Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36003 LG11 10016127 10020018 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase NAK
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 10016318 downstream_gene_variant
T/C 10016321 downstream_gene_variant
G/C 10016411 downstream_gene_variant
T/A 10016681 downstream_gene_variant
G/A 10016690 downstream_gene_variant
G/A 10016883 downstream_gene_variant
T/C 10017173 missense_variant p.Ile17Thr
A/G 10017414 synonymous_variant p.Arg97Arg
A/G 10017564 synonymous_variant p.Glu147Glu
G/C 10017628 missense_variant p.Val169Leu
A/G 10017650 missense_variant p.Asn176Ser
C/T 10017743 missense_variant p.Ala207Val
C/T 10017902 missense_variant p.Ser260Leu
T/G 10017954 missense_variant&splice_region_variant p.His277Gln
C/A 10017988 downstream_gene_variant
A/G 10018231 downstream_gene_variant
T/C 10018362 downstream_gene_variant
G/A 10018811 downstream_gene_variant
A/T 10018868 downstream_gene_variant
A/C,G 10018878 downstream_gene_variant
T/C 10018886 downstream_gene_variant
A/G 10019202 downstream_gene_variant
C/A 10019517 missense_variant p.Pro503His
C/T 10019518 synonymous_variant p.Pro503Pro
C/A 10019688 missense_variant p.Pro560Gln
C/G 10019697 stop_gained p.Ser563*
T/G 10019699 missense_variant p.Ser564Ala
C/A 10019700 missense_variant p.Ser564Tyr
T/A 10019701 synonymous_variant p.Ser564Ser
G/C 10019706 missense_variant p.Arg566Thr
C/T 10019770 synonymous_variant p.Asp587Asp
C/T 10019773 synonymous_variant p.Asp588Asp
G/A 10019933 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36003.1
MGCFTVLKYKKEKINKIRYTKCVSHIEHVPTVLPEPQIHTRSLHSAPSSFRNRVKSTHPINKVTNPRTRTLSAPSALDVATQNTLTTVEFEDQEESRYNVGSLKGQHSSNPLPLPLPSHQGGGELKATGSFKSGIVSGSVYGPDVAEQDALASVEYEEQEESKHRVGLVKDHCSTNSQPLPLPSRQGGGAALKAKISTKLGMATAPAYVCGPLPLPPTGLLRNLPFEEISAACHNFSSDRCMSECLSSTIYSASFGDDASSAKKFEATVTRLHSSTHGLKEFINDVNTLASLQHPNLCKLLGFHARDGSEPRMLVYERLYHGSLDQQLFGRSDGHSIDWNSRMKVAICAAQGLTFLHEEGPFQAMYNEFSAANIQIDKDFSAKLSGYGCVGRIPEEEISSSTCAVGNLSVETLERGILTPKSYVWGFGIILLELLTGRKNVDSHHPKEERNLVKWSRPFLADDFRLSLIMDPQLKGRYPPKAARAVADIAQRCLQKEPSERPPMRTIVEHLKVVQDMKYSCWFPLQEPAKQMSRSPSLNGVKCLTPTLSFSPSTAPVTRPSVSSPRWCAVPTLHLPLGACSSTFSMDDHVRPESRKSILNV*


CDS Sequence:
>Vu_36003.1
ATGGGGTGTTTCACTGTTCTGAAATACAAGAAGGAAAAGATCAATAAAATCCGATACACAAAATGTGTGAGCCATATTGAACATGTTCCTACAGTACTTCCTGAACCTCAAATTCATACTCGTTCCCTGCATTCTGCACCTTCTAGTTTTAGGAATAGAGTGAAATCCACTCACCCCATTAATAAAGTTACCAATCCCAGAACACGGACATTATCTGCTCCATCAGCTCTTGATGTGGCCACACAAAATACTCTTACCACAGTCGAGTTCGAGGATCAAGAGGAATCAAGATACAATGTTGGATCACTGAAGGGGCAGCATTCATCTAATCCACTACCTTTACCACTTCCTTCACACCAGGGTGGTGGTGAATTGAAAGCTACTGGAAGCTTTAAGTCAGGAATAGTTAGTGGTTCTGTGTATGGTCCTGATGTTGCAGAACAGGATGCTTTGGCCTCGGTTGAGTATGAGGAACAAGAAGAGTCAAAACACCGAGTTGGATTGGTGAAGGATCATTGTTCAACTAATTCACAACCTTTGCCTCTTCCATCTCGTCAAGGTGGTGGTGCTGCATTGAAGGCTAAGATCAGCACTAAGTTGGGAATGGCTACTGCTCCTGCATATGTCTGCGGACCTTTGCCTCTTCCACCTACCGGGTTGCTTAGAAACTTACCGTTTGAGGAGATTTCTGCTGCTTGTCACAACTTCTCTTCAGATCGATGCATGTCTGAATGTCTTTCTTCTACCATATATAGCGCTTCATTTGGTGATGATGCTTCAAGTGCAAAGAAGTTTGAAGCCACTGTCACTCGCCTTCATTCATCAACACATGGATTGAAGGAATTCATAAATGATGTCAATACCCTTGCATCTTTGCAACATCCAAACCTCTGTAAATTGCTAGGATTTCATGCCCGTGATGGTTCTGAACCAAGGATGTTGGTTTATGAGAGGCTATACCATGGAAGCTTGGACCAACAGTTGTTTGGAAGATCTGATGGCCATTCAATTGATTGGAACTCACGAATGAAAGTTGCCATATGCGCTGCACAAGGTCTTACTTTCTTGCATGAAGAAGGGCCTTTCCAGGCAATGTATAATGAATTTTCGGCAGCCAACATACAGATTGACAAAGATTTCAGTGCAAAACTTTCTGGGTATGGTTGTGTGGGACGAATTCCTGAGGAAGAGATTTCCAGCAGTACATGTGCTGTTGGAAACCTGTCTGTGGAGACACTGGAAAGAGGAATTCTTACTCCAAAGAGCTATGTTTGGGGTTTTGGAATTATTCTTTTGGAGCTACTTACTGGCAGAAAGAATGTGGATAGTCATCACCCCAAGGAAGAGAGGAACTTGGTGAAGTGGAGCCGGCCTTTCCTGGCCGATGATTTTCGACTGTCGTTGATTATGGATCCTCAACTTAAAGGTCGATATCCTCCCAAGGCAGCAAGAGCAGTAGCTGACATTGCACAAAGATGCCTCCAAAAGGAGCCATCAGAAAGACCCCCCATGAGAACCATTGTTGAGCATCTCAAAGTGGTTCAAGATATGAAGTACTCATGTTGGTTCCCACTGCAAGAGCCAGCAAAACAAATGTCAAGATCACCGAGTCTTAATGGTGTCAAATGTCTTACTCCTACACTGAGTTTCTCTCCCTCAACAGCACCAGTTACCAGACCATCTGTTTCATCTCCAAGATGGTGTGCTGTGCCCACACTGCATCTTCCTCTTGGCGCTTGTTCCTCCACTTTCTCCATGGACGACCATGTTAGGCCGGAAAGCCGGAAGTCAATCCTCAATGTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_36003::LG11:10014127-10016127(+)
TAACACATTTAAAAAGATAAAAGATAAAATTAGTTTCTCATTCCATCAACCAAATCTTTAATACTATTTTTTTTATAGTTTTTTTAGGGATTAGGGGATATAATTGAAAGAAACATAGGTATGCCTAAAAATTAGGTCCAAGTTAGAGTATCAATGTTAGATCACAATATAGAGATGCTAGAATGAGAATTAAATTTTTTTAATTTATTTCACTATGTATAATTTTAATTTCAAAATTATTAGTTTACTACTACTTAACCCCAACTTTGATAATTTGTAGTTTGAATTTATTAAAAAAATTAGAAATGTGTTATTTGTGTAAAAAAAAATGGAAGAAAATGTAAGATAAATTAAAATAGTTTGAACTCATTCTTCACGGTCAAACGAAAGAAAAGAATTAGTCAAATTAAAAGCAAGTTCGATCTGTGGAATGTTAAAAACGGCTTTGACGAACGGTCACGCCCATTCGAACACATTTCCAATGCATGGAACCAAATTTGGCAGCTACATTTTTTTATCATATATCTAATATTAAATATAGAACGTCATGTAACAACAAAATTAAAAAAATATAAAGGAGTTTTACATTATTATTATATTACATGTTTAAATAACTTATGTAACATCGAATATTTTCAAACGAGTCTTTGTTGAATGTTTTTATTTTCTTAAATAATTAAAATAAAATTTATTTTTATTTAAGCATTTTGTTTTTTGATTTTTTTCTAACGTGATGTGATAATTATAGTTATTTTTTCTTTAATTAATTAGAAGTAGGAGATGTTTGACAATAAAATTAAACTATAAGATATTTAGGTGAAAGTAAAAAATATATTAATCACTCAATATCATAACTTTGTTTATAAAAATTTAATATACGTCTAGAAATTAAAATTAAATTCAATTATGCGATTTTATATTTAAAAATAACTATTATTTAAAATTTTTTAAATTTTTTCTCTCTCAAATTGTGATAAAATATCTTTGATCTAATATAGAGTCCAGTGAGACCAATCTTTTGTCCTTTTGCGTTATTAAAATTATATATACATATATATATATATGTATATATATATGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATTCCAACATAAATAGTTGTAGTTCTTTTAATGAATGAGATTCTTTTGAAAAATCCAAATCTAGAATAGATATAGCATTAAAAAGATTCTATCTGACGGGTTTAACATCTTCAATTAAAAAAGGTTCTACGAATAAAAAACAGTTTTATTAGAGTAAAAAACATAAATTTACTAATAGAATTAAGAAATTCTTCAATGAGATTTATTTAAAATATAATTAAATCAAAATAAAAATACAATGTTTTTTTATATTTCTGAAAATATTTCCAACAAAATTATATTGAATTCCTCAAAAATTACGGGAGCTGTAAAAATAAATATTATTAAAGTAAATTATTTTTCAGTTTCTCAATACATTCTTTCTTATGCAAATTCTATCATTAGTTAAAGTAAAATAAACCTCATATGCATTTTGAAAAAAAAAAGTTTATTAGGTTATAGGATGTATAATACAATAAAAAGAAGATAAAAAAATTATTTAATAAATGTATATATCAGAATCATTATCTTTAGTTAAAATTATTAAAAAAAAAAGTGATCATTAGAGAAATCTGTTATGATTATGAATTTTAATAGACAGTAAAAGAAAAAATTGGTTGAGAAGATATTAGAAAGTGTGATGTGAATGAAGATTTGTGTTGAATTAATTCCATAAAAAAGGGTCATAGAATTGAACACTTTCATTTTGACCACTCATTGATTTCCCCACCAGTTTGAGACCAATTCTCTGTTTTTTACCATTCCAAATTTCCACATACATACTCTTCATTTTCAAAGAAACATCACTTCCCACCACTCAGCTTTTCCGTTCTGCTCACATTCTTTGACTTCATAAGCCTTTCTTCGTGGTCCAAGCACAACCACATCTTCTA


Gene Sequence:
>Vu_36003(+)
ACCCATTTTTAGTTTCACTCTGAGTTGCATGAGCTTCTATCTCATATCTCTCTCAACTTCCCTCCTTTTCGTTTTCTATATTCTCATGATTTGAATCCTCTTGTGTTTCAAACTTTCTTGGTAGGTCACTTTTTTTTCCCTTTTAATCTTAAAAGCATTGCTTTGATTGTGTTTTTGTTTGATTCATTAGCAGTTTTTCTTTAGTTTTTTAGTTGAATCATGGAATCATTGCCTTTTCTTTGTTTTTCCTGGGGTGGGGTTTGTTTTTGGCTATTTCTATTGGGGTTGAAATCTCAGGGCCTTGAAAATTGTTTTGAAATCTGTGGAAGTTGTTTTTGAGATTTGTTTCGTGTTATGGATCTGGATTGATTTTCCTGTAGTAGAATGAGTGAGCATTTGTGGGTATCTTGCTATTTTCTGAGAATAATTGGGTGCATGGAGTTTATAACTCCATATAACAGAGTAGTTTGGTTTATTAGCCACAAAGCATTTATGATATTTACTGTGAAGATTGACCAATGACATAGGAAAAATGAAGTGATTAATTGCTCTGTTTTGGGAGTGTGCTTGACGCAACACAAGCATGTACAGCACAGGAGATTTGTTTGGGGACCAGTTCATCCATTCTTATGATGTCTACTGCTGTACGTTTACATTTTATCTGCAATCATTGACCAGTAATAATGGTCTCTGAGAGCAAAGAATGAGATTGATGAGAACTGAGATGGGGGAAAAGAAAAATGGAAATGAAAATGTGGGGAAATGGGAGATTGCTGTTTGTATTCATTTCATTGTTTCAAGTTGTGTGATCACTAGAGAATCTAAATAAAATGAAAAACAAATCTAAATACACATTTCTTCTTGGATCTATTTTGAAATTGAAGGTAGCTCTTTATGTGGAAATTCTATGATACCATTGAGGTTCTATTAACTTTGTTTAGGCCTTTTCTTTTGCAGCAAAGGCAATTTTATTCAACAACTGAATTCTGTACAGAAGATGGGGTGTTTCACTGTTCTGAAATACAAGAAGGAAAAGATCAATAAAATCCGATACACAAAATGTGTGAGCCATATTGAACATGTTCCTACAGTACTTCCTGAACCTCAAATTCATACTCGTTCCCTGCATTCTGCACCTTCTAGTTTTAGGAATAGAGTGAAATCCACTCACCCCATTAATAAAGTTACCAATCCCAGAACACGGACATTATCTGCTCCATCAGCTCTTGATGTGGCCACACAAAATACTCTTACCACAGTCGAGTTCGAGGATCAAGAGGAATCAAGATACAATGTTGGATCACTGAAGGGGCAGCATTCATCTAATCCACTACCTTTACCACTTCCTTCACACCAGGGTGGTGGTGAATTGAAAGCTACTGGAAGCTTTAAGTCAGGAATAGTTAGTGGTTCTGTGTATGGTCCTGATGTTGCAGAACAGGATGCTTTGGCCTCGGTTGAGTATGAGGAACAAGAAGAGTCAAAACACCGAGTTGGATTGGTGAAGGATCATTGTTCAACTAATTCACAACCTTTGCCTCTTCCATCTCGTCAAGGTGGTGGTGCTGCATTGAAGGCTAAGATCAGCACTAAGTTGGGAATGGCTACTGCTCCTGCATATGTCTGCGGACCTTTGCCTCTTCCACCTACCGGGTTGCTTAGAAACTTACCGTTTGAGGAGATTTCTGCTGCTTGTCACAACTTCTCTTCAGATCGATGCATGTCTGAATGTCTTTCTTCTACCATATATAGCGCTTCATTTGGTGATGATGCTTCAAGTGCAAAGAAGTTTGAAGCCACTGTCACTCGCCTTCATTCATCAACACATGTACTTTTCTTCATTCTGCATTATTACTCTCATCTCTTGATGGTATCCTCATGCCTAGTACAATGATGTTTTATCATCAATTATATATGATGCTTCTGTTTCTATATATAGAGAAGTAACGAGGTCTTATCTTAAAATGGCTAGAGTCAACAGAAGATTGTTATGCCTTTTGAAAACCATTTTAAGAGGGGCATGAAAGAGTTTAGGTTTGTCAACTGCTGTCATCTGGTTCTAAACCTTGTTCTTCTTGCTGTCCTTCTTCCTCTGTTACTTCTCACAGCACATTTGAATGTTTTCAAACCATTTTGAAATCAAACGAGGAAAGTTGTAAAAAATTTCCCTTTTACTGTTCCAAACGTAAATATGAATTATTGTTAGTATTGCATCGAGAGGTTTATGAATTTTGGTCCAAGACAAAAGTTTGAAAGCAGCTGAGAACTTTCTGACATGGTCTATGTGACTGTAATGTATCTTGCAGGGATTGAAGGAATTCATAAATGATGTCAATACCCTTGCATCTTTGCAACATCCAAACCTCTGTAAATTGCTAGGATTTCATGCCCGTGATGGTTCTGAACCAAGGATGTTGGTTTATGAGAGGCTATACCATGGAAGCTTGGACCAACAGTTGTTTGGAAGATCTGATGGCCATTCAATTGATTGGAACTCACGAATGAAAGTTGCCATATGCGCTGCACAAGGTCTTACTTTCTTGCATGAAGAAGGGCCTTTCCAGGTAATAAATTTTCTGTTTTTGCTTAAGTGGGTGTAAAGTGTATGTCTTATATTCAAAACTGAAGCAGCCTTCCGTGCTCATGTCTGCACTGTTTTTCTCCCTTCTTTACTTGTGGCTTTTGGACCACATTAAATGCTGTTGGACTCGAGCTATTTCTTAATATTGGAGTACAATTATATTATGAGAAAATATTTTTCTATGTTCCTTGTACATTTATATCTCTGCTGACGAACCTCTGTGAATTAATTGTAGGCAATGTATAATGAATTTTCGGCAGCCAACATACAGATTGACAAAGATTTCAGTGCAAAACTTTCTGGGTATGGTTGTGTGGGACGAATTCCTGAGGAAGAGATTTCCAGCAGTACATGTGTAAGTTCATTTACTCTATAAAATGCTGTATGTGTATTATTATAAATCATGAACTATTCATCTGACATTTTCTCGCTTTGAATCTTTTTTGACATGTAACAGTATTCCATAAGTTTTGTCCTCATTCATTTGGTTCTTGAATTTATTATTGTACAGGCTGTTGGAAACCTGTCTGTGGAGACACTGGAAAGAGGAATTCTTACTCCAAAGAGCTATGTTTGGGGTTTTGGAATTATTCTTTTGGAGCTACTTACTGGCAGAAAGAATGTGGATAGTCATCACCCCAAGGAAGAGAGGAACTTGGTGAAGTGGAGCCGGCCTTTCCTGGCCGATGATTTTCGACTGTCGTTGATTATGGATCCTCAACTTAAAGGTCGATATCCTCCCAAGGCAGCAAGAGCAGTAGCTGACATTGCACAAAGATGCCTCCAAAAGGAGCCATCAGAAAGACCCCCCATGAGAACCATTGTTGAGCATCTCAAAGTGGTTCAAGATATGAAGTACTCATGTTGGTTCCCACTGCAAGAGCCAGCAAAACAAATGTCAAGATCACCGAGTCTTAATGGTGTCAAATGTCTTACTCCTACACTGAGTTTCTCTCCCTCAACAGCACCAGTTACCAGACCATCTGTTTCATCTCCAAGATGGTGTGCTGTGCCCACACTGCATCTTCCTCTTGGCGCTTGTTCCTCCACTTTCTCCATGGACGACCATGTTAGGCCGGAAAGCCGGAAGTCAATCCTCAATGTGTAGGAGAGCTAATGTTGAAGGATATTGACTGTCTATAATGCTCATTTTTATTATATTTTGTTTGTTGCTTTGATCAGTTTTAGGGTGATTCAACACAATTGTATAGGAGATTAAGGTACGGTTCTTCCATATTTCTATTTCTTTCCATGAGAAGATGTTCTTTTGTAGATAGTGCAAAGGTTGCTTATACTGGGGATCTTGATATG