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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36219 LG11 19265095 19266758 probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 19265138 splice_region_variant&intron_variant
G/T 19265439 synonymous_variant p.Ser440Ser
G/T 19265501 missense_variant p.Leu420Ile
T/A 19265510 stop_gained p.Lys417*
C/A 19265520 synonymous_variant p.Gly413Gly
A/G 19265631 synonymous_variant p.Asn376Asn
T/C 19265893 missense_variant p.His289Arg
T/C 19265923 missense_variant p.Asn279Ser
G/A 19266144 synonymous_variant p.Ser205Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36219.1
MENSYSSLPLLDLVSVIFFYALFLQGVIADIIAASNSSSTNEEQKAFYQSGWGAQNISEYCKWNGIVCNEAQSVIEISTKNNFYIPSTQAHIQHFNVAAFPDLISLELSGSGLKGNIPSEISSLKKLVHLDLSSNCLQGELPSSLSSLNQLQTLNISNNFLTGEIPSTLQHLIHLKVLDLSHNKISGVIPEGISALTELTSVQLSWNQITGSLPSGIGKILRLQSLDISNNHLKGPIPDDVLKHCQYLQLRNNSLNGSIPSQVGNISYLDLSYNDLTGNIPEALHSVSHLNLSYNSFNASDHSFCGFPKDSLIGNKDMKDSCSFDVDVSDADISLVMILVFSIFNGMIFSMVLVCWGIHVFCPLHNEFGNEHRRKNGDMLSIWNYDGKIAFEDIIKATEDFDIKYCIGTGAYGSVYKAQLPSGRIVALKKLHKAESENPSSYKSFCNETKILTEIRHRFHLRLWHCKTS*


CDS Sequence:
>Vu_36219.1
ATGGAAAACTCATATAGCAGTTTACCATTACTGGATCTTGTATCTGTTATCTTCTTTTATGCATTGTTCCTACAAGGTGTCATTGCTGACATTATAGCAGCTTCCAATTCCTCATCCACTAATGAGGAACAAAAAGCTTTTTATCAGAGTGGATGGGGAGCTCAAAATATCTCAGAATACTGTAAATGGAATGGTATTGTGTGCAATGAAGCTCAAAGTGTTATAGAGATTTCAACTAAGAACAATTTTTATATTCCTTCAACACAAGCTCATATTCAGCATTTCAATGTGGCTGCATTCCCTGATTTAATCAGTCTAGAGCTTAGTGGATCAGGACTCAAAGGAAATATTCCTTCAGAAATTAGCTCTCTTAAAAAGCTTGTCCATCTTGATCTGTCTTCTAATTGTCTTCAAGGTGAGTTGCCTAGTTCTCTTTCAAGTCTCAATCAACTTCAGACACTAAATATTTCTAACAATTTTCTTACTGGTGAGATCCCTTCTACTTTACAGCACTTGATCCATCTCAAAGTTTTGGATCTTTCTCATAATAAGATTTCTGGTGTTATACCAGAGGGGATATCTGCACTGACAGAACTAACTAGTGTTCAACTATCCTGGAATCAAATAACTGGTTCCCTTCCATCTGGGATTGGGAAAATCCTAAGACTTCAAAGTTTAGATATTTCCAACAATCATCTTAAGGGACCTATCCCAGATGATGTTTTGAAGCATTGTCAGTATCTGCAGTTAAGGAATAACTCTTTAAATGGGAGCATTCCTTCTCAAGTAGGAAATATTTCATATCTAGATCTTAGTTATAATGACCTCACAGGCAACATACCTGAGGCCCTTCATTCTGTTTCTCACCTTAATTTGTCATACAATTCCTTTAATGCTTCAGATCACAGTTTTTGTGGTTTTCCAAAAGACTCTTTAATTGGTAACAAGGATATGAAAGATTCTTGCTCTTTTGATGTTGATGTTTCTGATGCTGATATTTCTCTTGTAATGATACTTGTCTTCTCTATCTTCAATGGCATGATTTTCTCAATGGTCCTTGTCTGTTGGGGAATTCATGTTTTCTGTCCCCTCCATAATGAGTTTGGAAATGAGCATAGAAGAAAGAATGGAGACATGCTTTCAATTTGGAACTATGATGGTAAGATTGCATTTGAAGACATAATTAAGGCCACAGAAGACTTTGATATAAAGTATTGCATAGGAACGGGTGCTTATGGGAGTGTGTACAAAGCACAACTTCCCAGTGGCAGAATTGTTGCACTGAAAAAACTTCACAAAGCAGAATCTGAAAATCCATCCTCTTACAAGAGCTTTTGCAATGAGACCAAAATCTTGACAGAAATTCGCCATCGCTTTCATCTCAGACTTTGGCACTGCAAGACTTCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_36219::LG11:19266758-19268758(-)
CTTTGGGAGCCAGACAAAACTGGGCTTTGGGGGCCAAGCAAGCTAGGCTTTGGAGGCCAAACAAAACTGGGCTTTGGGGGCCAGGCGAGCTGGGCTTTGTACGCCAGATGAAACTGGGCTTAGGGGACCAGGCGAATTGCACTTTGTGGGCCAACCAAAATTGGGCTTTGGGAGCCAGACAAAACTAGGCTTTCAAATTTCGAAATTCTTGAAACTTGTAGTTTTGTGAAATGTTTTTTGTAATTTTTGAAAGAAATTTGATATTGGAAAAGACATTAGTGACCATTCCCAAAAAGAGGGTCTTGATATTAGGAGAAGAGAACAAAGTATAAAGATTATGGTAGAGTGTTGAAACCCTCACTTAAAAGCAGTAAATAAGGTGTAAAGATGAGGTTGCTAAAAGCCCAAAATGAGAGAAAAACATGATCAACAAGAAATAGTATGACTTGAAAGAGAAAACCAGAATGTTATTCTTTGTATTTTTTAATAAGAAAGATTCGTATGAAAAAGGTTTCGATCCAAAAGATTTTTTAATGGCAAACATATGATGTACGTATGAAAAACATTTTTTTTTTGCCTCAGTCAAATGTTCTAATTGCAATCATCAAACTCACTTTTATTTTCAATGTTTTGTGAAAGTAACGAGTGTCACGTCTCGACGTTTAATTTTCAATATGATTATATAATTTAATTAAGTTATTTTTGTTTGATTGTAATTAATATTGTTTTCATATATATTGTGGCAGTTTGTAATTTTATTTTATTTTTTTATTTCTTTTTAGTTTTTTAAAATTCTTTTTCACGTGTAAAATTATTGTCGTGTGAAAATATTACACGTTCAATTCAATTTTTATATTTAAAATTTTAACTTAATATAAATTTATTTTTTTAAAAAAATAAAATAATGTGTTTTTCTTTCATACTAAATTAATAATTAAATTTAATTACAATATACTTGTTAAAATAATTTTTTAAAATTTATCCACCCAACCACTCAATCTAAATTAATTTTATTTTTTACATGTTTAATTTTGATAAAAAAACTCCTATTTAAAATTTATAATTTTAAAAAATATAAATATAAATAACACTTGTAATTTTTAAGTTTTAATATATTTGTCATATCAAGTTAAAATTTAACAATCAGATTCCATCTCAAAAAACTATTCGATAAAATGTAGAAACAGATATTATTATTTTTTATTTTATTAATATAAAACTGGAAGCAATGTTTTTAAGTTGTTTATGTTAATTATTTAAAGTATTTAAAGCATAATTCAAATTCAACTCAATAGTGACAACTTGAACCAATATTTGGTTTGCATGACCTTGACTTTTGCAGAAACTATCAGCAACCAATAATCTTAGAATTCCAATGTGTAGAAGTATTTTGCACGGCTATAGACTTAGTCCCATTCAACAGCTTTTTTTTTTCTTTCTAAAATTTGAAAGAAAATTCCAAACTGAAACCATAATCTCATGCCAGTATCATATGTTCAAAGTTCTGGGACCAAGGGCATTCATTACTGCGTTCAACAAGTCATTCAAATTTGTATGTACCATGGAAAATTCTTTATAAACACTAAAAATAAGACAAAACAAAATCCATCTTTTTAAACTAAAATTATCTTATACACAATTTCATTCGTTTTTATATGAATTATTATGTATAACTCATGTTTAAACTAATTTTATTTTTATTTTTCTATTTTTTTTCTAAAGTATTTAAGAAGAAATTTCCTCCAAACTAACCTTAAATGTCTCATTCTATCATCAACCACAATTTGAAAAGTCTTTTCTGCAAAACCATATCTTATCAGCTGTTCTCATATGTAACTGAAAATTGCAAGGAAACTTCAAAATTTAATCCTAAATTTCCACATGGTCCTGGTGGACATTGCTTAGGCTAGTATCACACACACATAATTAATCCAAGGGCCAGTATAAGTTATAACCAAGCTTCTCATTAGAAAATTCAATCATTCAAATTTGAATTGAGC


Gene Sequence:
>Vu_36219(-)
ATGGAAAACTCATATAGCAGTTTACCATTACTGGATCTTGTATCTGTTATCTTCTTTTATGCATTGTTCCTACAAGGTGTCATTGCTGACATTATAGCAGCTTCCAATTCCTCATCCACTAATGAGGAACAAAAAGCTTTTTATCAGAGTGGATGGGGAGCTCAAAATATCTCAGAATACTGTAAATGGAATGGTATTGTGTGCAATGAAGCTCAAAGTGTTATAGAGATTTCAACTAAGAACAATTTTTATATTCCTTCAACACAAGCTCATATTCAGCATTTCAATGTGGCTGCATTCCCTGATTTAATCAGTCTAGAGCTTAGTGGATCAGGACTCAAAGGAAATATTCCTTCAGAAATTAGCTCTCTTAAAAAGCTTGTCCATCTTGATCTGTCTTCTAATTGTCTTCAAGGTGAGTTGCCTAGTTCTCTTTCAAGTCTCAATCAACTTCAGACACTAAATATTTCTAACAATTTTCTTACTGGTGAGATCCCTTCTACTTTACAGCACTTGATCCATCTCAAAGTTTTGGATCTTTCTCATAATAAGATTTCTGGTGTTATACCAGAGGGGATATCTGCACTGACAGAACTAACTAGTGTTCAACTATCCTGGAATCAAATAACTGGTTCCCTTCCATCTGGGATTGGGAAAATCCTAAGACTTCAAAGTTTAGATATTTCCAACAATCATCTTAAGGGACCTATCCCAGATGATGTTTTGAAGCATTGTCAGTATCTGCAGTTAAGGAATAACTCTTTAAATGGGAGCATTCCTTCTCAAGTAGGAAATATTTCATATCTAGATCTTAGTTATAATGACCTCACAGGCAACATACCTGAGGCCCTTCATTCTGTTTCTCACCTTAATTTGTCATACAATTCCTTTAATGCTTCAGATCACAGTTTTTGTGGTTTTCCAAAAGACTCTTTAATTGGTAACAAGGATATGAAAGATTCTTGCTCTTTTGATGTTGATGTTTCTGATGCTGATATTTCTCTTGTAATGATACTTGTCTTCTCTATCTTCAATGGCATGATTTTCTCAATGGTCCTTGTCTGTTGGGGAATTCATGTTTTCTGTCCCCTCCATAATGAGTTTGGAAATGAGCATAGAAGAAAGAATGGAGACATGCTTTCAATTTGGAACTATGATGGTAAGATTGCATTTGAAGACATAATTAAGGCCACAGAAGACTTTGATATAAAGTATTGCATAGGAACGGGTGCTTATGGGAGTGTGTACAAAGCACAACTTCCCAGTGGCAGAATTGTTGCACTGAAAAAACTTCACAAAGCAGAATCTGAAAATCCATCCTCTTACAAGAGCTTTTGCAATGAGACCAAAATCTTGACAGAAATTCGCCATCGTAACATCATCAAGCTTTATGGCTTTTGTTTGCATAACAAGTGTATGTTTTTAGTGTATGAGTATATGGAAAGAGGAAGCTTATTTTGCAACTTGTCTTATGATGTTGAAGCTCAAGAGCTGAATTGGAGCAAGAGGATAAATGTTGTAAAAGGAATAGCAAATGGCTTGGCTCACATGCACCATGATTGTACCCCACCCATTGTTCATAGAGACATAAGCAGTAACAACATTTTGTTAAACTCAGAGTTGCAGGCTTTCATCTCAGACTTTGGCACTGCAAGACTTCTTGA

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