Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36242 LG11 19825070 19831494 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03041 Spliceosome [BR:ko03041]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 19825285 3_prime_UTR_variant
T/C 19825635 downstream_gene_variant
A/T 19825640 downstream_gene_variant
C/T 19827305 downstream_gene_variant
A/G 19827329 downstream_gene_variant
A/G 19827335 downstream_gene_variant
A/G 19827396 downstream_gene_variant
A/T 19827950 downstream_gene_variant
G/A 19828221 downstream_gene_variant
A/T 19828277 downstream_gene_variant
A/T 19828347 downstream_gene_variant
C/A 19828422 downstream_gene_variant
G/A 19828426 downstream_gene_variant
G/T 19828435 downstream_gene_variant
A/T 19828658 downstream_gene_variant
C/A 19828664 downstream_gene_variant
A/G 19829172 downstream_gene_variant
A/T 19829248 downstream_gene_variant
A/T 19829362 downstream_gene_variant
A/G 19829680 downstream_gene_variant
C/T 19829691 downstream_gene_variant
T/C 19830013 upstream_gene_variant
T/A 19830070 upstream_gene_variant
G/A 19830174 upstream_gene_variant
A/T 19830194 upstream_gene_variant
C/T 19830260 upstream_gene_variant
A/G 19830835 upstream_gene_variant
A/T 19831041 upstream_gene_variant
G/A 19831155 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36242.1
MEDSDQPAKSTENQQTEQVCSFFRKPINKKNIRKRTIDDEDNEEDSNKETSVLHVQKKTLKPDNKLFFSTGSSKSSVSAEPSEESGKPVFQFESSKEIQVQHDSKATATLETETEFSKDARAIRERALKQASESLKGKSARPEDEKLYKGMNSYKDYKAGFRREQTIASEKAGGAHGPLRASAHIRVSARFDYQPDICKDYKETGYCGYGDSCKFMHDRGDYKSGWQLEKEWEEAEKARKMRLAAGEDADEEEGANLNDEDDEDSLPFACFICRNPFADPVVTKCKHYFCEHCALKHHAKNKKCFVCNQPTLGIFNVAHEIRRKMAEDK*


CDS Sequence:
>Vu_36242.1
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Promoter Sequence:
>Vu_36242::LG11:19831494-19833494(-)
AAAGTCTCGTAAACCTAACATATCTATGTTTATGTGAAAAATAAAATAAAGGTTTAAACCCTCAGATTGTCCTTGTATTTGTAGGAAAATCTCAAGTGGGTGCTCTTGTTGAAAACGGTCTCAATTGAGTCCAAATTTTTGAAAAATTGAGTTAATTAAGCCCTCTCCGTTAAGTTTTTCCATAGGCATTAACAAATGCTGAAGTGGTGCACACATAATATGGTGATATATACGTCTTATATATTACGTGGAATTTGTTATTTAATTTGTTATTAAGTCTTGTATAAGTGTTATATGACGTGTTATGTTAAATTATTTAATTGTTCAAATTAGGGATTTCTTCAGATTAGGAGATTTTTAATGAAATAGGGTTAGAGAAAGGGAATTATTGATTTGGTCAGTGTGAGAAGATGAATTGGAATCCTAGAGAGCATTCTCTTCAACTCCGATGAACCACTCATTTCACCAAACACGACCTAAGCATAGGAATGAGCATTGGATGACCAGGTTGGAAAGCTCAAGGCTGGAAGCTATGGCGTGTCACGTCAGAAAGGACCCCTCGGCCAACGACGACAGTGATGGTTGTTGGTGGTGAGCGAACACGATCAGTTCGTGGATGATGGTTACTTCCCAGAAGATGAATGGTGATGTTGGAAGATGGCGATTTGGGATTGTCCGCGATTAGGGTTTGTGTTATGCCATGGTTGCAATGATTGTGGTTGGTTTGATTTTTCTGTTTTATAGGTTTCAGTGAAGGTGGTATGCGATGACTACCAAGGTTATGATGGCTGGGTTAGGGCTTGCATGACCAGAAGGAAATTGAGGAATTGGGAGGATGAATTTAGAGGTTGAATCTAATGGATTTGAAGGTTTTGATAGATAATAGGAAAGGGTTATGCCTTGTAATTCTTGTGATTGGATTGATAATGAAAATGAGCATGTCCAGAATTAAATCTAATTTCATGGAATGAATATCATATTCATTGGTTAGTTCTCTCAATTTGTAATGTCTTTTTTTCTAGGCATGAGTTTTCTGAGTGGAGGTTGTAAAAATATCAAAGCTTTGATGTTGAGGAAGGGATAACCTGAAAACCAGGTGCTTTCAGAAGATAAAATGAAGAGCTTCATGGAAGGCTGGCCATGGGAAGTCAAAACAGAGTAACCACTTTACTCTATAAAACCACTTTCCCAGCCGAACTTTTCCCTCTTCCGCACCATCATATCCCTGCTTGTTCGTCACTCCCCGACACCACTCTCCTCACTCAAAGCCTTTGAAGAAAACAAAATCCCTAAATTTTAACATCAGAAAAGGATTATTTTTCAATTTGATATTATGTAAGGAGTGGTGGGATGAAAAATCTAAATCGAGGTGTTCATCTTCTCTCGTGTGTTCGTCTCCTATATTCACTGATAAAATCCCTAATTCCATTTCTCTAACCCTATTTACTAATCCTAAAAAATTCCTAACATTACTAATTCAATTTTGTGTCACGTCAAAAAAATATTAATTTAAATAAAAAATTCCATGTAAAATAACAATTTTATATCAGTAGATTAAGTGTATAGCATGCCAACAAATTTTAACGTTGTTTCTCAACCCTTAACGGAAAGAGTTTAATTGGCTTAGTTTTTCAAAACTTAGGATTAGACCGTTTTCAAGAAGAGGACCTACTTAATATTCTCTTACAAAAATACGAGGATGGTTTGAGAATTTAAATCTAAAATAAAATAATAATTAGTTAAGTTAAATGTGTACTTGTGTGTGTGTGTGAGGGTTTGCTACTTTTTTATTTTTATTTTTGCTTCAGTTTTTTATATTTTTGGGTTTGGCTACGAGGCGCATATATTAGGGCTGTTAGGGTCAAATTTCAGAAAGATCATTTCTTCCTTTCTTCTATTTCTCGTCTTTTCTGTCTTCTTCTTTCTCTTTCTTTTTGTTTTAAAAAACCCTAGGGTTAGGGTAAGCTTGGGGCGCGAGTAAGAGAGTGGCGGATGTAAAC


Gene Sequence:
>Vu_36242(-)
CGTTTTTTCGGGAAGTAACGGAAGGAGAAGTTAAGATGGGAGGCGCAGTTTCAAGGGAGAAAAGGAGAGGAAGGAATCCGAGAATGCGGGTTTAATTTCTAGGGTTCGAGAATTTAATTTATGAGTGATGGAGGAAGCCTATAAAAGAACGAGCAAGTGAGTGTTAGAGACACACCAAAACAAGCATTTTAGAAATCTAAGAGACGCGGAAGTGCAGAGCTAGGTAGAAGTGGTTGCGACGTGAAGAAGAGCAAATTTCCAGGTATGGGGAGTTATTTAAATTCTTAATTGTTTGTTCGAAGATGGTGAAGCATATAATATTTTTGTGGGTGTTGTGTGCAAAGGGAATAATATTTGGGTTTCTTTTCTGAAAAGGTGAAATGAGTAATTTATGGTTGGAAAATTGTATAGGTCCTGTTGGGTTGTAATATGTTTAAACTGGGAAATGGTTTGTGGGTCTGGAAGGGATGAGTTTACTGATATTAATTGGATATCTATATTCTGAAAAGAATGAGTAGAATAAGGGTTCTGTTTGTACTTTGAAATTGGTTAATAAAGAGGTTATGGTCTGGAAAATTATGGTGAGTATATTTTGGGATTTATACTGCCACGGGATTTTCTTTGTGATTGAAATGGTGTATTCTCTTTTATAAAAAGAGTATTATGAATGGGGGTTTAGGAATTAAAGTTTATGGGTAAGTAGAAAAGGAATTGGTGGGTGCAGTATGTGTAAGTTCACTATGATATTCTGGATGCTATGTATAATTGTTTACATTGTTTAATTGAAGATGGGAATTGAATGGTATGATTATAAGTATGATGACACTCTGATATAAGGTTCTGCTCTAAAAGAAATTGATAAATGAATAGTTAACATTGGTTCTTGGGAATTTAGCCTTGTTAATTGTGTGAATCATGTTGACTGAAAAATGTTGCTTATACTAGATGTAAATATGTTTAAAATGGAACTCAAACGTGAATGAGATATTGTGAGTGAATGGGAGTTGTGTGAAGAAGTATAATGGTGAATATTCTGCGAAAGTAAGAAATGAAAAGATAGTAATTATGGTATTATGATTTATGAAAGGGCTGGATTTTTGTTATGTATTTTACTCAAGTTTTTGTAAGAATAAAAAGTAAATAAGAATGCTATGGTATTTGTGCTGTTTTGACAATAATAATATGAATTATTATATATGGTAGAGTAATTAGTAAAGGAACAAAGCATGATTCAGTGGAGAAACTTGGACGTTTGGAATGTTTGAATGATGTTTGTATCTTTATCAGCAATGGATGTACTTTGGATATGTTGATGTTTGACGGACCATGACTTATTTGGGATTAAATAAACTGAAACAGTAGGAACTGGTTGAGTAGGAATAGTATAGAGGAAGCTTTAAGTATTTATATATATGAATAATATCACTAATGAGTTGGAGTTAGTAATCTGTATGAAACTTTGAGTGCATGAGTTATGATGAAAATGTATAGGTTAGTACAAATGGGAGTTTGTTTATAGAAGTTAGAATGTTCTTAGCTAATCTGGTGGTTTATTGAACATTTTATGATGCTTGTATGAGTTTTAAATGTTAAAGTGTGCAAAATGGGTGTTGGGGGTGTTTTGGAAATCATAAGGGATTTTATGACGCACAACACAGGTGCTGGACGAGGGGCCAATGCTGGGCCAGAGGACCTCTCTGGAAACCCAGCGCTGAGTGCCAGGTTGCACCGCTGGGCGGTGGCCCACTGGGCGCTAGAGAGGTTTCGCTGAGCGAGACCTGGGTGGCTCATTTCTGGTTGGATGAGGGCTGTTTTGGTGGTGTTTTAGGTGCTAAGTAAGTTGCTGTTGGGTCATTGCATGATGGAGGTTAAATTTTAAGAATATACTGAATGTTGTGTGTGTAATGGATATGTGATGTACCCTGTTGTATGCCTATTTGCTTGTTTACATGTAGCTGGATTGTAGATAAAATTATAGGTCAGGAAAACGTGAGTCTGCATAATGAGAATTTGAAGCAATGGACATCACTGCTGCTGTTTTATTTTTGGTCTGTTAAATATGTAATAATATGAAAAAACTGAACTTGAGTAACAGGGCTAGCTGTCTCGGTGGTTTTAGGCTGGATTAAGTCTCTTATTGTGTGTGATAAAGTGCTATCATGTGATTGGAAGTTTCTGTGCACCAATGATACTGATAAAATTGAATATGGGTCTGTCTGTGTCCACTGGATGTAAGAGTTCCTGTTTGGGTAAATTGGAAAACATGATATGATTTAGTGGGTAGAAAAATGGGTTAAGTAAAGGTCAAACTGGTTAGTAGGTTAGGACTGGTATAACATATATGAAAAAACAATGAGCTGTGTGACTCTGGTTGGTTAAGTCTGTGTTTATGACAAAGGAAGTTGCTAAACCGATATGTTGGTTAATAAGTGTGAATGATTCCTTGGCCTGTAGCCTATTAACCGAAAGTAGATGCACTAGAATATCATTTGTTTTGTGACCGCTGGCTATATGTGACAATCTTCTAATAAACCTTGCATGTTACACGAATTTTGTATTTGAATATAATGTAATGAAATGCAGGATACTGGTTCTGTGAATGAGAATGTCCCATTTTATTTCACGGCCCTGCTGTTAGTCATATGTAACTTAGTGCTTGTGTATGCATGTTTACATGATAGCTGGGCTAGTTTTACTCACCTTTTGGAGCAGTATTAGGCACCTACCTGCATGTTAACTGGGACTTTGGGCAGAATGTGGTGTAAGTCATGTAGCATAAGTTTTAGAACTAGATATACTCCTTTTGAAAGTTGTTCATATGCATAACTCTGATGTTTTACTGCAACCATATCCGTGTATTCTGTTTGATCGTTTGTGCTATGGCATAGTTAAAAAGAATTCAAATGCTTATGTAAGTGCAGTCAGAATATAGGATTTAAGAAATATGGTTTGATCAGTGTTAATGCTGCTGTCTTGAACTGTACTGTCCTATGTTTGGTTTGCCCATAATATCTTGCTGCTATATGCTTGGTTTGTCCATATTACCTGGCTGTCCTAAGCATATACACCTCTGTTTATGCTTGATTTTGACGCTGTATGCATCGTTCTGGACTTTCGCAGTCGCTGGAATTTGGTTGTTAATGAGATTTTCTTTTAAACAATGTAATGTTAATTATGAAAATGAATTCATGTAACAGCTCTTTCTTGGATTATTTTATAATGTGTATTAAAAGGATTAAGGTGGCATATTAACGGTTTTTGGGGGTGTTACAACAATAAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAATGAGTGTTAAAAAAAAATGGGAATGAATAGATTTATAGGAAAAGTAAAAAGTAAGATTAAAATAAAACTTAAAAGTTTAAAGGTTTCATTTCCCCACCCCCTCTTCATTAAATCCACACTTATTTTACAAAAATGTAAATAATCATATGAACAATCAAACATACTCATTTTATTAATTTAATATGAGTTCTTGAATTTACTTGAGAGACAATGTTTTATTATAATAATCTCATGTAAGTTCTCTATATAAACAAAATTATTATTTTAGTAAGTTTAATAATCTTTTTTCTTTTACAATGATTTTTTTAAAATGAGTTATTACAAAAGTTGTTATAATTAATTTTGAAAAAGTTTTATATTTATAACATAAAAGAATTTCCTTTTCAATCTACACATGTCCTTATTATTTTATCTTTTAAATAATTATTTCTTTAAATTAAAATAATTATTTATGGTAAAAAAATTTACTTACAAATAAATAAGAACTATTTATCATTATCTATATCTTGTTATTGATATATAGAATTTTCTCTTTCGGTGTATAATCTATTTTTAATTTTATTCTTTTAATAACTGGTTTCTTAATTTTAAATAATTATGAAAATATCATTTTTGATATTTCACATCCCCCTATTTTTCTTTTGGCACCCCTGCCTGAACCACCTAAAATCCCCTCAACTCAAAAAAGTGTCATGTGTCCTACCTTCTCTCTCTCCTAACCTACTCTCTCACACCACTCACCGCAAGCCCGCTGCTATTGGAGCTCTCATCTCCTCGCTGCCCTGCGACGTCGGAACCTTAGGCCGCCGCTGCCATTTCTGTTCCCTCTCATGTTTTTCTGTGTGTGCGTATCATCCTCTCTCCCTCTTTCTCTGTATCGTTTCTTTCTCGATTTGGATACGTTCTGAGGGTGATTGGTTGTCTTCTAATGGTTGTTGAAACCAAATGGAGATGGTGAAGCTGATAATTCCTCAGGACTATTCGCATCTTCCCGAACTTTGGAAATTTGTGTTTAATTGTTTGAGATGATTGTGTAATTTGTTAGATTTTTTGATGATTTATTCGATTGTGAAATTCGTTTGTTTTATTTGGTGATTTGAGTTGCTACCGAGTGATGTTGAAGAGGTTGAGTTGGGGTGGGGTTTATCTACACCGGTTATTTAAAATATGATTGTTATGTCCTGCAACCTAATTGGTGAGTTTATGCTGTGTTTGAGTGTTTAAAGAGGCCTATTTTGTCTAATGTGGAAAAGGCAATTTGTCTAAGTTTACAGCTAAGTTTGATGCTTATGGTTTTTGGGTCATCATTAAGGAAATTATTTTATTTATTTTCATACATTGGTTTATACAATTTGTAAATATAGATTCATAAATATGATATAGTCTTATTCCTAATTAGGATTTGGATGTCAGGTGCATAAATCATTCTGATTATGGAAGATTCTGACCAACCTGCCAAGTCAACTGAAAACCAGCAAACTGAACAAGGTATGTCCGATTATTTTATCTATAATTTGTTAAAATCTGCCTCTGCATTGGACCCAAATGTCCAATCTTGTTTGCTTTTTGTTCTCTTGATCAGAGTTTGTTAGTTGTTACTAGTACTCTATCGTATTATTTGATGTTTTGTTTTCTTTCAGTTTGTAGTTTTTTCAGA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