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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36903 LG11 30414958 30417896 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 62-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 30415675 downstream_gene_variant
G/T 30417004 missense_variant p.Arg222Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36903.1
MATKDSPMELYEISTESDGSDSDSDWEDSGEDPDYDALEESHSKFSNLSLKHKAKARFIEEKGRGEEVLVVTASVNDGENFGKVQKLIEEGLLEKLKVDECKLYLRKNGLRLTGNKDTLIERIREHLEILNGGEKKYPSSSFVFNCKGDACTGDVVLFEQNVYEMFNIASRSASGPPCGKRIVAGRIVKESYGAAKQQHTFTIEVLWSKGEKPLPPLYPLLIKGRNLYRLKTLRQKWEDEAERQKILMEKHSRGSLARADREERIQEKEKRKHTKENRVSKKEARNQRQSNSHVTRPQYQPQGTNVVINPENPEFPSRNSVLSVNMMKERYCILNNSAATFGGTSFAVHSMHRNHTSDFRNTFDIGRVRGAETGANYYADPHFRENLPRFVNCHPNMAEMGTHHRIPLANANHSHPFMAPNRESFKINQVCRHYSRGRCYFGDKCKFLHDLRDKGNA*


CDS Sequence:
>Vu_36903.1
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Promoter Sequence:
>Vu_36903::LG11:30412958-30414958(+)
GCTAAAGTTGGGTACATCTTTCTGCCTTATCAATGATCCCAATTGGCTACTGCAACAACTGCGATGGTCGAACAACGACAACAGTGGCTATTGTTGCAGCGGAAACGGATCTCCCAAGATCGGGAGTTCTAATACCAACTTAAAAAAGAGAATGATTTTATTGTTTTCATTCATGTTAATTAATTACATTCTCTTATCTCTATTTGTACCAGTCTAATCTTCTAAAAAAGAGAAATAAAGAAACAAAATAATCTAAAAAATCATATACATGTTTTCTCTAATTTTATAAATATTTTCTCTAATAGAATATTTTATAAATTTTTCTTCTAATTACAACATTTTTCAAATCACATTGTATCACGTATTTTAATTATATTTAGTTTTATTTATTTTCTAGTATTTCACAACAAATCAAATTTGAATTTCCTAGAGTTGAAAAACAAGCGTGGAAAGAATTTAAGACATATTCAGTTTTAGTTCTTTGTCTAAGTTCTTAGATAAGAACTCAATTCTTATTTAATTTTTGTCTTGGAGAAAATTAGATGATATCTGTTTGTAAAATTCATTATTTTACAATAATGTTGAGAAACTTGGTTTACAGTAGAAACAAATGACAAAGAATGAAAAGAAAACAGATTTTAAGAAAAAAAAATGAATGAGGATTATAAGGGAGAAGAGCAAAGAAGTGAAAATTGGGATGAGTGATACCAGTAAATTTTAATTTATTTCAGTTTATGTTAAAAAATAAAATTAAAATATAATATTATAAAAATTATTAAAAATGAAATGACAACTAAAATTACATTTAAATATTAGAAAAAACAATGTGGAAAATTTGTAAGCTATACATGACAACAATAGATAAAAAAAGTTAATGATTCAAAATTTTAATTAATATACTTTTATTATTTAATATATGACACTAACTTGTTTACTGTTTAACATTTGATGCAGTTTCTGTAAAGAGGATCAAATCAATCCTTACTTTACAAAAATATCAATGTAATAAATAATATGATAGATAAAAAAATTTGAAAATGTCAACCAAATATTTTTCTTAACGCATTGAACATACGGTCAAGAATTATTTATTTATATAATATATGGTTTTCCTGTTTTTTTCTCCACTTTTATTCTAACTTAATTAGTATGCATTGATAAAAAAAATATTCCATAGTCAAATTTTAAAATGTTATGTATTTTAAATATGAAAATAAAGTTATTTCACCCCATTACCATTATCTTTGACTATTTTTATAAAGATAAAATGATTTTGTCAAAAGTTAACTTTTGTATTTCCAAAACAAAGAGAGAGAATGGAAGAGAAATAGTAATGTCAAAAAATCATAAAAAAATGTGGTGTCAAAATGTCAGTATCTTAAAAGGAATTATCCTTTTTGTGTTTACCTTTTTTTCCATTTTTAATTACCATTTTATTTAAATTTGACTGATTTTTTAAATTTTATTTTTTTAAAATTTTAAATATTTTTTAAAATTAAATAAATAAAAATAATCTATAAAATAAATAAAACTATTTATAATTAAATTATCAAAAAATATTTATATTTTTTTTATGATTATAATTTTATTATTTTCTATAAAAAAAAGTGAATACATGTGTGTGTTTTGACTTGTATATATATACCCAATTCCTTCTTGTTTTTATAATTAAAAAATCAATTTAAGTAAAAAACGTAAATTGATGTGGTTATTTGTTTTTATGTAGAAGGGACCTAAAGAAAACCAAGTGAATAATTCTGAAGATAAAAGAAATAAACTATAAACTTCAATAGATACTTTTTTAAGGAAATGAAAGAGGTATTATATATTGTATTGTTTTCTTTTAATTATTCTTTATGATACTATTAATTATTAATAATAACAATTATTTATTTATTTGTTTTTGAATCCCACACATCGAAAACCTTGCTTTTGCAACGGTCAAGAGCTTCTTCAACTCCCTTTGAGTTGCTGAAACTCTCAACACTTTCATTCACCAA


Gene Sequence:
>Vu_36903(+)
ATGGCGACCAAAGATTCTCCTATGGAACTGTACGAAATCTCTACGGAATCCGATGGATCCGACTCCGATTCCGACTGGGAGGACTCGGGAGAAGACCCCGACTACGACGCGCTTGAAGAAAGTCATAGCAAATTCTCAAACCTCTCACTTAAGCACAAGGCAAAAGCGCGGTAAAATCATGAACCGATTGCACTCCATTGTTTAAAATTGAACTTTTAAGCTTTATTTGGTCGTAGCTTGGTGTATCAGCTTTATCGAGGAGAAGGGTCGAGGTGAGGAAGTGTTGGTGGTCACTGCATCTGTAAATGATGGAGAGAATTTTGGGAAAGTTCAAAAGTTAATCGAAGGTTAATCCTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTCATTTTGGGTTTTACTATGAAGATTTTAACAATCGTTAGCTACTCTTTTCAAATCTTTCTTTTAAACCCTTCGTGTTCTTATGTAGAAGTGGAAATGGAAATAAACATGATGCGTGTTTTTTGCAGTGTTTACGTTTTTCTATTGAACATTTTCATTTGTCATTTGTTTTGGCTGGCAGAGGGATTGTTGGAGAAATTGAAAGTGGATGAATGCAAGTTGTATTTGAGGAAGAATGGTCTGAGGCTAACTGGAAACAAGGACACACTTATAGAACGCATAAGGGAGCACTTGGAGTAATTGACGTTTTCTGTGAAACACTTCAACCAGCAGTTTTTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAGTTGTATGAATTCTTTAATTGTATGATTTTCAGGATTTTAAATGGTGGGGAGAAGAAGTATCCGTCTTCTAGCTTTGTGTTTAATTGTAAAGGTGGGTTCTTGTGATTTTTTAAATATGCTGTTTTAATGAAGCATTTCCAAAAGCTATGAGATTACTTGTTCGGATCAACATAATATGTAAACTGATTCATCGTGTTCCTCATAAGTTTGAAAGGATTATTGTGATAATTCGAACCACAAGAATATTTGGAGTTCAGTTGTTTTTTTTTCCAACATTTTGTTTCTAAGACAAAGTTTTAATTAAGTACTCTGTTTTTGAAATCTAATAATATTAAGCATTCACCTGTATCCCTATTGCTAATATATTAAATATATTTCTTGTTTGTATCATTTACTTTCCTGATTTCTATATCTATTTAACAGTTTCTGCAGTTAGGTACATCCTCTAGATATGCGATCATCGTCTTTTAGTTTATGTGGCCTCAAACTCTGTTGGTCTAATTTTATTTTATCATCCATATGCTTCAGAACCTGAAAATACTTTGGCTTGTGCAGGTGATGCATGCACTGGTGATGTAGTTTTGTTTGAGCAAAATGTCTATGAAATGTAAGCTGCTTTTTTATATATTTTTTTCTATCTCAATTCATTTTAAATGGAAAAGACCTTACATGCTATATTTTATACACTGAATCATTTTGGAGGGCGTACATATATGCATAAAGATTGACAAACACAGTATTTTTATGCTTACTGCTACTAATATACATGTCATTGGATATACTGTTCAGAGATGACAGATTAATGATATTGGTGAAGTTCAATTCTAAATTACTGCCATCTTCCAGTTTCTTTATAAGATTTGGTTTTCTCAGGTTTAACATCGCATCCAGAAGTGCTAGTGGTCCACCTTGTGGCAAAAGGATTGTTGCAGGCCGCATAGTGAAAGAAAGCTATGGTGCTGCCAAACAACAGCATACATTTACGGTGAGAATAAATTTAGATAGTTTTCTTTGATGGATACTAACATTACGGCAAAGTATGTTTCTCTTACACAAGGGTACTGGTCACTGGTCTATCAGACTACAGAAAATCTTTAGAGCTATGGTTTCCTTTTCTTGGAGTATATTTTTAAATACCAATGAAGATGCATATTATCTCTCCTTGGATAGCAGGATAGTTTAAGCTGCTATCATTATGATTTTCCAGTAACAATATGCTTTGTACTTATCCTTTTCATAAATAGATTGAAGTGCTCTGGAGTAAAGGAGAAAAGCCTCTCCCTCCCCTTTACCCCCTACTGATTAAGGGTCGAAACCTTTACAGGCTGAAGACTTTGAGACAGGTTCCTCATTTGCTACCATCTCCTCATTTCCCTGAGAAAGGTTCCTTAAATGATTAATATGTTCTGTGTCCCTAATATTAGAAATGGGAAGATGAAGCAGAAAGGCAAAAAATATTGATGGAAAAACACTCAAGGGGATCTCTTGCTAGGGCAGATAGAGAAGAAAGGATTCAAGAAAAGGAGAAGAGGAAACATACCAAGGAAAATAGGTACTTCATTTCAGATTTAAAGTATTTTGTCTTCTACACTGCCACTGTTAAGTGTACTAACTACTTATGATTACAAAATAATTTCATGTACTTTCTGCGTTATATGTTTAGGGTCTCCAAAAAGGAAGCAAGGAACCAACGTCAATCAAATTCACACGTTACAAGGCCACAATATCAACCTCAAGGAACAAATGTAGTCATTAATCCAGAAAACCCTGAATTTCCATCTCGAAATTCAGTTTTATCTGTCAATATGATGAAAGAAAGATACTGTATTTTAAATAATTCAGCAGCAACTTTTGGAGGAACATCATTTGCTGTTCACAGTATGCATAGAAATCACACAAGTGACTTTAGGAATACTTTTGATATTGGTCGTGTGCGAGGAGCAGAAACTGGTGCAAACTATTATGCAGACCCCCATTTCAGAGAAAACCTCCCTAGATTTGTGAACTGCCACCCTAACATGGCTGAAATGGGCACTCATCATAGAATACCTTTGGCAAATGCAAACCATTCTCACCCATTTATGGCCCCCAATAGAGAAAGCTTTAAGATAAATCAAGTGTGCAGACATTATTCCCGTGGAAGGTGCTATTTTGGGGACAAATGCAAATTCTTACATGATCTTAGAGACAAAGGGAATGCATGA

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