Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36438 LG11 23553609 23553791 PREDICTED: myb-related protein Zm38-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 23553644 missense_variant p.Leu50Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36438.1
MGRKPCCDKMGMKKGPWTAEEDEILVNYINKNGGHGSWRSLPKLAGFHALFLSTLLASGN*


CDS Sequence:
>Vu_36438.1
ATGGGAAGGAAACCCTGTTGTGACAAGATGGGTATGAAGAAGGGTCCTTGGACTGCTGAAGAGGATGAGATTCTTGTCAATTATATCAACAAGAATGGTGGCCATGGAAGTTGGCGTTCTCTTCCCAAGTTAGCAGGTTTTCATGCCCTTTTTCTTTCTACTTTACTTGCTTCAGGGAACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36438::LG11:23553791-23555791(-)
ATCATTATAATTGATAATGACATTGAATATCATATACCTTTTTATTCTTCTTCTCTTAGCATTCTATATATTAAACCTAATGTGTTCAAATGCTTTAATTAAACTCTACAGTTGAAATGAAACATAGATACTTATTGAAGGTTTCTTCGTTTCTTATTGATTATTTCAATCTAAATTAAGTGTAAAGTATTTCTATCTCTCACATATATTATTAATAAAGGGACGGATCTTTAATACATATGTCAGGATATTAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTCATGTCAAGGATATAAAATATATTAACAATAAATTAAAATTTTAAAAGAATATCTTAAATTATATATTAATTTATATAAATATAAAAAAAATGAATTTAGCAGACAAAATTCATCCTATTACCGTTAAAGTCTGCCACTACTAATAGACTTCATATTCCTTGAACACAGAAAATTTTCATATGAAATCTTACGTCTTACTTTTACTTTTTCTTTTTATAAACAAAGGTTTTTTCTTTTTTTTGATATATCACTATATCAATCCATAAAAAAATATTTCTAGGAATATCATCTTCTATGCATTTGTTTTCCTTATTTTTCAAGCATCTATGTTCATAATATTGCCTACATTCCTTTGTTTATTCCTTCTTACTCATCCTTTTATTTGATTTTCCTACTATGATTCAACCAAGTACTACTGCATAATACACCTCTTATTTATTTATTGACCTAAAACCTCAATAAAACTATATAATTTTAAATATAATTTTTATAATAATTTAAATATAAAAAATATATTTAAATCAATAAAAAAACATTATTTTTTGAAAAGATTTAATTTGTATAAAAAAATTGCAACGGTTTCCTGTAATAGAAGAGAGTGTCTTAATTAATGGTGGTGAATCCGTACACTGAGTGGCATTAATTGGAGCTTCATTGATGCTTCTTTTCGGCTCAGTCTATCCTTTGAAATATCTGAACATGTCACTGTGCATGTTCATTGCTCAATCTTTATTTTTTTCTTTTTCTTTTTCATTCTCTAACTAATGCAATCACCATCCTCTTCATTGCTTCCCATTTTCTCTGTCATTCCATTTATGTGCAAATCAAAAAACCTCTATTCAACCCAACACACCCTTTTCCTCCTTTATCATGCATCTCTTATTTTTCCTATTTTATGTGTCACTGTGTCTTTAATATTTTCAATTTAAAAATTATTCAGATAATAAATTATGTCAAATATTTTTATATAGATATAATGATTTTTCACCATCCAAACATTGCATGTTCTTTAGGTGAATCCTCTTACTTAGGCACCAATTATTTGTATATATTATACAAGTTAAACTTAATTAATTAATCAAAACTCAAACCAACTTAAAAACTATTTCTTGGCCTTTGTAGCAAGAGAGATAAAGATGATCTTGCAACTTTATAGGTTATGCAATACATTGTTGATTAAGTATGTTATGGATTCATTCATCTGATTGATCACTCACAATAAAATATTCTTCTCTCAATCACAACAAAACATTTGAAAAAGCAAGAAAATAAATAAATAAGGACAATGTGTGTGCAATAAATATGAATGAATATGAGCAGACTATGATTCAAGTTCTGAATTACTGAGCACATTTATTGCATAAAGCCAGCTTGAAAGTCGCCTATAGTCCTTGCAAGCCCAATCAATAAATACTGTCTCCTCAAATAGCCATAATGATCATACACATTTTCTTTATACTTTAAAATCCTTCCAAATTTATGTCATAGCCACTTCCGGGCTTAAAGTGTGTATGTAGTACAGGGATCTCATTCACTCACTTGAAGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGAGAAATTAAAAGAAAACATATGCTGTTGTTTTTGTCTGGTTTATTATGAATGTTGGTTTGGTTTTTATTGTGATGATTTTCACTTTGTTGGTGTGTTGTGGTAAGG


Gene Sequence:
>Vu_36438(-)
ATGGGAAGGAAACCCTGTTGTGACAAGATGGGTATGAAGAAGGGTCCTTGGACTGCTGAAGAGGATGAGATTCTTGTCAATTATATCAACAAGAATGGTGGCCATGGAAGTTGGCGTTCTCTTCCCAAGTTAGCAGGTTTTCATGCCCTTTTTCTTTCTACTTTACTTGCTTCAGGGAACTGA