Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36005 LG11 10042000 10049508 PREDICTED: B3 domain-containing transcription repressor VAL2 isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 10042007 synonymous_variant p.Thr961Thr
C/G 10042116 missense_variant p.Arg925Pro
T/A 10042765 stop_gained p.Lys709*
T/C 10043064 intron_variant
A/T 10043067 intron_variant
C/A 10043512 intron_variant
G/T 10043572 intron_variant
G/T 10043884 synonymous_variant p.Pro668Pro
A/T 10043977 intron_variant
T/A 10044340 intron_variant
T/A 10044635 intron_variant
T/A 10046198 missense_variant p.Asn473Ile
T/G 10046199 missense_variant p.Asn473His
A/T 10046267 missense_variant p.Leu450His
G/T 10046268 missense_variant p.Leu450Ile
A/G 10047358 intron_variant
T/C 10047458 intron_variant
A/G 10047806 intron_variant
G/A 10048095 intron_variant
T/A 10048597 intron_variant
A/T 10048602 intron_variant
A/T 10048608 intron_variant
G/A 10048817 intron_variant
G/C 10049206 intron_variant
A/T 10049227 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36005.1
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CDS Sequence:
>Vu_36005.1
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Promoter Sequence:
>Vu_36005::LG11:10049508-10051508(-)
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Gene Sequence:
>Vu_36005(-)
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