Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36357 LG11 22257615 22275986 PREDICTED: MADS-box protein SOC1 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 22257991 3_prime_UTR_variant
G/A 22257999 3_prime_UTR_variant
T/A 22258074 synonymous_variant p.Thr219Thr
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T/G 22275571 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36357.1
MVRGKTQMKRIENATSRQVTFSKRRNGLLKKAFELSVLCDAEVSLIIFSPRGKLYEFSSTSIHQSIERYRRHTKSETSTTFRSVEQNMQHLKQEAANMMKKIELLEAAKRKFLGEGVGSCSVEELLRIEQQLERSLSNVRARKLQLFRDQIEQLKEKEKALVDENAKLTENVRLAEKNGMHLQLATKDQNENQPQNCAESSPSSDVVTELFIGLPDTRTKGLSHQV*


CDS Sequence:
>Vu_36357.1
ATGGTGAGAGGAAAGACTCAAATGAAGCGTATAGAGAACGCCACAAGCCGGCAAGTAACTTTCTCGAAGCGGCGAAATGGGTTGCTGAAGAAGGCTTTTGAGCTATCAGTTCTTTGTGATGCTGAGGTTTCTCTTATCATCTTCTCTCCAAGAGGGAAGCTCTATGAATTTTCTAGCACCAGCATACATCAGTCAATAGAACGTTACCGCAGACATACCAAAAGTGAAACCTCAACTACGTTCAGATCAGTTGAACAAAACATGCAGCATCTGAAGCAAGAAGCAGCAAACATGATGAAGAAGATTGAACTTCTTGAAGCTGCAAAACGGAAATTCTTGGGAGAAGGTGTGGGGTCTTGCTCCGTTGAGGAATTGCTACGGATAGAACAACAGTTGGAGAGGAGTTTAAGTAATGTTCGAGCAAGAAAGCTCCAGCTTTTCAGGGACCAAATTGAGCAACTGAAAGAAAAGGAAAAAGCCCTAGTAGATGAAAATGCCAAGCTCACTGAAAATGTAAGGCTAGCTGAGAAGAATGGCATGCATCTACAGCTAGCAACAAAGGATCAGAATGAAAATCAACCCCAAAACTGTGCAGAAAGTAGCCCAAGTTCAGATGTGGTGACTGAATTGTTCATTGGACTTCCAGATACAAGAACAAAAGGCCTCTCTCATCAGGTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_36357::LG11:22275986-22277986(-)
TAATAGAAACTTGAGAGCATGAAAAAGCAGACAATATTATACCTCGGTTGCCAAGAGAGTCGATGCCAAAACACATAAAAAAATATATTTTAATTATTTTAAAAGTCAGAAAAGGGCCTATAGCCTCGGTTCCCCCTAGAACCAAGGCCAAAACCCCTATGCAGAATTAATTACCTTCTTGAAAATATGAACGTTACAACTGACTGACTTTATGAGAAGAGGGTATGGCCTCGGTTCCATGCAGAACCAATGGCATATCCCCTTTGAAAAAGTCTGTCAGTTCAAACGTTAGAGTACAAAGCAGAAATGTCAGTTGGAGTAGAGGGGTTTGGCATCGGTTCTAAGAATAATCGATGCCAAAAGATCTGCATAGAGATTTTGTCAGACTACAGATAGGATTGTTAGTTGGAGCAGGGGGTTTTGGCTTCGGTTGCTCTCAGAACCGAGGCCAAAAACCATGCACAGATATCTTTGTCAGCTAAAAAGTCTTTTCTTGGCATGTGTAGCAAACTCTATGTCCTCGGTTGCCCTTGTAATCGAGGCCATATGAACTCTACGACTTCGGTTGGGAGAGAACCGAAGCATATACTTTTCCAATAATTTTAAAAATGTCACTACGTCACGTTATGTTTCGGTTTCTAGCCAATCAAAGGACGCTTTAGTAGTTTTTTTACTAGTCATCATTTAACAAAAGATAAATAATTAACTTTTATCTCTTTAGATCATTTAAGAAAGTGTAAAATAGCTTACTTCTAACTAGTTACGTTCCCGTGCCCGTTTTATGACATCTCAACTATCGGTGTTTTGACTAACATCTCTATGTCCTTATATATTAAATCTTTAAAATTAACCAGTCATTTTATAAATTTTTATTTTATTGTAGATATTAAAAAAATACTTTTCTTGACAAATTAAATACTACTTAAAAATGAATTTTAAAGACAAAAAAACATATAAAATAAGGAATGAGAAAACCGTTCAGAATTTTAAGAAGAATCGAATTATGTACTGGTATAACAAATTTTATTTAAACACGATGAATTCTGCTCGAGTTTTGAACCCGAACTTATATCAGTTACAGTAAACGAGTCATTTATGCATTACAAATAAAGAAAAAAAAAACAGAGTGGTGTGTCAATGCAACATAATGGTCATAATTACTTTTGATGGCAAGTTTCTTTGTTTTCGAGGTATTATTGGTCAGTTTTTGTACGATGTTGTACGGACGAAGTTGACGTGTTTCTAACACTGTACCGTTTTCTCTATTTTTAACTGTGATGCTGTGCCACCACAGTTCCTGAACCACCACCACCCTCCCACCTTCCTTTTCTCCTTTCCCATGTCTCACTTTTCACACTTCCTAAATATCAAACTACCATAACTACAATTTATAAACATTACTATCATGCCATTAAACCAAAACCATTCTTTCACCATTCATCCTCACTGTTTTTCGCTATTTTTATCACCACCTTTACGTAAATACCACTTCATTTTATGTTTCATGTGTTGGGGGTAGCAATGTAAATGCATAATTGTTTACTCTTCTTTCCCAAACGAAAATATCTTCAGAAGCCACTTTTTGAAGGTATCGAATAATTTTTTTCTCTGTTTTTTTATATTATTCGTAGTACAAAGAAGACGAGCAACGAAGCAAATTGAAGCTTGCAGTAATGATATAAATAAAGGTTTCCATATATATGGACTTCCCTGTCGTCCTTTATATGCATATTTTTTTACATGTCCCTTTATAGAAAAATCAAAGCATCATTTTCATGTATATTTTTTTATTGATGTGGAAATTTTTTTTTGGGTGGTTGGTGTGTTGTTTTTACTAAATGAAGCAAGGGATGAGGTTTCAATTTTCCATAACCATGTATAAAATAATTTGTTTCTTAATATAGTGTTGGGAACACAAGGTGGATGAATAAGGAAAGATGTTCTGTCTATGTGCTTTCTCTCTTGGCTAAAGATAGGTCAAATCCAACTCATTTTTCTTC


Gene Sequence:
>Vu_36357(-)
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