Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36797 LG11 29281209 29289441 PREDICTED: protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 29281210 5_prime_UTR_variant
A/T,* 29281219 5_prime_UTR_variant
G/T 29281232 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 29281754 intron_variant
A/T 29282182 intron_variant
G/A 29282450 intron_variant
G/C 29282523 intron_variant
C/A 29282524 intron_variant
A/T 29282527 intron_variant
C/A 29282617 intron_variant
T/A 29282978 intron_variant
A/T 29283675 intron_variant
T/C 29283679 intron_variant
T/A 29283866 intron_variant
A/T 29283867 intron_variant
T/A 29284068 intron_variant
A/G 29284073 intron_variant
C/T 29284085 intron_variant
C/G 29284086 intron_variant
T/A 29284435 intron_variant
C/T 29284445 intron_variant
T/A 29284457 intron_variant
T/A 29284587 intron_variant
C/A 29284865 synonymous_variant p.Pro243Pro
T/A 29284874 synonymous_variant p.Pro246Pro
C/T 29284882 missense_variant p.Thr249Ile
G/A 29285151 intron_variant
T/G 29285650 downstream_gene_variant
C/A 29285657 downstream_gene_variant
G/T 29285837 missense_variant p.Lys388Asn
T/A 29285849 synonymous_variant p.Ala392Ala
T/A 29286058 downstream_gene_variant
C/A 29286065 downstream_gene_variant
C/T 29286066 downstream_gene_variant
A/C 29286071 downstream_gene_variant
C/T 29286078 downstream_gene_variant
A/T 29286217 downstream_gene_variant
T/C 29286601 downstream_gene_variant
A/C 29286910 downstream_gene_variant
T/C 29286997 downstream_gene_variant
G/T 29287200 downstream_gene_variant
T/C 29287553 downstream_gene_variant
T/G 29288232 missense_variant p.Ser577Ala
C/A 29288245 missense_variant p.Ala581Asp
C/A 29288249 synonymous_variant p.Pro582Pro
T/C 29288540 synonymous_variant p.Leu646Leu
A/G 29288542 synonymous_variant p.Leu646Leu
G/A 29288543 missense_variant p.Glu647Lys
A/G 29288548 synonymous_variant p.Gly648Gly
C/T 29288554 synonymous_variant p.Tyr650Tyr
G/C 29288560 synonymous_variant p.Val652Val
G/A 29288563 synonymous_variant p.Lys653Lys
T/A 29288569 synonymous_variant p.Leu655Leu
T/A 29288572 synonymous_variant p.Ser656Ser
A/T 29288575 synonymous_variant p.Arg657Arg
A/T 29288581 synonymous_variant p.Ala659Ala
G/A 29288759 downstream_gene_variant
A/G 29288960 downstream_gene_variant
A/G 29288965 downstream_gene_variant
A/T 29289057 missense_variant p.Lys694Met
G/T 29289098 missense_variant p.Gly708Trp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36797.1
MVLDPRLVLLVFISTCILAIDGDTDPNDAGALRAMFQSMNSPSQLNWNGADPCGQSWQGITCSGNRVTEIKLPGRSLSGSLGYQLESLSSVTNLDMSNNNLGGSIPYQLPPSLQYLNLANNNFNGQIPYSLSQKASLIVLNLGHNQLQQALNVDFQKLSSLSTLDLSFNSFTGDLPQTLSSLSSISTMYLQNNQFTGTINVLANLPLETLNVGNNHFTGWIPQQLNNINLQKDGNDWSSGPAPPPPPGTPPVVPRNRNHKSGGHTPSDAGSSDDGGKKSGIGGGGIAGIVISILVVAAIVAFFLVKKRSKKSSGDIEKLDNQPLAPHTSHHHEMNALQTSSVTDLNTFDTPTAPISLKPPPFDRHKSFDEDEFSVKPATVIKPTTVKKNVTAPTNVKSYSVADLQIATGSFSVDQLIGEGSFGRVYRAQFDDGKVLAVKKIDSSVLPNDLSDDFVELVSSISHLHHPNVTELVGYCSEHGQHLLVYEFHKNGSLHDFLHLPDDYSKPLIWNSRVKIALGIARALEYLHEVCSPSVVHKNIKSANILLDTDLNPHLSDSGLASYIPNANQVLNNNSGSGYEAPEVVMSGQYTLKSDVFSFGVIMLELLSGRKPFDSSRPRSEQGLVRWATPQLHDIDALAKMVDPALEGLYPVKSLSRFADVIALCVQPEPEFRPPMSEVVQALVRLVQRTNMSKRTTFVTDQGVSNRGGDNQESQDM*


CDS Sequence:
>Vu_36797.1
ATGGTGTTGGATCCAAGGCTGGTGCTGTTAGTGTTCATCAGCACCTGCATTTTGGCCATTGATGGTGACACAGATCCAAATGACGCTGGTGCTCTGAGGGCTATGTTTCAAAGTATGAACTCACCATCTCAGCTAAATTGGAATGGGGCAGATCCTTGTGGACAGTCTTGGCAAGGCATCACTTGCTCTGGCAATCGAGTCACAGAGATTAAGTTACCTGGTCGTTCACTTTCTGGATCTTTGGGTTACCAGCTAGAATCCTTGTCATCGGTTACAAACCTAGACATGAGTAATAATAATCTTGGTGGCTCCATACCGTACCAACTTCCTCCTAGTCTGCAGTACTTAAATCTTGCCAATAATAATTTCAATGGGCAGATCCCTTATTCTCTTTCTCAAAAGGCTTCGCTTATTGTCCTGAATCTCGGTCACAATCAGCTCCAGCAAGCACTTAATGTTGATTTCCAAAAGCTTTCTTCCCTCTCTACATTGGATCTCTCATTCAATTCTTTTACAGGTGACCTGCCTCAGACTTTGAGCTCACTTTCTAGCATAAGCACCATGTATCTGCAAAACAACCAGTTTACAGGCACCATTAATGTCCTTGCTAATCTTCCTCTGGAAACTCTGAATGTGGGAAATAATCATTTTACAGGCTGGATACCACAACAATTGAATAACATAAACCTGCAAAAGGATGGTAATGATTGGAGCTCAGGACCTGCACCCCCACCTCCTCCTGGGACACCTCCAGTAGTACCAAGAAATCGAAATCATAAATCTGGGGGACATACCCCATCAGATGCTGGCTCAAGTGACGATGGAGGCAAAAAATCTGGTATTGGAGGTGGTGGCATTGCTGGAATAGTAATCTCCATCCTGGTTGTTGCGGCAATAGTGGCATTCTTTCTGGTGAAGAAAAGATCTAAAAAGTCGTCTGGTGATATTGAAAAGCTTGACAATCAACCCTTGGCTCCTCATACTTCACATCATCATGAAATGAATGCCCTGCAAACTTCATCTGTAACTGACTTGAATACATTTGATACACCTACGGCCCCGATAAGTCTTAAACCTCCACCTTTTGATCGCCATAAATCATTTGACGAGGATGAGTTTTCAGTGAAGCCCGCCACTGTCATTAAGCCCACTACAGTGAAGAAGAACGTCACAGCTCCTACAAATGTAAAATCTTATTCTGTAGCTGACCTGCAGATTGCTACTGGAAGCTTCAGTGTGGATCAACTTATTGGTGAGGGGTCTTTTGGACGTGTATATCGAGCTCAATTTGATGATGGAAAGGTTCTTGCTGTTAAGAAGATAGATTCCTCTGTCCTTCCTAATGATTTGTCTGATGATTTTGTGGAACTGGTTTCAAGCATATCCCATTTGCACCATCCCAATGTGACAGAGCTTGTAGGTTATTGTTCAGAGCATGGACAGCACTTACTAGTCTACGAGTTTCATAAAAACGGATCACTGCATGACTTCCTCCACCTACCTGACGACTATAGTAAACCATTGATATGGAATTCACGCGTGAAGATTGCCTTGGGGATTGCACGTGCTTTAGAGTATCTTCATGAAGTTTGTTCACCATCTGTTGTTCATAAGAATATAAAGTCAGCCAACATATTGCTTGATACAGATCTCAATCCTCATCTTTCTGACAGTGGATTGGCAAGCTATATTCCAAATGCAAATCAGGTATTGAACAATAATTCTGGATCTGGGTATGAAGCTCCCGAAGTTGTCATGTCTGGCCAATACACTCTTAAGAGTGATGTCTTTAGTTTTGGGGTTATCATGTTGGAACTTCTTAGTGGACGGAAACCATTTGATAGCTCAAGGCCAAGGTCTGAGCAGGGTTTGGTTCGATGGGCAACACCTCAACTCCATGATATCGATGCTCTGGCTAAAATGGTTGATCCTGCATTAGAAGGACTATACCCTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTGCAGATGTTATTGCTCTTTGTGTTCAGCCGGAGCCGGAATTCCGACCACCTATGTCAGAAGTGGTTCAAGCGCTGGTTCGATTAGTGCAGCGAACTAACATGAGTAAGAGGACGACGTTTGTAACTGATCAAGGAGTATCCAACCGAGGGGGAGATAACCAAGAATCACAAGACATGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_36797::LG11:29279209-29281209(+)
TAATTGTTTTTAATTTATAAACTTCTAAAACAAAACTTTATCCAAAAATACTTTTATAATATATATCGCGAAATGCTTATTAATTTAATTAGTTTACAACAGTGTAGAAGTTGTAATTTTTTTTTTTTTGGTAAATGTCTCGTTGTATTTGTTGTTTGTTGGCGGTGCTAATAGTAATTAAATTTCTCTTGTTTGAGTTATCATAAAAGCCACGTGTGCCTCTTCTCGTTTTTATATGTATTTTTTGTCAAATTTATTGCGACTTAATCGAGTTGTTTTCAACCAACAAACTATTAATTTATCTATTTATGTAATAATAAAAGAGAAGTACACTTTTACGAGAAATGACTCACACCGTTTAAAACCAATTTTATTTTAAAGTTACGGTTATAGTTTAATCTTAGGTATATTGTCAACGAAAGGAAAGTAACTATATTTATTGCAAATTTAAAATTTTATTTTAACTCTAATAGATTAGACTATTAACTTGAACATCAATTTATCTTTAACATGTATCTATTTATGTAATTTGAAGTTTAGACATGACATAGTGAAAAAAAAATTAACTAAGAACATTTAAGATAATAAAAACAGTGTGAAAAAATGTTTTACGATGACCATAGATTTTACACTCGAAACAAATATAGATAAAAAAATAAATAAAAATATATATTATTAGTTCAATATATTATTTTAAGATTTTTTTGTTTTTGTTTTTATAAATCTATTCTTTTAATTAATTATTGTTTTCGTTTTAATAATTTTTTAATTATATTAATAATAGTCTTTTAGTTAGATGTAGATAAACATCTGGTATATATCAGAACGATATAAAATTAAAATAAATTTATTATAAACAAGGAAACCTGATGGGTATTGTTTATTTATAGGATACACATATTGGATATATATTTGTGTTTTCTTTTATTTACTTTTATCTCCTTTTTGTAAATTAATTATAACTCTTCTTTTAATTGCATGTTTCTTTAAAGGTATGTTTGACTATATTATAATTGTTCGATGTAGAAATTTACTGGATTGTTTATAAACCTTTGTGAGACTCAGTCCTTTTTTTATCATGTGATAACTAATAGCTGTTTCTATTTTATTTTATTTTATCTTAAAAAATGTATTAACTCTACCTTTTATTGCATTTATATAAAATAAAATTTATTATAATTTTACTGTTTTCTTAAAGTACTTTCATATTGCATTGTTTATTTTGAAAAATCCGTTATTTATTGTTATTTTAGCATTACATTTCAAAATATCATAATCAATTAATCATGATAATGCCCATGTTTAATGAAATTGGTATGTCAATAAAAATAATAAAAGTAAGATATAAATCAAAATATTTATTTATTTTTTTGCAAACTTTATGGAGAGTATTTTAAGTTATAATATAATAGTATAGTAGAATTTACTATAAAAAATAATTATTTTATTCAAACACGATTAGAGATCAAAATCAATTAAAATTATAATTACTGAAAACATTTTTTGTTAAATAAAATTGAAATTTATAAAAAACAAAAAACATTTTTGTATCATTTCGTGCTTAGCAGCTATTTCGGCATATGATTTTCCTAAATACTAATAATTTAGCAAGTTACTTTAAAAATATTCAGTTTTTATGAATTAGTCATTCAATGTGATCTAAAAAATAGAAAAAAAAATTAAGCAAAAAAAAAGACAGAGGAGAAATAAACGAGTTCTTTAATTATTTTTACCAAATAATACTCTTAATTCAATAAAGGAAATGAGAAAAGATATCACAGGTTAATTAAAAAGAGAGGACAAAGATTAACAACGGAGTAAAATATTTATTTTTATTTATTGAAAAATAAGTTTGTAATAATTTATTTCCTTAATTAGACATGACGGCAAGGAAGGTAATAAATAATTTCCAAAATAATGTGATAAGGCGATTCGTGCTTGCCAGCTTTACTGGGCAATGGTGGCAACATATATAGCCATCACTAATAATTAATTTTGCG


Gene Sequence:
>Vu_36797(+)
GAAAAATTAAAAATTGGCAAAAAGGGGTTCATTGCACATCCTTTTTGCTTTCTGGGTTGAAAGAATTTTCGAGAAAAGATTGATTCACAGGAAAGATGGTGTTGGATCCAAGGCTGGTGCTGTTAGTGTTCATCAGCACCTGCATTTTGGCCATTGATGGTGACACAGATCCAAATGACGGTTAGTGTGTGCTCTGATCTCACTCTCAGCTTTGCAATTTTCATCACTCCCTCTGTGTGTTGCATTATGCTACTGTTAGTTACGACTGCTTCTTTCTCTGCTTTCTTCCCTTATTGCTGAGATGTTTTTATTTGATTGTCTATCATTTTGTATGGACAGCTCTGCCAATTCATCATCAGATTAGTTTGATTTGGCTTATGTTTTGTGTCTGGTTTTATTGGTTTTTAAACCATTGTGAAGTTTTCCAGCTGATCTCTTGAGTGACACTTGTTTACTTTAGTTGCCCTGAATGACACTGGTACTCAATGATTTCAGCAAATGGAAGGACTATTTTTTTGGGTACTTTTTCTCCTTTTGTTTTCAGCGATGTTTGAGCTGTGAGTTCTGTCTGTATGTAGCCGGTTGATGCAATTCTCACTTCTTCACTGTAGAGAATGTTGTCAATGAATATGGACTGATTGAACATCTGGAATTTGGTGCAACAATACGGTTCCTGTTTTCTTATATTTTCTTCTTATTTTTACAGTCGAACGAATTTCCAAGTTTTTAGAAAAAGGAAAAACAAGTTAGAATAATATCCACTCATCCTTGTGACAGCTGAGTGGGACCCTTAATCTTCGACTTCAATCCGCTACCATGTACTTGTCTTCGATAATTTGTGTGTCGTTTGTTTGATGTTCAGATTTTTCCGTTTTTTATTGTGATATCAAATGCATTGAAACCTTGAAATCTATGAGAAGATTGAGCTACACATATTGCAGTTCAATGTTGTGTCTGATCTCCCTACGGGGGTATGTAAAAATTTTAATAAAGTACTTAGACCTCGTGTCACTGATATCTTGGGCTGTTAAGCTCACCACTCTGTGGCTGCTCTCCATTTGTAATAGGTTTCAGTGAGATTTGAATTATTACATATTGATTGAAACAATTCCACCGGCATGCTACATTCTATCTTGAGCTGTATGGAATATCTGATATACCAATCACTAAAGTCTCGTTGTCTCCAGCTCTCAATGTAGGATTTGAGAATTCGTGCATGGACTAAATAAGCTTGTTTTACTGGTTTTTTCATCGTATTATTCTTTTCTGATGCTATCCTATAATATATTTATTCTTCTTTCGTTATCCACATCTGCGTACTTAACCAGCAACTTGCTCTGCTTCGTGACACTTAAAATATATAAATGTTTGCAAGGTGAACATATGATGTTTAAATTTCTACTAAACCCCCAATAATAAACTTTTGTAAATTTAAACATGTGATGGTTTAAAATCCTTTCATATTTACTCTGATTTGGTTGGTGGCTAGGTGATATATATGTGAATATATTTTCTTCATCTTCTCTGTAGTCAGTAATATTATTTTCTAGTGAACTCCCATTCACGCATTAATTTAATATGGTATCATGTATTTCGGCCCATCAGATTGCAGTGCATCATTTTAAGAATCCTCAATGAATCTGAGTTTCTTAATTATTACTTCTTTCTTGATGTTTAATGGATTAAAGTCAGCATCTCAAATAATCAATTCTTCAATGTGAACATTTTCTGAACTTGGGCTTTGAAGATTAATGATTTAATTTGTTACCTTATGCTTGTAAGTTCGAAGTGATATACTTGTAAATGCTATGATAATAGCTTCAATAGTTGGCAAGTACTTTATATCTTTAGATATGTAAAAAGGATGGTGGTGATTGATAAAGACACTAAATTAATAGAAATATATCATACAACTTTCTATTTAACATGTCTGGGGTTGGCAATTATCTTTTTCTGAATGTTTGATGCAGCTGGTGCTCTGAGGGCTATGTTTCAAAGTATGAACTCACCATCTCAGCTAAATTGGAATGGGGCAGATCCTTGTGGACAGTCTTGGCAAGGCATCACTTGCTCTGGCAATCGAGTCACAGAGATGTGAAGTCACAATCTTCTCCCTTTCACTTGATATGACTTGATTGTTATTGCTTTTGGTGCTGTGGCATCTGATTCATTATTTGGTTATTTTCACTTCGTTTCAGTAAGTTACCTGGTCGTTCACTTTCTGGATCTTTGGGTTACCAGCTAGAATCCTTGTCATCGGTTACAAACCTGTAAGTTATTCATCATTTAACTTGTTTTATATGTATCGTGGTTACTATTCTTGTGACCTTGTAAAATTCTGCAGAGACATGAGTAATAATAATCTTGGTGGCTCCATACCGTACCAACTTCCTCCTAGTCTGCAGTACTTGTATGTTTCTATTATCTTTTGCTACTTGTTTTGTTTTTTTGTTGTTTTTATTTTATAATTTTAATTTCTAACGTTCTTGTTGCTTTGGATGCAGAAATCTTGCCAATAATAATTTCAATGGGCAGATCCCTTATTCTCTTTCTCAAAAGGCTTCGCTTATTGTCCTGTGTGTAAACAATCTTGACTTCTTCTTGACATCTTATTGTATAAATCTCCTTCACAAGCAACTACATTTTTTCTAAGTTGATATTTTTAATGTAGGAATCTCGGTCACAATCAGCTCCAGCAAGCACTTAATGTTGATTTCCAAAAGCTTTCTTCCCTCTCTACATTGTGAGATTTCCTATTACTCCTGCACTTCAACTATGTAAAAGTATAAATGTCTATCAAGTTTATGTTAACCATAAAATAGTGATCTTTTTCTTTTTCATTCTGAGATTTTATGCTTTTTGCTATGGATTTTTTGCCCTGTTCATTTGATAATTTCACAATATTACTTTTGATCCCATTTTAGGACAATTTATGCTATTCTTCTGCAGAACAATTATCCCTATACACTGATTACACTATATTTCACATGTGCTTCTGTTAATTTAAAAACCCATGTTTTTCAAAAGTAAAAATTGAGGCTTTGTTTGTTTAATCTTCAAATTAAAGTATGCTAGAATTGCTTCAGTGACAATTCAGGGCCAGTTTATAATATCTATTGTTTGTTGCAGGGATCTCTCATTCAATTCTTTTACAGGTGACCTGCCTCAGACTTTGAGCTCACTTTCTAGCATAAGCACCATGTAAATGTCTGACTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTCCATTTTTCTGCTTACGTTTACACGGTATTGATTGCATTCTGAGTTGAGTTGTTTACTAATATGTAGGTATCTGCAAAACAACCAGTTTACAGGCACCATTAATGTCCTTGCTAATCTTCCTCTGGAAACTCTGTGTGTTTCTGTTTCATATATCTGCTTGGAATGCTCTTTCGTATATTTCTAAAGAAGTATCTTTTCGGTTTAATTTATGTTCTTAAAATTATTTCAGGAATGTGGGAAATAATCATTTTACAGGCTGGATACCACAACAATTGAATAACATAAACCTGCAGTAAGCATTGTCATTATCAGCACCTTTTCCCAAGAATAATTTTTTTTTCATAAATTCTATAAATCTTGAAAATGGTCAAATTTAATGACAGAAAGGATGGTAATGATTGGAGCTCAGGACCTGCACCCCCACCTCCTCCTGGGACACCTCCAGTAGTACCAAGAAATCGAAATCATAAATCTGGGGGACATACCCCATCAGATGCTGGCTCAAGTGACGATGGAGGCAAAAAATCTGGTATTGGAGGTGGTGGCATTGCTGGAATAGTAATCTCCATCCTGGTTGTTGCGGCAATAGTGGCATTCTTTCTGGTGAAGAAAAGATCTAAAAAGTCGTCTGGTGATATTGAAAAGCTTGACAATCAACCCTTGGCTCCTCATACTTCACATCATCATGGTCTGCATGTTATTCTTGTATGCTATTGAAAAATCATTTTTATTCTATTATATAAGGTCTCCCTTATTTTAGATCACTTGTATATATTATATTCATAGAATTTCAATTTTCTTAGGTTCATCCTTCATTCTAAAGCTACCTTCTCTATTGGCACTTGGCAGATATTCTTAAATATAAAGTACTTAATTCTGGTTTTGATATATGAATTTGGTGATTTAACCTATAGTGTTAGAAGATAATCTGTTTTTTAACTGTAGGCCAGTTGGTGGCATTTACTTCAACACCTTTTTCAGGGACCAACGCATGCTCGGCACCATGGATGTGATTAGACTAGAGAAAGCATATTTTTGTTATGATTAATTAGTTGAGCCAAACTGCAACCCCAATTAGAAAATGACTGGACTAACTACATTTTTCTTTCTCCTAGTGGATATGACTACTTTGTCTTAATGCTTTCAGTTTAAATTTTAGCTGCTAAGTCATTCCGCATTCATTATGTTCTGATTGAAATTGACATATTAATCTGTCATAATGCAGAAATGAATGCCCTGCAAACTTCATCTGTAACTGACTTGAATACATTTGATACACCTACGGCCCCGATAAGTCTTAAACCTCCACCTTTTGATCGCCATAAATCATTTGACGAGGATGAGTTTTCAGTGAAGCCCGCCACTGTCATTAAGCCCACTACAGTGAAGAAGAACGTCACAGCTCCTACAAATGTAAAATCTTATTCTGTAGCTGACCTGCAGATTGCTACTGGAAGCTTCAGTGTGGATCAACTTATTGGTGAGGGGTCTTTTGGACGTGTATATCGAGCTCAATTTGATGATGGAAAGGTATTCCTTACCTTTTTGTTTTGTACATATCCAATCCCAGAGGCAGAGATATATGATTCCTAAATAGCATCACCACGTTACATAATTTTCCTAGGAATGGCTCTATAAAAGCACGTGAATGTATGTCTTTTTGATGCATATAGAAATTCCTATGGTTTTACAAGTATAAAATAGAAAACGTCTGAGAAGTCCTGGTGCATGTATATGACACATGTACAACCAATATAGACCAC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