Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36446 LG11 23660271 23660656 PREDICTED: calcium/calmodulin-regulated receptor-like kinase 1
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SNP Position Effect Amino acid change
G/A 23660366 synonymous_variant p.Leu32Leu
A/C,* 23660481 splice_region_variant&synonymous_variant p.Gly38Gly
G/C 23660508 missense_variant p.Glu47Asp
G/A 23660577 stop_gained p.Trp70*
G/C 23660625 missense_variant p.Gln86His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36446.1
MVQHPNLVRLIGYCADDHYRILVYEFLANGSLENQLLGEGKEPLDWKSRMKIAKGLEYLHSSEDTPIIYRGFKSSNIVLDDNFNAIRGFIGRKSMW*


CDS Sequence:
>Vu_36446.1
ATGGTTCAACACCCAAACCTTGTGAGGCTCATTGGCTATTGTGCAGATGACCATTATAGGATTTTGGTTTATGAATTCCTGGCCAATGGGAGTTTGGAAAATCAGCTTCTAGGTGAAGGTAAGGAGCCTTTAGATTGGAAGAGCAGGATGAAAATAGCTAAAGGACTTGAATATTTGCATAGCAGTGAAGATACACCTATCATATACCGTGGTTTCAAATCATCTAATATAGTGTTAGATGATAACTTTAACGCAATCAGAGGCTTCATTGGCAGGAAAAGTATGTGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_36446::LG11:23658271-23660271(+)
TTGGTGAGTCTTTTACCATGTGATGTTGAGATGGTAACACAAATATTCCAAATGGTTTAAAAATATTACTATAATATAAATTAAATAATAAAATGAATTTAAGATTGTTATATCAAAATAGTTATCTGTAAAGTCGTGGAAGCTTGTTGATGTTGATGGTGAGAGTTTCTTCAATCAGGATCAATATGTAGTGGCCTGGTCGTCATGATGATGTTGAGACTGCGTCCTTGTCTGGTTCCTTGCAGTTTCAGCGGGATGTCGCTCAGCCGATAAGCTCTAGATTGGCCAAGTGATTTGTGTATATGATCCTGTCATCTGCACTGCGAGGCCGAGTGGCCGAATATCTGTGAGGCCAAATGACCGAATACTTGATGGTCGAATGGCCGAATACTTGTGATTCAATGGAAACTGTCTGGTTGGTAAGTCGAACGGTTTGCAGGGGTTATGTTCCCTTCTATCTCGACCGTTCGGGTTGGTGTGATTATGGCTTGCTTCATTGCAATTCTGTCTGTTTGAAGCGGACCTCTCAGGAGGGACTCGTTCCGCCCTTAGCGCCGCAATCTCCTCTGCGTGCTCCTCCATGTTTCTCGTGGTCACCATTGGGTTTCTTTAGCTTGCTCTCGGCCCCACGGTGGATGCCAAAATGCTTCGGTAGGGATTTTGTAGGACCGAGAGACTAACATTTCTAACGTGGCTCTGCTGCTTTCCAGCGCTAGAATCGTGTGCTCCGCTTGCTTGCCTTCAGTCAGGACCGCTTAGTTGCCTTCTGGATCGCTCGCCTGCCAACCTCTCTGCTCAGTCGTCACCGGCTCCGATCGGTTGTACTCTTGACCGGAGGGGGGTACCTGGAAAAGGTGCTCCGACACTCAAGTTAGGAGCGATTTTATGAATATTTAAGTCCTGATCGGACGTAAGTAGAGTGTAGTGGAGTGTGAGTTGAACATAAGTAGAACGTACCTGACCTTTGGCCCTGTCATTGTACTTATAAGTCGTTTCATGGATCTAATCTAGCACAAATCCAATAAAATAAAAACATACTTACCTTTAGATTTGGTCATTTGCTCATAAACAGCTTATCAATATCTTTAATCAGATACTTTTGATTATTTTATCGTCCGCTGGACATTTGACCCAATAATAACTGATCCAATTATGACCACCCAATATCATTTAACTTGGTTGAACTTAGTTGAACTTAGTTGGTGTGGCGTCTGGACCGAAGGGTCCTGGATTGTTACCGTTCGACCGGAATACATACGATACAATATTCAATAGTCTTTGAACCATATAATATGGCATAAAGGCATATTTGGCCTAAGTGTGTTGTTCATTTTTAAATTATTTTCCTAAAATTGTATTTTGTTTTTATTTTAAAGTATGTATCAATTCTGTTTTTACACTTCATAGAAACCTATGAAGTATCATCGGCATCAAATGATAGCTAGAGTTATTGACAACAGTTTTATTATGTGATAAACTGATTTACTTTGTTTTTGGATTAGACTTACATTTGATTTTTTTTCTCCAAGTCTTACTAACTGTTAACTATGAAACACCGTTAAAAACAATAAATTATTAACCGATGTACTAAAAAATAAATAAAAAAAGGCTATCACATTAATTATTCATAAAACCGTAATGATTAATACATTAATTCTCTTTAAAATTGTAACCATATTGTATTAGTATTATAGCATTACAATTGTGAATACAAAGGTAAGATTTTTTTTCTCTATTTGATATAATACTGTGTTATTAAATTCAATTGCAGATGTTTGGCCTTCTAGCCATACAACCAAAATTTAATAAAACAAACTCCATATATTAAAGGTCGAAGAAAATGAATAGGATTCATTTTCTAATAATGCTTTGAGCTTTTCACAAGGTTGTGAAAATCTAATGTGAAGTATTTTGTGTTCAAACTGTAGCTGTGAAGGTACTGAACAGGGACGGAGCACAAGGAACACGAGAATTTTTTGCAGAAATTTTGATGTTAAGTA


Gene Sequence:
>Vu_36446(+)
ATGGTTCAACACCCAAACCTTGTGAGGCTCATTGGCTATTGTGCAGATGACCATTATAGGATTTTGGTTTATGAATTCCTGGCCAATGGGAGTTTGGAAAATCAGCTTCTAGGTATGATGACAGAAAAGTCTGGTGTGGACTTAACTTTACAGAAACACATTGTATATTATGCAACTCTAACTAGATTTTATTGATGTCAGACATAGGTGAAGGTAAGGAGCCTTTAGATTGGAAGAGCAGGATGAAAATAGCTAAAGGACTTGAATATTTGCATAGCAGTGAAGATACACCTATCATATACCGTGGTTTCAAATCATCTAATATAGTGTTAGATGATAACTTTAACGCAATCAGAGGCTTCATTGGCAGGAAAAGTATGTGGTAA