Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36523 LG11 25477145 25480640 PREDICTED: AT-rich interactive domain-containing protein 2-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 25477381 missense_variant p.Pro593Thr
C/A 25477676 missense_variant p.Gln494His
G/A 25477889 synonymous_variant p.Ser423Ser
T/A 25478215 intron_variant
T/G,A 25478233 intron_variant
G/T 25478235 intron_variant
A/T 25478600 intron_variant
A/T 25478650 intron_variant
G/T 25478872 intron_variant
G/T 25478923 intron_variant
T/G,* 25479359 intron_variant
A/C 25479476 intron_variant
T/G 25480563 missense_variant p.Lys26Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36523.1
MSMAGRLQLYDGVREEDSGEIFGGSKDDSLCRFERLFAEFFSEICAFNCVLHYPPMLSDGQDVDLYRLFLVVRGKGGYDAVCKGKLWDSVGEESGMGVSVGSSVELVYSRYLSALDSWMKKVAESKVSPEFGVVDDRDKFGRRLMELQAEVEGLLSGCADERVVLVGEDVEGGLDEDDHNLDGRELSGANGVKSNGDEGGEHRQCDDSEMPDNDMDEAVLGNSDKGNDLMGGEEGFDGGKMPEEQAVDISDGANKSGTGVVSGGKQCDDSDDKGLVLDASGGNSDDDSSGHKRKREGSVWDSSSDDCDSPSRKRMRESAMDMLSWITGVAKDPGDPEVGSIPEKSKWKSYSSQEVWKQVLLFREATFYRRGSEASNEQRNWQNQKMHPCLYEEQVGTNYNLRDRLKCDKKLLFGKSASVRSSSDSSLATENRTPGSHTEGQSELRDSPDANSGLDKCATVRIPLGTNHQAEIPEWTGVTSESDSKWLGTRIWPQETVNTRLIERDPIGKGRQGSCGCPEEGSVECVRFHISEKRAKVKLELGNAFYDWDFDRVGEEVRLMWTKEEEKKFEDVVRSNPPSLEKYYWDYIFRAFPDKSRAELVSYYFNVFILQRRGYQNRHTPDDIDSDDNDDEAGPLRNVFGPLIQNSGHEMQSSRGSSLLTPKKTHKKGK*


CDS Sequence:
>Vu_36523.1
ATGTCCATGGCAGGGCGGTTGCAGTTATACGACGGTGTTCGCGAAGAAGATAGTGGTGAAATATTTGGAGGCTCGAAAGACGATTCTTTGTGCCGTTTCGAGAGGTTGTTTGCAGAGTTCTTTAGTGAGATCTGTGCGTTTAATTGCGTTTTGCATTATCCTCCAATGCTGTCTGATGGGCAGGACGTGGATTTGTATAGGTTGTTTTTGGTGGTAAGAGGGAAGGGTGGATACGATGCCGTTTGCAAAGGGAAGTTGTGGGATTCGGTTGGGGAGGAGTCTGGGATGGGAGTGAGTGTTGGGTCCTCTGTTGAGTTGGTTTACAGTAGGTACTTGAGTGCTTTGGATTCATGGATGAAGAAAGTTGCTGAGAGTAAGGTGTCTCCCGAATTTGGTGTGGTGGATGATAGGGATAAGTTTGGGAGGCGGTTAATGGAGTTGCAGGCTGAGGTGGAAGGGTTGCTTTCCGGTTGTGCGGATGAGAGGGTGGTTTTGGTTGGGGAGGATGTCGAGGGTGGTCTTGATGAAGATGATCACAACTTGGATGGGAGGGAGTTATCCGGTGCTAATGGGGTGAAAAGTAACGGTGATGAAGGAGGTGAACATAGACAATGTGATGATTCGGAGATGCCGGACAATGACATGGATGAGGCGGTTCTTGGAAACTCGGATAAGGGAAATGATTTAATGGGAGGGGAGGAAGGGTTTGATGGAGGGAAAATGCCTGAAGAGCAGGCTGTGGATATATCGGATGGGGCTAACAAAAGTGGGACTGGAGTGGTGAGTGGAGGCAAGCAGTGTGACGACAGTGATGATAAGGGCTTGGTGTTGGATGCATCTGGTGGTAATAGTGATGATGATAGTTCTGGTCACAAGAGGAAGAGAGAGGGGTCTGTGTGGGATTCATCTAGTGATGATTGTGATAGTCCTAGTCGTAAGAGAATGCGAGAGTCTGCAATGGATATGCTGAGCTGGATTACTGGTGTTGCAAAAGATCCCGGTGATCCTGAAGTTGGTTCAATACCTGAAAAGTCAAAGTGGAAGTCTTACAGTAGTCAGGAGGTGTGGAAACAGGTGCTGTTGTTTCGGGAAGCTACGTTTTACAGAAGAGGTTCTGAGGCAAGCAATGAACAACGTAATTGGCAGAATCAGAAGATGCATCCGTGCTTGTATGAAGAACAAGTTGGGACAAACTACAATCTCAGAGACAGGTTGAAATGTGACAAGAAGCTTTTGTTTGGCAAATCTGCATCTGTGCGAAGCTCTTCCGATTCATCTTTGGCAACTGAGAACAGAACACCTGGTTCTCACACTGAAGGTCAATCTGAGTTGCGTGATTCTCCAGATGCAAATTCAGGTCTTGACAAATGTGCAACAGTACGCATTCCTTTGGGGACAAATCATCAAGCCGAAATACCAGAATGGACTGGTGTGACTTCTGAAAGTGATTCTAAGTGGTTAGGGACTCGAATATGGCCACAGGAAACAGTAAATACCAGACTTATTGAAAGGGACCCCATAGGAAAGGGGAGACAAGGTTCATGTGGCTGCCCAGAAGAAGGTTCTGTTGAGTGTGTAAGATTTCACATTTCAGAGAAAAGAGCTAAAGTTAAGCTGGAATTGGGTAATGCATTTTACGATTGGGACTTTGATCGGGTTGGTGAAGAAGTTAGGCTAATGTGGACGAAAGAAGAAGAGAAAAAGTTTGAGGATGTGGTTCGGTCAAACCCTCCATCACTTGAGAAATATTACTGGGACTATATTTTTAGGGCATTTCCTGATAAAAGCAGGGCAGAGTTAGTTAGCTACTACTTCAATGTCTTTATATTGCAGCGCAGAGGATACCAGAATAGGCACACTCCCGATGACATTGATAGTGATGACAATGATGACGAAGCTGGACCATTAAGGAATGTTTTTGGACCTCTGATACAGAATTCTGGACATGAGATGCAGAGTTCGCGAGGCTCCAGCTTATTAACCCCCAAAAAGACACATAAAAAGGGAAAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_36523::LG11:25480640-25482640(-)
AATTATTATTTTTATTATGATATTTTTTATATAAATAATTAGTCTTTGAAAAATGGTATTTGATATTTATTATTTTATGTTATTTAATTCTTAATTTTTTTAAGGATACGTAATCGTGAGTATAAAAAGTATTTACATTTTTTAATATAATAAAAAAATTACATTCTTAATACAAAAAATTCAATTTCTTTAATTTTATTTGAACTTCGTTAATTATTAAAATATTTGAATAAATATTTGATCTTTAATAATTATGTTTGTTTATTAAAGAAAATTAGAGATATAATACAATTTTTAATAATAATTTTAAGACAAAAAATATTTAAGCTAATATTAAATTAATATAAAAATTATACATAAATAAAAATTCATATAACATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATAATAATTTTAAAATATAGTAAGCAATGAAATTAAAATTAAAGAATAAATAATATTGATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAGTAATAAGAGTAATAATAGACAAATCTTTTTCCACTTAATTTAAGTAGTTAATAATTTAAAGCTACTTGAATATCTCTTTTCTTTTTTCATCTTCAGCACTATCAAAAAAATAAAACTAATATTTTAAAAATCATTAGAAATACCATTTAAAATGAATTTCAATTTTAAACCAAATGTTTAAAAATTATTAACTATAACCACACACAATTCTCAATAGGTAATTTTAAATTTTGGGTGAGAGCATACAATTTTTAATTTATGCAACTTGGGTTTAGATGTATTGGTGTGTATGATAAGTTTTTGGTGAATCATAATCACCTTATTCAAAAAATCCAACAAGCATCAAAAGGAAAGCATTGGATTTGATTTTAACTATAGTGATAGATTCAAATTTATATATGAATAAAAATAGATAGATTTTAATATTAAAAAGAATGATAGGAAATGAAATCCCCAAAATTTAGAATTATAATATAAAGTAAAAAAAAAAAAAAGATTACATTGAATGTGTGAAATGAATTTGGTATGTTCTTAGGAAGAAAGGGTAAGAAAGATGATAAATCTTGAAATCTATGAGAACCATTGACAAGGGCACCATGTGTTGATGACAACAACCTATCTCATGCCTCTTCATATTAAAGCCTCTTTTACATAATTAAATATTTTTCTTGACCTAGTTAAAGAAATAATTCAAGTCCACCAATAATAATAATTATTATTATAATAATGATAATAATAATTATAATAATCCAAACCCAACCATGATGTAGTTAAATACTAACCAAGGTTAGTGGTTCCCCCAAAGGCACTATATAACAAGAGGATGATGCTGTGGATTCAAGCAACTTCCCCCTCATCAGAAAACCCTATTAAATCCCTATTTTTTTTCAGATTTAGGAAAATGGAAGTTGTAAATTCTCCCAAAACAAAATGAAATAGAAAAGGGGGAAAATGGAAAATGAATAGCCACATAGTTTAGGCAAAGGTCAAGGAAGTCACAACACAAAGACTCATCATAGGGTCCATCGAAACCCTGTCTCTAATAACTGGTACGTCTCTCTCTTTTTTCTTTTTTACTTCCAATGAAAATTCAGATATTGAAGAAGAGGGTCTGCGTCTGTTGAAAACTTGAATTTTAGCCCCGAACCCCATTTCTCTCTCACACCCACTTTCTCTCTCTGCAATTAACATCACTGTAGAGAGAGAAAGAAAGCGCGGGACAATGAAAACATTTCCTCCTCCCACACAAAGGTGGTAGACCAAACAAGCCCTAGACAGTATCAGATCCTCACCCTTTTCCATTTTCCCGCCAAAATCTACTTTTGACCCCGACCCGGATTCTCAATCGGTGCCAATTTCACAACCCTTGAAACTGTTTTCGTCGATTTCTCGAAAAAAAAAGAAAATCTAAAAAAAATGCCTGTTTTTAAAATTTCAAAAATAATGGGTTATTGGGAGTGGGATTATATGTTTCTAGGGTTTGAATTCG


Gene Sequence:
>Vu_36523(-)
ATGTCCATGGCAGGGCGGTTGCAGTTATACGACGGTGTTCGCGAAGAAGATAGTGGTGAAATATTTGGAGGCTCGAAAGACGATTCTTTGTGCCGTTTCGAGAGGTTGTTTGCAGAGTTCTTTAGTGAGATCTGTGCGTTTAATTGCGTTTTGCATTATCCTCCAATGCTGTCTGATGGGCAGGACGTGGATTTGTATAGGTTGTTTTTGGTGGTAAGAGGGAAGGGTGGATACGATGCCGTTTGCAAAGGGAAGTTGTGGGATTCGGTTGGGGAGGAGTCTGGGATGGGAGTGAGTGTTGGGTCCTCTGTTGAGTTGGTTTACAGTAGGTACTTGAGTGCTTTGGATTCATGGATGAAGAAAGTTGCTGAGAGTAAGGTGTCTCCCGAATTTGGTGTGGTGGATGATAGGGATAAGTTTGGGAGGCGGTTAATGGAGTTGCAGGCTGAGGTGGAAGGGTTGCTTTCCGGTTGTGCGGATGAGAGGGTGGTTTTGGTTGGGGAGGATGTCGAGGGTGGTCTTGATGAAGATGATCACAACTTGGATGGGAGGGAGTTATCCGGTGCTAATGGGGTGAAAAGTAACGGTGATGAAGGAGGTGAACATAGACAATGTGATGATTCGGAGATGCCGGACAATGACATGGATGAGGCGGTTCTTGGAAACTCGGATAAGGGAAATGATTTAATGGGAGGGGAGGAAGGGTTTGATGGAGGGAAAATGCCTGAAGAGCAGGCTGTGGATATATCGGATGGGGCTAACAAAAGTGGGACTGGAGTGGTGAGTGGAGGCAAGCAGTGTGACGACAGTGATGATAAGGGCTTGGTGTTGGATGCATCTGGTGGTAATAGTGATGATGATAGTTCTGGTCACAAGAGGAAGAGAGAGGGGTCTGTGTGGGATTCATCTAGTGATGATTGTGATAGTCCTAGTCGTAAGAGAATGCGAGAGTCTGCAATGGATATGCTGAGCTGGATTACTGGTGTTGCAAAAGATCCCGGTGATCCTGAAGTTGGTTCAATACCTGAAAAGTCAAAGTGGAAGTCTTACAGTAGTCAGGAGGTGTGGAAACAGGTGCTGTTGTTTCGGGAAGCTACGTTTTACAGAAGAGGTTCTGAGGCAAGCAATGAACAACGTAATTGGCAGGTAATTTGAAATTATAAATTTAGCTAACCTTAAATTGCTTTGTAAATGAACTTGTTTCTATTACATGCTTAAACATTAATAAACTCAAAATGAGTATGTCTGATAAAAGCTTTTCTATAATTGTACATATTTCTCATTCTGTTTATCTTACATTCTTGTGTGAAACTTATTTAACTAATCAACCACTCCTGATTTTTCCTTTCCTCGAGTGTATTTGTTCATGAATGTGTAATCTTTGTGTGCACTGGTTACTTTGAACTTCCTTATCCTTTTGATCCCTACTTTTATTGTCAGCTTCCTTACCCTATTTATTTTAGGGAAATATATATTTTGGTAGCCATGCAGATGACCGATGAAGCCTGAACTATAAAGTTGGACTACATGACATTGTTTTGTTCTGAAACTGTATATTCATATTATTAGTCTGTTTGTTTTGCGCCAGTGTATGCATCTGTGGATATCAAACTAAAGTTAACTGATGATTTTACAATTCTAGATAAACTGAATATGCCAACATTCTATCAAACAGTTTTTTGGGTAGATTTGTCAAATTAGCATAAAATTGCATGAACTCTTGAGTTAGTAGGGAGACAACGAGTTTGAAATCACATGTAAGTTTCCTCCCATGACAATGTTTTATTGTGCTCGAATGATTTGATGAAGTAACCTACTTTTTAAAAGTTCACTTCAATAGCTTGTATTTTTATGAATTTATATATAATTTGGTTGTTTATATAATTTAATATTTTTTATTACTAATGTGCTAATAAACTTTTCTTTCTGTGATTCTATATTTTGCTTTATTATGAAGTTCAAAATTAAATTATTATTGTGCTATTAGTATTTTGTTCAGCGTAAGTAATAGATTTTTTAATATTAGTCAACTTTAGAAGTTGAATTTACGTACACTATAGACTTTACTTATCTATCTGTAAATTATGGTGTGATTAAATTCTATTTTCATATCCTCCTTATTTTAAATACTCTGATTATTGTTTCATTTTTGCATGGAAATCAAATCTATTGACATAGAATGCTCTTTCTTCTATAATATATATGAAAACTGTGCTCAATAAACAAGGAAGAAAAACTATATATTTGTGTACTATTAATCTTGAAACTAAGTGTGTTTGTGGATTAATAAAGTTGTTGGGGGCTACTTTGATTACTTAGACATGGGTAACTTGTGTATTTGTGTCTCCATATTAGAGGATATACACCAAATTGCATATTAAAAATAAAACTATAAAAGCAGAGATCAATTGAAGTTAGTTTATATAATAAGTGTCAAGTATATAATTACCATCTGTAGACAAGTTTTTGGTTAGTTGAATGCTTTTGGATAATAAATTTCTTTTTCTTTTTATTAGCTGGTTCTGTAGATTCTCGAATCTTTGTCCTAGTGCTGCCATTTTATATATTTGAGTAGACAAATTTCAAATATTGTTTTTATATCATACTCAAGCCTAATCTCATTTTGTAGAATCAGAAGATGCATCCGTGCTTGTATGAAGAACAAGTTGGGACAAACTACAATCTCAGAGACAGGTTGAAATGTGACAAGAAGCTTTTGTTTGGCAAATCTGCATCTGTGCGAAGCTCTTCCGATTCATCTTTGGCAACTGAGAACAGAACACCTGGTTCTCACACTGAAGGTCAATCTGAGTTGCGTGATTCTCCAGATGCAAATTCAGGTCTTGACAAATGTGCAACAGTACGCATTCCTTTGGGGACAAATCATCAAGCCGAAATACCAGAATGGACTGGTGTGACTTCTGAAAGTGATTCTAAGTGGTTAGGGACTCGAATATGGCCACAGGAAACAGTAAATACCAGACTTATTGAAAGGGACCCCATAGGAAAGGGGAGACAAGGTTCATGTGGCTGCCCAGAAGAAGGTTCTGTTGAGTGTGTAAGATTTCACATTTCAGAGAAAAGAGCTAAAGTTAAGCTGGAATTGGGTAATGCATTTTACGATTGGGACTTTGATCGGGTTGGTGAAGAAGTTAGGCTAATGTGGACGAAAGAAGAAGAGAAAAAGTTTGAGGATGTGGTTCGGTCAAACCCTCCATCACTTGAGAAATATTACTGGGACTATATTTTTAGGGCATTTCCTGATAAAAGCAGGGCAGAGTTAGTTAGCTACTACTTCAATGTCTTTATATTGCAGCGCAGAGGATACCAGAATAGGCACACTCCCGATGACATTGATAGTGATGACAATGATGACGAAGCTGGACCATTAAGGAATGTTTTTGGACCTCTGATACAGAATTCTGGACATGAGATGCAGAGTTCGCGAGGCTCCAGCTTATTAACCCCCAAAAAGACACATAAAAAGGGAAAATAG