Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36387 LG11 22881551 22882519 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 22881553 start_lost p.Met1?
A/G 22881584 missense_variant p.Thr12Ala
T/A 22882111 synonymous_variant p.Ala187Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36387.1
MAGAEATKYGSTTSPTTTATTNMATRSSKPATMIRRFIGVRQRPSGRWVAEIKDSSQHVRLWLGTYDTPEEAARAYDEAARALRGENARTNFAPMNQATGQSGSNLLTGDGKHGLSFASLKAKLSKNLQNIMARASDHNKSSKSRVSDHFTFANIFHRRSYQIPEGDMRNIEKVVQPSIIVPPVEGAVDYASAANWESASTVSDCSSEWVGFGKLGLDQSDGSDIGEFSVGDQGFLEQLMGWVESPDVTDQSECSRSKRFKVSSSVLVPPTFTASPYDCGSPYSGYASPYNGYSSPYNGYASPYNGCASPCNGCVSPYYNKK*


CDS Sequence:
>Vu_36387.1
ATGGCAGGAGCTGAAGCTACAAAATATGGTTCTACTACAAGTCCTACAACCACTGCTACCACCAACATGGCCACCAGATCGAGCAAGCCAGCAACCATGATCAGAAGATTCATTGGGGTGAGGCAAAGACCCTCAGGAAGGTGGGTGGCTGAGATCAAAGACTCTTCTCAGCACGTGAGGTTGTGGCTTGGAACCTATGACACCCCAGAAGAGGCTGCAAGGGCCTATGATGAAGCTGCAAGAGCCCTGAGAGGTGAAAATGCCAGAACCAACTTTGCTCCAATGAACCAAGCCACAGGGCAATCAGGGTCTAACCTTTTAACTGGTGATGGGAAGCATGGTTTGAGCTTTGCTTCCTTGAAAGCCAAGTTGAGCAAGAATCTTCAGAACATCATGGCTAGGGCAAGTGATCACAACAAGTCCTCCAAGAGTCGGGTGAGTGACCACTTCACCTTTGCCAACATCTTCCACCGCAGGAGCTACCAAATCCCTGAAGGGGACATGAGGAACATTGAGAAAGTGGTGCAGCCTAGCATTATAGTACCACCTGTGGAAGGTGCTGTTGATTATGCTTCAGCTGCTAACTGGGAAAGTGCTTCCACTGTCTCTGATTGCAGCTCTGAGTGGGTCGGATTCGGCAAACTCGGGTTGGATCAGTCAGACGGGTCGGATATTGGAGAGTTCAGTGTTGGTGATCAAGGGTTCTTGGAGCAGTTGATGGGGTGGGTTGAAAGCCCTGATGTTACTGATCAAAGTGAGTGTTCAAGGAGTAAGAGGTTCAAGGTATCTTCTTCAGTGCTTGTACCTCCAACTTTCACTGCTTCTCCTTATGACTGTGGATCCCCTTATAGCGGTTATGCCTCCCCTTATAACGGTTATTCTTCTCCCTATAACGGTTATGCTTCCCCCTATAACGGTTGTGCCTCCCCTTGTAATGGTTGTGTTTCTCCATATTACAACAAGAAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36387::LG11:22879551-22881551(+)
AATGCAACAAGTTTTACACACTGAATAAACGTTTGGTTAATTCAATTTTTTTTTAAAAATAATCATGTATATTTTCAATTTCACAACTTTAAACAAATGGGTGATTATTTTCCTGAAAATATTTTGTACTATATAAAAAAAATTAAGATATTTATTCGAACATGAGTGATAAAACTTAATATAATTAGCTTAATATGGCAAAAAGTTTGCAAAGATATATATAATACGGACAAATATTTTTTAAATATTATTAGTGTAAATGATTTACTTGGTCAACCAGTAAGAAAATAATAATATTTATACTTTTTAAGATATCTATAGTTACTATATTAAAATCAACAACACCTTACCTTACCGTAACAATTGTTTTGGATGATATATTTGTATACGAATGACACAATTATATTCCTTAAATTTGTTCTGAAACTGATATTAAGGCCAGATAGAAAAGTAAAAGTAGAAGTAATTTTAAAATATATTACTTTTACGTTGAGCAAAGATTAGATATGAAGGTGATAGCAGTGCAAGTGTAATGTGGTGTTTCGACAACATAAAATGGCAACCTTTTGCAACAAACAATAATCTTCCCTATCCTTAATTTACTTTGCAACATACACGCAAAAACAGACTGTCAAAAGATTTACTTTTTCTGTCGTGACCTTGATGCCTAGTAGCTCCTCACATCCACAAGAGTCAAGAAATACCTTTGCGTATGGTCCCTTTTTTTATTCAATGAACATATCCAAGGTTTCATCTTTCACTGGTCTGACTTGTCTGAAAGAAAAGTACAAAGTCTGATGAACTAGGTTAATGTTAGAACAAATTGATCTTAAGTTCAGCACATTGTGTTCAACTTGTTGATTCATAGTCCCTTGAATGCACTTAAATTAACTCACTTTTCTTCATATATATATATAGTTAGAGCTCCACTAGGAAGAAAAATATTATTTGTATCTGAAATTCAACCATATATATATATGTTGCTAGGATAGGCTTTGCAGAAGCTAAAGAGTAAAATGTTAAAGTATGAATGGTCAACCATGGAGTTAAGTGTGTAGTCATGCAAAATTACAAATACAAAAATTACAAAGGTAGCATTACTCGAGTTAAGTTGGCTGATATATCTGTTTCTGCACGCACATATTGCAGGCATGCATTGTAAATAATTGAGCTTGGATGATTTTGTGGCTAGTAGTGATTAACACGGTTCAATTTGGAATTTAGCAGATATTGACCATGCTATATCCTAAAGAGGAAATAATTATAACTCATTTATTATTCTTCACCTTTACAATCATCAATGACCCCTAAAATTATCTCAAATGCTCAAAATAAAACGTACTTTAATGATTAAACGTATAATTTATCTATAAATAAAAATTATGGACTTGTTCTAAACATAAAATGTAAAACTTTCACCCCAAAATTACTAAATGACACATCTGTTACATTACATCAGTTTAAAGAAAAGTGGGTGTATAAAAATTTAGATAGAATGTGATTAAAAGAGAGATGAAAAGTGTTAGTTGAATGTTTAAAATAATGATGATAAACCATCATTACTCTATTCTAAATCACAAATTGTGCACATGAACCTACGTAAGAGTGATATATTTAGCATAGTATGAACTGTTGGCATTTTCAGAAGCTCATCAAACCCATCCAATGTGCCGGGAGAGCAACTTGCAAGTACAAGAGGCACACATTATAAGTATTAAAAATTAGAAGCATGAAGAAACGTACAAACTACAAATGGGGATGGGAATATGCCTACATTCATACGCACGCTCTTCCAAAATTTTACTCACATATATATATACAGCTCATATAGATCAGTATCATCACATAAGCCACCAACGTGTTTTCTCTATCCAATCATACACAGCATATGCTAAAAAATACTCCAAACTCAACCCAAACCAAAACAAGCTACTCTACCTAATTAAAACGCCAAAATCTCATTCTCTTCTTTGTTTCCCTTTTTATTATTATTCTTGTTA


Gene Sequence:
>Vu_36387(+)
ATGGCAGGAGCTGAAGCTACAAAATATGGTTCTACTACAAGTCCTACAACCACTGCTACCACCAACATGGCCACCAGATCGAGCAAGCCAGCAACCATGATCAGAAGATTCATTGGGGTGAGGCAAAGACCCTCAGGAAGGTGGGTGGCTGAGATCAAAGACTCTTCTCAGCACGTGAGGTTGTGGCTTGGAACCTATGACACCCCAGAAGAGGCTGCAAGGGCCTATGATGAAGCTGCAAGAGCCCTGAGAGGTGAAAATGCCAGAACCAACTTTGCTCCAATGAACCAAGCCACAGGGCAATCAGGGTCTAACCTTTTAACTGGTGATGGGAAGCATGGTTTGAGCTTTGCTTCCTTGAAAGCCAAGTTGAGCAAGAATCTTCAGAACATCATGGCTAGGGCAAGTGATCACAACAAGTCCTCCAAGAGTCGGGTGAGTGACCACTTCACCTTTGCCAACATCTTCCACCGCAGGAGCTACCAAATCCCTGAAGGGGACATGAGGAACATTGAGAAAGTGGTGCAGCCTAGCATTATAGTACCACCTGTGGAAGGTGCTGTTGATTATGCTTCAGCTGCTAACTGGGAAAGTGCTTCCACTGTCTCTGATTGCAGCTCTGAGTGGGTCGGATTCGGCAAACTCGGGTTGGATCAGTCAGACGGGTCGGATATTGGAGAGTTCAGTGTTGGTGATCAAGGGTTCTTGGAGCAGTTGATGGGGTGGGTTGAAAGCCCTGATGTTACTGATCAAAGTGAGTGTTCAAGGAGTAAGAGGTTCAAGGTATCTTCTTCAGTGCTTGTACCTCCAACTTTCACTGCTTCTCCTTATGACTGTGGATCCCCTTATAGCGGTTATGCCTCCCCTTATAACGGTTATTCTTCTCCCTATAACGGTTATGCTTCCCCCTATAACGGTTGTGCCTCCCCTTGTAATGGTTGTGTTTCTCCATATTACAACAAGAAGTGA