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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36320 LG11 21599977 21601902 PREDICTED: receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g45590
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 21599997 synonymous_variant p.Pro7Pro
G/A 21601184 missense_variant p.Ser403Asn
A/G 21601272 synonymous_variant p.Arg432Arg
G/C 21601292 missense_variant p.Arg439Thr
G/T 21601297 stop_gained p.Glu441*
G/A 21601371 synonymous_variant p.Gly465Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36320.1
MPSRPPPPSPHAAVSAISHRREMILCGVIGGALFLTALIVSVTVFLYRKLSYNRTAPFEHNQRRFSYSVLRRATNSFSPSTKLGHGGFGSVHKATLPSGQTVALKVMDSPGSIQGEREFHNELTLCSNLRSPFVISLLGFSSDRRGRKLVLVYELMPNRSLQDALLDRRCPELMSWAKRFDIAVSVAMGLEYLHHSCEPPVIHGDIKPSNVLLDEDFGAKIGDFGLARVKAVEDLGMVEEKKEGVVEIAVEEFGVTEEGESVSVVDVDRSPESCPVRAVDYSDASPVGGDKLSVVSDGCFESVDSENVNLNKKKGGGGSGRDWWWRQESGAGGESGRVKDYVMEWIGSEIKKERPKSEWVDSCSSSSPKVENENGNANGNEKSKKERKRLDWWASLDEEKVKSKVKKNRKPREWWKEEFCEELSKKSKKKKRGLEWWQREEEGVEQKKKRKSKGSRGSIDWWLDGLSGEIRNNGRRNSQDWGISGDVPKSGGISSTPSMRGTVCYIAPEYGGGGQLSEKCDVYSFGVLLLVLVAGRRPLQVTASPISEFERANLISWARQLAHNGRLLDLVDTSIHSLDKEQALLCITIALLCLQRCPGKRPSMKEVVGMLNGEADPPHLPFEFSPSPPSNFLFKGRKKAR*


CDS Sequence:
>Vu_36320.1
ATGCCATCGCGTCCGCCGCCTCCCTCGCCTCACGCGGCGGTTTCCGCCATCTCGCACCGTCGAGAGATGATTCTCTGCGGGGTAATCGGCGGGGCGCTCTTCTTAACGGCGCTTATTGTCTCTGTCACGGTCTTTCTCTACCGGAAACTTTCTTACAACCGAACGGCGCCGTTTGAGCACAACCAGCGACGTTTCTCTTACTCTGTTCTACGCCGCGCGACGAACTCGTTCTCGCCGTCGACGAAGCTCGGGCACGGCGGGTTCGGTTCGGTTCACAAAGCGACTCTGCCTTCCGGCCAGACTGTGGCGTTGAAGGTTATGGACTCGCCCGGGTCAATCCAGGGGGAGAGAGAGTTCCACAACGAGTTGACGCTGTGTTCGAATCTGAGGTCGCCGTTTGTTATTTCGTTGCTCGGTTTTTCTTCGGACCGGCGCGGTCGGAAGCTGGTTCTGGTTTACGAGCTGATGCCGAACCGGAGTTTGCAGGATGCGTTGCTGGACCGGCGGTGTCCGGAGCTGATGTCTTGGGCGAAGAGGTTTGACATCGCCGTTTCGGTGGCGATGGGGTTGGAGTATTTGCACCACTCGTGTGAGCCTCCGGTGATTCATGGGGATATAAAGCCGAGTAATGTGTTGCTGGATGAGGATTTTGGAGCGAAGATTGGGGATTTTGGGCTTGCTAGGGTTAAGGCGGTGGAGGATCTGGGAATGGTGGAGGAGAAGAAGGAAGGGGTTGTCGAAATTGCGGTCGAGGAGTTTGGGGTGACGGAGGAGGGGGAGAGTGTGAGTGTGGTGGATGTTGACCGGTCGCCGGAGAGTTGTCCTGTGAGGGCTGTCGATTACTCGGACGCGTCCCCGGTAGGGGGTGATAAGTTGAGTGTGGTGTCGGATGGGTGCTTTGAGAGTGTTGATAGTGAGAATGTGAATTTGAACAAGAAGAAGGGTGGTGGTGGTTCAGGGAGGGATTGGTGGTGGAGGCAGGAGAGTGGGGCAGGGGGGGAATCGGGGAGAGTGAAGGATTATGTAATGGAGTGGATCGGGAGTGAGATTAAGAAAGAGAGGCCCAAGAGTGAATGGGTTGATTCGTGTTCATCTTCTTCTCCTAAGGTGGAGAACGAGAATGGGAATGCTAATGGGAATGAGAAAAGTAAAAAGGAGAGGAAGAGGCTGGATTGGTGGGCGTCTCTCGATGAGGAGAAGGTTAAGAGTAAGGTGAAGAAGAATCGGAAGCCGAGGGAGTGGTGGAAGGAGGAGTTTTGTGAGGAGTTGTCTAAAAAGAGTAAGAAGAAGAAGAGAGGTTTGGAGTGGTGGCAGAGGGAGGAGGAAGGGGTGGAGCAGAAGAAGAAGAGGAAGAGTAAGGGGAGTAGAGGGAGTATTGATTGGTGGTTGGATGGGTTGAGTGGGGAGATAAGGAACAATGGGAGGAGGAACAGCCAGGATTGGGGGATTAGTGGGGATGTGCCGAAGAGTGGTGGGATCAGTAGCACTCCTAGTATGAGGGGGACTGTTTGTTACATTGCTCCTGAGTATGGTGGAGGAGGGCAATTGTCTGAAAAGTGTGATGTGTACAGTTTTGGGGTTCTGCTTTTGGTTCTGGTGGCGGGGAGGCGGCCGCTGCAGGTGACCGCATCGCCGATTTCTGAGTTTGAGAGGGCCAATTTGATTTCCTGGGCCAGGCAGCTTGCTCACAATGGGAGGCTTTTAGATCTTGTTGACACTTCTATTCATTCATTGGATAAGGAGCAGGCGCTGCTCTGCATCACCATAGCCTTGTTGTGTTTGCAGAGGTGCCCAGGGAAGAGGCCTTCCATGAAGGAGGTTGTGGGAATGCTCAATGGGGAAGCTGATCCACCACATTTACCGTTCGAATTCTCACCGTCACCGCCGTCAAATTTCCTGTTCAAGGGACGGAAGAAGGCTCGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36320::LG11:21597977-21599977(+)
AGATTGATTTACAATACCACTTGATCACAATATATACAAAAGATAGTTCATTTGGTGTACATATAAAATATGTTAATCTTATAACATTCTTTCAATAAATCACCTAAGTTGCTCCAACACTAAAGCATACCATAAATCACTACGTAACATATTAACGTTTTTTTTAAAATATAAAGACATACAATATTTCTTTTCACTCATTTATAATCATTCACATTCTATTTTTCACTTATTTTTTCTTTTTTCTACCATTACTAAGTGAATATTAAACATAATATTTTTTGTTGAAATGATTAATAATATATATTAAACAGGGTTTAATATTTATACACTCCGTATAAATATTATGAAAATAAACATGTAATACACTTATTACATAAATTAATCCGAGATGAAGTAAAATCTACACTCCTGAGTGCATAATTTATTTTTTCTATGGTTTTTAACAAAATACAGTATTTGTTTTATTTTTAATTAATTAATATCTTAGCGAATGAATAGGGGTGTGTGTGGAACATGGTTGGTGCATGAGGCACGTGACAAGAGATCACGTTCGCCACGCCCACGCGCACTTCCTGTGCTCGTGTTTACACTCCAAAGGAGATTTACTCGCTTTTCAACGGGATTTTCTCGTTGACTTTTCTTCTGTCATCAAAAGCAACACAAGTTCCAGTAACATCATCATTCAACATTATTTTTCTTTTATCTTTTTACAACCATAAATTCATTTTATTTATTTATATTTTAATTTCTCACAAATCCTATATTCCCAAATTGCCAAAATAGACCAAATCAAATTAATTTAAAAATGCAATGTAAAAAATATTTAAATTGAAAAAACATCAGAATAATAAAAAGGCTGGGGCACGTGTCATTTCATTATTTGAAAAATGTACTAAAAACTGTATTTTAAAAAAAAATCTATTTAAATCTAATATATGCAGTTCAACTTAATTACTGTCAGGTTTCCTAATAATATATTTTTAATGATAAAATTGATGAGTGGTATTTCTTTCTCTAGATCATAATGTGAATAATTTAAAACATTTAATAGAAAAATGAAGATATTAACCACTCATAATCTCAAATAACAGTTGATAATTTGGTCTCTTAATTAAGCATTAATATAACGTTCCCTATGGCTTTGCCTTCTTCTTTAATATCTTTAATTATGACACTAACACACCAACTAAGCATAATAAAATAACATATTTATCGTATAATTTAAAAAAAAAATAATCAAGAAAGAGAAGGAGAAGTAATTCAAAAGGACAAAAATACACCCATTTTAAGTTAAATTATTTAAAAATTAATAAGTAATTATTTCTTTTCAATTTTTTACAATTTATTGCACAATGTAACATGTTGGACAGATGATTAATTAAATGTGGAACCTAAAAGTTTGTACATTTTAAAAAAAACATCTGTTGTATATGAAAAAAGATTTATTAAGACAGATAAACAGAAATTAATGATTTGGTTGTTTGAATGAACAGCAAAAGTATTTTAAGCCGTGTTTGTTTAGATTTTTACCAATTTTGGTAAAATATGTCTACAGCGTTTTTTAATAGACAGGTCCACAAGCACAGTGGCACAGTGCAACTCCCTCCAAACAGAGCACTTATGAAAGGTTTGAACTTTTTTTCTCCAACTTTCTTCAATAGTTTAACTATCACCCTCACTCACCTTCTAATACTTTATTAATATTAGGGAAAAGGAAAAGAAAAGGGAATCTCAAGATAATTTTATTTTTTATTATTATTCATCAAAAGCAACCCTTTATTTATTTATTTATTATTTGTTTATTTAAATATTTATTTATTTCATTTATCTATCACAATATTGGTTGGCCAAGGGAACAAAATAAGTCACTCCTCACTGCTACTTCTTCTTCTCAACACAAAAGAAAATTCATCTGTTCACTTTCTCTTTCTCTTTTCTCATGAATGGTTAACGTCAAAATTAACATTTTCATTTCCTTCTCTTCGTTTTTACAGCCA


Gene Sequence:
>Vu_36320(+)
ATGCCATCGCGTCCGCCGCCTCCCTCGCCTCACGCGGCGGTTTCCGCCATCTCGCACCGTCGAGAGATGATTCTCTGCGGGGTAATCGGCGGGGCGCTCTTCTTAACGGCGCTTATTGTCTCTGTCACGGTCTTTCTCTACCGGAAACTTTCTTACAACCGAACGGCGCCGTTTGAGCACAACCAGCGACGTTTCTCTTACTCTGTTCTACGCCGCGCGACGAACTCGTTCTCGCCGTCGACGAAGCTCGGGCACGGCGGGTTCGGTTCGGTTCACAAAGCGACTCTGCCTTCCGGCCAGACTGTGGCGTTGAAGGTTATGGACTCGCCCGGGTCAATCCAGGGGGAGAGAGAGTTCCACAACGAGTTGACGCTGTGTTCGAATCTGAGGTCGCCGTTTGTTATTTCGTTGCTCGGTTTTTCTTCGGACCGGCGCGGTCGGAAGCTGGTTCTGGTTTACGAGCTGATGCCGAACCGGAGTTTGCAGGATGCGTTGCTGGACCGGCGGTGTCCGGAGCTGATGTCTTGGGCGAAGAGGTTTGACATCGCCGTTTCGGTGGCGATGGGGTTGGAGTATTTGCACCACTCGTGTGAGCCTCCGGTGATTCATGGGGATATAAAGCCGAGTAATGTGTTGCTGGATGAGGATTTTGGAGCGAAGATTGGGGATTTTGGGCTTGCTAGGGTTAAGGCGGTGGAGGATCTGGGAATGGTGGAGGAGAAGAAGGAAGGGGTTGTCGAAATTGCGGTCGAGGAGTTTGGGGTGACGGAGGAGGGGGAGAGTGTGAGTGTGGTGGATGTTGACCGGTCGCCGGAGAGTTGTCCTGTGAGGGCTGTCGATTACTCGGACGCGTCCCCGGTAGGGGGTGATAAGTTGAGTGTGGTGTCGGATGGGTGCTTTGAGAGTGTTGATAGTGAGAATGTGAATTTGAACAAGAAGAAGGGTGGTGGTGGTTCAGGGAGGGATTGGTGGTGGAGGCAGGAGAGTGGGGCAGGGGGGGAATCGGGGAGAGTGAAGGATTATGTAATGGAGTGGATCGGGAGTGAGATTAAGAAAGAGAGGCCCAAGAGTGAATGGGTTGATTCGTGTTCATCTTCTTCTCCTAAGGTGGAGAACGAGAATGGGAATGCTAATGGGAATGAGAAAAGTAAAAAGGAGAGGAAGAGGCTGGATTGGTGGGCGTCTCTCGATGAGGAGAAGGTTAAGAGTAAGGTGAAGAAGAATCGGAAGCCGAGGGAGTGGTGGAAGGAGGAGTTTTGTGAGGAGTTGTCTAAAAAGAGTAAGAAGAAGAAGAGAGGTTTGGAGTGGTGGCAGAGGGAGGAGGAAGGGGTGGAGCAGAAGAAGAAGAGGAAGAGTAAGGGGAGTAGAGGGAGTATTGATTGGTGGTTGGATGGGTTGAGTGGGGAGATAAGGAACAATGGGAGGAGGAACAGCCAGGATTGGGGGATTAGTGGGGATGTGCCGAAGAGTGGTGGGATCAGTAGCACTCCTAGTATGAGGGGGACTGTTTGTTACATTGCTCCTGAGTATGGTGGAGGAGGGCAATTGTCTGAAAAGTGTGATGTGTACAGTTTTGGGGTTCTGCTTTTGGTTCTGGTGGCGGGGAGGCGGCCGCTGCAGGTGACCGCATCGCCGATTTCTGAGTTTGAGAGGGCCAATTTGATTTCCTGGGCCAGGCAGCTTGCTCACAATGGGAGGCTTTTAGATCTTGTTGACACTTCTATTCATTCATTGGATAAGGAGCAGGCGCTGCTCTGCATCACCATAGCCTTGTTGTGTTTGCAGAGGTGCCCAGGGAAGAGGCCTTCCATGAAGGAGGTTGTGGGAATGCTCAATGGGGAAGCTGATCCACCACATTTACCGTTCGAATTCTCACCGTCACCGCCGTCAAATTTCCTGTTCAAGGGACGGAAGAAGGCTCGGTGA

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