042 missense_variant p.Asp103Glu
T/A 30980452 missense_variant p.Leu189Gln
T/C 30980539 splice_donor_variant&intron_variant
G/A 30980542 splice_region_variant&intron_variant
A/G 30980581 intron_variant
T/C 30980854 intron_variant
G/T 30980987 intron_variant
G/A 30981353 missense_variant p.Gly220Glu
T/C 30981357 synonymous_variant p.Ile221Ile
G/A 30981576 intron_variant
C/T 30981678 stop_gained p.Gln298*
T/C 30982362 synonymous_variant p.Leu495Leu
A/C 30982599 missense_variant p.Glu574Asp
G/A 30982605 synonymous_variant p.Lys576Lys
C/T 30982983 synonymous_variant p.Asp702Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36950.1
MQSVVNPMSFQVSHRIKYVVFISLVFVTCSTSSNDTSQIKYDVFVSFRGEDVRRGFLSHLIEAFSQKQIAFFVDDSIQKGEELSEALFGAIEESYISLVIFSDNYASSRWCLSELEKILECRRKNGQTVVPIFYKVDPSDIRHQRNTYGDAFVKHERNYSLTTVQTWRSALSESANLSGFHLSQFLDEAELVKKIVKSVWRTLNHVHQVNSKGLVGIVAAGLERLKDKAFISISQENTVSMHDIIQETAWQIAGEESIENPRRSQIRLFVPDDIYDVLTHNEGNEAIRSIVVNLLRIKQLHLKPQVFTKMSKLHFLNIYTAGTRDTRFYERWGLYLHQGLESLPNELRYLGWMHYPLESLPSNFSAENLVELHLPYSRVKKLWHKVPDLVNLKVLMLYSSSNIKELPDFSKASNLEVIDLRSCVGLTSVHPSVFSLKKLEKLDLDECRSLTSLRSNVQMESLRYLSLFKCMELKDFSVTSKNMIMLNLEKTDIKQLPSSFGSQSKLEHLNLKFSSIESLPADMKDLKGLQHLDLRYCRNLSFLPELPPSIETLDCRECVSLGSVAFPSIAEQWKENKKKALFWNCLNLDERSLKAIETNARINMVKFAHRHLSTSGDAHAIYVYPGSQVPEWLTHKTTHDDDYYDDDDGGGGDDCITFAPNPSHLGYIFCLILPAVQYSERVLKLTVSTEGEDEGDSMIVYLDRPRHTIKSDHVYLMYNEALSRFLTSRAKQQPMLKIKVTVATLTFSSTYTEVQLRGFGVSTISNLLQKRQLYDTPIPKEHSEVCPDALWNS*


CDS Sequence:
>Vu_36950.1
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Promoter Sequence:
>Vu_36950::LG11:30977734-30979734(+)
ATTTGACCATTTTTTATTTAATTTTCAAACTTAATTATTTTTAATTAAAAAATATCTACATAAATAAAAACCATTTATAAAAAATTAAAATATATATTTAATTTTATAATTTAAAAACAACAATAATAATTTTATTATTTTTTATTATCAGAAAGAAACAACAATGTCTTTTCACTAATATTAATAATGAAAATAACTGATTGAAAGAGACAACAAATTTTTTAAAAGTTATTCCTACTCTTTTTGTCTTATAAATGCTTGGAAAGAGAAATAACTCCTAAAATATATATGGTAATTAAGGAAGCTTCTTCTTTTTTTTTTCTGCATTCCTATATCTCATAACAATTAGTTTGAAATTTATTGACAAATATTTTATCAAATTGTGAAAAAGACATTTTTCTGTCTGAAATAAATCCAAGCATTATCCACACTAATTGTTTCTACTAGTTTTTGTCTCATCTTTTCTTCTTCTCCTCTAGATTGATTATCAATATTTTGCGTGGTCAATATATTAAATACTTATTTGGATATACTATAAATATTTATAAAATAAAAAATAAAAGACCATTAGCTCATTTTTTAAATTAAAAAAATTTGATTATTAATATGTTAGAAAAGTACAATATATAGAAAATTACATTTTAAAACCTAATAGTTTAAAAATAGTAAAACTCAATTATTATAATATTAATTTTTTTAGTATAAATCAAAATTATTTTTCTAAAGTCATTTTATTGAATAATTGAGACTATGAGATCAATTTTTGCGTTGAGTTTTTTAATTTAGATTGATAAATTTTCTTTTTTTATATATGTTGATTTTCAGACATATTTCTTGGTCTTGTGTTTTGTTATTTGTTTATGTTTTTTTTTTCCATTTACATGTGTATTTTTAATAAGTGATTATAACATTATGTTCTAATCATTTTTATGATATTTCTGTGTAGATAGAACATTTGCAAGTAGGGAAGAGTTTAACTAGTTAGAGTTTTATGAGTTGTTGGTTAAGCAAGGGAAACTAAATGTACAATTTTTAAGTTATATATACCTTGAAATTTCTAATTTTATAATTATATGGTAAATTGACTTAATGATTGATCTCTCTTGATGAATGTGATATGTTGAATTTTGGTTAGGTTTTTACATTGACTGAATTTATTATATGTTAAAATATGAAAATGTTGTTTGATTGATGTTGCATATGAAATTGTTGAGTTAATGAAAATTATGTAACTTGATGTTAGAGATGAAATTGATGTTTTTACATCTATGATTGTTGTTGGACTAAATTTACAATGGAATCACATATATCTACATAATTATGCAGACTCGCTAGGTGAGAATATACTGACTAAATGAAAATTAGTCAGAGAGTTTTTGACTTGGTTGTCACTTAAAAATATATAGTTATTGGGTGAAATCAAAGTCAGTGAATTTCTCACTTAGTTGTCGCTCAATAAAGATATACTTGCTAAACGTAACTAAAGTTAAAGAGTTCATTGACCTAATACGAGTTCACTGACCTAATACTAGTTACACGAAACTAGTTTTGTTAGATGACATTTAGAGAAAATTTAAGCCTGTGAATTTTAGTAATAATTTCGCTAAATAAGTTATCATTTAAATGATTTTTATTATAAGCAGATGATTTTTAGTGACTGTAGCTTGATGTTAATGGATAATAAAATATAAAATTAAATATTACAAAAGGTAAAAAAAATGATTAACATATATATTTTTTTGCCAATATCGTATTCTTATAAGTTTTAATCTGAAAAGGAAAAAAAATTAAACACAAATTTATTATTTATGTTCTATTTTTTTTATATATTTTTTGTATTATTTTTTAAGAAAAAAAATAATTCTTTCTTGTAATTTTCTTCGTATTTTCCTTTTAAGAAAAAAAAACCATCTTCGTATCCATTTATAGATTTCTAGATATATTATGGCTGACAATTGTTTTCTATATTGCAAAGGTGTAGAGAGACGAAGAAGTTAGGA


Gene Sequence:
>Vu_36950(+)
ATGCAGTCTGTAGTCAATCCAATGTCTTTTCAAGTTTCTCATAGAATCAAATATGTTGTATTCATCTCTCTCGTGTTTGTAACATGTTCTACATCTTCCAATGACACTTCTCAAATAAAGTACGATGTATTTGTTAGCTTCAGAGGTGAAGATGTCCGTAGAGGTTTCCTTAGCCATTTGATCGAGGCATTTTCTCAGAAGCAAATTGCTTTCTTCGTAGATGATAGCATTCAAAAAGGGGAAGAACTATCTGAAGCACTATTTGGAGCAATTGAAGAATCATATATTTCTTTGGTTATATTTTCAGACAACTATGCTTCTTCAAGATGGTGTTTGTCAGAACTTGAGAAAATTTTGGAGTGCAGGAGAAAAAATGGACAAACTGTAGTGCCTATTTTCTACAAAGTTGACCCTTCAGACATACGACATCAAAGGAATACTTATGGAGATGCCTTTGTCAAACATGAAAGAAACTATTCCTTGACTACTGTGCAAACCTGGCGATCTGCTTTGAGTGAATCTGCTAATCTATCAGGATTTCATTTATCCCAATTTCTGTGAGTTTTTTGCTCCCTATCATGGTTTAAGATATCTAAAGAAAAATGCTATTTCAAACAAAATCTTTTATGTTCACAGACCGGAATTTTTGTTTCTCTTTCTCTTATGCTTGATTCTTTTGAGTTTCTCATAACTTCTTTTTGTTGCACAGAGATGAAGCTGAACTTGTTAAAAAGATTGTTAAATCTGTCTGGAGGACGTTGAATCATGTTCACCAAGTTAACTCCAAAGGGCTTGTTGGAATTGGTAAGCGAATAGCACAAGTTGAATCATTGCTGCAATTAGAAACAAAAGATGTTCGCATGATTGGAATTTGGGGCATGGGAGGTATTGGTAAGACAACTATTGCGCAAGAAGTATATAATAAACTGTGTTTTAAATATGACAGTTGTTGTTTTCTGGCTAACATAAGGGAGGAGTCATGGAGACATGGAATAAACTCTTTGAAGGAAAAGCTTTTTTCAACATTATTAAGAGAAGAACATTTGAAAATTGGCAGACCTTTTGGGTTCCAGAAGTTAGTTGAGAGAAGACTTCATCGGATGAAAGTTCTTATTATTCTTGATGATGTCGGTGACGCAGAGCAACTAGAAAATTTAGCCAGAACAGATTGGTTTGGATCTGGTAGTAGAATCATTGTGACAACCAGAGATAAACAGGTGCTTGCTGAGGAGTCTGCCAGTGTATACCATGTTGAAGCCTTAAACTTTGATGAATCTTTGCGACTTTTCAATTTAAATGCCTTTAAGCAAAATCATATAGAGACAGAGTACGAGGAGCTGTCAAAGAAAGCAGTTGATTACGCCAAAGGCATTCCGTTTGTTCTTAAAGTTCTGGGTCACCGTCTTCATGGGAAAGACAAAGAGACATGGGAAAGTGAATTAGAAAGACAACAAGTGCACAACAAAAAGGTTCATGATATTATTAAATCGAGTTACTATGATCTTGAGGAGGATGAAAAGAGGATTTTTTTGGATATTGCATGTTTTTTTTATGGGCAGCAACTGCAGGTAAAGTACATAGATTTTTTATTGAAAGATCGTGATTATTCAGTGGCTGCGGGATTGGAAAGGTTAAAGGATAAAGCTTTTATCAGTATTTCTCAAGAAAATACTGTATCAATGCATGACATCATACAAGAAACTGCTTGGCAGATTGCTGGCGAAGAATCCATTGAAAATCCCAGAAGAAGCCAGATTCGACTATTTGTCCCAGATGACATTTATGATGTACTAACACACAACGAGGTAATAGAGAAAATAACACAGAAGAATTGGATATTTTGGGGGAAAATATTTTATACTGATGTTTACAGATTTTCTATTATTATTCTTGCAGGGTAACGAGGCTATCAGAAGCATAGTGGTCAACTTGTTGAGAATCAAGCAACTACATTTGAAGCCACAAGTATTTACTAAGATGAGCAAGCTCCACTTTCTAAATATTTACACTGCAGGAACTCGTGATACTCGCTTCTACGAACGGTGGGGCTTGTATCTTCATCAAGGGCTCGAATCCCTGCCGAATGAGCTAAGATATCTTGGTTGGATGCATTATCCTTTGGAATCTTTGCCTTCAAACTTTTCTGCAGAAAATCTAGTTGAGTTGCACTTGCCATACAGCCGGGTGAAAAAACTATGGCATAAAGTGCCGGTAAATATTATATATATTTATAACTTTTAATCTAAAATTAAAATTAGCCCATGTCATGTCTTCAATAATCTGTTTGTTTCAACTGCTACAGGATCTTGTGAATTTAAAGGTCCTTATGCTGTATTCATCCTCGAACATAAAGGAGCTGCCAGACTTTTCAAAGGCCTCAAACCTTGAAGTAATAGATCTTCGATCCTGTGTAGGGTTGACTAGTGTTCATCCATCAGTTTTCTCTCTCAAAAAGCTTGAGAAATTAGATTTGGATGAATGCAGATCCCTTACAAGCCTTCGAAGCAATGTCCAAATGGAATCCCTTCGTTACCTCTCCCTCTTTAAATGCATGGAACTAAAAGATTTCTCGGTGACCTCAAAGAATATGATAATGTTGAATTTAGAAAAGACAGATATCAAGCAACTTCCTTCATCTTTTGGATCTCAAAGCAAGCTTGAACACTTAAATCTAAAGTTCTCTTCCATTGAGAGCTTGCCTGCAGACATGAAAGATCTTAAAGGGTTGCAACATCTCGATCTACGATACTGTAGGAATCTTAGCTTCCTACCAGAGCTTCCTCCATCTATTGAAACACTAGATTGCCGAGAATGCGTGTCATTGGGGAGCGTAGCATTCCCTTCTATTGCTGAACAATGGAAAGAAAATAAGAAAAAGGCTCTCTTTTGGAACTGCTTGAACTTGGATGAACGTTCACTCAAGGCCATTGAGACGAATGCGCGAATTAACATGGTGAAATTTGCACACCGGCATTTGTCTACATCTGGTGATGCTCACGCTATTTATGTGTACCCAGGAAGCCAGGTTCCAGAATGGTTGACGCATAAGACCACACATGATGATGATTATTATGATGATGATGATGGTGGTGGTGGTGATGATTGCATAACTTTTGCTCCAAATCCCTCTCACCTGGGCTACATTTTTTGCTTGATTTTACCGGCAGTGCAGTATTCGGAAAGGGTTTTGAAATTGACGGTCAGTACTGAAGGTGAAGATGAAGGTGACAGTATGATTGTGTACTTAGACAGACCACGTCATACTATTAAGTCGGATCACGTGTATCTGATGTACAACGAAGCATTATCTCGCTTTCTAACCAGTCGTGCCAAACAGCAACCAATGCTAAAAATTAAGGTTACAGTAGCAACACTAACATTCTCATCAACATACACGGAGGTGCAGTTAAGAGGGTTTGGGGTTAGCACAATCAGCAATCTTCTTCAGAAACGACAATTGTATGATACTCCAATTCCAAAGGAACATTCTGAAGTCTGTCCAGATGCTCTGTGGAATAGCTGA