Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36013 LG11 10243143 10247519 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 10243382 3_prime_UTR_variant
T/C 10243882 synonymous_variant p.Glu816Glu
T/A 10243909 missense_variant p.Arg807Ser
T/A 10244015 missense_variant p.Glu772Val
T/C 10244038 synonymous_variant p.Pro764Pro
T/A 10244048 missense_variant p.Tyr761Phe
T/A 10244051 missense_variant p.Tyr760Phe
A/T 10245308 stop_gained p.Leu404*
A/T 10245605 stop_gained p.Leu305*
T/C 10245633 missense_variant p.Ile296Val
G/T 10245642 missense_variant p.Pro293Thr
T/C 10245823 synonymous_variant p.Glu232Glu
C/T 10245852 missense_variant p.Gly223Arg
G/T 10246038 missense_variant p.Leu161Ile
C/A 10246278 missense_variant p.Val81Leu
C/A 10246575 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 10246617 5_prime_UTR_variant
C/A 10246638 splice_acceptor_variant&intron_variant
A/G 10246650 downstream_gene_variant
G/T 10246712 downstream_gene_variant
A/T 10246921 splice_donor_variant&intron_variant
C/G 10246978 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 10247193 5_prime_UTR_variant
A/C 10247238 5_prime_UTR_variant
G/A 10247344 5_prime_UTR_variant
A/T 10247348 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36013.1
MHCYKIDITLMKQVQFIPFLSLCFVFYCPLLVISINPSFNDDVLGLIMFKAGLEDPKGKLSTWNEDDYSPCNWVGVKCDPVNNRVSSLVLDGFSLSGHIDRGLLRLQFLQILSLSRNNFTGTIAPDLLGIGDLQVVDLSENNLSGLIPDEIFQQCWSLRVLSFANNNLAGKIPDSLSSCYSLAVVNFSSNQIHGELPSGMWFLRGLQSIDLSNNLLEGEIPEGIQNLIDLRELRLGKNLFTGRIPEHIGDCLLLKLVDFSSNSLSGRLPESMQKLTSCTFLSLQGNSFTGGIPHWIGEMKSLDTLDLSTNRFSGWIPKSIGNLDLLSRLNLSRNQITGNLPELMVNCIKLLTLDISHNHLSGHLPSWIFRMGLQSISLSGNGFSEGNYPSLTSIPVSFHGLQVLDLSSNAFFGQLPSGIGGLGSLQVLNLSTNNISGSIPVSIGDLKSLYNLDLSGNKLNGSVPSEIEGATSLSEMRLQKNFLRGRIPAQIDKCSELIFLNLSHNKLIGSIPSAIANLTNLQDVDFSWNELSGSLPKELTNLSNLFSFNVSHNHLQGELPVGGFFNTISPSSVSGNPLLCGSVVNHSCPSVHPKPIVLNPNSSYSNSGSSLQNNHHKIMLSISVLIAIGAAIFIVIGVVVVTVLNIHVRSSMPLSATPFIFSGGEDYSGSPGNDPNHGKLVMFYGDAEFADGAHNLLNKDSEIGRGGFGVVYCTVLRDGHCVAIKKLTVSTLTKSQEDFEREVKMLGKIKHQNLVALEGYYWTPSLQLLIYEYLARGSLQKLLHDDDSSKNILSWRKRFKIILGIARGLAYLHQMELIHYNLKSTNVFIDCSDEARIGDFGLVRLLPMLDPCVLSSKIQSALGYMAPEFACRTVKITEKCDIYSFGILILEVVTGKRPVEYMEDDVVVLCDKVRSALDDGKVEQCVDENLKGNFAAEEAVPVIKLGLVCASQVPSKRPDMAEVINILELIQCPSEEQEEIQ*


CDS Sequence:
>Vu_36013.1
ATGCATTGCTACAAGATAGATATTACTCTGATGAAGCAAGTGCAATTCATCCCATTCCTATCACTTTGTTTTGTTTTCTATTGTCCATTGCTAGTGATCTCTATAAATCCTTCTTTCAACGATGATGTGTTGGGGTTGATTATGTTCAAGGCTGGTCTAGAAGACCCAAAAGGAAAACTCTCTACGTGGAATGAAGATGATTATAGTCCCTGCAACTGGGTTGGTGTCAAATGTGACCCTGTAAACAATAGGGTATCTTCTCTTGTTCTTGATGGATTCTCACTTTCTGGTCATATTGATAGAGGACTTTTGAGACTGCAGTTCCTTCAGATTCTGTCCCTTTCGAGGAACAATTTCACAGGGACCATAGCTCCTGACCTTCTCGGCATTGGTGATTTACAAGTAGTTGATTTGAGTGAGAACAACCTCTCTGGGCTAATTCCAGATGAGATTTTCCAGCAATGTTGGTCTCTGAGAGTACTATCATTTGCCAACAACAACCTCGCAGGTAAGATTCCTGATTCATTGAGCTCCTGCTACTCTTTGGCAGTTGTGAACTTTTCCTCTAATCAGATACATGGGGAACTTCCATCTGGAATGTGGTTTTTGAGGGGACTTCAATCAATTGATCTTTCAAACAACTTGCTGGAGGGAGAGATTCCAGAAGGAATTCAGAATCTGATTGATTTAAGGGAATTGAGGCTGGGGAAGAACCTCTTCACTGGTAGGATTCCTGAGCATATTGGTGACTGCTTGCTTTTGAAGTTGGTTGATTTCAGCAGTAATTCTCTCTCTGGGAGACTTCCTGAATCAATGCAAAAGCTCACCTCATGCACATTTCTCAGCTTGCAAGGCAATTCATTCACAGGTGGCATTCCACATTGGATTGGAGAAATGAAAAGTCTAGATACATTGGATCTTTCTACAAACAGATTTTCTGGTTGGATTCCAAAGTCAATAGGAAATCTTGACTTGCTGAGTAGGTTGAATCTTTCAAGGAATCAGATCACAGGAAACCTGCCAGAGTTGATGGTGAACTGCATTAAGCTTTTGACTCTTGACATCAGCCACAATCACTTGTCAGGCCATCTTCCTTCATGGATATTTCGGATGGGTTTACAAAGTATCTCTCTTTCTGGGAATGGCTTCAGTGAGGGAAATTATCCCTCACTTACTTCCATTCCTGTATCTTTTCATGGCCTTCAGGTTTTGGATTTGTCATCAAATGCATTTTTTGGCCAACTTCCATCTGGAATTGGAGGTCTAGGTAGCTTGCAAGTCTTGAATTTGTCCACCAACAATATCTCAGGTTCTATTCCTGTGAGTATAGGAGACCTTAAATCTTTGTACAATCTTGACTTAAGTGGCAACAAGCTTAATGGAAGCGTTCCTTCTGAAATAGAAGGAGCAACATCACTCAGTGAAATGAGGCTACAAAAGAACTTCCTACGTGGGAGAATTCCAGCCCAAATTGACAAGTGTTCAGAACTAATATTTCTGAATTTATCTCACAACAAGCTTATTGGCTCAATCCCTTCAGCCATAGCAAACCTAACCAATCTTCAGGATGTAGATTTCTCATGGAATGAACTCTCTGGAAGCTTACCAAAGGAGCTGACAAATCTCTCAAACCTTTTCTCCTTTAATGTTTCACACAACCACCTTCAAGGTGAGCTACCAGTGGGTGGCTTCTTCAACACCATCTCTCCTTCATCTGTCTCTGGTAATCCATTGTTATGTGGTTCTGTTGTTAATCACTCATGCCCTTCTGTTCATCCAAAGCCTATTGTCCTAAACCCCAATTCTTCATACTCCAACTCTGGCTCTTCATTACAGAACAATCACCATAAGATTATGCTAAGTATCTCTGTTCTCATTGCTATTGGTGCTGCTATTTTTATTGTCATTGGTGTGGTGGTTGTTACTGTTCTAAATATCCATGTGAGGTCTTCAATGCCTCTTTCTGCTACTCCATTTATATTCTCTGGTGGTGAGGACTATAGCGGTTCACCCGGGAATGATCCAAACCATGGCAAGCTCGTGATGTTTTATGGTGATGCAGAATTTGCTGATGGTGCTCATAATCTTCTTAACAAAGACAGTGAAATAGGTCGCGGTGGATTTGGAGTTGTTTATTGCACTGTCCTCAGAGATGGTCATTGTGTTGCAATCAAGAAGCTTACAGTGTCCACCTTAACCAAGTCACAAGAAGACTTTGAGAGGGAGGTTAAAATGCTTGGGAAGATCAAGCACCAAAATCTTGTGGCACTTGAAGGTTATTATTGGACTCCATCCTTGCAGCTCCTAATTTATGAGTACCTAGCCAGAGGGAGTTTGCAGAAGCTTCTACATGATGATGATAGCAGCAAAAATATACTTTCTTGGAGAAAAAGGTTCAAGATCATACTTGGAATTGCAAGAGGGTTGGCCTATTTGCATCAAATGGAATTGATTCATTACAATTTAAAGTCAACAAACGTGTTCATAGATTGTTCTGATGAGGCAAGAATAGGAGACTTTGGCTTGGTGAGGCTACTTCCAATGCTAGACCCTTGTGTTTTGAGCAGCAAAATTCAAAGTGCACTCGGCTACATGGCTCCTGAATTTGCTTGCCGCACAGTGAAGATAACTGAGAAGTGTGACATATACAGTTTTGGAATTTTGATTTTGGAGGTGGTGACAGGAAAAAGACCAGTGGAATACATGGAGGATGATGTGGTTGTTCTTTGTGACAAGGTGAGAAGTGCATTGGATGATGGCAAAGTGGAGCAATGTGTTGATGAAAATCTAAAGGGTAATTTTGCTGCAGAAGAAGCAGTTCCTGTGATAAAACTGGGGTTGGTTTGTGCATCACAAGTTCCCTCAAAGCGACCAGATATGGCTGAGGTTATCAACATATTGGAGTTGATCCAATGCCCTTCTGAAGAACAAGAAGAAATACAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_36013::LG11:10247519-10249519(-)
AACTGAGATGAAAACTGAATTATTAAAAAGTATGCTGTGATTGATTTCTAACCATTCTCCCTTAGTAAGGAATCCAAGCAATTGCAGAATTTCTAGATTTTACAGACCTCATTCAAATTTATGAGGCTGATGGTGTTACTCGTGTACTTGCCTTGCTATGTCTTATTAGAGCTTGTCAGGGATAACTTGAATTTTGGACATTAACTGTGTTTTTGTTGAAACAATCTGTTTGAGAATTAACAAATGTGTCTTGGAATATTTGTTTAAATTTACAAAAAAAGGGAAAAAAAAAACTGTTTTCGTATAGAAAAGTGGTTTTTATATATCTAGATGTATACATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTAAACAATTATTAAAACGTTTAATTTTTAGAATTATCTGAAAGGTGCTCGCATAACAGAGGAGGCCAGAATTCCTGATAATCCTAAGCATTTTGTAAACTCTTGCAGTTCACAAATGTCCTTGGGGAAGTGAGTGATGAAATCAACATGGAAATTCCATACAATTATTTCAGTCAGATTTTCCAGACATAATTTCAAGTTGGAAAATGTTGATGGATGTACTTAACATTGCTTAATTTTTTTTTATTAACATATTTGCATAACTTAGAATACATTGTTCAGGTTTCTTTACTAAAGGATCAATTTCCTTTGTAATTACACAATGAAAGCTGGCTCTTTAAATATTACGGTCGGAATTGGGTGAAGTAGTGCAAGAATAATCCGAAACGACTTCAGTTCAAGTATGAGTCAAATTTGTTCTATTCAAAGTCCTATGTGTATTTTTTTTAATAGATAGCCCAACTTCAGTTAAGAGTATTTGTTTTTTCTGCTTTATGACGGTTTTACTTAAAAAAATAGAACTAAAGTTGTTACTTCTTACTACTTTAGCTATAAAAAAAAATTCTTCGAACTCAAGTTGAGTCAACTATGACGACTTCATTAGTCTAAAGTCATACTAACATACATGACTTTAAATAAAACAAATTTAACTCATACCCTATAATTGAAGTCGATAAGTGATATGACTTCACATTTTAAAAATCGTTTCATCTTGCACGACTTCACCTAATCCCGTAATATTTTAAAAAAGTGTTCTTTTGCGTAATTACAAAAGCAAATTGATCCCTTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAATTTTTCAATTAAAGGTTTTTCGTTTTTGATTTCTTAATCCAGATCCTAGTGTGTGGTACTGCCATTGGCAACACATTTTCTACTTATGTGTGGATCTTGTTATTTGCATGAACTAGACTTGAATTTTGTTCTGCGATGAAGAAAACATCTATTATTCCAATTTGAGATCAATTTCAACATGTTGCACACTTTTTTTACATACCTTCAACAGATTGCCTCCTTTCAAAAATATGGAATCTGCAACTTCTGCTACTGCATGACGAATTGACTCCAACCCATTGAACCACTTTTGTTTGTTGGTTTCCTTCTTGTGAACATACCCAGTAACAGCATTGTTCTATAACTTTACACATCTTAGATAGATAACACGTAGACGAAGAACTATTCTTAAAAACTCTTTCTTTACATCAAAAAATAATTTAAAGGTTTGTGTTGGCAGACTCGTTTTATTTAAAATAAAAAAGTTGAACAATTGAAGCGAAAAGTTGCTAAACTTCTTTAACTTGATGTAACATAGATGGACTCAGAAAAACAGAATTAACAACTTGCAAGGATGTTCACTATTGGAGATGCTATTAACTACTTTTCAATATGATTTTCTCTTGCTCCTACTTGCAAAATAGCATGGCCATGAATAATAAGGATCATAATCATGCGTCCGAACCACGTCAGATGAAAAAGTTGTCTTAAAGCACAACAATCTTGTTCACACCCATGATTCTGGTTTGACCCACAGAGCCAAATGCCACGCCATGCACACCATAGCAACTTCCCTCAT


Gene Sequence:
>Vu_36013(-)
AGGCCATGCCAAAGCACACAATAGAAAAAAGCTTCTCTCCTGTCACACTCTCTCTTTCACTCTTTCTCTTTAAATTTATCACTTTACTCTCTTTTTCAGAACCAGAAGACGATGAACAACCACAACAACAAGCTGTAGAAAAACAGCACTTTGATTGGAACCGTGGTTTTTTGTACTCACTTTCTTTTTCAACATCTCTGCCTTCTGTCAGCTTCTTATTTTTAACTCTGTTCCCGATCCATGCTCTTTTAGCAGCTTCTATAAAACAAACTCTTCTTGGTTCCAATTTCAGCTCACAAGGCTCAATCACGCCCTCAACTTTTAACCACTGTTTTATTCATGTCAAATGGATATTACACTCTCAAGAAGGCTTCCTTCCTTCGCCATGTCACAGCATGTGGTGCGATCTCGTGTTTCTGCTTTGCTTGTGTAATTTCACTGCACTTTTCTCTACAACCACCAATTCTTTGTTTTCTTTCTGAAAACACTGTGTTGCGTCACCCCACTTGAAATAAAAAATATTCAAAAGTTCTTCTCTTCTGTGAGTGCAATGATCACCATTCCTCCTTGGAAATTCTGAAGTTTGAAAAGCAGAAAGTGAGTTTGCTGAAGTTACTTTACTTTGTTCTTTTTTTTTTTCATCCTCACATGGTTACTGTCTTATGTCTAGTATAGCCTATTCCTTTGTTTGTTTTTACTGCTCTTTTTGTTTATATCCACCGAGGATTTGATTGTTACTCCTCCCACTTTTTCGTGTCCTTTCTACTGCCACTGTTGCAGTTGTATAATAACACTAGCACCTTTGTGCTTCTCTCTCTCATTATTTTTCTTGCATTTCAAACTTTCTTATACTTGTGCGTGACTTGTTTTCCTTTGGTTTAGACACTATGCTTTATGGGACCCGCCAACCTTTATCTACCGTATGTAAGCAAAATGGAATGGCTGTGTGTTTCTGTAAGGAAATAGTTGCTTTCTGAAAAATTCATGAAGCGCTCCACTGAATGCATTGCTACAAGATAGATATTACTCTGATGAAGCAAGTGCAATTCATCCCATTCCTATCACTTTGTTTTGTTTTCTATTGTCCATTGCTAGTGATCTCTATAAATCCTTCTTTCAACGATGATGTGTTGGGGTTGATTATGTTCAAGGCTGGTCTAGAAGACCCAAAAGGAAAACTCTCTACGTGGAATGAAGATGATTATAGTCCCTGCAACTGGGTTGGTGTCAAATGTGACCCTGTAAACAATAGGGTATCTTCTCTTGTTCTTGATGGATTCTCACTTTCTGGTCATATTGATAGAGGACTTTTGAGACTGCAGTTCCTTCAGATTCTGTCCCTTTCGAGGAACAATTTCACAGGGACCATAGCTCCTGACCTTCTCGGCATTGGTGATTTACAAGTAGTTGATTTGAGTGAGAACAACCTCTCTGGGCTAATTCCAGATGAGATTTTCCAGCAATGTTGGTCTCTGAGAGTACTATCATTTGCCAACAACAACCTCGCAGGTAAGATTCCTGATTCATTGAGCTCCTGCTACTCTTTGGCAGTTGTGAACTTTTCCTCTAATCAGATACATGGGGAACTTCCATCTGGAATGTGGTTTTTGAGGGGACTTCAATCAATTGATCTTTCAAACAACTTGCTGGAGGGAGAGATTCCAGAAGGAATTCAGAATCTGATTGATTTAAGGGAATTGAGGCTGGGGAAGAACCTCTTCACTGGTAGGATTCCTGAGCATATTGGTGACTGCTTGCTTTTGAAGTTGGTTGATTTCAGCAGTAATTCTCTCTCTGGGAGACTTCCTGAATCAATGCAAAAGCTCACCTCATGCACATTTCTCAGCTTGCAAGGCAATTCATTCACAGGTGGCATTCCACATTGGATTGGAGAAATGAAAAGTCTAGATACATTGGATCTTTCTACAAACAGATTTTCTGGTTGGATTCCAAAGTCAATAGGAAATCTTGACTTGCTGAGTAGGTTGAATCTTTCAAGGAATCAGATCACAGGAAACCTGCCAGAGTTGATGGTGAACTGCATTAAGCTTTTGACTCTTGACATCAGCCACAATCACTTGTCAGGCCATCTTCCTTCATGGATATTTCGGATGGGTTTACAAAGTATCTCTCTTTCTGGGAATGGCTTCAGTGAGGGAAATTATCCCTCACTTACTTCCATTCCTGTATCTTTTCATGGCCTTCAGGTTTTGGATTTGTCATCAAATGCATTTTTTGGCCAACTTCCATCTGGAATTGGAGGTCTAGGTAGCTTGCAAGTCTTGAATTTGTCCACCAACAATATCTCAGGTTCTATTCCTGTGAGTATAGGAGACCTTAAATCTTTGTACAATCTTGACTTAAGTGGCAACAAGCTTAATGGAAGCGTTCCTTCTGAAATAGAAGGAGCAACATCACTCAGTGAAATGAGGCTACAAAAGAACTTCCTACGTGGGAGAATTCCAGCCCAAATTGACAAGTGTTCAGAACTAATATTTCTGTAAGAACTCTCTCATAGCTTCCATTTTTCATGCTTTATTCTTCTAATATAATTTAGTTGAGTTGTTTTAAAAACCTTTCCTTGGTTCTATTTTAGTTATGAAAATTGAAATATTGTGAATACGGTGTTTATGAGTCTACAATTTTTTTCTAATGTTTCCCCTTTGTGCATTTCAATGGAATGGTACAGGAATTTATCTCACAACAAGCTTATTGGCTCAATCCCTTCAGCCATAGCAAACCTAACCAATCTTCAGGATGTAGATTTCTCATGGAATGAACTCTCTGGAAGCTTACCAAAGGAGCTGACAAATCTCTCAAACCTTTTCTCCTTTAATGTTTCACACAACCACCTTCAAGGTGAGCTACCAGTGGGTGGCTTCTTCAACACCATCTCTCCTTCATCTGTCTCTGGTAATCCATTGTTATGTGGTTCTGTTGTTAATCACTCATGCCCTTCTGTTCATCCAAAGCCTATTGTCCTAAACCCCAATTCTTCATACTCCAACTCTGGCTCTTCATTACAGAACAATCACCATAAGATTATGCTAAGTATCTCTGTTCTCATTGCTATTGGTGCTGCTATTTTTATTGTCATTGGTGTGGTGGTTGTTACTGTTCTAAATATCCATGTGAGGTCTTCAATGCCTCTTTCTGCTACTCCATTTATATTCTCTGGTGGTGAGGACTATAGCGGTTCACCCGGGAATGATCCAAACCATGGCAAGCTCGTGATGTTTTATGGTGATGCAGAATTTGCTGATGGTGCTCATAATCTTCTTAACAAAGACAGTGAAATAGGTCGCGGTGGATTTGGAGTTGTTTATTGCACTGTCCTCAGAGATGGTCATTGTGTTGCAATCAAGAAGCTTACAGTGTCCACCTTAACCAAGTCACAAGAAGACTTTGAGAGGGAGGTTAAAATGCTTGGGAAGATCAAGCACCAAAATCTTGTGGCACTTGAAGGTTATTATTGGACTCCATCCTTGCAGCTCCTAATTTATGAGTACCTAGCCAGAGGGAGTTTGCAGAAGCTTCTACATGATGATGATAGCAGCAAAAATATACTTTCTTGGAGAAAAAGGTTCAAGATCATACTTGGAATTGCAAGAGGGTTGGCCTATTTGCATCAAATGGAATTGATTCATTACAATTTAAAGTCAACAAACGTGTTCATAGATTGTTCTGATGAGGCAAGAATAGGAGACTTTGGCTTGGTGAGGCTACTTCCAATGCTAGACCCTTGTGTTTTGAGCAGCAAAATTCAAAGTGCACTCGGCTACATGGCTCCTGAATTTGCTTGCCGCACAGTGAAGATAACTGAGAAGTGTGACATATACAGTTTTGGAATTTTGATTTTGGAGGTGGTGACAGGAAAAAGACCAGTGGAATACATGGAGGATGATGTGGTTGTTCTTTGTGACAAGGTGAGAAGTGCATTGGATGATGGCAAAGTGGAGCAATGTGTTGATGAAAATCTAAAGGGTAATTTTGCTGCAGAAGAAGCAGTTCCTGTGATAAAACTGGGGTTGGTTTGTGCATCACAAGTTCCCTCAAAGCGACCAGATATGGCTGAGGTTATCAACATATTGGAGTTGATCCAATGCCCTTCTGAAGAACAAGAAGAAATACAATGAATTTTAAGTTATAGTGATTGAGACATAACAGATATTGCATACCTGGTGAAGAACAATCCAGTTTTCTTGCTTTAATGCTATTATACAATATGAATCATGCAGAGAATATTCACTTAATTTGTTTCCAACTTTTGTTTGTTGCTTCAGTTGTTGTAAGTTTTGTTGTTTTTACTTTTGGTCGTTTCAAGTTGTACTGCTGGATTTTTCTTCACCAGTTTGGCTGCTAATACAACAGTGTTTC