Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36364 LG11 22432001 22435321 PREDICTED: receptor-like protein 12
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 22432229 synonymous_variant p.Ser733Ser
A/T 22432231 missense_variant p.Ser733Thr
G/C 22432233 stop_gained p.Ser732*
G/A 22432521 intron_variant
A/G 22432524 intron_variant
T/G 22432528 intron_variant
C/G 22432559 intron_variant
T/C 22432769 intron_variant
A/T 22432984 synonymous_variant p.Ile664Ile
C/A 22433009 missense_variant p.Cys656Phe
A/G 22433010 missense_variant p.Cys656Arg
A/G 22433680 missense_variant p.Phe548Leu
A/G 22433885 synonymous_variant p.Leu479Leu
A/T 22433892 missense_variant p.Leu477His
A/T 22434188 synonymous_variant p.Val378Val
A/G 22434280 missense_variant p.Ser348Pro
C/T 22434281 missense_variant p.Met347Ile
T/A 22434283 missense_variant p.Met347Leu
A/T 22434289 missense_variant p.Tyr345Asn
A/G 22434290 synonymous_variant p.Pro344Pro
A/C 22434293 synonymous_variant p.Leu343Leu
T/A 22434302 missense_variant p.Arg340Ser
G/A 22434305 synonymous_variant p.Phe339Phe
C/T 22434308 synonymous_variant p.Gln338Gln
T/A 22434309 missense_variant p.Gln338Leu
G/A 22434323 synonymous_variant p.Asp333Asp
T/C 22434326 synonymous_variant p.Leu332Leu
A/G 22434328 synonymous_variant p.Leu332Leu
T/A 22434329 missense_variant p.Lys331Asn
T/A 22434739 stop_gained p.Lys195*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36364.1
MSIIILCLFLLPFCLLNLSTNIIFVTGHCLGHQQSLLLHLRNNLVFNPTKSKKLIHWNQSDDCCEWTGVTCSKGHVIALDLSQESISRGIDHLSSLFELQYLQSLNLAHNDFHSEIPPQFKKLKNLRHLNLSNAGFEGQIPIEISYLIKLETLDLSSTVTSKHGLKLETPNIAMLVQNFTEIKELHLDGIAISAKGEVWSHALSSLTSMQVLSMSSCNLSGPLDSSLVKLQSLLILQLNQNNLAGPVPESLGSLFNLTTLQLSDCGLNGVFPKTIFQIPSLQVLDVSDNPGLHGSLPNFPSQGSLYNFNLSHTNFSGPLPESIDNLKQLSKLDLSNCQFRGTLPYSMSNLTQLVHLDLSYNNFTGPIPSFNRSKALIVLSLNHNHFMGTVPSTHFKGLTNLMRIDLGDNSFDGRVPSSLLRLQSLQHLMLYYNKFDGVLDEFPNASLSSLEMLDLSGNNFEGPIPMSVFQLKRLRLLYLSKNKFNGTLQLGVIGRLQNLSSLDLAHNNLSVDARIDDASSFPSLKTLWLGSCNLRAFPEFLRNKSSLFFLDLSSNHIEGTIPNWIWKFDSMVILNVSYNLLTDFEGPFQNLTSNLLKLDLHSNSLQGPAPTYLKNAIYLDYSSNNFSSINFVDIANLRALDLSHNRFNGLIPMSNKLHGSIGCSNYIGNWETLQIVDLASNNFSGTLPSSLLLSWKTLMLDEDKGGRFGHLYFNLYDDFNPNCDGGGKKFSPPSSETHTKGSIEWNILSVELGFTFGFGIYIFPLIFFKRWRMWYSKHLENILCKIVPQLDFVYVHRVGQNYRIMRWNPY*


CDS Sequence:
>Vu_36364.1
ATGAGTATTATTATCTTGTGCCTTTTTTTGCTACCCTTTTGCCTCTTAAACTTGAGCACCAACATCATTTTTGTAACTGGTCATTGTCTTGGCCATCAACAATCTTTGCTGCTGCATTTGAGGAACAACCTTGTATTCAATCCGACCAAGTCCAAAAAACTGATTCACTGGAACCAAAGTGATGATTGTTGTGAATGGACTGGAGTGACATGCAGCAAAGGCCATGTTATAGCTCTTGACTTGAGCCAAGAATCCATCTCTAGAGGTATTGATCATTTAAGCAGTCTCTTCGAGTTGCAATATTTGCAGAGTTTGAATTTGGCCCACAATGATTTTCATTCTGAGATTCCTCCACAGTTCAAAAAACTGAAGAATTTGAGGCATTTGAATTTGTCAAATGCTGGATTTGAGGGGCAAATTCCAATTGAGATTTCTTACTTGATCAAGTTAGAAACTCTTGATTTGTCTAGCACAGTTACTTCAAAACATGGTTTAAAACTTGAGACACCAAATATTGCAATGCTTGTGCAGAACTTCACAGAAATCAAAGAGTTACATCTGGATGGCATTGCAATATCAGCCAAAGGAGAGGTGTGGAGCCATGCTTTATCTTCACTCACTAGCATGCAAGTGTTAAGTATGTCATCTTGTAATCTCTCTGGTCCTTTGGATTCTTCATTAGTAAAACTGCAATCTCTCTTAATTCTTCAGTTGAACCAGAACAATTTAGCAGGTCCAGTTCCAGAGTCTTTGGGAAGTTTGTTCAATTTGACCACCTTGCAACTCAGTGATTGTGGTTTGAATGGAGTCTTTCCAAAAACTATCTTCCAAATACCATCATTGCAGGTGCTTGATGTGTCTGATAATCCAGGTCTTCATGGCTCTCTACCAAACTTTCCAAGTCAAGGCTCTCTCTACAACTTCAACCTTAGCCACACAAATTTTTCTGGGCCTCTGCCAGAATCTATTGACAATTTGAAGCAATTGTCTAAATTAGACCTATCAAATTGCCAGTTCAGAGGAACACTTCCTTATTCAATGTCAAATCTCACCCAACTTGTTCATCTAGACTTGTCATACAATAACTTTACTGGTCCTATTCCATCTTTTAATAGATCCAAGGCCCTGATAGTTTTATCCCTTAATCATAATCATTTTATGGGTACAGTTCCATCTACTCATTTTAAAGGCCTCACAAATCTCATGAGGATTGATTTAGGAGATAACTCCTTTGATGGAAGAGTCCCTTCATCTTTGTTAAGACTTCAATCTCTTCAACATCTCATGCTTTATTACAACAAATTTGATGGTGTGTTGGATGAATTTCCTAATGCATCTTTGTCATCATTAGAGATGCTTGATTTGAGTGGCAACAACTTTGAAGGGCCTATTCCTATGTCTGTCTTTCAACTCAAAAGACTTCGTTTGCTTTATCTTTCCAAAAATAAGTTCAATGGCACTCTACAACTTGGTGTGATTGGGAGGCTGCAGAATTTGTCTTCACTTGATCTTGCACACAATAACTTGTCAGTTGATGCAAGAATTGATGATGCATCATCCTTTCCCAGTTTGAAAACTCTATGGTTGGGTTCATGCAATTTGAGAGCATTCCCTGAATTTTTGAGAAACAAATCTTCACTGTTCTTCCTAGACTTGTCTAGCAATCACATTGAAGGAACAATACCAAACTGGATTTGGAAATTTGACAGTATGGTTATCTTGAATGTTTCTTACAACCTTTTGACAGATTTTGAAGGGCCTTTCCAAAACCTTACTTCAAATTTGCTCAAACTTGACCTTCACTCAAACAGTCTCCAAGGGCCTGCTCCTACTTATCTGAAAAATGCCATTTATTTGGATTACTCAAGCAATAACTTCAGCTCTATTAATTTTGTCGACATTGCTAATCTTCGAGCACTTGATCTTTCTCATAACAGATTCAACGGCCTCATTCCAATGTCAAACAAATTGCATGGGAGTATTGGATGTTCCAATTACATTGGCAATTGGGAGACACTTCAAATTGTTGATTTAGCCTCCAACAATTTCAGTGGCACATTACCATCATCACTCTTACTGAGTTGGAAAACTCTGATGCTTGATGAAGATAAGGGTGGACGATTTGGCCATCTATATTTCAATCTCTATGATGACTTTAATCCTAACTGTGATGGTGGAGGGAAAAAGTTTTCACCACCATCATCAGAAACACATACAAAGGGTTCAATTGAATGGAATATCTTGAGTGTGGAATTGGGGTTTACTTTTGGCTTTGGAATTTACATATTCCCACTCATTTTCTTCAAGAGATGGAGAATGTGGTATTCCAAACACCTGGAAAACATCCTCTGCAAGATTGTTCCTCAGCTTGATTTTGTTTATGTGCATCGTGTGGGGCAAAATTATAGAATCATGAGGTGGAACCCTTATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36364::LG11:22435321-22437321(-)
TAAAGGTGATTTAGATAATGAACCTAACTTTAAAAAATTATATTTATATTATAAGATTATTTTAAAATAAAATAGTCGGTCTCATTATTTTAATACACCTATTTATTCTAATACTCTATTTTCTACGTTCTTACAATTAGTTCATAGTTTTAATTTTAACTCTGTGTTGGAAACATTCAAAACAAAAAAATTAAACGTCTTAAATGTTTTATGCTTTTTCAAGTTTGAAAAAATTGTAAAAACAAAAAGAAAATATTTAAAAAAAAGGTTATAATTTATATTTGTTAATAACAGACGTCGACTATGGTATAGTCCAATTGACATTGGTGTTTATTAGTGTAGTAACATATGTCAATTGTATTTTATTTTTTGTTAGAAGTGATACGAATTGGACAAAGATGTATAGTATAATTCGTCGTAAATTGCCGTCAAATTTTCCTATGATCGATGTTTAACATGTATATTTTATTTCAATGTCAATTTGATGTGGTCCGCTAAGATATTAGAGTTTAATCCTTTAAAAATAAAAAACAATGTACTTTAAAAATCGTTTTTTTAGTAGTGAATGGTTAATTAGTGATTACTGCATACTGAGACTAAACCCATTCAGTGTGTGGGTTACGTAGCTTTGATCTAAAGATTTTCTACATCTCTATATTCAAATATTCTGTGTGGGTTATATTTAAGTCTATGAAGTTGAAAGATATAATTAGAAGAATTTTGACTTTCCATGCATGCATAGTCAAAACGTGAAAGATGGACAAGTTTCAAATGTGGTTCAGAATTATTCAAAATTCTGATTCCCCTCCAACACTTGCCATTGCCAAAACCTTGAAATATTGTGTGATCACTCTAATTTACAGTAATAATTTTCGTTCACGTATGATTTGGTTCAATAAAATCGTAGTTTTTCATGTCCCAGACTTCAAAACTTCACATCTATTTGGATTGATTTCACATGACTTTATAATCCATAAAATAATAATTTTAAATATATAAATATTAAGACAAAATATATATTTTAAATTTAAAGTAGATTAGTAAATGTAATTGTAATTAAAAATAATACATTGATATACAATATATAATATATAATATACAATACATGGATGTATTTTAATAAAATAATGTTACCTTTTAAAAAAATATATATATTATTTTATAAAGTGTTTTGACTGAGCCTAACTTCTTAAAACGTGGATTAAACGAATTGAAGACAAAAGATTAAAATGTATTTAATTTAGCCTTCAATGTTGTTTTTGTCGGTTTTTTTATCACTATGTTGGTTAAATTCATTTTACCTAATTTCGTTTTAACTGTTTTAATAATAATAAAAAAATTGTCGTGAAATATTAATATTTCTTTGCAAGTATAGAAGTACTCGAGAATATATTTACGCAACCAATAATCAAAGAGAATAATTGTTCCCATTTTCATATTCCTGGGAATGGAAAAAGAAAATGCGCCTAAATATAATTCTTTTGTTTTGGTATTGGCGAATACAAATCTAAATCCTAAATATTAAGGTAAATAAGTCTAATGTTGGTAGTTCAAGATTTTGTTGGTCAATAACAGAAACATATGAATTTCAAAGTATTAGGGACGCGTCCTCTCCGTTCTCATTTTGTTTTCAACATCTTCATTGTACCACAAAATTGTTTGCATTTTTCTTTGCCACTTAAGTCTTCAAATTTGTTGGAAAATAACTTAATTAATTTAGTCATGAATCTCACTAATGTGATGTTTACATATATTGAACTTCCAAAGAGATATTTGTGAGTACAATCCTTGAAAAAGTTAAACTAAGTTTAAAGTTCATTTTATAATATTATAATATTGTGTATCAAAGTTATGAGCCCTTCATATCAGAACAACATCAAGTTAGATTTAGTCAACTTGTGAATTGATAATTAGGATCTATAAAAGGAACAGATCATGTCCTAAAAGGCAAAACAACCTTAAAATTTGTCGTAGGGTTGAGTCTCATAATCATATATCCA


Gene Sequence:
>Vu_36364(-)
ATGAGTATTATTATCTTGTGCCTTTTTTTGCTACCCTTTTGCCTCTTAAACTTGAGCACCAACATCATTTTTGTAACTGGTCATTGTCTTGGCCATCAACAATCTTTGCTGCTGCATTTGAGGAACAACCTTGTATTCAATCCGACCAAGTCCAAAAAACTGATTCACTGGAACCAAAGTGATGATTGTTGTGAATGGACTGGAGTGACATGCAGCAAAGGCCATGTTATAGCTCTTGACTTGAGCCAAGAATCCATCTCTAGAGGTATTGATCATTTAAGCAGTCTCTTCGAGTTGCAATATTTGCAGAGTTTGAATTTGGCCCACAATGATTTTCATTCTGAGATTCCTCCACAGTTCAAAAAACTGAAGAATTTGAGGCATTTGAATTTGTCAAATGCTGGATTTGAGGGGCAAATTCCAATTGAGATTTCTTACTTGATCAAGTTAGAAACTCTTGATTTGTCTAGCACAGTTACTTCAAAACATGGTTTAAAACTTGAGACACCAAATATTGCAATGCTTGTGCAGAACTTCACAGAAATCAAAGAGTTACATCTGGATGGCATTGCAATATCAGCCAAAGGAGAGGTGTGGAGCCATGCTTTATCTTCACTCACTAGCATGCAAGTGTTAAGTATGTCATCTTGTAATCTCTCTGGTCCTTTGGATTCTTCATTAGTAAAACTGCAATCTCTCTTAATTCTTCAGTTGAACCAGAACAATTTAGCAGGTCCAGTTCCAGAGTCTTTGGGAAGTTTGTTCAATTTGACCACCTTGCAACTCAGTGATTGTGGTTTGAATGGAGTCTTTCCAAAAACTATCTTCCAAATACCATCATTGCAGGTGCTTGATGTGTCTGATAATCCAGGTCTTCATGGCTCTCTACCAAACTTTCCAAGTCAAGGCTCTCTCTACAACTTCAACCTTAGCCACACAAATTTTTCTGGGCCTCTGCCAGAATCTATTGACAATTTGAAGCAATTGTCTAAATTAGACCTATCAAATTGCCAGTTCAGAGGAACACTTCCTTATTCAATGTCAAATCTCACCCAACTTGTTCATCTAGACTTGTCATACAATAACTTTACTGGTCCTATTCCATCTTTTAATAGATCCAAGGCCCTGATAGTTTTATCCCTTAATCATAATCATTTTATGGGTACAGTTCCATCTACTCATTTTAAAGGCCTCACAAATCTCATGAGGATTGATTTAGGAGATAACTCCTTTGATGGAAGAGTCCCTTCATCTTTGTTAAGACTTCAATCTCTTCAACATCTCATGCTTTATTACAACAAATTTGATGGTGTGTTGGATGAATTTCCTAATGCATCTTTGTCATCATTAGAGATGCTTGATTTGAGTGGCAACAACTTTGAAGGGCCTATTCCTATGTCTGTCTTTCAACTCAAAAGACTTCGTTTGCTTTATCTTTCCAAAAATAAGTTCAATGGCACTCTACAACTTGGTGTGATTGGGAGGCTGCAGAATTTGTCTTCACTTGATCTTGCACACAATAACTTGTCAGTTGATGCAAGAATTGATGATGCATCATCCTTTCCCAGTTTGAAAACTCTATGGTTGGGTTCATGCAATTTGAGAGCATTCCCTGAATTTTTGAGAAACAAATCTTCACTGTTCTTCCTAGACTTGTCTAGCAATCACATTGAAGGAACAATACCAAACTGGATTTGGAAATTTGACAGTATGGTTATCTTGAATGTTTCTTACAACCTTTTGACAGATTTTGAAGGGCCTTTCCAAAACCTTACTTCAAATTTGCTCAAACTTGACCTTCACTCAAACAGTCTCCAAGGGCCTGCTCCTACTTATCTGAAAAATGCCATTTATTTGGATTACTCAAGCAATAACTTCAGCTCTATTAATTTTGTCGACATTGCTAGTAACATTCCTTTCTTGTACTTTCTCTCCCTTTCAAACAACAGTTTTCATGGAAAAATTCATGAATCCTTTTGTAACATTTCAGATCTTCGAGCACTTGATCTTTCTCATAACAGATTCAACGGCCTCATTCCAATGTGTTTGACAGGAAGTAGCAAACTCAGGCTACTAAATCTTGGTGGAAATAAACTCAATGGTTATATTTCAGATACATTCTCAACTTCATGTTCTCTAAGGTTTTTGGATCTTGGTGGGAATCTTCTAAGGGGAACCATCCCAAAATCTCTGGCTAATTGCCAAAAACTACAAGTTCTAAACCTTGGAAACAATCAACTAACTGACAGATTTCCATGCTTCTTGAAGAGCATCTCCTCCCTCAAAGTCATGATTTTAAGGTCAAACAAATTGCATGGGAGTATTGGATGTTCCAATTACATTGGCAATTGGGAGACACTTCAAATTGTTGATTTAGCCTCCAACAATTTCAGTGGCACATTACCATCATCACTCTTACTGAGTTGGAAAACTCTGATGCTTGATGAAGATAAGGGTGGACGATTTGGCCATCTATATTTCAATCTCTATGATGACTTTAATCCTGTGAGTTTCATAACTGCAATTGTAGATCTCAGTAGTGAGCTACAAATAAAGTTAGCAAAAGTTATAGCATCAGAGCCCATCCTTATAATAGACCACATAATCTCTCATGTCTTTGAGGAAGGTGTTGGTGTAAGAACATATGAGGATTCAGTTACAATTGTCAACAAAGGTAGACAGTTAAATTTGGTTAAAATCCTCACTGCCTTCACTTCCTTGGATTTCTCATCAAACAGTTTTGAAGGGCCAATAACAGAAGAGCTTATGAATCTCACTGCACTGCATGCTCTTAACTTGTCACATAACACTTTCTCAGGTAGCATCCCTTCTTCCTTAGGCAATCTGAAGCACCTTGAGTCCTTAGACTTGTCAGTAAACACTTTGAGTGGAGAGATTCCAACAGAGCTTGCAAAGTTATCATTTCTTGCTGTCATGAATCTATCTTACAACCATTTGGTGGGCAGAATACCCACAGGCACACAGATTCAGACATTTGAGAGTGATTCATTTGTGGGCAATGAAGGGCTATGTGGACCTCCACTAACCCAGAACTGTGATGGTGGAGGGAAAAAGTTTTCACCACCATCATCAGAAACACATACAAAGGGTTCAATTGAATGGAATATCTTGAGTGTGGAATTGGGGTTTACTTTTGGCTTTGGAATTTACATATTCCCACTCATTTTCTTCAAGAGATGGAGAATGTGGTATTCCAAACACCTGGAAAACATCCTCTGCAAGATTGTTCCTCAGCTTGATTTTGTTTATGTGCATCGTGTGGGGCAAAATTATAGAATCATGAGGTGGAACCCTTATTGA