Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36680 LG11 27745645 27746287 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 27745737 missense_variant p.Gly25Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36680.1
MDQPPHHHSSAATTSADKPATQRGGTRHPLFRGVRKRRWGKWVSEIREPRKKSRIWLGSFPAPEMAAKAYDVAAYCLKGRKAQLNFPDEVHRLPPLPSACTARDIQAAAAKAAHMMIVQAAAAAPDSPEKSSITSGCGHAADDFWREIELPELLHSKWWTSSADSSPWTEDDLPPQQPFTTACL*


CDS Sequence:
>Vu_36680.1
ATGGACCAACCGCCGCACCACCACAGCAGCGCCGCCACTACCTCCGCCGATAAGCCCGCCACGCAGCGAGGCGGCACGCGTCACCCGCTCTTCCGCGGCGTCCGCAAGCGCCGCTGGGGAAAATGGGTGTCCGAAATCCGGGAGCCGCGCAAGAAGTCGCGCATATGGCTCGGCTCCTTCCCGGCACCGGAGATGGCGGCGAAGGCCTACGATGTCGCAGCCTACTGCCTCAAGGGCCGCAAGGCGCAGCTCAATTTCCCCGACGAGGTCCACCGCCTCCCGCCGCTCCCTTCCGCCTGCACCGCCCGCGACATCCAGGCCGCCGCCGCCAAGGCGGCCCACATGATGATAGTCCAGGCCGCCGCCGCCGCCCCCGACTCTCCGGAGAAGAGCAGCATTACCTCCGGCTGCGGCCACGCAGCCGATGACTTCTGGCGAGAAATTGAGCTGCCGGAGCTCCTCCACAGCAAGTGGTGGACCTCTTCCGCCGACTCGTCGCCATGGACGGAGGATGACCTTCCGCCGCAGCAACCCTTCACCACGGCGTGCTTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_36680::LG11:27743645-27745645(+)
CTATTTAATTGTTTTGTCGCTTGACGTTATAGCAAATGTTGACACGGACGGTCTTGCACTAACTATTATTCGTTATTTACTAGACAAGTTATGATCCTTGCTAGCTTCGTTGCTCTCTTGAACCGTACAATCAACTTTTTGCGCAATTGTTTGCTCGATTCGGGTAGCATCGGGATGGAAGGCACGAGATTCTTATCATCCCAATCGTGTCACATGACTGCATTCTCTGAGCGCATGTCTTTAAATTCTTCCTCATTTATTCTCTACATCTCATTCATTTGCTTTTGTAGGTTCCTCATCATCTCCCTCAGATCCAACTAGTTGCCTGAGACTTCCTCTAAGACAACATTTCTCATTATGTTCCTTGTGGTCACCATGATGTTAGGAAGCCAAAGTATTTTAATAAGTAGGATTGATCAAATTGTTAGTTGTCCAACAGTCCTTGCTCAGCTTTCTTGTTCGTTAACATCAATTGGTGAGTACCTGTGAAAGGTTATCCAATGCTAAAGTTAGTTAAGTTCGAGTGTTATAGTAATAAATGTGTAATTATTGTCTAACCTACCACCTTACCTTATACCTCTATTTATAGCTTTGTAGTGGACATTTTATTATTGTTGGCCTAATTACAACCAAAACTCCACTAATTTTGTTTAGGAATTTAATCAGAATGATTTTCTACTTTAAGTTGTTCTACCTTAACTGTTGAATCGTTTTGATAAAAAATGTTATTTAAATACTTAATTAAGAAGATAGAAATATCACATTTAACTGACTAACAGGTTAACCACTCGATCAACAAATTGATTGGACGAGACATACCTTACAATAAATTTTAAATGTTACCCAAAAGTATTTTGCAATTAACAATATTATAATATCTGAATATAAATTTATACATATGAGATTAGAGAAATAAGTTAATTAAGTATTTATTTAATATTCTATTAATAAAGTAAATGATAATATTTGTAATTTTTGTTGTAATGTGGTGGAAAAAATCTCATTATTGTAATAATTTTCTGGAAGTTACTAGAATAATTTGGAAAACACTTTTGAAAGGTCATGAAGTTTACTTTTAGAAAAAAAAAAGCTGATAAATTAGTTGAGATTTTTAAATAAAACCTTAAGATATTGACATAATTTATTGAACTAGTTGAAAGTGTGATTAAACAAAACCAATTGTTGGACGAGGTCAAAATATAAAACGATACAAAAGACCATATTTATACAACTTCAGCGAAAAACGATTGCAGGTAATTTTAATTTTAAACTCTTGTTATTTTTTTATTAAACAATAAGTACAAAGAATGTAGTAGATAATGAAAGTAGTTTAATGTTAAATAGTGTAATAAATAGTTCAAAATTAATTGAGGCGATGAATTTTAAAATTAACATATTCAGAGCAAAGAGGACAAGTCAATATAAATTATAGAAGTTCAAATCCTAATTTTATTTGCTTGGGGAAACAAGTTAAAGGGAAGGTGATAACAAAAGTGAATACTCTCTTATTCTTGAAAAACCAGCACAAACTAAACTTTATAAAAGATAACTTGTTAATGTAAGATACATATTTAATATTAATTAATGAAATGTAAGTCATATTTTTACATTTGAATGTTGTGATAAGATTTTCTTAAACACTTATCTAGTGAAAGAATATCCCAAATACATAATTTACATTATAATAATGTTTGGCACTAATTAAAGAAGTAATTAAGAGTGAAGAAAATTTAGGTGTAGAAATAGTAGTAGAAAGAAATGCGCATAGTGGTGCGCGTGTTGCGATGGTGAGAATGTGCGAAGGAAGGACCAACGCTTTCTTTATTTAATTGCATGCTGGTCCTTTACGTAGAAAAATCGAACGAGTAACTTTAGTTCCTTTCCTCTATCTTTTTCTGTAGGGGCATTTCGGTAATTGAGCGGCACTCGCCATTGTAACGAACTAAAAAGCCGTTTGTTTATAAATGCAGAAGATAATAGCGGAGACAAGCTTCTGATGT


Gene Sequence:
>Vu_36680(+)
TACATTAAAAGAATTCCTAATGGACCAACCGCCGCACCACCACAGCAGCGCCGCCACTACCTCCGCCGATAAGCCCGCCACGCAGCGAGGCGGCACGCGTCACCCGCTCTTCCGCGGCGTCCGCAAGCGCCGCTGGGGAAAATGGGTGTCCGAAATCCGGGAGCCGCGCAAGAAGTCGCGCATATGGCTCGGCTCCTTCCCGGCACCGGAGATGGCGGCGAAGGCCTACGATGTCGCAGCCTACTGCCTCAAGGGCCGCAAGGCGCAGCTCAATTTCCCCGACGAGGTCCACCGCCTCCCGCCGCTCCCTTCCGCCTGCACCGCCCGCGACATCCAGGCCGCCGCCGCCAAGGCGGCCCACATGATGATAGTCCAGGCCGCCGCCGCCGCCCCCGACTCTCCGGAGAAGAGCAGCATTACCTCCGGCTGCGGCCACGCAGCCGATGACTTCTGGCGAGAAATTGAGCTGCCGGAGCTCCTCCACAGCAAGTGGTGGACCTCTTCCGCCGACTCGTCGCCATGGACGGAGGATGACCTTCCGCCGCAGCAACCCTTCACCACGGCGTGCTTGTAGTTTGTAATAATCAATAAAACCTTCCGCTTCTGCCATTTGGTAATTGGTATATTATTATTGCTCATATAC