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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36295 LG11 20753456 20758401 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase Aurora-3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 20754235 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36295.1
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CDS Sequence:
>Vu_36295.1
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Promoter Sequence:
>Vu_36295::LG11:20758401-20760401(-)
AGATGGTCAACTATAGCTCAGGAGGTCAACTAACGAAACGGCTTAGCTAGGCCAGCTAGCCACACACCAACCCGGATAAGTTAATCCGCAATTTGGAAGAGCAAACCAACGAGTCCAGCCGAACACTCAAGAGGTTGGCTGACCATACACCAATCCGGATGGACATCTCACAACCCAATCACCATTTCGGCTGACCAGTCATGTACCAAGTCGATTAACAAGACACCGAACTCGGTTGGTCAACAAATAGGTCACCCAACCATGTACCAGTTCAGATAATAGGCCATCGAGCCTGGATGATCACTAAACTGTTCAACATTCAATTGGACGATCAGTATGGACCATACTAGAATAGATAAAACAAAAATTGATCAACTTAAGAGTAAAGTATAATTACTCACGATTACATCATAGTTAGATCAATGTTAATCAAAAACCCAAGATTTGAGATAAAAAATATAGGTTGCGTGCATTAATTATGAACTGACTTTGATATTGATATTGGAATACTTCCTGCATACACCATCTGACTAGTTTGAACACACAAGATACAGTTCACCAGACAACATGTACACTTAGGACAATATAGCACAGCCTGGACGGTTGACCTTGACCCACACTCGACACAGTTTGATATACAATCTTTAGTCCACTTTTCTTCATTCATATAAGACTAAGTTCTGAAATACTTGGTTAACTGAATTCATTTACTTTCAAACAAGTGTTAGTGAAAAGAAATTGTCCCAAAAAGAACCAAATTGAAGCACCTTAACAAATTCAAAACAAAAAATTTCAATTCTTCCACAATCATATACTAGATTTTAGGAAATAATAACCACTCACTTGCATATCAAAAACTTGACCCTGATGGGAAAGTTCTGAGATAATTCTGACCAACTTGGCAGCATTTCTTCTAAAAACAGAACAACTGAAATCTCTAAGAACCCTTGTGGAGAATTCATAGCTTGCAAGCTTCCTTTGCTGCCTCCACTTGTCACCATCAACTGCAAAAATCCCCTCACCAAAAAGATCAGTCACAATATCCTGGTTATACTTGCCTTTGGAGTACTTATCAAAGTTGGTTTTCAGTATGTGTTCAACATTTCTCGGGTCTGCAGTGTACACCTCGCTTTGATCAGGAGCCAGTAGACGAAAAGTTGGAATCGTCTTGGCCATTTCAGCATGGTAGTCATGGAGTGTGTTGAAGTAGAAAAGCTGGTTAAACACTGTTCCTTTCACTGGAGCATAATCAGGGTCTCCAATGGATTTTCCCAGAATCGTGGTCAACATGATGAAACAGAAGACTAGGAAGATACCCAGAAGAGAAAAAGCTATGAAACTCAATAGGGTATACAAAAGATCCATCTTTGTGTGTGCTATTTCTCTTCCGATACAAAGAGACACTTCTGTCTTAACCCTGCAGTGATGTTTTGGTTCTTCTAAAATCCTTTCTAAGAATTATTTTTTCTGTTTGTTTATTCGACATAGTTTGTTATTCAAACGTTGGTCTTGTCGTCAACGTCACAATGGGGTGGTTGAGTCATCAACCTGAACTAAGGATTAGAATTGACATTTATTAACTTAATTAAATTCTTTGAAAGCCTTAATTAAAAGCTATTCTCTTCTAATTTTTTTTTATTTATTTAGCTATTTGAAAGATTATATTTAGAAAAAAAAAAAAGACATTACCATTTCTTTTAATTAGACAGCATTCAAATTAATTCATGTCTGTTTCAAAATTTCTTTCGATTTTCATCTAATAGTTTGTGACAAATCTTTGGAAAAATATTTTTAGAGTGTCAAATTTTCTTTTGATAATATCTCCATAGAATAAATAATAGAATAAAATAATATTTTTTGTCACTATCAACCAAGTAGTGATAGGTACGCGGTTTATATAATGCTATAAATAGTCGCTCTCAACAAATACTGAACGGTGCGTTTGAAGTTACGCGGCTTCGAACGAATTCAAATTTTGAAAACATTCATCGCAACAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_36295(-)
ATGGGAGAAAACCCGGAACGACAATGGTGCCTCAGTGACTTCGAAATCGGAAAGCCTCTTGGAAAAGGCAAATTCGGCAGAGTCTACGTCGCCCGAGAACGCAAGGTTTCAATTTCTTCAAAAGAAATTTCAAATAGCCAAATTGTTTTAGGTTTTCGGGAACTTCGAATTTTGAAATTCGACGGAAATCGCTGAAGGGATTTGTTTAATTATTGTTATTTTTATTTGTTTGGCTTTCGCAGAGCAAATTTGTTGTTGCATTGAAGGTTATTTCGAAGGAGCAATTAGAGAAGTACAAAATCCATCATCAACTGAGGAGGGAGATGGAGATTCAGTACAGTCTGAAGCATCCGAACGTACTTCGTCTGTATGGCTGGTTTCATGACTCCGAGAACGTCTTTTTAATTCTGGAATATGCTCACAATGGTGAGCTTTACAAGGAGCTTAGCAGAAAAGGGCATTTCAGCGAGCAACAAGCTGCCACGGTAGTCCTTTCTTATTGTCAATATTTCTCTCTATATTAGAAAATGATTAGAAAATGACTTCAAGTTTAACTAATTCTCATGCGACAAAACCGGTTTGGAAAGTAAGTATATAGATTGGACAATCATTACTTTTCATGAGGATAAGTTAGACTTAAACTTATTTTTTAATATATTATCAGAGTCTATCTTAATATATTATCGGAAACTGTCTTATTAAGGCTTGTTAAACATATTGTGTCAAGCATCATATGTTATTAGACTACCCACAAAAATATAGTTTCAAGCACGGGATGGCCTCGGCATAAAAGGATGTGTTGGAGATCCCAAATAACAATTTTAATTCCTTCTTCAGTTTGAGTAGCAATAGCATTGATCATAGGTAGCAAGAGTCTTTTTGCCTTCTTTGTTAGTATGAGAAGTTGACATTTTAGATCATTTTCCCGTAGTTGAATCTTGGTATTCTAGGGGTCTTCCTGTTGAAACAATGGACAACGATCATTCTGTGAACATTCTGCTGCTCCATAACTGCAAAATTTTCTTTGTTCCACATTCTACTTCTCAATGGTTACTTAATTTTCTCTCACTTTTTGCTGCATCACGGTTGTAGATGTTCTGCCACATTCTCCAGTTTCTTGGTTGCTAGCACATTCTACTGCTCCATGCTTGCCAATTGTTTTGGCACATTCTGCTGCTCCGCTGTTGCAAATTGTTCCGGCACATTCTACTTCTTCCTGAGAATATTCTGCAGCATCATGATTTCCAAATATTCTAGACCATTCTGACATGAAATATTTTTGCAGTTCCATGCTATCCAAATGTTCTTGGTTCTGTTCTTCCTAGAATATTTTGCAGTTCTATCCTATCTAAATGTTCTTGTACATTATGCTTTTCCATGGTTGGAAAATTTTCTCGCACATTTTTTTTGCTTCACAGTTGTTGATTGTTCTGCCACATCCTCCCACTTCATGGTTATTGACACATTCTGCTGCTTCACCGTTGCCAATTGTTCTGCTACATTCTGCTGCTCACTGTTGTAAATTATTCTGGCACATTCTACTCCTTCAAGAGAATATTCTGCAGTGTCATGATTTCCAAATATTCTGGAGCGTTCTGACCTCCAATGATAATGTTGTGCAGTTTCATGAAAATATTATGCAGTTCCATGCCATCCAAATGTTCTTGGTCATTCTTCTCTTCCATGAGAATATTCTGCAGTTCCATGAGAATGCTCTACAGTTCCAATGATAAATGAAAATATTATGCAGTTCCATGCCATCCAAATGTTCTTGGTCATTCTGCTCTTCCATGAGAATATTCTACAGTTCCATGAGAATGCTCTACAGTTCCAATGATATCTAAATGTTCTTGGACATTATGCTCTTCCATGGTTGCAAAAACTTCTCACTCATTTTACTGCTGAACGGTCAGAAATATGGTGGAGCAAACTGCTCATGTGGTTAAGACATGTATCTTGACTTTCTGCTACTCCATGAGATGATGTTGCTGCTCCATAGTTAAGAAAGGGCATTTATCATTCTATTGATCCATCAGAAGATTTTGCTACTACAAGGCATAGTTGCCAGCGCAACAGTAACCAAATGTTCTTGAACTGTATGTTGCTCCTTGGTAAAGAAAAGTTCCTGAACATTCCTAGGAGAAAAACATTTTTTCTGCTCCAAGGTAGTTAAGTATCCTTGATCATTATTGTTGCTCCATTTGAACATCTTGTCTAGTTCAATATGGAAATATCTATTGTACCATATGTTATTCTCCCTCATGCTGAGGCATGGATATTCCGTGCGGGGTCCTATAGTAATCCGATAATAGGTAACATGATAGGCCTAACAAACCTTATTAGGATGATAGACTATTATGATACTAGGAAGTAAATATAAGCCTAACTCATCTTCACACAAGATTTGTTTGTAAGATAATGATTGTCCTCACTTATATACTGGAGATTGATCTTACATCTAATGAATGTGGGATCTCCAATATGATATGTGATTTTTGAAGATTCATAGCATGTTTGATTTTCTAATTAGAGAGCTGCACATTCATGCTATTTAAAAATGGAAGTAGTTGCAGCAAAAATAGCATGTTTGACTTCATTCGGCGGGCAACCAATCATGTTTTTAGTGTATGTTTGTCTGCATGCTTACAAGATCGATATTGGATGAAATTAGTTTTTGAAGTTAAATCATCTATGTTTGGATGCTTTATTCTAAAACAATGTGTTTTAATTCTCTGTTATAGTAATTTTGGTGTACTGTAAAAGTACTCCTGTAACTTTAATCCAAACTTAAAAATTCTTCAATATTAGTTTTTCTTCTACTTATAAATTGTAAATTGACATTATCTCTCATTAATGTGGGATCTCCAATACACACCAAGCATGGATATCTTAGGAAGTGATATCATATTAGAAAGTTAATTTAAACCTAACTTATTCATACAATATCAACTTATAAGGTGAGGTTTGCTTCTACTTATATATTGTAAATTGACTTTATCTCTAGTAGATTTGGGATTTCTAACACCCTTATTCTTTATTTGTTTTAAATTTTGGTAGAATTGATTTTGAATGTTGTCGGTCCTTATTCCTTGTATGCATGCTTGAATTAAACTTAATTATAAATTTTACGTTGAAATGTGTGCTATGGTGTGTTGAGGGAGTGTTTAGTTTAAGAGATTATTTTCTGTTTTCTTTCTTGTTTTCATGTTTGTATGGAAACAGTGACATTACTTTTATTCTTCCACCTTTAGTGTTTAATATACGAAATTTTTAAAGCGTGGAATAAAGTGACATAAGCTTGGTTTCTTGCCTTGGATTTAACTAGAGTATTGACTTATGTTGTGAAGGCTGACTTGTCTAACTTGTGTAACCTTTTACCTTGCTATTCCGCCCTTCCTGACTCTAATACCGTTTAATTAAACACTTGTTTATGTTTTGATCGGCCTTCTTTTTAGGGGTAGCATAACTGTGGCTTAGTGGCTGAATGATGAACATTTTCTTTGGTTCTAGGCATTGGGCTAGATCTTTGGATTTTGACATGAGAAAGAAAAATGCAAGCAGAAAGAAGCCATAATGTATTTATGAGAAAATTAATTAAATAACTGGAGAAATGGGATGGGAACGGAACAGAACTGTTCTTTAAAATTAATTAAATACTATAAAGTTATTATGTGTTGACATCCTGTGAAATATGGTAACTATAAAGAAATTAAGTGGAATGGATCAGAAAAAAAATTCTTAAAGAGGGTTTACGTTATATTTTACGCCTGTTTATATATTGTCTTAAAGCAAGTCTTTTGCATTTTTGTATTATGTTCAATATGTCAACTTGTAACTCTATTACATTTGATAATTTTAGTATATTTTAAGCCTCACAAAGGCATTGGCGTATTGTCACGATAAGCATGTTATTCACAGGGATATCAAGCCTGAAAATTTGTTACTTGATCATGAGGTATGCTTTCTCTTCTTTTACCCTCATTTTACATTTCTTTTGCCCATGCTAGTACTTGAAGAGTTATTATATTTCAACACTAGTAATGTCTGTTTTTTTTTTCACTTGGCATCAACTTAGGGCCACAACTCAGAAATCCAGTGACTTACATAATAATAAGTATACATCATATTTGCATTTCATTTCTATCATTTCTTACCCCTCTCGGGATTTTTTTAAACAATTTAAGTTTCACCGTATTAGATGTTTTTTTTTTCTTTCTTCATTCGCTTTCCATGCTACATTTTCTCCCATTGAAAACGAGATCAAAAATAAGGAAAGCAAACTTTCAATGAGAATGTTCCTAATTGTAGATATGTGATGAAACCTTTTGGTAACTAGTTGGAACCAATTATGTTTGAGCTGTAGGGAACTTTAACAATTAATTTGATATTGGCTTGGTCTCAGGGTCGTCTTAAGATTGCAGACTTTGGTTGGTCAGTACAGTCTAGAAGCAAAAGGCATACCATGTGTGGAACCTTGGATTATTTAGCACCCGAAATGGTAGAAAACAAAGCTCATGATTATGCAGTTGATAACTGGACTTTAGGTATCCTTTGCTATGAATTCCTTTATGGTGCTCCGCCATTTGAGGCTGATAGTCAAGTTGATACCTTCAAAAGGTGTGGAATTGCAAGTGACTTTTATACACTGTAGTTAAAATAAATGTCATTTTTGTTACGCATATGTAATGTTTTATATTTGTGTAGGATAATGAAGGTTGACTTAAGTTTCCCCTCTACTCCTTATGTTTCTTCAGAAGCCAAACATCTTATTAGTCGGGTAAGTTCATATCTACATTTTCAGAGAAGATTTGGTCCTTCTTCTTACTGCAATCTGTAAATTGATGCAGCTTCTGGTAAAAGACTCTTCACGAAGGCTCTCTCTTCAGAGGATAATGGAGCATCCTTGGATAATCAAGAATGCAAATCCTTTAGGTGTCTGCAGCTAG

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