Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36457 LG11 23805392 23810481 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase At5g41260
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 23805751 missense_variant p.Lys91Glu
T/C 23805819 synonymous_variant p.Pro113Pro
T/C 23805840 intron_variant
C/T 23805922 intron_variant
T/C 23805931 intron_variant
T/G 23806097 intron_variant
A/T 23806107 intron_variant
G/A 23806138 intron_variant
T/A 23806147 intron_variant
G/T 23807678 intron_variant
G/A 23807783 intron_variant
G/A 23807798 splice_region_variant&intron_variant
A/C 23807915 intron_variant
T/A 23807984 intron_variant
T/A 23807992 intron_variant
T/A 23808259 downstream_gene_variant
A/T 23808524 synonymous_variant p.Ala278Ala
A/G 23808798 downstream_gene_variant
A/T 23809170 downstream_gene_variant
G/A 23809201 downstream_gene_variant
T/G 23809212 downstream_gene_variant
G/T 23809213 downstream_gene_variant
A/G 23809376 missense_variant p.Asn326Asp
A/G 23809386 missense_variant p.Tyr329Cys
T/C 23809513 downstream_gene_variant
C/T 23809689 downstream_gene_variant
T/C 23809699 downstream_gene_variant
T/C 23809906 downstream_gene_variant
T/A 23810100 downstream_gene_variant
G/T 23810102 downstream_gene_variant
A/G 23810108 downstream_gene_variant
G/T 23810190 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36457.1
MGIQCSRLIPCCVDSQVKASVIETPDAEIEDSSEVSNWPTFREFTLEQLKNATSGFAVENIVSEHGEKAPNVVYKGKLENQMRIAVKRFNRNAWPDARQFLVNSYASFGFIFNLAFNWETQPMKWAMRLRVVLHLAQALEYCTSKGRALYHDLNAYRVLFDEDGNPRLSSFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTPESVIYSFGTLLLDLLSGKHIPPSHALDVIRGRNIQMLTDSCLEGQFSDDDGTELVRLASRCLQYEPRERPNPKSLAAALAPLQKETEVPSHVLMGIQHSTNFASLSPLGEACSRKDLTAIHEVLENIGYKDDEGVANELSFQMWTDQMQETLNCKKKGDVAFRQKDFRLAIECYTQFIDAGTMVSPTVYARRSICYLISDMPQEALNDAMQVQVVSPVWHIASYLQSVALTALGMENEAQAALKDGTTLESKRSATTKQK*


CDS Sequence:
>Vu_36457.1
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Promoter Sequence:
>Vu_36457::LG11:23803392-23805392(+)
TTACAATAGTATTATTATTATTTATTTCCATTAACTATGTTACAAATAAAATTGTCCCCCTGAAACTCAATTAGTAGCATTATCCTTTCTCTTTTCTTTAGTTTTTGTAAAATGCACACATTGATTGGTTGATATGCCAGCAATAAATATTTGACTTGATAAGCTTTAGCCATGACAGATAATCCTCCAAAACAATTGGCGGTGGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATCATACTTTGACCAGACTGGGGAGTAAAATTTTAGTTAATAGAAAGAAAATAATTAGTTCTAATTCAATGGTTCGTAATATTATAATTCAGTGGACACATTTAATTTCTGTTTACTGTTACTAATGAGTTCTTAGATTGTAACTATATCTCTGTAAAATTTCATCCAATGATCCTAATCTCAATTATTTATTGATATAGAAAGTAATATTTTATTGCAACCAACCATCTTATAAGAAATTTTAACAATAAAAAGCAAAACTTGAAACACTGGAAATGATAAAATAAAATAAAATGTACAAGCAAATGTGTTATGCCAACAAATTCTTAATAAAAAATTGTTTAAATAACATACAGATTCCTGATCTTGAACATATACTCATGACATACACTCATGATATGTCGGTAATAATTGATTTGTTTATTTATTTATTAAAACTAAAAAGGCTAAAAGAGAAAATGTCAGAAAACCAAAGCCATAGCTCTATCATTCATCACCATCTTCTTATTCTTCTGCTTCTCAACAGATCTTCAGTTCAGCTTTGAGTTCTCAACCAACTACTGTATTTTTCTCCTCTCAAGCTGATTTTGTTCATAGAAAAACTGAATTTTTTATAGTGTGGGGTTTGAGCATTTTACTTGATCTGTTTGAACCGAGAGGGGTGATTTGTAAAATCCTGATTTTCTGAGGAGAAAAGATTATTGGGGTTTGGTTGGATCGAGGGAAAGACTTGAACTTTGCAGATTGCAAAACGAGGTTCTATGGGAGCGAAAATGTGGATCTTGTAAAAGGTGTTGATTTGATCGAGAAAGACAAGAAAAGAAGAGAAAAGACACATTTTTTCAGCTCCAGGTGGTTCAACTTTTTCCTCTGCCATTGGAGAAGGTTAGAAGAAGTTTAAAAGGTGAAATAGCCTTTTGAGTAGGTTGAAAAAGTTGGTGCTTTTTGCCCAGCATTTTGTTTATGAAGACTTGAGTGTAACTGAGTTGACTTGAAGCAAAAAAACCAAAAAAGATAGATAGAAAATATAGATGTTAAAATATTATTAGGTAGGCTATCATATGAAGTTAAATCTTCATCATATGCGTGTTTGTGTTTCATTTTAACTTACACATTTTGAGGAATGCAGTAATTCTTCATGTCTGGTGTTCCTTAGCTTTTAATGCTAAGGTGGTAGTAGTTAGACTGTCATACTTAAAGAGCATCTTAATTGGGGTTGTTGCTGTCATTAGTTGTGGTTGTGAGAACATGAACTTGTCTACAAAAGTACTCGCTTTCCATCTTATGCTTAAATGAAGAAGTACTTTTCCGTTTGTTGTGCTTTTATGGATTTTTAATTTTTCTACGCTGCTTATTCCTTCCAAAAGGTTCCTGATGTTCATAAAATCTGGAAAACAAGTACAGAATCTACAGATTATTCATTTTCAATTGCTTGATTGTTTGTATTGAAATATTTGAAGATCATGTTGATAAATAATTTGTGCTATAGTCAAATGATTTTTGTTCACTTGAGGAAAGCTTTTGAAGTGATTCACAGACAATTCTGGCTTTGTTACAGATACATAAGCTGTGGTATCAAAGCCAAATATGAATGTGGCTTGTGACAGTGCATAGGGTTGATAAGGTCCAGGTGGATCTGAGTGGACTGATTGTCATTTTCAAATATTTTCAGTCAAGACTGCTTCGTCATTGAAAGTGGAAGAGGTTTTCATTACTTCAAGTTTGATTTCAGCCTGTCAAAA


Gene Sequence:
>Vu_36457(+)
ATGGGTATTCAGTGTTCCAGACTCATACCATGCTGTGTGGATTCACAAGTTAAGGCATCTGTTATTGAAACTCCAGATGCTGGTGGGTAAAGTGACACTCTAGTGCCTTATATAGTTCCAGATGATTATAAGGAGATATGATATATGCTTATTTGAACATTTGTTCCAGAAATTGAGGATAGTAGTGAGGTCAGTAACTGGCCTACATTCCGGGAATTTACACTCGAGCAACTCAAGAATGCAACATCTGGTTTTGCTGTTGAGAACATTGTATCTGAACATGGAGAGAAGGCTCCCAATGTTGTTTATAAAGGAAAACTGGAGAATCAAATGAGGATTGCTGTTAAGCGGTTTAACAGAAATGCTTGGCCGGATGCTCGGCAGTTTTTGGTAAATTCATATGCTTCATTTGGTTTCATCTTCAACCTTGCTTTTAACTGTATATTCTTCTGGTCATGACCTTGCATTGCACAAATGCATTATTTATGTGCTCTGCATTACTCAAATGAGCGTATAGATATGGACTAGTGCCAGTGAACTATATGTGAAAATGATAAATAAATCATAGTAAGTATTCTGAGTTCTTTTGGCCATAATCAAGTTTTCAAATGGGTATAAGCTATCCTATATATTCTTCCCATGTTGCCTGGTCAATTTTGCTGTTTTGGTCACATGCAAGTGTGCCTGATGCTTAACACTGTATCTTTATTTACAAATTTCAATGGGCTGAATAATCCCAGATTCCTGGGTTTCAGTGTGTTTGAGTTATTGGTGTGCATTTGGTTGTTCTGCTAGACCTTCCTTTTTGTTTTTCATTTTCACTTTCAGTTAATCAAAACAGATTTATTTCATAACTGCAGGAGGAAGCAAGATCAGTGGGTCAGCTTCGTAACCAAAGATTGGCGAATTTGCTTGGTTGTTTTTGTGAAGGAGATGAGAGGTTGCTTGTGGCAGAATATATGCCCAATGAAACACTGGCAAAACACCTTTTCCATTGTAAGAGCTCCTTTCATGCATTTTTTTAAACTCTGAAGTATTGAAAATCTAATCAGTGCTAAAGTTATGGTTTATGGTTTTGTTGTTTTTGTGCTTTTCTGTGCGGTTAATGCTCTGCTTTGTTGGTGCAACATACTTGATTGGTACATAAGCTACCAAACTTCTAACATTTTATTTTTTGATTTTCATGATGTTGCCCACTTTTTTTAAATGTGTTTGTTGATTATCATGTGGGCGTGGACAAACTGAACACATTATAAACCACTGAACACATTATAAAAGATGCTAGTACAGTATGTTATGATTATAATAACTTGAGTAACTTTTGTTTGATAATTACATTTCTTCCCTTTTCTCTTTAGAAGTCACTTATATAAATCAATATGCTTTTAATTAGTTAGTAATTTTTTTTTGTGATAAGTAATGAAGTGTAAACAAATTTCAGTCTTGGTTTCTTTCTGAATTGTGATTTAGGTTGTAGAGGACAACTGCTTTGATAATATTTGACTGACTACAACTTGTTGGAATATTGTTGTTTACAAAATTTTGTTTTAACTGTCAAATTTTGAAGAAGAGCACGTGCAAAATGAATGTCAATATCTATGAAGACTTCTATATAAATATACTGTATTGGGAAGTGTCTAAAGTTATGCTAGATGATGGAAGCTATGTCTTTTTTAATACCAATTTTCTAGAGTCAGTCTTTACATGGTTTCCCAAACAGTGTATATTTTAGTCCTTCAAAGTCTGATAAAAACATTGTAAGGTAGATCTTATAATAAGCTTATGTGGCATACATCTATATTTCATGAGGTTTGCTCCCCTTACTCTTCTAATCTCGTATTTGTTTTTGTATGTTGTTATGATTGTGTTGTTGGAATGATACTTTAAACACCAGATCCCTGAAGTTATTAATAATGTGGTCATGTGTCTAATCAGGGGAAACACAACCCATGAAATGGGCAATGCGACTAAGAGTTGTTCTACATCTTGCACAAGCTCTAGAGTACTGCACAAGCAAAGGGCGAGCTCTCTATCATGACCTTAATGCATATAGAGTTCTTTTTGACGAGGTAAGTTTTTGTGTATCCCCTTTTTGTACACATCCCAATAATTATATTAATAAAAAATGTGTTAGAACTTTGCAGGATGGTAATCCCAGGCTTTCGAGTTTTGGTCTTATGAAAAACAGCAGGGATGGGAAAAGTTATAGCACAAATTTGGCATTTACTCCTCCAGAGTATCTCAGAACTGGTATGCCATATAATAGCTTTTCTTTTTTATTAATTGGGTCTTCTTGCTCATGTTTTTATGATATTGAAATGAGTATCTGTTTTGCATTTGTAAATTTACAACTGTTTTTGTTAAGTAGAGATGAGCAATACATGATTTCTTGTATGTCTTTGTTTTGTAGGGAGAGTAACACCAGAGAGTGTAATATATAGCTTTGGCACTCTTCTGCTTGACCTTCTCAGTGGGAAGCATATCCCCCCAAGTCATGTAAGTAATTCTTACCAATGGGTAAAGAATATGAGTGCAGGTTGATTACAATGACTTGTGAGTTTAGTTTAGGTCCTAAAAAGTCCACAGTGAGTCTTATTTGTTTGGTTGGTAGACTCAATTTTTTAATGTTCATGAATTTTCCTTTTCCCTTTTTTCCTAATAAAACAAATGTGCCAATGCCAACAATTCCAGAAGTTTAAGTTTAATCATGGAAATTTAACAGGTTTCTTTTCTTGTTTTGATGCTAAAATCCTTGAACAAAATGTGTTTTAAAAAAAAGGTTGTGGTGGTCACAAGATCATCCCCAATTTTCCTTCCCTGATTTGAAAATTTCTTAACAAGAATGAAGTCTATTCAAATCCTTATTCTCCCCTCCCATATCTTCCATCTACAACATACCATTATTAGCTAATTATATATTACTATGTTGTATGTAAACTTGCATATGTGATTATTAGAAAATTTGGTGCAGGCACTCGATGTCATTCGTGGAAGAAACATTCAAATGCTGACAGATTCTTGTTTGGAAGGACAATTTTCTGATGATGATGGAACTGAGTTAGTACGCTTGGCGTCTCGATGTTTACAATATGAACCTAGAGAACGGCCTAATCCAAAGTCATTGGCAGCTGCATTGGCTCCTCTTCAGAAGGAAACAGAGGTTGGTTTAGTATTTTTATGTAATAGTTAGGAATCATGTACCAGTAGTAATCAACCAGTATTTTGTTTGAAATCTTGTTTGCTTATTGCAAATAGCTTTGTAGGGGATATTCATAAATTGGTCTAATTCAATGCAAACTGCAGAAACTAAACTGAGCAAACTGAAAACTAAATAAACTATAAACTGAAAGAATTGAGAGAAAGAAATACTAGATTGAACCAGATTTCAAATATAATTTTAAACACTAAATTTATATATCAAGATATAATTCGATCCGATACCACTTTTAAGTAGTCTGTATTAGAGATCATATTAAATCAATCTAAATGGAAACAGAGCTTATTTTTATGGTTATATTAGATGAATTTTTGCTTAGAAACCGATCAAAACTGATGAATAAACACTGTATTTGTTTATATGTTTTAAGTGACCTCAAATGGTTGTGTGGAGAAAAACCAGATTTTTGTTTATATCTGTTCTCTTGTAACATACGCACATCATCTCAAGCAATTAAACTAACATTTATTTAGGCTCTATCTTATACTTAAGGCATATCTTTCTTAGCATATCTTTATTATTCATTCAGGTTATCATATATTTGTACACTATCCATTACATACAGATCACAACAGCTTGGTTAATCAATTTGGAAGTTCAAGTTGTGATTATTTTTTTCTTAACAATATTCATTTATTCTCATTTATTTCTAGGTTCCTTCACATGTCTTGATGGGCATCCAGCACAGTACTAATTTTGCCTCATTATCTCCACTTGGTGAAGCATGCTCAAGGAAGGACTTGACTGCCATACATGAAGTTCTGGAAAATATTGGCTATAAAGATGATGAAGGAGTGGCAAATGAGGTTCTCTTTCTAAATTATATTTTACTGAGTTACTGCATATCTTTTAATTGTTGGGGTTATCTTTTTCCACAAACCATGAACCTAATAACAAATATATATACATACATTCACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACACACTACACAAACACACGACACAAACACACGACACAAACGCATACGTGTTCTTCAAAAGAAGATAACTTATGTATTTTCTCTACTTTTTTGTGGTATTGCAGTTATCATTTCAGATGTGGACTGATCAGATGCAGGAGACATTAAATTGCAAGAAAAAGGGGGATGTTGCTTTCCGGCAGAAAGATTTTAGACTGGCAATTGAGTGCTATACGCAGGTAGATTACTGATGTTGATAAGTTGGACTTGTCTGAATTGGCTTGCACTTTTTTTATTCAGAGATTGCTGATTAGTTAAATTAGATTGCATATCACAAAATAGATCTCTACTTGATTTTTAAAATAAAACTGAATCTGGTAGTGACCCGATCCTCCAGATCCACTACATGGGAGATTTTCATAATTATGAATAATGCTTTAGATTTCTTGGTAGAGATGCACACTATACCTTATGTTTAGTAAGACTATTGGTCAAAAATAAAGGTTTTTTTTTCACTGATAGTGACCAGATCTTTCATATTGATCTGTTCTGCTCAATGTTTTATTTGGATTCTAATGCTAGTTTAGTCATTATGAGCTCGTTGTTCTTTGCAGTTCATTGATGCTGGAACAATGGTTTCTCCAACAGTCTATGCAAGGCGTAGTATATGTTATCTAATCAGTGACATGCCTCAGGAAGCGCTGAACGATGCAATGCAGGTGCAAGTTGTTTCCCCTGTTTGGCACATAGCATCATATCTTCAATCTGTTGCCCTCACTGCACTTGGGATGGAGAATGAAGCTCAAGCAGCACTTAAAGATGGCACAACTCTGGAATCCAAGCGAAGTGCAACTACCAAGCAAAAATGA