Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36694 LG11 27957006 27961222 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase WNK10 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 27957189 5_prime_UTR_variant
G/A 27957441 5_prime_UTR_variant
A/T 27957485 5_prime_UTR_variant
C/A 27958234 upstream_gene_variant
C/A 27958514 upstream_gene_variant
A/C 27958573 upstream_gene_variant
C/G 27958650 upstream_gene_variant
C/T 27958682 upstream_gene_variant
G/T 27958874 missense_variant p.Glu111Asp
G/A 27959189 missense_variant p.Gly187Ser
G/A 27959476 synonymous_variant p.Lys250Lys
G/A 27959562 upstream_gene_variant
C/T 27959596 synonymous_variant p.Ser260Ser
T/G 27960698 synonymous_variant p.Val582Val
G/A 27960861 missense_variant p.Asp637Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36694.1
MNSGAVLTLPPVCNAFGTREPQDFEDEFAEKDPTGRYTRYTEVLGRGAFKTVYRAFDEVDGIEVAWNQVKIDGLLHSVDDLAKLYSEVNLLKSLKHDNIIKFCDSWIDDKEKTVNMITELFTSGNLRQYRKKHKYVEMKAIKGWARQILHGLLYLHSHKPPIIHRDLKCDNIFVNGNQGEVKIGDLGLAIVMQQPTARSVIGTPEFMAPELYEESYTELVDIYSFGMCILEMVTFEYPYAECKNPAQIFKKVTSGIKPASLNKVSDPQIREFIEKCLVPASERLSAEELLKDPFLQVENSKDPVLYPLQPPRRTLRAYSFKSSSHSMDLDGDYKQFSMSICSESNQESPYCPVFEVQRANINNEFRLKGTKNDDNSVSLTLRIADTCAGRVRNIHFLFYLDSDTAVSVATEMVEHLELADHDVPFIAELIDYLIMKLLPWWNPSHDRWACGEINPNIDAQNFMGWPWASALPSLPSDLAIEEDGYSGIDTTPKEDFVAAENSLTESGDKATFEGDYHSQRSEASEVVVENASMKDDNCHYSSVDASSKCLSSRSISELDLGDEYFEDCKLQQENYSSGEEVVINEYPANSGSVLGTSTNVGSTRSSCSYVSSSVEEIDLELQFELAVIETHYQHWIDELNKMKLEALESTRRRWMAKKKLAVR*


CDS Sequence:
>Vu_36694.1
ATGAATTCTGGTGCTGTCTTGACACTGCCTCCCGTGTGCAATGCGTTCGGGACCAGGGAGCCTCAGGATTTTGAGGACGAGTTTGCGGAGAAAGATCCAACCGGGCGGTATACAAGGTATACTGAAGTCTTGGGAAGGGGTGCCTTCAAAACTGTTTATAGGGCCTTTGATGAAGTTGATGGAATTGAAGTTGCTTGGAATCAAGTTAAGATTGATGGCCTCTTGCATTCAGTAGATGATCTTGCGAAATTGTATTCTGAAGTTAATCTTTTGAAGTCTTTGAAACATGACAATATCATTAAGTTCTGTGATTCTTGGATTGATGATAAGGAGAAAACTGTTAACATGATTACTGAACTGTTCACATCTGGAAATTTAAGGCAATATCGCAAGAAGCATAAATATGTTGAAATGAAAGCTATAAAAGGTTGGGCCAGGCAGATTCTTCATGGCTTACTATATCTTCATAGTCACAAGCCACCCATTATTCATAGAGACTTGAAATGTGACAACATCTTTGTGAATGGAAACCAGGGTGAAGTTAAGATAGGGGATCTTGGTTTGGCAATTGTCATGCAACAACCTACCGCCCGAAGTGTTATTGGAACTCCTGAGTTTATGGCTCCAGAACTATATGAAGAGTCATACACAGAACTGGTTGACATCTATTCTTTTGGGATGTGCATATTGGAGATGGTCACTTTTGAGTATCCCTATGCCGAATGCAAAAATCCAGCTCAAATCTTTAAGAAAGTTACCTCAGGCATCAAACCTGCTTCCCTTAATAAGGTGAGTGATCCTCAAATTAGGGAGTTTATTGAGAAATGTTTGGTTCCAGCATCTGAGAGATTGTCAGCAGAGGAGCTTCTGAAAGATCCATTTCTACAAGTTGAGAATTCAAAGGATCCCGTCCTTTATCCTTTACAACCACCTAGAAGAACTCTGAGAGCGTACTCATTCAAGTCTAGTTCTCATTCTATGGACTTGGATGGTGACTACAAACAGTTTTCTATGAGTATCTGTTCCGAAAGCAACCAAGAAAGCCCATATTGTCCTGTTTTTGAGGTTCAGAGGGCAAATATTAACAATGAGTTTAGGTTGAAAGGGACTAAAAATGATGATAACTCGGTATCATTGACCTTGCGTATTGCTGATACATGTGCAGGTCGAGTGAGGAACATACATTTTCTGTTTTACCTTGATTCAGATACCGCAGTCTCTGTGGCCACAGAGATGGTTGAACATTTGGAGCTGGCAGATCACGATGTACCTTTCATAGCTGAGCTTATTGATTATTTGATAATGAAACTTCTCCCTTGGTGGAATCCTTCGCATGATCGTTGGGCATGTGGTGAAATAAATCCTAATATAGATGCCCAAAACTTCATGGGATGGCCATGGGCTTCTGCCCTACCAAGTCTTCCCTCTGATTTGGCTATTGAGGAGGATGGCTACTCTGGGATTGATACAACCCCCAAAGAAGATTTTGTGGCAGCCGAGAACAGCTTAACAGAAAGTGGTGATAAGGCTACTTTCGAGGGTGATTATCATTCACAAAGATCTGAAGCTTCTGAGGTAGTTGTTGAGAATGCTTCTATGAAAGATGACAATTGTCATTATTCCAGTGTTGATGCAAGCTCTAAGTGCTTAAGTAGTAGGTCCATCTCTGAACTTGATCTTGGGGATGAATATTTTGAGGACTGTAAATTGCAACAAGAAAATTATTCTTCTGGGGAAGAAGTTGTTATAAATGAATACCCAGCGAACTCGGGGTCAGTTCTTGGAACATCTACTAATGTTGGGAGCACAAGAAGTAGCTGTTCTTATGTGTCTTCATCAGTAGAGGAGATTGATCTTGAGCTACAGTTTGAACTTGCTGTAATTGAGACTCACTATCAGCATTGGATTGATGAACTTAACAAAATGAAGTTGGAGGCATTAGAATCCACCAGAAGGAGATGGATGGCCAAGAAGAAACTGGCTGTTCGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36694::LG11:27955006-27957006(+)
AAATTGGACGAACGATGTTTTATCAAAGTTGATCACTTAGAAACGAGTACAAACGCTCGGTATAATACCGAGCGCCATTCTTTACGAGAGCTTGGGGTGAGGCCTATCAATAATTAAACTTATACTAGAAACATTAATAATGATATAATAAGATACGATGGAGACAGTGTTTAGGAAATAACTAAATATACAAATACAAGTTTACGAGATTTTCAGTTCATCGCATAACACTCAGCTGCATCTACGATTGACCGAACGCTCAAACGTAGCATTATTACAAAAAGGCGCTCGTCCTCAACTAGAATTCTTCTCAAATGAAAGAATTCAATTTCAAAGAAGTTAACTAGAAACACCGAACGGTCAAGGACCGTTCAATGACGAACGTATATTATCATAGGAAATTTCATATTCAAGACTCATTTATCTTCAAGTCATTTCTCATTACATAATTTCATAACTTTATAAAATTCATATCATACTAATAAATCATTTTCCACATAAACAATCATATCAACATTCATACAATCCAAACATATCAACCATCATGCATTATTTTCATTTCAGTCCATTAACGATCGTTCATTCAACACAATAAACATACAGATTAAATTAAATAAGCTTCCCTTACCTCTGAGCGTGAACGATCGTCCTATAGACAAGATACGCTTCGTCTGACTACAGATCTTTCTACCCTGACGTTCTACAACTCTTCAAACTAACCAAACAGCCAAAAACCAATAGTGGTTCAGACAAGGTAACAACATGCAACCGATACTTGGTTTGCATGTAACAGAGAACGGACCGCTAAAGATGAGAAACTTACTAGTTCAGAAGTCGAAGCTGTTCGGTTCAGAATGAAACTCAGGGCGCCGGAAACGCTTTCACGGTGCCTGAATGGTGATCGGAGAAAAGAAAGGGTAAGATTTCTTAGAGAGAAGGGAGAGTTTTCTAGTGAGAAGGAGGAGAATTTGAAAAGATCAGAGTTTGGAGGAGAAGATGCATGCAGAGAGTGGGACATGATTTCTCTAAAAGTCAGTTTTGCTTAAGACAAACGTCCGCTCATCTGTTGACACCTGCATTGTACTATCTGATTTTCGAATCCTCGTTGCTTGACACCTGGCGTCCGTTCAGAGAGGTTTTGGGTGCATTTTAATGAGCCTGACGGGAGTGGTTTTGAGTGCGTTTAACGAGGCCTGACAAATTCCATACAAAATTGTAAGTGTATTTTCTATAAAAACAAAAAAAAATCAAACATAAAAGTACTACTTATATAAAAATAAATAAAATCATCTATGCAAACATAATTTTTAACACACAAAATAAATACTCAACAAGAAGTATAAAAACACCAATTTATTTTATTTGAAAGTAGTGTTTCCATCACATCATATGACTAAGACTTTTTTTATAAATTTTATCCAATTTCCATAAAGAAAGAAAATGATATCATTTTAATAATTTTTTCAAAAAAGACTCTTACTCAATATATTCATATTTTTGTACTAGAAATTTCCAATGTGAACAACTCCTTACAGTCTAAACTAAAGGAAATGGTTCAAAGCAACATTCTGAGAGAGTTCTTGTGAGAAAGATCTTAAGGGATATATAGCTTCTCTGCAACATGGAAATCTTAAAGCACCTTTTCAGAATTCACCATTCTGAAGAAACTAATGAAGAAATCTTGCAGCATTTTTACTAACTAATTTACAGTCTAGAATTGTTCTTAAGCTTAAATCTCTGCAGTAAAACATTACATTCTCTCTGTTGCATTCTGATATGCTGTGACATATTTTTCTGTTACTCTTTTCGATTATGTTTCTGTTACACTTGTAATAGGCTGGAAATAAGTTATGTCTTACCTTCTCATTTTGTTTCTCATTTTGTTGGATGTTTTTCTTTTTTTAAACCCTTTTGTCTTATTTTAATCTAACAATAAAAAGAATTCATCCGTGATATTTTGTCTTTCCATCAACTTAAAGATAAAAGTCATCTGATTCTCA


Gene Sequence:
>Vu_36694(+)
ACCTCAGCATAGCTAAGATGTACGATTTGTTTCCGTTAGTTAGTTCCCAACTTTCCCTTTTTCCAACTTTTCAAACGCAAATTTGATAACAAAATTAGCACTCTGATTCACCATCCACCTGTCTGTTCCCCGCTTCTCTTTCGCCTCCACAGTTTTCTCATTTTCTCTCTCTTTCCCGCCAACCACCTTTCCTCAATCCCCCCTTTTGATATTTTTCCTCAGAAGATTGGATAATGGGAGACCCATCTGGTAAATTTTGAACCTTTGGAAGGTTTTGGTACCTGGGTCGCTGGAAAGAATGGACTTTGAGAGGAAGGTGGAGGTGGTGGGTTTGGTTTGAGGATGAATTTTTGTTATGACATGGAAGGTTGGGTTTTGGATTTAGGTTCATTGCCTCCAACCATTGTCATCGAATGCCGATTCCAGCTGCGGTCGGCATTCGATTCCTCCTTCGTTCCGTTCCTACCTTTCTCCATTCCAATCACAAACTAGGCCCCATCCGATAAACATATACTAATAATTAGAAAAAAGAAACAATTTGTCTTGAATTCTGATTGTTTCAGCCACTAGAATGAATTCTGGTGCTGTCTTGACACTGCCTCCCGTGTGCAATGCGTTCGGGACCAGGGAGCCTCAGGATTTTGAGGACGAGTTTGCGGAGAAAGATCCAACCGGGCGGTATACAAGGGTATTATGACTCGAGTCTCACAAGCACCTTCACCAATTATTCATTTATATGTTTTTTGGATTCATTTTTAGTCAACTTCGGTGGTTCTTCTAAAGTTTAATAATTGCGTGTGAACTGTTGTGGTGTGTTTTTTATGGCTTTGGCGGGTAAGTTTGAATTACTTGTGTTGGTGGTGAAAATATGGTCGTTGAGCCAGAGGGATTGTTTTTAAGCAATAGTGATTTGAAATTGATTAGCCTCGTTTTTCTCGTTTGCCTGGATGATAAACTTGAAATGCAAGGTATATAAGTTGAAGAAATGACTATATGGTAGAGATGGTGTATCATGCGGAAAAAGCCTCATCTCCGTCCTTTTGAATTAGGAACACTTTTGTGAGGCTTGCAAGTGTGTTATCATTAGAGAAACGGTTTAAATTGGCTGTTTGGTATCTGGTATTTTATTTATTAATGATGTATCTGTAATGAATCACCTTTATCAGCTGTGAAAGAGAGTTTCACAAATTAAGTTCCACTTTTACTTTGTAATGCAGAAGTGTAAAACCTATCTCATACTTAAGATTCAATACTACAAATAATCCTCTTTATGAAAAAAATTGCTTTCTGTGAAGCACAGCTAGGGGCACTTAATACAATATACCCACATTGTTCAAGGGGATTTGTTTACTTCATTTCTACGATTCACTTTGTTCATTATATTTGCTATTAGTTTGATTTTTTTTCTCTCTTTTGTTTTTGTCTCAGTATACTGAAGTCTTGGGAAGGGGTGCCTTCAAAACTGTGTAAGATTTAATGCCTAATCCTTCTCTCTTCTATTTTTCTTTCTATATATAATTCTCTGTTATCTCTAATATTTCGTATTTTCTTTCTAGTGTTCTAGGTTAATTTGAGAATTTTACTTGCTATGAATTATTTCTCCAGGAAATTTATTATTCAATAACATTTTTTATTTTTATGGCACTTTTTACTCGTGAAAGCATGCTATTTAATCTCTTTCCCTTTTCCAGTTATAGGGCCTTTGATGAAGTTGATGGAATTGAAGTTGCTTGGAATCAAGTTAAGATTGATGGCCTCTTGCATTCAGTAGATGATCTTGCGAAATTGTATTCTGAAGTTAATCTTTTGAAGTCTTTGAAACATGACAATATCATTAAGTTCTGTGATTCTTGGATTGATGATAAGGAGAAAACTGTTAACATGATTACTGAACTGTTCACATCTGGAAATTTAAGGCAGTAGGTTCTCCTGATTTTTGTCCCCTTTCCTTTATATTATTTGGTTGTAACATGCACATATGAAATTTTTGTACACCTTTGGCTGACAGATATCGCAAGAAGCATAAATATGTTGAAATGAAAGCTATAAAAGGTTGGGCCAGGCAGATTCTTCATGGCTTACTATATCTTCATAGTCACAAGCCACCCATTATTCATAGAGACTTGAAATGTGACAACATCTTTGTGAATGGAAACCAGGGTGAAGTTAAGATAGGGGATCTTGGTTTGGCAATTGTCATGCAACAACCTACCGCCCGAAGTGTTATTGGTAACATATTACTTCCTGAATTGTGATGTTTTTATCATATTGGTTCCAATGGCACTGAGCTATGCTTGTGTTTGTTGTTTCTCTATTTTACAAAAGGAACTCCTGAGTTTATGGCTCCAGAACTATATGAAGAGTCATACACAGAACTGGTTGACATCTATTCTTTTGGGATGTGCATATTGGAGATGGTCACTTTTGAGTATCCCTATGCCGAATGCAAAAATCCAGCTCAAATCTTTAAGAAAGTTACCTCAGTGAGTAAATAAATTATTGGCATATTCTTACCACTTTAACTTATAACGCAAACAATTTAACTTGCTGTATTGTGATGCATGTCATTGCAGGGCATCAAACCTGCTTCCCTTAATAAGGTGAGTGATCCTCAAATTAGGGAGTTTATTGAGAAATGTTTGGTTCCAGCATCTGAGAGATTGTCAGCAGAGGAGCTTCTGAAAGATCCATTTCTACAAGTTGAGAATTCAAAGGATCCCGTCCTTTATCCTTTACAACCACCTAGAAGAACTCTGAGAGCGTACTCATTCAAGTCTAGTTCTCATTCTATGGACTTGGATGGTGACTACAAACAGTTTTCTATGAGTATCTGTTCCGAAAGCAACCAAGAAAGCCCATATTGTCCTGTTTTTGAGGTTCAGAGGGCAAATATTAACAATGAGTTTAGGTTGAAAGGGACTAAAAATGATGATAACTCGGTATCATTGACCTTGCGTATTGCTGATACATGTGGTGAGTATTTTCTCTTTCCTTCGCCTTCACCTTATGCTACTTTTGTTTCAAGGAGGAGCAGGTGAGTAGAGAACATCTGAATTAGTTTTCGACAGGCTCGAAAGTTGATGCTGAAAGGTGTTTGTTGTGTTCCTAGCAGGTCGAGTGAGGAACATACATTTTCTGTTTTACCTTGATTCAGATACCGCAGTCTCTGTGGCCACAGAGATGGTTGAACATTTGGAGCTGGCAGATCACGATGTACCTTTCATAGCTGAGCTTATTGATTATTTGATAATGAAACTTCTCCCTTGGTGGAATCCTTCGCATGATCGTTGGGCATGTGGTGAAATAAATCCTAATATAGATGCCCAAAACTTCATGGGATGGCCATGGGCTTCTGCCCTACCAAGTCTTCCCTCTGATTTGGCTATTGAGGAGGATGGCTACTCTGGGATTGATACAACCCCCAAAGAAGATTTTGTGGCAGCCGAGAACAGCTTAACAGAAAGTGGTGATAAGGCTACTTTCGAGGGTGATTATCATTCACAAAGATCTGAAGCTTCTGAGGTAGTTGTTGAGAATGCTTCTATGAAAGATGACAATTGTCATTATTCCAGTGTTGATGCAAGCTCTAAGTGCTTAAGTAGTAGGTCCATCTCTGAACTTGATCTTGGGGATGAATATTTTGAGGACTGTAAATTGCAACAAGAAAATTATTCTTCTGGGGAAGAAGTTGTTATAAATGAATACCCAGCGAACTCGGGGTCAGTTCTTGGAACATCTACTAATGTTGGGAGCACAAGAAGTAGCTGTTCTTATGTGTCTTCATCAGTAGAGGAGATTGATCTTGAGCTACAGTTTGAACTTGCTGTAATTGAGACTCACTATCAGCATTGGATTGATGAACTTAACAAAATGAAGTTGGAGGCATTAGAATCCACCAGAAGGAGATGGATGGCCAAGAAGAAACTGGCTGTTCGGTGATTTTGAGCTTGTTGATTGACCACTTGTTAACCCTTGTCGAAATTGTTTCACTGTAAAGTGTGTTGTGATCTTAACTGTACTTTGTATATTGGATGTGGCTCTTTTTAGTGAGTGTCCTTACCCTCAACCTACTTTTTCCTTGTTTTGGAGATATTTCTCAATCTCTCTTTAGCATAATGTAGGAGATGCGTCTCAAGAAATTTTATAGTTCTAGAAGACACATTCTCATGGAGACACTTTGCTATTTTAGTATATTTTTCACCATTTCAGCTTTGCAT