Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36940 LG11 30883622 30884812 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 30883783 stop_lost p.Ter238Tyrext*?
T/C 30884156 missense_variant p.Asn114Ser
T/G 30884357 intron_variant
A/T 30884613 intron_variant
G/A 30884627 intron_variant
G/A 30884629 intron_variant
T/A 30884771 missense_variant p.Lys14Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36940.1
MGRSPCCSKEGLNKGAWTALEDKILTEYINVHGEGKWRHLPKRAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPGIKRGNITNDEEELIIRLHNLLGNRWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTNIGRKLQNGTPGYSITNGGARNTLNTVQHDQNLKNQEWQYDKGSCLVQTKATRWSKVTVSDEISHHNDEDNKSNVGDHSKMKAFLVSPSSESNNDPVLNFMENLEMDGSFFSELLKMDFPESSCQGNKIVEDNDNPSSVEKGYLSPKSSCETTHFSWGDSLYDPNFEFLPVTTFTETGFDWL*


CDS Sequence:
>Vu_36940.1
ATGGGAAGAAGTCCTTGTTGTTCTAAAGAAGGTTTGAACAAAGGAGCATGGACAGCTCTGGAAGATAAAATTCTCACGGAATACATTAACGTCCATGGCGAAGGAAAATGGAGACACTTGCCCAAAAGAGCAGGTCTTAAGAGATGCGGGAAAAGTTGCAGACTGAGATGGTTGAATTATCTAAGACCTGGCATTAAGAGAGGCAACATTACTAATGATGAAGAGGAGCTAATTATCAGGCTTCACAATCTTCTAGGAAACAGGTGGTCCTTGATTGCTGGACGGCTTCCAGGACGAACAGACAATGAAATCAAGAATTATTGGAACACCAACATTGGAAGGAAACTTCAGAATGGCACCCCAGGATACTCCATTACAAATGGTGGTGCACGAAACACTTTAAACACGGTTCAGCATGATCAAAATTTGAAGAACCAAGAATGGCAATACGATAAAGGTTCGTGTCTTGTACAGACTAAAGCAACAAGGTGGAGTAAGGTCACAGTCAGTGACGAAATTAGTCACCATAATGATGAAGACAATAAGAGCAATGTCGGTGATCATAGCAAAATGAAGGCATTTCTGGTGTCTCCGTCTTCAGAGAGTAACAATGATCCAGTTTTGAATTTCATGGAAAATCTTGAAATGGATGGCAGTTTCTTCTCGGAGCTACTCAAGATGGATTTTCCTGAATCATCTTGTCAAGGAAACAAGATAGTTGAAGATAATGATAACCCTAGTTCGGTTGAGAAAGGGTATTTATCTCCAAAATCATCCTGTGAAACCACTCACTTTTCTTGGGGTGATTCACTGTATGACCCGAATTTTGAATTTCTACCAGTGACAACTTTTACAGAGACCGGATTTGATTGGCTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_36940::LG11:30884812-30886812(-)
GGTTGCCACATCACCACTATTATTTTAAACAAAACAGTCCACGTAAGAAACCCTAAACACGTCACCACATTCTCTGTGCTCCAGCTCACACCATTTTAACGCCGTTTCACAACACTTAACGGTTATGGCAAAATGTGCTCACTTTTACAAAAAATATGACCCAATTGAGACAGAAAAAAACTTGAGGACCCAACTGAGATTTTCATACAAACTTGAGGACCAACGAAGGGTTTAAACCAAAAAAAAAATCCTTTATTAGGACCCCTCCACCTTCACTCCCTCTTAGATGGGAAAAAAGCAAACTTTCCATGCAAAAATTAGAGAATAATAAATAAATGGTAGGTTTACTTTCTCAAATTACAATTTACCATTTCTTTCTAGAGGTAATAAAATAACATAAAATTGTAATTTTAGGAAGTAAATTTGTGATTTGATTATTTATCTTTAAAATCATGATATGTTGGCAGTTAAAAAAGCTGATTCATTGGGAGCACTATCTGGATTTAATGGTCTGACTATACGTACAATAACTGAAACTTTGTCCTTCGTTATTTATCCTTGTTCACCAGAAAATTGAAATGAAAATATCACTTTATGAGTTGAAATTATTTTGCGAAAATAAATGATACGTTAAAAAAGACAAAATTAAATAATATGGGTTGTCACAACTATTTAAACGGAAAACTGATATTCATAATAAGGAATAAAAATATATTATTTTTTTATTTGTAAAACTTAAAGAAAAGAAAATATTAAAGCTTTCAATATCGCAACATGATGGAAAAGATAGTACTTTCAGCACCTGAAATATCTGCTTGGTTGAAGGGACAGAGTTAAAAAGTTGTTGCAATTCTATAATAATATTTTATTAACTAAACAATTTTTGAAAACGTTTACAAAAGATTAATTAAAACACTAATTGTGATAATAATAAGTAAAAATATTAAATGAAATGCAAAGAATAAAATAAAAACAGATGACTACTATTAATTAGTTTACTACACAATGCATCCACTCTCCCGTATAGAGGAATTATAAAGCTAACACTTACAAAGAATATGAAAAATAATACAAATTTAAATTTATTTTAAAACTTAAATCTTAGTTAGTGCTACCCAACATTTTTCTAGTTCTCTGTAAAAGAAAAAAAAAAACTAATCAGCTTTTATAAGCAAAATGTTTTGTTGAAAATTAGCTAGTGGCCTAACATTACAAGTCAGCCAGAATAAAAGAGAGATACAATTTAAAGTTTTTTTTTTCATTAACAAGTATTTATTATTCTAAATATATATTTTTTTCTAAACTTTATATCTTGTGCAAATTTTATTTTTAAAATAAAGAAACAAGAAGAAAATGATTGAAACTTTCGGTGTGGGAGTTAATTAGCAAAATACAGTCCATGTTTAGTACCAGTACAAGATGGGGTATAGGTTTGATGAATCAAAAGAACACTGAACCGAAACCGAAACTCAGTATATTCCTTCTTGTCGAATGAAATTTACTTTTAATCATCTAAAACCCAGAGAGAATTAAGGGTTTTTAGAAATCGGATCTCAGTTTAATTTCGAAACTTTCGGACACCTGATATCCAACAAACTTTCAGGAGTGTGGGAAAGTTAGATAGAAAGTAGCTACGAGTGATGTGTATGAATGGCAGATGGGTGTATTGACGTATGAGTTTTATTTTATTTTGTAATAATTAATTAATCTCCATTCACTGAAAACATTGTCAAAACTGCATGTGGTTCATATGAGACAAGCTGATCTGAAACCCTAATTAAGCTAATTTATATTCGATGAAAATACTTTAACGAGCAAATTATTGGTGGTGGAGACCCAGAAAGGGTTCCTTTTGGGTCTTCCCTAATAAGAATAATGTATTTATGCATATTATATATAGAGCATACGTGATTACGCACCCATCAGCTGCCAGCACATACCATCTTTCTCACTCTCTTCATCACACTCACATACATTTGTGAACCACGTGCTCGAAAGAG


Gene Sequence:
>Vu_36940(-)
ATGGGAAGAAGTCCTTGTTGTTCTAAAGAAGGTTTGAACAAAGGAGCATGGACAGCTCTGGAAGATAAAATTCTCACGGAATACATTAACGTCCATGGCGAAGGAAAATGGAGACACTTGCCCAAAAGAGCAGGTCATGACTATGAATGAATGCATGCATATATGGATCAACTTGCACACTTTCGCATACATCATTGATTGATTCGGTTCGAATAACTTGGAAACTTGAATTGGTTAATTTTCAAACAGTAGTTTTCTGATATGTGCAATGGTTTCATGCAGGTCTTAAGAGATGCGGGAAAAGTTGCAGACTGAGATGGTTGAATTATCTAAGACCTGGCATTAAGAGAGGCAACATTACTAATGATGAAGAGGAGCTAATTATCAGGCTTCACAATCTTCTAGGAAACAGGTATATCTACAGACATTATAGTACATGTTTTTCTGTCTTTCTCATACTCATTACTAATTTTTTATCTCTCTAGGAGTGTTTGTTATTTACATTGTATTGATTTGAAAATGGTATCAATTGTTGCAGATTTCATAGAATAACAGAAGTGTTGCATTGATTTTAGGTGGTCCTTGATTGCTGGACGGCTTCCAGGACGAACAGACAATGAAATCAAGAATTATTGGAACACCAACATTGGAAGGAAACTTCAGAATGGCACCCCAGGATACTCCATTACAAATGGTGGTGCACGAAACACTTTAAACACGGTTCAGCATGATCAAAATTTGAAGAACCAAGAATGGCAATACGATAAAGGTTCGTGTCTTGTACAGACTAAAGCAACAAGGTGGAGTAAGGTCACAGTCAGTGACGAAATTAGTCACCATAATGATGAAGACAATAAGAGCAATGTCGGTGATCATAGCAAAATGAAGGCATTTCTGGTGTCTCCGTCTTCAGAGAGTAACAATGATCCAGTTTTGAATTTCATGGAAAATCTTGAAATGGATGGCAGTTTCTTCTCGGAGCTACTCAAGATGGATTTTCCTGAATCATCTTGTCAAGGAAACAAGATAGTTGAAGATAATGATAACCCTAGTTCGGTTGAGAAAGGGTATTTATCTCCAAAATCATCCTGTGAAACCACTCACTTTTCTTGGGGTGATTCACTGTATGACCCGAATTTTGAATTTCTACCAGTGACAACTTTTACAGAGACCGGATTTGATTGGCTATGA