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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36874 LG11 30048460 30051388 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 62-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 30050415 downstream_gene_variant
C/A 30050918 synonymous_variant p.Leu298Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36874.1
MATKDSPMELYEISTESDGSDSGSDWEDSGEDPDYDALEESHSKFSNLSLKHKAKARFIEEKGRGEEVLVVTASVNDGENFGKVQKLIEEGLLEKLKVDECKLYLRKNGLRLTGNKDTLIERIREHLEILNGGEKKYPSSSFVFNCKGDACTGDVVLFEQNVYEMFNIASRSASGPPCGKRIVAGRIVKESYGAAKQQHTFTIEVLWSKGEKPLPPLYPLLIKGRNLYRLKTLRQKWEDEAERQKILMEKHSRGSLARADREERIQEKEKRKHTKENRVSKKEARNQRQSNSHVTRPQYQPQGTNVVINPENPEFPSRNSVLSVNMMKERYCILNNSAATFGGTSFAVHSMHRNHTSDFRNTFDIGRVRGAETGANYYADPHFRENLPRFVNCHPNMAEMGTHHRIPLANANHSHPFMAPNRESFKINQVCRHYSRGRCYFGDKCKFLHDLRDKGNA*


CDS Sequence:
>Vu_36874.1
ATGGCGACCAAAGATTCTCCTATGGAACTGTACGAAATCTCTACGGAATCCGATGGATCCGACTCCGGTTCCGACTGGGAGGACTCGGGAGAAGACCCCGACTACGACGCGCTTGAAGAAAGTCATAGCAAATTCTCAAACCTCTCACTTAAGCACAAGGCAAAAGCGCGCTTTATCGAGGAGAAGGGTCGAGGTGAGGAAGTGTTGGTGGTCACTGCATCTGTAAATGATGGAGAGAATTTTGGGAAAGTTCAAAAGTTAATCGAAGAGGGATTGTTGGAGAAATTGAAAGTGGATGAATGCAAGTTGTATTTGAGGAAGAATGGTCTGAGGCTAACTGGAAACAAGGACACACTTATAGAACGCATAAGGGAGCACTTGGAGATTTTAAATGGTGGGGAGAAGAAGTATCCGTCTTCTAGCTTTGTGTTTAATTGTAAAGGTGATGCATGCACTGGTGATGTAGTTTTGTTTGAGCAAAATGTCTATGAAATGTTTAACATCGCATCCAGAAGTGCTAGTGGTCCACCTTGTGGCAAAAGGATTGTTGCAGGCCGCATAGTGAAAGAAAGCTATGGTGCTGCCAAACAACAGCATACATTTACGATTGAAGTGCTCTGGAGTAAAGGAGAAAAGCCTCTCCCTCCCCTTTACCCCCTACTGATTAAGGGTCGAAACCTTTACAGGCTGAAGACTTTGAGACAGAAATGGGAAGATGAAGCAGAAAGGCAAAAAATATTGATGGAAAAACACTCAAGGGGATCTCTTGCTAGGGCAGATAGAGAAGAAAGGATTCAAGAAAAGGAGAAGAGGAAACATACCAAGGAAAATAGGGTCTCCAAAAAGGAAGCAAGGAACCAACGTCAATCAAATTCACACGTTACAAGGCCACAATATCAACCTCAAGGAACAAATGTAGTCATTAATCCAGAAAACCCTGAATTTCCATCTCGAAATTCAGTTTTATCTGTCAATATGATGAAAGAAAGATACTGTATTTTAAATAATTCAGCAGCAACTTTTGGAGGAACATCATTTGCTGTTCACAGTATGCATAGAAATCACACAAGTGACTTTAGGAATACTTTTGATATTGGTCGTGTGCGAGGAGCAGAAACTGGTGCAAACTATTATGCAGACCCCCATTTCAGAGAAAACCTCCCTAGATTTGTGAACTGCCACCCTAACATGGCTGAAATGGGCACTCATCATAGAATACCTTTGGCAAATGCAAACCATTCTCACCCATTTATGGCCCCCAATAGAGAAAGCTTTAAGATAAATCAAGTGTGCAGACATTATTCCCGTGGAAGGTGCTATTTTGGGGACAAATGCAAATTCTTACATGATCTTAGAGACAAAGGGAATGCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_36874::LG11:30046460-30048460(+)
GCACATCTTTCTGCCTTATCAATGACCCCAATTGGCTACTGCAACAACTGCGATGGTCGAACAACGACAGCAGTCTATTGTTGCAGCGGAAACGGATCTCCCAAGATCGGGAGTTCTAATACCAACTTAAAAAAGAGAATGATTTTATTATTTTCATTCATGTTAATTAATTACATTCTCTTATCTCTATTTGTATCAGTCTAATCTTCTAAAAAAGAGAAATAAAGAAACAAAATAATCTAAAAAATCATATACATGTTTTCTCTAATTTTATAAATATTTTCTCTAATAGAATATTTTATAAATTTTTCTTCTAATTACAACATTTTTCAAATCACATTGTATCACGTATTTTAATTATATTTAGTTTTATTTATTTTCTAGTATTTCACAACAAATCAAATTTGAATTCCCTAGAGTTGAAAAACAAGCGTGGAAAGAATTTAAGACATATTCAGTTTTAGTTCTTTGTCTAAGTTCTTAGATAAGAACTCAATTCTTATTTAATTTTTGTCTTGGAGAAAATTAGATGATATCTGTTTGTAAAATTCATTATTTTACAATAATGTTGAGAAACTTGGTTTACAGTAGAAACAAATGACAAAGAATGAAAAGAAAACAGATTTTAAGAAAAAAAAAATGAATGATGATTATAAGGGAGAAGAGCAAAGAAGTGAAAATTGGGATGAGTGATACCAGTAAATTTTAATTTATTTCAGTTTATGTTAAAAAATAAAATTAAAATATAATATTATAAAATTTATTAAAAATGAAATGACAACTAAAATTACATTTAAATATTAGAAAAAACAATGTGGAAAATTTGTAAGCTATACATCACGACAATAGATAAAAAAAGTTAATGATTCAAAATTTTAATTAATATACTTTTATTATTTAATATATGACACTAACTTGTTTACTGTTTAACATTTGATGCAGTTTCTGTAAAGAGGATCAAATCAATCCTTACTTTACAAAAATATCAATGTAATAAATAATATGATAGATAAAAAAATTTGAAAATGTCAACCAAATTTTTTTCTTAACGCATTGTACATACGGTCAAGAATTATTTATTTATTTATTTATATAATATATGGTTTTCCTGTTTTTTTTCTCCACTTTTATTCTAACTTAATTAGTATGCATTGATAAAAAAAAAATATTCCATAGTCAAATTTTAAAATGTTATGTATTTTAAATATGAAAATAAAGTTATTTCACCCCCATTACCATTATCTTTGACTATTTTTATAAAGATAAAATGATTTTGTCAAAAGTTAACTTTTGTATTTCCAAAACAAAGAGAGAGAATGGAAGAGAAACAGTAATGTCAAAAAATCATAAAAAAATGTGGTGTCAAAATGTCAGTATCTTAAAAGGAATTATCCTTTTTGTGTTTACCTTTTTTTTCATTTTTAATTACCATTTTATTTAAATTTGACTGATTTTTTAAATTTTATTTTTTTAAAATTTTAAATATTTTTTAAAATTAAATAAATAAAAATAATCTATAAAATAAATAAAACTATTTATAATTAAATTATCAAAAAATATTTATATTTTTTTTATGATTATAATTTTATTATTTTCTATAAAAAAAAGTGAATACATGTGTGTGTTTTGACTTGTATATATATACCCAATTCCTTCTTGTTTTTATAATTAAAAAATCAATTTAAGTAAAAAACGTAAATTGATGTGGTTATTTGTTTTTATGTAGAAGGGACCTAAAGAAAACCAAGTGAATAATTCTGAAGATAAAAGAAATAAACTATAAACTTCAATAGATACTTTTTTAAGGAAATGAAAGAGGTATTATATATTGTATTGTTTTCTTTTAATTATTCTTTATGATACTATTAATTATTAATAATAACAACTATTTATTTATTTGTTTTTGAATCCCACACATCGAAAACCTTGCTTTTGCAACGGTCAAGAGCTTCTTCAACTCCCTTTGAGTTGCTGAAACTCTCAACACTTTCATTCACCAA


Gene Sequence:
>Vu_36874(+)
ATGGCGACCAAAGATTCTCCTATGGAACTGTACGAAATCTCTACGGAATCCGATGGATCCGACTCCGGTTCCGACTGGGAGGACTCGGGAGAAGACCCCGACTACGACGCGCTTGAAGAAAGTCATAGCAAATTCTCAAACCTCTCACTTAAGCACAAGGCAAAAGCGCGGTAAAATCATGAACCGATTGCACTCCATTGTTTAAAATTGAACTTTTAAGCTTTATTTGGTCGTAGCTTGGTGTATCAGCTTTATCGAGGAGAAGGGTCGAGGTGAGGAAGTGTTGGTGGTCACTGCATCTGTAAATGATGGAGAGAATTTTGGGAAAGTTCAAAAGTTAATCGAAGGTTAATCCTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTCATTTTGGGTTTTACTATGAAGATTTTAACAATCGTTAGCTACTCTTTTCAAATCTTTCTTTTAAACCCTTCGTGTTCTTATGTAGAAGTGGAAATGGAAATAAACATGATGCGTGTTTTTTGCAGTGTTTACGTTTTTCTATTGAACATTTTCATTTGTCATTTGTTTTGGCTGGCAGAGGGATTGTTGGAGAAATTGAAAGTGGATGAATGCAAGTTGTATTTGAGGAAGAATGGTCTGAGGCTAACTGGAAACAAGGACACACTTATAGAACGCATAAGGGAGCACTTGGAGTAATTGACGTTTTCTGTGAAACACTTCAACCAGCAGTTTTTCAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTTGTATGAATTCTTTAATTGTATGATTTTCAGGATTTTAAATGGTGGGGAGAAGAAGTATCCGTCTTCTAGCTTTGTGTTTAATTGTAAAGGTGGGTTCTTGTGATTTTTTAAATATGCTGTTTTAATGAAGCATTTCCAAAAGCTATGAGATTACTTGTTCGGATCAACATAATATGTAAACTGATTCATCGTGTTCCTCATAAGTTTGAAAGGATTATTGTGATAATTCGAACCACAAGAATATTTGGAGTTCAGTTGTTTTTTTTTCCAACATTTTGTTTCTAAGACAAAGTTTTAATTAAGTACTCTGTTTTTGAAATCTAATAATATTAAGCATTCACCTGTATCCCTATTGCTAATATATTAAATATATTTCTTGTTTGTATCATTTACTTTCCTGATTTCTATATCTATTTAACAGTTTCTGCAGTTAGGTACATCCTCTAGATATGCGATCATCGTCTTTTAGTTTATGTGGCCTCAAACTCTGTTGGTCTAATTTTATTTTATCATCCATATGCTTCAGAACCTGAAAATACTTTGGCTTGTGCAGGTGATGCATGCACTGGTGATGTAGTTTTGTTTGAGCAAAATGTCTATGAAATGTAAGCTGCTTTTTTATATATTTTTTTCTATCTCAATTCATTTTAAATGGAAAAGACCTTACATGCTATATTTTATACACTGAAACATTTTGGAGGGCGTACATATATGCATAAAGATTGACAAACACAGTATTTTTATGCTTACTGCTACTAATATACATGTCATTGGATATACTGTTCAGAGATGACAGATTAATGATATTGGTGAAGTTCAATTCTAAATTACTGCCATCTTCCAGTTTCTTTATAAGATTTGGTTTTCTCAGGTTTAACATCGCATCCAGAAGTGCTAGTGGTCCACCTTGTGGCAAAAGGATTGTTGCAGGCCGCATAGTGAAAGAAAGCTATGGTGCTGCCAAACAACAGCATACATTTACGGTGAGAATAAATTTAGATAGTTTTCTTTGATGGATACTAACATTACGGCAAAGTATGTTTCTCTTACACAAGGGTACTGGTCACTGGTCTATCAGACTACAGAAAATTTATGGTTTCCTTTTCTTGGAGTATATTTTTAAATACCAATGAAGATGCATATTATCTCTCCTTGGATAGCAGGATAGTTTAAGCTGCTATCATTATGATTTTCCAGTAACAATATGCTTTGTACTTATCCTGTTCATAAATAGATTGAAGTGCTCTGGAGTAAAGGAGAAAAGCCTCTCCCTCCCCTTTACCCCCTACTGATTAAGGGTCGAAACCTTTACAGGCTGAAGACTTTGAGACAGGTTCCTCATTTGCTACCATCTCCTCATTTCCCTTTGAGAAAGGTTCCTTAAATGATTAATATGTTCTGTGTCCCTAATATTAGAAATGGGAAGATGAAGCAGAAAGGCAAAAAATATTGATGGAAAAACACTCAAGGGGATCTCTTGCTAGGGCAGATAGAGAAGAAAGGATTCAAGAAAAGGAGAAGAGGAAACATACCAAGGAAAATAGGTACTTCATTTCAGATTTAAAGTATTTTGTCTTCTACACTGCCACTGTTAAGTGTACTAACTACTTATGATTACAAAATAATTTTATGTACTTTCTGCGTTATATGTTTAGGGTCTCCAAAAAGGAAGCAAGGAACCAACGTCAATCAAATTCACACGTTACAAGGCCACAATATCAACCTCAAGGAACAAATGTAGTCATTAATCCAGAAAACCCTGAATTTCCATCTCGAAATTCAGTTTTATCTGTCAATATGATGAAAGAAAGATACTGTATTTTAAATAATTCAGCAGCAACTTTTGGAGGAACATCATTTGCTGTTCACAGTATGCATAGAAATCACACAAGTGACTTTAGGAATACTTTTGATATTGGTCGTGTGCGAGGAGCAGAAACTGGTGCAAACTATTATGCAGACCCCCATTTCAGAGAAAACCTCCCTAGATTTGTGAACTGCCACCCTAACATGGCTGAAATGGGCACTCATCATAGAATACCTTTGGCAAATGCAAACCATTCTCACCCATTTATGGCCCCCAATAGAGAAAGCTTTAAGATAAATCAAGTGTGCAGACATTATTCCCGTGGAAGGTGCTATTTTGGGGACAAATGCAAATTCTTACATGATCTTAGAGACAAAGGGAATGCATGA

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