People Important Links Contact Us
Chickpea portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Menu

Genetic Resources

Genomic Resources

Agronomic Practice

Publications

Nutrition

Social Resources
  • Maps
  • Gene Families
  • Gene Search
  • MARKERs  
    • SSRs
    • SNPs
  • JBrowse
  • Download

Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36069 LG11 11465520 11469797 "PREDICTED: uncharacterized aarF domain-containing protein kinase At1g79600, chloroplastic-like "
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36069.1
MATIATMLSSSLPGQPFCSFSNHAPSFSFKSITVTRPRPRTRTRTSFTWLNPQPRGVLVEETPPSSPSSPSSRDGSIKVLALPENRSDDIQAEARALARAANASVYSPQLVASKYGSQPIKVVGRALQVLTAVGLFGLKLLVDQKSGVLDQNKRIRAIELRDTFTRLGPTFVKLGQGLSTRPDICPPEYLEELSELQDGLPTFPDEQAFECIERELGLSIDSIFSSISPRAVAAASLGQVYKGQLKYSGKLVAVKVQRPDIEEAIGLDFYLIRGLGFLINKYVNFITSDVVALVDEFARRVFQELNYVQEGQNARRFKKLYADKENIFVPDVFWDYTSVKVLTMEWVDGVKLSEQEAIERQGLKVLDLVNAGIQCSLRQLLEYGYFHADPHPGNLLATPEGKLAFLDFGMMSETPEEARYAIIGHVVHLVNRDYEAMARDYYDLDFLSRDVDVSPIVPALRNFFDDALNYTVSELNFKTLVDGLGNVLYQYPFNVPAYYALILRSLTVLEGLALYADPNFKVLAASYPYFAKRLLTDPNPYLRDALIELLFKDGKFRWNRLENLLTQGRKDRDFSAKEALQPVLKVLLSADGEDLRNLVIKEAARVSEAFTLGTMSETYRYIPHFVRTLVFNGNANGPFMMSETELQNMIELRDQVLRIWGLLQSSHDFDPAIFLPILQVLEQQPEARRLGGRVVSGITQRLAARFLQQILRVPSTASE*


CDS Sequence:
>Vu_36069.1
ATGGCTACAATTGCAACAATGCTATCTTCTTCCCTCCCGGGTCAACCCTTTTGTTCTTTTTCAAATCATGCCCCTTCATTCTCTTTCAAAAGCATCACTGTCACAAGACCAAGACCTAGAACCAGAACTAGAACAAGCTTCACATGGCTGAATCCTCAACCTCGTGGTGTTTTGGTTGAGGAAACGCCGCCAAGTTCACCTTCTTCTCCTTCTTCACGAGATGGATCCATCAAGGTGCTTGCGCTTCCTGAGAACCGTTCTGATGACATTCAAGCTGAGGCCAGAGCGTTGGCTCGTGCTGCCAATGCTTCTGTCTACTCGCCTCAGCTTGTGGCCTCCAAATATGGTTCTCAACCCATCAAGGTGGTGGGAAGGGCCCTTCAGGTTCTGACTGCGGTGGGCTTGTTTGGGTTGAAGCTGTTGGTTGACCAGAAAAGTGGAGTGCTTGATCAGAATAAAAGGATTCGTGCAATTGAGCTTAGGGACACTTTCACTCGGCTGGGACCAACTTTTGTCAAATTGGGTCAGGGGTTGTCTACCAGGCCTGATATATGTCCCCCTGAGTATCTGGAGGAGCTCTCTGAACTTCAAGATGGATTGCCAACGTTTCCTGATGAGCAGGCCTTTGAATGCATAGAGAGGGAACTAGGACTATCTATTGACTCTATTTTCTCTTCTATATCTCCGAGGGCTGTAGCAGCAGCCAGTTTGGGTCAAGTTTATAAAGGCCAGCTGAAGTATTCTGGGAAACTTGTTGCTGTTAAGGTGCAACGGCCTGACATTGAAGAAGCTATAGGATTGGACTTCTACCTAATTAGAGGTCTAGGGTTTCTTATAAATAAATATGTGAACTTTATCACCAGTGATGTTGTTGCTCTTGTTGATGAATTTGCGCGTAGAGTTTTTCAAGAGCTCAACTATGTTCAGGAGGGACAAAATGCAAGGAGATTCAAAAAATTGTATGCTGACAAGGAAAATATCTTTGTTCCTGATGTTTTCTGGGACTATACAAGTGTTAAAGTTCTAACAATGGAGTGGGTTGATGGAGTAAAACTAAGTGAGCAAGAAGCAATTGAGAGACAAGGATTAAAAGTCTTGGATCTGGTAAACGCAGGCATACAGTGCAGTCTCAGACAGTTACTTGAGTATGGATATTTTCATGCAGATCCTCACCCTGGGAATCTTTTGGCAACACCTGAGGGAAAACTTGCCTTTCTTGATTTCGGCATGATGAGTGAGACTCCAGAAGAAGCAAGATATGCCATAATTGGTCATGTTGTTCACTTGGTTAACCGAGACTATGAGGCCATGGCTCGTGACTACTATGATCTTGATTTTTTATCAAGGGATGTTGATGTATCTCCAATAGTGCCAGCACTTAGGAACTTTTTTGATGATGCACTTAATTATACTGTGAGTGAGCTCAACTTCAAGACACTAGTAGATGGTCTGGGAAACGTTTTATATCAGTATCCATTTAATGTTCCTGCATACTACGCATTAATATTACGTTCTCTCACAGTTTTAGAAGGTTTAGCATTGTATGCTGATCCCAATTTTAAGGTACTGGCTGCATCATACCCATATTTTGCAAAAAGGCTTCTAACAGATCCAAATCCATATCTAAGAGATGCTCTTATAGAGTTGCTTTTCAAGGATGGGAAGTTCAGATGGAATAGACTTGAAAACCTGCTAACTCAGGGGAGAAAGGATAGAGATTTTTCTGCTAAGGAGGCTTTACAACCTGTCCTGAAGGTGTTATTGAGTGCAGATGGTGAAGATTTGAGGAATCTTGTTATAAAAGAGGCTGCTCGAGTATCAGAAGCTTTTACCCTCGGCACAATGTCTGAAACGTACCGATATATTCCTCACTTTGTTAGGACCCTTGTCTTCAATGGCAATGCAAACGGACCATTTATGATGTCGGAAACTGAATTGCAAAACATGATAGAGCTTAGAGATCAAGTTCTTAGAATATGGGGACTTCTTCAATCCTCTCATGATTTTGATCCAGCTATTTTTCTGCCCATACTACAGGTCCTTGAGCAACAACCTGAGGCACGCAGACTTGGGGGGCGTGTTGTTAGTGGAATCACTCAACGTCTTGCAGCACGCTTTCTTCAGCAAATACTCAGAGTTCCATCAACAGCTTCAGAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_36069::LG11:11463520-11465520(+)
TTGTCTCATTTCTTAACATATAGTTTCATATCTTTATACATTCATATCATAATCAACTTTCATACTTCATAAAATCCATATCATATAAGGTTCATATCTTTCATGCATTAAAACATAACTCAACCATATTTCATTTCCATTCATTAAACAAACGAATGTTCATGCAATCCAATCATATCAATCATCATGCATCAAAGTCATTCAGTTAACTAACGAATGATCATATAGTACAGTAGCATACATATTAAATTAAATAAGCTTCCCTTACCTCTGAGCGTGACCGAACGTTCCCAGACGCAGAAATAAAATTTCACCACTACAGGTTCTTCTACCGTCAACGCTCGACAATTCCAACTACACCAAGTGACAACCCGACACTATCAGAACCACTCATTTTAAGAATGGTGATTAACACACGAACCCAGAACTGGATTTGCATGTTTAGGAAAACGAACGACAGAGCGAAGAGAAGGACTTACCAGCCCAGCTTCACAAACCGAATGGTTTATCTGGAAGCTCTTGACGCCGGAAGTGCTTCTATGGTGCCGGAATAGTGATCGGAGAAGAGAAAGTGAGTGTTTTCTCTGAGAGAAGATGAAGAGGATCTAGAGAGAAGGAGGAGAGAATGGGGTTCTTCAGAAATTTAGAAAAGAGAGTGCATGCAGAGAGTGAGGTAGGTTTTTCTGAAAATCCAAGTTTTGCTTCACACTTCAAAACGGACGTCCCTTCATCTGTCGACACCTGCTTTCCACTAACTGATTTCCGGGTCTCCTTCACTTGACACCTGGCGTTCGTCATCTGAGTGTCGAGCCTTCCTCTTGACACGTGAATTCCACTAACGACACGTGCTTGTATTTTACTGATTCTGACAGTAATAAATCTCCTCTTATATTTTCAAAATAACAATAATTAGCTATATAATACCAGAGCAACAATATCACATATTTTCAAAATACTTGTCTTTTTCAAGAATTCTAAAATAATAAGCTCTGTATAAGACATTCATGAAAATAAATTACTGTTTTATTCTTATTATTTCTCTTAAATATAATTGGTGGAAATTTATGTCAATTCAATTTTCTTTTAATTGATATATGTAGAGTAAAACTATCCCAACATGTGAAACATTATTTCTCCTTTAAAAAACATCTATACTTTCTAAATTAAATAATTAATTTAAAAAAAAATTTACCATTTCATTTTTCTAATTTAAAACAACTCATACATGGATTTGCATTGGTGGATAGAAGTTTGAATGTAGAGTTTTTATACTTGGTCCACACAATCCATGGTTTAAACCAGTTTCACATCTGGGTTTTGTAAACTACATGAAATTTACTTTACCAGGCTCATTTTAGTCCAAATTTTATTCATCCTTGTTTTATGGGTCATAAATATGTGAAACAATACCACTACATTAAAGATTTCATATAAAATTATAGTATTTTTTTTTATGTTATGCTAATATATGTTGAATCAATTATTAATGTCATTCTAAGCTTATATATATATATATATATATATATTGATTTTTTATTATATATATATATATTGATTTTTTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTTGAATCAATTAGTTTGATTTTTATTATAGGTTGGATATAATATATTCTATTTTTAAAAATTATATAATTAGTAAAAAAAAAAGTTGCTTTAAATTTTTCTAAAAAAACTTATGATTTGTTGTTTCTCAAATTTGAGGTACCGCACCCACCATCTTCAACATTATAGTGTTGTTCTTCCATGTGAACAGTGAACAAGTTCATTCATTGAGTTGCAATATCCATTCCCATGATCCAAACCCAAATTACCTAACCCCCATTATACTTTGTGCCAAATTCACTACCTCTTCGCTAACTTCTTCAATTGGTCTTTTCCATTATTCACAAAGTTTTCAGATTTGACGCTTTACAGCATCACAGTGGAGCAAGGAAGCAAGTGCTCA


Gene Sequence:
>Vu_36069(+)
ATGGCTACAATTGCAACAATGCTATCTTCTTCCCTCCCGGGTCAACCCTTTTGTTCTTTTTCAAATCATGCCCCTTCATTCTCTTTCAAAAGCATCACTGTCACAAGACCAAGACCTAGAACCAGAACTAGAACAAGCTTCACATGGCTGAATCCTCAACCTCGTGGTGTTTTGGTTGAGGAAACGCCGCCAAGTTCACCTTCTTCTCCTTCTTCACGAGATGGATCCATCAAGGTGCTTGCGCTTCCTGAGAACCGTTCTGATGACATTCAAGCTGAGGCCAGAGCGTTGGCTCGTGCTGCCAATGCTTCTGTCTACTCGCCTCAGCTTGTGGCCTCCAAATATGGTTCTCAACCCATCAAGGTTTTTCACTTTTTCCTTTTCTGCTTCTCTCGAATTTTGAGTCTTTTTGGGATTATCTTTTGTGGGTGTGGTTGGGTTTTGTGAATTGATTTTACCCTTTTTCTTGGTAGGTGGTGGGAAGGGCCCTTCAGGTTCTGACTGCGGTGGGCTTGTTTGGGTTGAAGCTGTTGGTTGACCAGAAAAGTGGAGTGCTTGATCAGAATAAAAGGATTCGTGCAATTGAGCTTAGGGACACTTTCACTCGGCTGGGACCAACTTTTGTCAAATTGGGTCAGGGGTTGTCTACCAGGCCTGATATATGTCCCCCTGAGTATCTGGAGGAGCTCTCTGAACTTCAAGTATTGAATTTTATGTACTCTTTCACCTCTTTATTTGATTGGGGGTGGTTTAGCCTGTTAGGGTTTTCTAGTGAAGCATGTTCTAGGAATTGATTAACTCTGGCCTTTTGTGAGAATAATGATTGGTGTTGTGATTATGTCCATATGCAACATAGGAGGATCTTCACTATTTCATTTGACTTTATGGTCTCTTCAAATTTCTTCATTAACCCAACTGACTGACATTGTGTGATTCATGTAACTGATCTCATTTACTGATATAAGACTTTTATTGTATATGGTCTTTATATTAACAATGGACAATATTGATGATATTCAATGAAAATTTTTCTCTAATGTGATGGTCTATGTCTATTAGTAGTGAGTTGTGGTCTATGTATATTTGTTTGTGTTATGATATTTATGAATGAACTGGTTACTTAGGTTGTCTTCATTATTTCTGTGCTTTATCAGGATGGATTGCCAACGTTTCCTGATGAGCAGGCCTTTGAATGCATAGAGAGGGAACTAGGACTATCTATTGACTCTATTTTCTCTTCTATATCTCCGAGGGCTGTAGCAGCAGCCAGTTTGGGTCAAGTTTATAAAGGCCAGCTGAAGTATTCTGGGAAACTTGTTGCTGTTAAGGTGCAACGGCCTGACATTGAAGAAGCTATAGGATTGGACTTCTACCTAATTAGAGGTCTAGGGTTTCTTATAAATAAATATGTGAACTTTATCACCAGTGATGTTGTTGCTCTTGTTGATGAATTTGCGCGTAGAGTTTTTCAAGAGCTCAACTATGTTCAGGTTATTCCTTCTGCCAGTATCAAACTTTGTATTTTAGTTGAATTCAGGCATGCATGATTCATCTATTGCCAATTTCCAAATCTATTTAATTTCTCTATGAACATGGTTTTAAGTTGTGGTCACAGTAATGGTTGCTGTTTTGGGGTAATCCTTATTGATTTGGTAATTGCAGTCATGGTGACTCCAAAACCTTGATACCATGGCCAAAATCGTGGCTGTGGACCTTTCTAAAACCTTGTTTATGAAAATAAAAATAAAATTAAACATTGAGCCTTTGCTGATTTGCCAAAATTAGGCAAAAGGCAGGCATATAACCATAGTATCTTTTTCCAATTGTAATTGAAAACTTCCCTAGGATGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATGTATAAGTTATGTAAGATATTTGTTGGGATTGAATGTTAATTTTGACAGGTTCCTGCAGGAGGGACAAAATGCAAGGAGATTCAAAAAATTGTATGCTGACAAGGAAAATATCTTTGTTCCTGATGTTTTCTGGGACTATACAAGTGTTAAAGTTCTAACAATGGAGTGGGTTGATGGAGTAAAACTAAGTGAGCAAGAAGCAATTGAGAGACAAGGATTAAAAGTCTTGGATCTGGTAAACGCAGGCATACAGTGCAGTCTCAGACAGTTACTTGAGTATGGATATTTTCATGCAGATCCTCACCCTGGGAATCTTTTGGCAACACCTGAGGGAAAACTTGCCTTTCTTGATTTCGGCATGATGAGTGAGACTCCAGAAGAAGCAAGATATGCCATAATTGGTCATGTTGTTCACTTGGTTAACCGAGACTATGAGGCCATGGCTCGTGACTACTATGATCTTGATTTTTTATCAAGGGATGTTGATGTATCTCCAATAGTGCCAGCACTTAGGAACTTTTTTGATGATGCACTTAATTATACTGTGAGTGAGCTCAACTTCAAGACACTAGTAGATGGTCTGGGAAACGTTTTATATCAGTATCCATTTAATGGTAAGATAGGCTATGCTTATCAGTGACTTATCATTTCCATAATTTCTTTTCCAATATTAGGGGAGTGACTTATAAACATTTACTTCTTATTCCTAAATCCTAACTTTCTTTCAGATTCTGTTTTGCTGATTTTTGTTTTTTCTGTTCGTTTCCTCTTCTGTTGACAGTTCCTGCATACTACGCATTAATATTACGTTCTCTCACAGTTTTAGAAGGTTTAGCATTGTATGCTGATCCCAATTTTAAGGTACTGGCTGCATCATACCCATATTTTGCAAAAAGGCTTCTAACAGATCCAAATCCATATCTAAGAGATGCTCTTATAGAGTTGCTTTTCAAGGATGGGAAGTTCAGGTTTGAAATATGCTACTATCTTAAATCCATTGTGATTTGAACTTGGTGCTGTAGAATAATGTATGTTTAGTGCAATTGAATATTCATTAATCGGGTCTGGTGCAGATGGAATAGACTTGAAAACCTGCTAACTCAGGGGAGAAAGGATAGAGATTTTTCTGCTAAGGAGGCTTTACAACCTGTCCTGAAGGTGTTATTGAGTGCAGATGGTGAAGATTTGAGGAATCTTGTTATAAAAGAGGCTGCTCGAGTATCAGAAGCTTTTACCCTCGGCACAATGTCTGAAACGTACCGATATATTCCTCACTTTGTTAGGACCCTTGTCTTCAATGGCAATGCAAACGGACCATTTATGATGTCGGAAACTGAATTGCAAAACATGATAGAGCTTAGAGATCAAGTTCTTAGAATATGGGGACTTCTTCAATCCTCTCATGATTTTGATCCAGCTATTTTTCTGCCCATACTACAGGTAAGATTATCATTTATAATTGCAGCATCATTCAAATCGGAATAACTATTCCCTTGTGTTAGGACATGGAGGGTTTATGAAAGGAGAAAGAAAGTAGAGAAATAAGGAAGAATACTTAACTGCTGAACAGTTAAGGGGGGCGGGAAAAAGTCTATATAAGGGACTTCTTTTGTAGTTTCATGGAGGGAGTTACTACATTCATTTGTGTTGACCGGTTTTGAACTTGGTGAAGGAGGTTAAGCTCCTGGTCTATAGATTGTATTCTTGATTCTTTTGTTGTGAATACAATACAACTCTTACTCAATTCTTGACTTGTGATTACTGGTGTGTGTTAGAGAGTGAGTGAGTTGGGATTCTTACCCAGATTCCTAACACCTTGTCTGCATCTTTTGCATATTTTATGTTGCTTACAACTTAGGTGTGTAACTTCAAAATTACTTTATTATCGAACGTGTTAGGCATATAAACTAATTTGGATGAATGCTACAAAACTCCAAAATTGGTGATTATTATTTATGATATTCCTTTAACAGAGCATTTTGTGAGTATCATTGCATACTAAATCAGAAGGGAGTTTGTGGAACATTTCAATTTTGGAGCGTCTAGATGTTAAAAGACGTGATCGTGCAACTAAAATATAGCATTGAAAATTACATTAAGAGCTAAGATGATCTTTAAAAAAGTGAACTGTAATAGTTCATTATATAGTACCGAGTTAACTTTTGAAATTTACATTAACATATTACTTTCTTGTAAAGTATTTAGTAGATTGGATCGAACTTTTTCAGCCTTATACAACTATATAAAAACTTTCTATTCAAAATCGTAACGTATGAGCAGGTCCTTGAGCAACAACCTGAGGCACGCAGACTTGGGGGGCGTGTTGTTAGTGGAATCACTCAACGTCTTGCAGCACGCTTTCTTCAGCAAATACTCAGAGTTCCATCAACAGCTTCAGAATAG

NIPGR © 2020

This project is funded by the Department of Biotechnology
Ministry of Science and Technology
Government of India

Visits: 1574555