Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36204 LG11 18853771 18856103 probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 18853950 missense_variant p.Tyr651Cys
A/G 18854139 missense_variant p.Ile588Thr
G/C 18854261 missense_variant p.Cys581Trp
G/C 18854266 missense_variant p.His580Asp
C/T 18854477 synonymous_variant p.Leu509Leu
A/T 18854488 stop_lost p.Ter506Argext*?
G/A 18854503 stop_gained p.Arg501*
C/T 18855054 missense_variant p.Arg317Lys
G/A 18855361 missense_variant p.His215Tyr
T/G 18855375 missense_variant p.Asn210Thr
G/A 18855520 missense_variant p.His162Tyr
C/A 18855548 synonymous_variant p.Leu152Leu
G/T 18855552 missense_variant p.Ser151Tyr
G/A 18855555 missense_variant p.Thr150Ile
T/A 18855566 synonymous_variant p.Gly146Gly
A/G 18855579 missense_variant p.Phe142Ser
T/A 18855582 missense_variant p.Asn141Ile
G/T 18855589 missense_variant p.Pro139Thr
A/G 18855595 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/A 18855621 intron_variant
A/T 18855657 intron_variant
C/G 18855668 intron_variant
A/T 18855678 intron_variant
C/A 18855683 intron_variant
T/A 18855696 missense_variant&splice_region_variant p.Gln136His
G/A 18855701 missense_variant p.Leu135Phe
A/T 18855723 synonymous_variant p.Ser127Ser
A/G,* 18855729 synonymous_variant p.Leu125Leu
T/A,C 18855733 missense_variant p.Tyr124Phe
A/T 18855739 missense_variant p.Leu122His
A/T 18855744 synonymous_variant p.Gly120Gly
A/T 18855774 synonymous_variant p.Gly110Gly
A/G 18855826 missense_variant p.Leu93Ser
G/C 18855886 missense_variant p.Thr73Ser
G/T 18856027 missense_variant p.Pro26His
A/T 18856033 missense_variant p.Met24Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36204.1
MFPSRRVMAFYMMSEVLSVICRAMPPSLIEERQALLHSGWWNDYLNISDYRNISDHCYWPGIFCNETLRSVATIDSGSIKIPSSKELLWIEKLNVSAFPNLVSLHLSGMGLRGTIPTDIGSLTYLTSLDLSNNGLQGSIPPTLGRLENLVHLCLHSNQLEGHIPEHLGNLSKLEALQLSHNKISGLLPPKLLQMDKMSSLNLSSNQLCGSIPLKTMRCPFATIVDLSHNLFNGNITSQIGCVNDLNLSHNFLVGEIPSPFTWSSELRRLDLSYNNLSGKVHQELSSLSYINLAYNSLDFSQDLDSKLKVPDYCFFKEDSLIDDNHMLNFTYCHLLNHTNPQTRKSNPMIMLIILPIIFFNLFVLLPLIYFSRCIPKKNCGRISTKNGDLFSIFNYDGKIAFEDIIEATEDFDLKYCIGTGGYGSVYRAQLPSGNVVALKKLHRMESQNPSFNKSFHNEVKMLTAIRHRNIVKLHGFCLHNQFMFLIYQYMERGSLFYILNNDMEAHELNWSKRVNVIKGMAQALSYMHHDCTTPMVHRDVTSSNVLLNSQLEACVSDFGTARLLDPDSSNQTLVVGTYGYIAPEFAYTLTVTEKCDVYSFGIVTLETLMGKHPRELISTLSNPITQNMLVKDLLDSRLPLPLEKDAKDVNLMINVGLSCLCSKPNLRPSMQQVIEKLFSFTLPLDLPFHEVSIHQVMSQDIFHLSSKFQE*


CDS Sequence:
>Vu_36204.1
ATGTTTCCATCGAGAAGAGTTATGGCGTTCTATATGATGAGTGAGGTATTATCTGTGATTTGTCGCGCCATGCCTCCTTCCCTCATTGAGGAACGACAGGCTTTGCTCCACAGTGGTTGGTGGAATGATTACCTAAATATCTCAGACTACCGAAATATCTCAGATCATTGTTATTGGCCGGGTATCTTTTGCAATGAAACTCTAAGAAGTGTTGCTACTATTGACAGTGGGTCCATCAAGATTCCTTCATCAAAAGAATTGCTTTGGATTGAGAAGTTGAACGTCAGTGCCTTCCCCAATTTAGTCTCTCTGCATCTATCTGGAATGGGTCTTAGAGGAACCATCCCCACAGATATAGGTTCTCTTACATACCTTACCTCTCTTGATTTGTCCAACAATGGTCTCCAAGGTTCAATCCCTCCAACTTTAGGTCGATTGGAGAACTTGGTACATCTCTGCCTTCATTCTAATCAACTAGAAGGTCACATACCCGAGCATTTAGGAAATTTGTCCAAATTAGAAGCTTTGCAACTATCTCATAACAAAATTTCGGGTTTATTACCTCCCAAACTTTTGCAAATGGACAAAATGTCCTCTTTAAATCTCTCGTCCAATCAATTATGTGGTTCAATCCCATTAAAAACCATGAGATGTCCCTTTGCTACAATAGTTGATTTGAGTCATAACTTGTTTAATGGAAATATAACCTCTCAAATTGGTTGTGTAAATGACCTTAATCTTAGTCACAATTTTCTTGTTGGTGAGATTCCATCTCCTTTTACATGGAGCTCCGAACTTAGACGATTGGATCTCAGTTATAATAATCTTTCAGGTAAAGTACACCAGGAACTTTCTAGTCTATCATACATAAACCTTGCATACAATTCCTTGGACTTCTCACAAGACCTTGACTCAAAATTGAAGGTACCAGACTATTGTTTTTTCAAGGAAGACTCGTTAATTGATGATAATCACATGCTAAATTTCACATATTGCCACTTATTGAACCACACGAATCCTCAAACTAGAAAAAGTAATCCCATGATCATGTTAATTATTCTTCCTATAATTTTCTTCAATCTTTTTGTACTCCTTCCATTAATATATTTCTCAAGATGTATTCCTAAGAAAAATTGTGGACGAATATCAACAAAGAATGGAGACTTGTTTTCTATATTCAATTATGATGGTAAAATTGCATTTGAGGATATCATTGAAGCAACTGAAGACTTTGACCTCAAGTACTGTATTGGGACAGGCGGATATGGTAGTGTTTATAGAGCACAATTACCCAGTGGTAACGTTGTAGCATTAAAAAAGCTTCATCGAATGGAATCTCAAAATCCATCTTTCAACAAAAGTTTCCACAATGAGGTGAAAATGTTAACAGCAATTCGTCATAGAAACATTGTAAAGCTTCATGGCTTTTGCCTCCACAATCAATTCATGTTTCTTATATATCAATACATGGAAAGAGGTAGTTTATTTTATATTTTGAATAACGATATGGAAGCTCATGAGTTGAATTGGAGTAAAAGGGTAAATGTCATTAAAGGGATGGCACAAGCTTTAAGCTACATGCATCATGATTGTACCACACCAATGGTTCATCGAGATGTAACAAGTAGTAATGTTCTATTAAACTCACAATTAGAGGCTTGTGTCTCAGACTTTGGTACAGCTAGACTCCTGGATCCTGATTCTTCAAATCAAACCTTGGTAGTTGGCACTTATGGCTACATTGCCCCAGAGTTTGCTTATACATTGACTGTGACAGAAAAATGTGATGTTTATAGTTTTGGGATAGTGACTTTGGAGACATTAATGGGAAAACATCCTAGAGAGTTAATCTCAACTTTATCAAACCCAATAACTCAAAATATGTTGGTGAAAGATCTCTTGGATTCACGTCTCCCTCTTCCTCTTGAGAAAGATGCTAAAGATGTAAATCTTATGATAAATGTAGGATTATCATGTTTGTGCTCCAAACCAAACTTGAGGCCATCAATGCAACAAGTGATTGAGAAACTCTTTAGTTTTACATTGCCATTAGATTTGCCTTTCCATGAAGTTTCCATCCATCAAGTGATGAGCCAAGACATATTTCATCTTTCATCCAAGTTTCAAGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_36204::LG11:18856103-18858103(-)
GAGCAACCCGCAATGGTAGAGAGCTGAAGCCACAAGACGGTAAGGAGAAATAAGTAGTGGTGGTGTGAAACTGAGTTGGTAAAGAAAATGAGGAGAAATGAGCGTCTGTGCCACATATATTGACATTGGAGCCAGAATTTGGGCGGGAAAATTCCCGCTTTTTTTACCGACGGTCAAAAGCCTTCGGTAAATCCATCGGTAAGTTACATTGACATTACCGACGGTAATGTGTATGTCAGTTACCGACGGATTTACCGAAGACTTTTGGCCGTCAGTAAATAAAATTCAAAATCCGTGGTAATGAAAATTTAGCGACGAAAATGTATCCATCGGTAAAATCCGTCGATAATATTAATAATTTTTGTAGTGCAACTCCGAAAGCTATATCACGTCTGTTATTGCAGACATATATCTAAGAGATCCAACTATTTGTTTATAAAGTGTTGCATCTATTCCCTTCTCACCCAATTCTTTAGTCAACTTTAAGTTTGCAATTATTGGTACTGGAATTGCATTGCAATTTGTCATGTTGAACTTCTTCAGGACCTTGCGAATGTATTTATTCTGATGCAGAAAAATGCCTCTGTCAGTGTGCACAAATTGCAGTCCCAAGAAATAGCTCAGTGTACCTAAATCGGTCATCTCAAATACTAAAATCATTTTCTCCTTAAATTGCTCAATATCAACCTGTGTTTCACCTGTTTCAATCAGGTCATCCACATAGAGGCACACTTTTAACAATTTCTGATGAGAATTTTCTTTTACATATACCAAATTCAACCTTGCTCTTGACAAATCCCTACTCACAAAGAAATGAGTTAATGAGCCTATTCCAAGCCCAATGTGCTTGCCTAAGGCCATATAAAGCCTTTCTTAACCTGTACACTTTCATCTCTTCTCCTTTCACTTCAAAACCCGGTGACTACCTCACGTATAATTACTCTTCTAGAGGACCATTTTGGAATGTTGATTTCACATCTAATTGGCATATTTTCCAATTCTCCAGCTAGCCACAACAATTACTAGCCTCATTGTTTCAAGCCTCGCAATAGGATATTTTCCTAAATTAACCTTTAAAAATGTCATTTTACTTTACTAACATTTTGATTAACGATTAAAGTAGTAATTGTTGTTTCGGATCATACTACGACTTTACCCTTGCCCAGCTTGACAAAATTGGTAAAGGAATAACCAACCTTTGTAATTGTCTGCAGTTTGCTACGAAAACTTTGAAGTTAGATCAATACAAAATTATTAAACTTCCCGATGCATGTGGGACTAAATTTTACTTTCCAATTTTTGTATGTGTTTTGGCCACTTGGTCCTCCCTCATACCATAATCCATAAACCATTCATGTATAATTTGTTAGATTGGTTACTGAACCAGTAAAAGAATAAACAAAATCATTATATGCAAGCCAACTTTGGTTCCCTGAGATTTACGAATTTAAATGTGTGTTGTAATATTCAGTGATGGAATGTTTTAGAAGTGTTATGTGACTTTTTTTAAGCGTTTTTGTTTTCTAGAGAAATATTTTGAATAGTCTGTGACACAGGTCTCAATCCAATTTTCTCTGACCAATTCTTGAACACAAATAAAACAATAACAAATCCATCAATTTAATATAACTTCGTTTATCATTCAGCTTAAAAGTAAAAATAAAAAAATTAACAAAATTTATCAATCTCGTGATATTTAACCAAAATCCACAGTAAAAGATCTGAAGCAGAAGCAGAATCCACTCCACATTGGTGAATAGAGATGTACAAAGGACAACGTTTTAATGAAGGCATGGAATGAACTTGCTGAAAGGGGCAGAAAGTCTATGAGTCAACACTGCTCTTTCTCATACAGATTCCACATGCAATGCACACCACAAAAGTTTTCTCCATCTCTTTCCACAAATATGGACCCCTTCAACAATTCCTACTATAATTTTTCTGGAAAAACTGCGTTTTCCATTTTTTCACCGAAAAAGATTGGGAAGAATTTTGAAAGG


Gene Sequence:
>Vu_36204(-)
ATGTTTCCATCGAGAAGAGTTATGGCGTTCTATATGATGAGTGAGGTATTATCTGTGATTTGTCGCGCCATGCCTCCTTCCCTCATTGAGGAACGACAGGCTTTGCTCCACAGTGGTTGGTGGAATGATTACCTAAATATCTCAGACTACCGAAATATCTCAGATCATTGTTATTGGCCGGGTATCTTTTGCAATGAAACTCTAAGAAGTGTTGCTACTATTGACAGTGGGTCCATCAAGATTCCTTCATCAAAAGAATTGCTTTGGATTGAGAAGTTGAACGTCAGTGCCTTCCCCAATTTAGTCTCTCTGCATCTATCTGGAATGGGTCTTAGAGGAACCATCCCCACAGATATAGGTTCTCTTACATACCTTACCTCTCTTGATTTGTCCAACAATGGTCTCCAAGGTAAGTTTATTGCAATTCTCTTGATTGTGTTATCCCTTACTAATTCTGTCAATAAAGGAGAATATAATAATCTCTTTCTTGTTCTCATCTAATTGCAGGTTCAATCCCTCCAACTTTAGGTCGATTGGAGAACTTGGTACATCTCTGCCTTCATTCTAATCAACTAGAAGGTCACATACCCGAGCATTTAGGAAATTTGTCCAAATTAGAAGCTTTGCAACTATCTCATAACAAAATTTCGGGTTTATTACCTCCCAAACTTTTGCAAATGGACAAAATGTCCTCTTTAAATCTCTCGTCCAATCAATTATGTGGTTCAATCCCATTAAAAACCATGAGATGTCCCTTTGCTACAATAGTTGATTTGAGTCATAACTTGTTTAATGGAAATATAACCTCTCAAATTGGTTGTGTAAATGACCTTAATCTTAGTCACAATTTTCTTGTTGGTGAGATTCCATCTCCTTTTACATGGAGCTCCGAACTTAGACGATTGGATCTCAGTTATAATAATCTTTCAGGTAAAGTACACCAGGAACTTTCTAGTCTATCATACATAAACCTTGCATACAATTCCTTGGACTTCTCACAAGACCTTGACTCAAAATTGAAGGTACCAGACTATTGTTTTTTCAAGGAAGACTCGTTAATTGATGATAATCACATGCTAAATTTCACATATTGCCACTTATTGAACCACACGAATCCTCAAACTAGAAAAAGTAATCCCATGATCATGTTAATTATTCTTCCTATAATTTTCTTCAATCTTTTTGTACTCCTTCCATTAATATATTTCTCAAGATGTATTCCTAAGAAAAATTGTGGACGAATATCAACAAAGAATGGAGACTTGTTTTCTATATTCAATTATGATGGTAAAATTGCATTTGAGGATATCATTGAAGCAACTGAAGACTTTGACCTCAAGTACTGTATTGGGACAGGCGGATATGGTAGTGTTTATAGAGCACAATTACCCAGTGGTAACGTTGTAGCATTAAAAAAGCTTCATCGAATGGAATCTCAAAATCCATCTTTCAACAAAAGTTTCCACAATGAGGTGAAAATGTTAACAGCAATTCGTCATAGAAACATTGTAAAGCTTCATGGCTTTTGCCTCCACAATCAATTCATGTTTCTTATATATCAATACATGGAAAGAGGTAGTTTATTTTATATTTTGAATAACGATATGGAAGCTCATGAGTTGAATTGGAGTAAAAGGGTAAATGTCATTAAAGGGATGGCACAAGCTTTAAGCTACATGCATCATGATTGTACCACACCAATGGTTCATCGAGATGTAACAAGTAGTAATGTTCTATTAAACTCACAATTAGAGGCTTGTGTCTCAGACTTTGGTACAGCTAGACTCCTGGATCCTGATTCTTCAAATCAAACCTTGGTAGTTGGCACTTATGGCTACATTGCCCCAGGTGAATGTCATTTTCTATTACAAAACCACTATTTTTTATAAATGTTGTAATAATATATTTTGATAAGTTAGTTAACTTTCTTCATTTCTTTGTCCACAACAGAGTTTGCTTATACATTGACTGTGACAGAAAAATGTGATGTTTATAGTTTTGGGATAGTGACTTTGGAGACATTAATGGGAAAACATCCTAGAGAGTTAATCTCAACTTTATCAAACCCAATAACTCAAAATATGTTGGTGAAAGATCTCTTGGATTCACGTCTCCCTCTTCCTCTTGAGAAAGATGCTAAAGATGTAAATCTTATGATAAATGTAGGATTATCATGTTTGTGCTCCAAACCAAACTTGAGGCCATCAATGCAACAAGTGATTGAGAAACTCTTTAGTTTTACATTGCCATTAGATTTGCCTTTCCATGAAGTTTCCATCCATCAAGTGATGAGCCAAGACATATTTCATCTTTCATCCAAGTTTCAAGAATGA