Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35989 LG11 9641446 9646566 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase WNK5 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 9641499 3_prime_UTR_variant
C/G 9642061 synonymous_variant p.Ser473Ser
T/A 9642204 intron_variant
C/A 9642209 intron_variant
T/A 9642240 intron_variant
G/T 9642326 intron_variant
A/T 9642358 missense_variant p.His460Gln
G/T 9642388 missense_variant p.His450Gln
C/T 9642436 synonymous_variant p.Pro434Pro
A/T 9642514 synonymous_variant p.Thr408Thr
C/A 9642687 stop_gained&splice_region_variant p.Glu351*
G/A 9642719 intron_variant
A/T 9642766 intron_variant
T/G 9642770 intron_variant
G/T 9642843 missense_variant p.Thr329Lys
C/A 9642994 missense_variant p.Asp279Tyr
C/A 9643106 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/C 9643694 missense_variant p.Ser181Cys
T/A 9643990 intron_variant
C/A 9644184 intron_variant
G/C 9644394 synonymous_variant p.Gly110Gly
T/C 9644865 intron_variant
C/A 9645021 intron_variant
G/A 9645133 intron_variant
A/T 9645172 intron_variant
G/A 9645359 intron_variant
C/A 9645442 intron_variant
G/C 9645541 intron_variant
T/G 9645676 synonymous_variant p.Gly8Gly
A/T 9646052 5_prime_UTR_variant
T/A 9646093 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 9646140 5_prime_UTR_variant
G/A 9646208 5_prime_UTR_variant
G/C 9646448 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 9646502 5_prime_UTR_variant
A/C 9646561 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35989.1
MYKGRLGGKAHLGYVETDPSGRYGRFRDILGKGAVKVVYRAFDEVLGIEVAWNQVNLGDVFHSPDLLQRLYSEVHLLKNLEHDSIMTFHDSWIDVNYRTFNFITELFTSGTLREYRKKYQRVDIRAVKNWARQILTGLEYLHSHDPPVIHRDLKCDNIFINGHLGQVKIGDLGLAAILRGSQHAHSVIGTPEFMAPELYEEEYNELVDIYSFGMCMIEMFTSEFPYSECSNPAQIYKKVTSGKLPEAFYRIHDLEAQKFVGKCLANVSERLSAKELLLDTFFAEDQLDSPLSSPTLPRKQTPTLNFTAPLAKGLPPMSDQIKDTHMTITGSINEEDDTIFLKVKISNKSGEKRNIFFPFDTINDTAIDVAVEMVKELEISDLEPLEIAEMIEEEISALVPTWRRDWGTSKYQRQHSFSYEDEYDMSNHHTYFSPSSRSSSHGSSHKHNSHLCGNHYPFAHDWPQDELFMNDDSSSQSSMNSFKCFNLKYCDPGNEDGHDPTAVLRAEALCYSPKGNEKCTRFCPREEVMDADCTKQFCNMKMDSHRYHGVQRLTRIRSFVDLRRQQLQRSLMEEIHKRRIFKTVGAIENIGFQNPEGAASFLF*


CDS Sequence:
>Vu_35989.1
ATGTACAAGGGTAGATTAGGAGGAAAAGCTCATCTTGGATATGTTGAAACTGACCCTTCTGGTCGATATGGTCGTTTCAGGGACATTCTTGGCAAAGGAGCAGTGAAGGTTGTGTATAGGGCATTTGATGAAGTCCTTGGAATAGAGGTTGCTTGGAACCAAGTTAACCTTGGTGATGTCTTTCATTCACCAGACCTACTTCAACGTCTTTACTCAGAGGTTCATCTCCTCAAGAACTTGGAACATGACTCCATCATGACCTTCCATGATTCTTGGATTGATGTCAATTATAGAACCTTCAACTTCATCACTGAATTGTTCACCTCTGGCACCCTAAGAGAGTACAGAAAGAAGTATCAGAGAGTAGATATCAGAGCAGTGAAGAACTGGGCACGCCAGATTCTAACTGGTTTGGAGTATTTGCATAGCCATGATCCTCCAGTGATACATAGAGACCTCAAGTGTGACAATATCTTCATCAATGGCCATCTGGGGCAGGTCAAAATTGGTGATTTGGGCCTTGCAGCCATTCTTCGTGGCTCCCAACATGCACACAGTGTCATAGGTACACCAGAATTTATGGCACCAGAATTGTATGAAGAGGAATACAACGAGCTGGTTGACATATACTCCTTTGGGATGTGTATGATAGAAATGTTTACTTCTGAGTTCCCATACAGCGAGTGCTCCAACCCAGCTCAAATATACAAGAAAGTTACTTCAGGGAAGCTGCCAGAAGCCTTTTACAGAATCCATGACTTGGAAGCTCAGAAGTTTGTGGGAAAATGTTTGGCAAATGTCTCAGAGAGGTTGTCAGCAAAGGAGCTGTTGTTGGACACATTTTTTGCTGAGGACCAACTAGACTCTCCACTCTCTAGCCCAACATTACCCAGAAAACAAACCCCCACACTCAATTTCACTGCACCACTGGCAAAAGGGCTACCACCAATGAGCGACCAAATAAAAGACACACACATGACCATCACAGGATCAATCAATGAAGAGGATGACACAATTTTCCTTAAAGTAAAAATTTCTAACAAAAGTGGGGAAAAGAGGAATATATTCTTTCCATTTGACACCATAAACGACACTGCAATTGATGTGGCAGTGGAGATGGTTAAAGAACTTGAAATTAGTGACTTGGAACCATTAGAGATTGCTGAAATGATTGAGGAAGAGATATCAGCTTTAGTCCCAACATGGAGGAGGGACTGGGGCACTTCTAAGTATCAAAGACAACATAGTTTTAGCTATGAAGATGAGTATGATATGAGTAACCACCACACATACTTCTCACCGTCTTCTCGCTCTTCCTCTCATGGTTCTTCCCACAAGCATAATTCCCACCTCTGTGGGAACCATTACCCTTTTGCTCATGATTGGCCTCAGGATGAACTGTTTATGAATGATGATTCGAGCTCTCAAAGCTCAATGAACTCCTTCAAGTGCTTCAATCTCAAGTACTGTGACCCTGGCAATGAAGATGGGCATGATCCAACTGCAGTACTACGAGCAGAAGCTCTTTGCTACTCTCCAAAAGGCAACGAAAAGTGCACAAGATTCTGTCCTCGAGAAGAAGTGATGGATGCTGATTGCACCAAACAGTTTTGCAACATGAAAATGGATTCTCACAGGTATCATGGAGTCCAGAGGCTAACCAGGATTCGTTCCTTTGTGGATCTAAGGAGACAACAACTGCAACGATCACTGATGGAAGAGATTCACAAGAGGAGAATCTTCAAGACGGTTGGTGCCATTGAGAACATTGGTTTTCAAAATCCAGAGGGAGCTGCGAGTTTTTTATTTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_35989::LG11:9646566-9648566(-)
ATTTGAGGTGTATACGAGGGTAGTTTCTCATATCTTTTACGAGTACAAACTTCTATTTATGTTGAGTTTATGAGAGTTATTTATGTTTTGGAGCATGCTTTGAAGGAGAACTTTCAAAAGCCTTGATTCTAGAGTAGTTCTACTTTAGATTGTCATGGTTTTTTAAATCAATAAGTGGTTCCTTAGAGGTTTTTCATGAAGAGAATAATTATACTGATAAATAAGCTAATTAAGCTTTCATTATTCATAAAGAACCATATAAGTGTTTAATGTTTTTCCTTTATGTATTTATTTAGATTTTTTTCATAATAGATATAGTTTATCTATGTTTCGTGACGTGTAACTTTTATCATGAGTTTGGTATGACCTCTCATGTCTTGTATTCTTTTATTTTATTTTATTTTTAATAAATTTATATGTGATGACAAATAATTATTAAATTTTTGAGTATTAATATAACTAAAATGTTAAAATTCATAACAATATGGAACATGATGTTATTTGGTAGAAGAATTAGACACCATCGAAGAAACGTAGAAAGTTGATTAAATATCACCAATTCTTATACATGTAATTTGGTTTGTATTTATATAGTTAGTTCACTTTTTCTTTATCTTAGTGTTTTAATCTATATTATTAATAGTTATTACGCTACGAAAATTGTAATCTGTTCTTAGATATAAGAATAATTTTTTTTGTATAATGATCTAAATTGAATCACTTAATAATATTTAAATTATATACTGTTAATCTTAAATGAGTTTATTTGTTAAATAATTAAAGTGGTGGTAATAAACTTAGAATTTATGTACTGAAAAATCAATAATTAATGATTTTCATTAATACAACAGATGAAAACTATCTTATAAATGCGATTAATAAATATTGGTTATATATAATTAAACCTCAACATATCTACCTTTTTTTTTACCTTTCCTTCAATTCTATAATTATTTATTATAATTTAAATTCTATTTTCAATCAAAACCACACCATCTCCATCTATTTATCTTTCCTTCAATTCTATAATTATTTACGGTAATTTAAATTCTATATTTCAACCAAAACGAATTTGGAATCAACATGAATATTTGTGATCACTACAATAAAAATGACTTTATATAATAATGAAAAATATATAATTTATTGCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATAATTAAACAACATATATTAACCAAGTTTGTGTGAACATCTTCTTGCTATTTTGAGTTTCCTAAAATATTTTAACCTATTCTTTCCGACATAAAGAATACATCCCATGTTATGTTATGAAAACTAAAAATCAAGTATTGAGTACTAAAATATTTTATTTGCTAGGTTTGTTGGATAATGTCAGTTCCTAGCAATAGTTTCTCAAATATGTAAAAAAGAAAGTTTCTCAAATTACATACGCAACCATTATTAATTGGATTGAAATTTTTTTATACGACTACAGTTCTCGTTTTTGGCGAAAACGACTGAATGTTTCTACAAAACCTGTTGAGGTAAGTAATGGAGTTTTCATGTGGACGAAACTAAGAATAACAATATATATAATTGGATAAACTAAGGGTGAAAAGGAAGGTCCAATTTTTTGACCAATAATTTTTTTTAATATGATCTATATATTAGGCATCAAATTTTAGATAAAAAAAGTAAAGTTAAAGCTATATAATTTTATAGCCATATTTAAAAAGAAGCATATTAATTATATATTATATTTAATTTATTTAATGAAATATTATCTAGCTTCAAAATCTTATTAAAATTATATTTACAAACTTTTTAACGTATTAACCAAATTAATAAAGTTTACCATATGCTTATAATTATTCAAAAAAGTAACTTCTTCTGAGTTACTTCTGTATGTTTAAGAGTATGTTCCTATAATTCTTGATACTCATTTTTGTATATAACCAAACAAACGTTGACTGCTATATATGCAATGTACTGTCATTTGTAATATC


Gene Sequence:
>Vu_35989(-)
ATTTGTAATAAGCGTAGACTCTCTTATATTACACCAACCACTCTTTTTCCTCCATCCACAGAACCAAAATCCTTAAAGCTTGATTCTGATTTGAGGATGCTTCTCTGATATCTTTTCTCTCCAAAATCAAAATCTGTTCAACCCTTTTCCTCCTCAGATTCTCACCTCTTTTCTAAGTATCTATCCAACTTTTGTGATCAGAAACCTTGACATCCACAAATGTTTTTCTCAAAGAATGGCCATAGATTCTTCAAATTCAGAAACGAGGTTTCAAGCCCTTGTCTCATACATGGTCTTTTCATTTTCTGATAACCTTTTCATCCTCATCAAAGCCTCCTCCTCCACAAGTATCTTCAACCAAAGCTCTCATTAGCCTTTTGGCTCACAAATCACAATCTTTGGTGTGACCTTATTGCGGGACAACACCCCATCATTGCTATTCTTTAATCCATACACAGTTTCCTTTCTCTTGCAGCAAAAATATCTCTCTAGTGCCACCTCTTTCTGTTTCCACTGCAACTCCTATTTAATCTAAGTTCTTCATCCTAAGCTTGCTGGTAGTTCACACCAATGGTTCACAAGCACTTCCACGACCTTTCATGTGGCGTTGTTGAAATGGCTTGGATCATGCTCAGTGTTGACTACTCACGGCTCTTGTATCAATTGTTTGGTGTCTTTTCCTACGAGAACCACGAATGGAAGCCTCGGATCATCTAGCATACACCTTCAGTTGAGTCAAAAACATACATACATATATAATATTACTTAATTTGTTGCTAAGTTTTCGATAAAAGTAGCTGTGTAAGTGTAGAGCACACGTGCTGGTTAAATCAACAGTGTGTTGAGTGTCAAGCCACATCAAGAACCATGTACAAGGGTAGATTAGGAGGAAAAGCTCATCTTGGATATGTTGAAACTGACCCTTCTGGTCGATATGGTCGTGTAAGTTTCTCTTTCATTTTAGCTTCATCTTCCTTTTTCTGTGAATGGATCATTAACTTTCTGACTGATTGGTCTGATATTCACAATACGGTGATTAAGGTGGAGGGATATCATACATAGATTCATGAAGATGTTCTTTTTTGTTAAACTTGAATGCAGATGCTGTGCTTGACTTTGAAAATGATGAAAAATAAGTTTAGTATATGACAATTATTAGTCATTTTAATCTCACATCTTAGTGTGCACCGTTCAATCTTATCTCTGCCATAGAAAGTGAAAATTATCTGATAGCTGTCAAAGTCAGATCAAATTTAAGGATTTTTAATCATAGGATGAAACTGATCAATAATGTTAATTAATTATACAAATCAATTTATTGATAATTATCAAGTCAGAGAATAATTTTGACCTTTATAAATAACAAATTCAATTGACATTTGATATTAGCTAATTTCAAGGATTTGAAGTAATATTTTACAGAAATTAGTCTGCCCATAAAAGCTGGTTTAGTCTGCATACATCATGCTCTTTTGTAACTGGCCAATTTCGTGGAATTACGTAATGTTTAGCTTTATTTTATTGTCTTAGAAAAGGGAAGATTTTGATTTTCTGTATTAACTTTTTCAGTAGCCGTCTTATGATTAAGTCAAATTATTTATAAAGTAATTAAATAAGCACCACTTGTTCTGTTTTGTCCTTTGCCAAGTCTTGGTTTATTGTCATGACGCACCACCTTACAGAGGGTTATCTTACCTCCATAGTACACTCAAGGGTCATTTTTTCTATAGAGCCAAATTCAATGGCCAAAAAACAACTATGTTACATACATTACATCCACAGTTAAGTTTGACTAGTAATGCAAACTAGTGGCAAATGTAAACTAATACCATCTATTTTGGCAACTAATCTAGTAGCTGGTTGGTCCTAAAACGAAATTATTTACTAATTTTTTATTGTTATCTTTGTTGGTGTGTAGTTCAGGGACATTCTTGGCAAAGGAGCAGTGAAGGTTGTGTATAGGGCATTTGATGAAGTCCTTGGAATAGAGGTTGCTTGGAACCAAGTTAACCTTGGTGATGTCTTTCATTCACCAGACCTACTTCAACGTCTTTACTCAGAGGTTCATCTCCTCAAGAACTTGGAACATGACTCCATCATGACCTTCCATGATTCTTGGATTGATGTCAATTATAGAACCTTCAACTTCATCACTGAATTGTTCACCTCTGGCACCCTAAGAGAGTAATATAATCAATCACATCTTATGATATATGTTTACATCTTTTAACCCTTTAACTGAACACCAATTCCTGCATGAATTCACTGCTTGAAGACAAAACCAACCAAAAGTTCAACTTAATGTTAAAATATCTTCAACATAGACTATCTTTTTAAAGACAAGACTTATATCTCATGTTGCTTGAATACTTTGTTTTTGCTGTTTTCTTGAACAGAATTGTAATTTCATCTAAATTAAACAATACAAATTCTGTTTAAAAAATACAGACAAGACAATTCATATTGTCTCAGTAAATCAGAGTTACAGCACACGGTTGAGATTCATAAATATCGTTGCATCGTGCAAATTTGACTGCTCTGAATGCAGATCCTTCAAACACATTTTCAATTTTCAAAAGTTTATGCTTATAAACGATGCATTCATGTAAAAACACGTCTTAAGAGAAAAAATGTTATTATTAATTTTACATAGTTTCTCTTATTTTATGCAGGTACAGAAAGAAGTATCAGAGAGTAGATATCAGAGCAGTGAAGAACTGGGCACGCCAGATTCTAACTGGTTTGGAGTATTTGCATAGCCATGATCCTCCAGTGATACATAGAGACCTCAAGTGTGACAATATCTTCATCAATGGCCATCTGGGGCAGGTCAAAATTGGTGATTTGGGCCTTGCAGCCATTCTTCGTGGCTCCCAACATGCACACAGTGTCATAGGCAATTTCACTTTCTCTTTTAGTTGGTACTTAAATAATCAGTTATTAGTAATCTAGACTTTGGTCCATAAAACTGAAATTTTTGTTTCGTTGAGAATTCAGGTACACCAGAATTTATGGCACCAGAATTGTATGAAGAGGAATACAACGAGCTGGTTGACATATACTCCTTTGGGATGTGTATGATAGAAATGTTTACTTCTGAGTTCCCATACAGCGAGTGCTCCAACCCAGCTCAAATATACAAGAAAGTTACTTCAGTAAGCTTTTATTCATTGGAAAGACTTTTCCTTTTTCTACTCTGTTTGGATCAGATTCTATTTCACTTATGCTTTGGTTCAACTTTTACAAACTTCATTTTGTAAACTTAGTTTTGGCTATAAATTTAAAATGAACTAATTTATGTTTGGAAACTTTTAAGTGAAAAGTACAGTTGTAACAAAGCCTTCGCTTAAGTAAATAAGATATTTGTACCAGAACATTATCTTAAGGTTTTTGAGCTAGATTATTGAAGACATGCACAAGCAAGCTCTCATTTCACGTATTTGACTGATCTGATTCAACAGGGGAAGCTGCCAGAAGCCTTTTACAGAATCCATGACTTGGAAGCTCAGAAGTTTGTGGGAAAATGTTTGGCAAATGTCTCAGAGAGGTTGTCAGCAAAGGAGCTGTTGTTGGACACATTTTTTGCTGAGGACCAACTAGACTCTCCACTCTCTAGCCCAACATTACCCAGAAAACAAACCCCCACACTCAATTTCACTGCACCACTGGCAAAAGGGCTACCACCAATGAGCGACCAAATAAAAGACACACACATGACCATCACAGGATCAATCAATGAAGAGGATGACACAATTTTCCTTAAAGTAAAAATTTCTAACAAAAGTGGTATGCACACATACTTTCATCACATGGACAATGATTTTTTGTTACATATAGTGGGGTGCTTCAGAGTTGTATTAATGTATTTTAAATGCAGGGGAAAAGAGGAATATATTCTTTCCATTTGACACCATAAACGACACTGCAATTGATGTGGCAGTGGAGATGGTTAAAGAACTTGAAATTAGTGACTTGGAACCATTAGAGATTGCTGAAATGATTGAGGAAGAGATATCAGCTTTAGTCCCAACATGGAGGAGGGACTGGGGCACTTCTAAGTATCAAAGACAACATAGTTTTAGCTATGAAGATGAGTATGATATGAGTAACCACCACACATACTTCTCACCGTCTTCTCGCTCTTCCTCTCATGGTTCTTCCCACAAGCATAATTCCCACCTCTGTGGGAACCATTACCCTTTTGCTCATGATTGGCCTCAGGGTAATAATACTCCTTCAACTTAGAAAGTAAATAACTTTTAACTCTGATTCTTTAAAAGCTGAAATGTTGTTTAATAAACACTTTGCTTAAGAAAACCAAGTCCAATAATACCAGCCAAGCCAATAATTTTTATCAGATTTAGTACTTTTTTAATAATAATGTTTACTACGTTGATGTTTTCTTCTCGAGAAAAGTTTACTATTGTTTTCAGTGGCATTAAAGAATATGATTCGACATCACTAACTAACTGTTTTGCAGATGAACTGTTTATGAATGATGATTCGAGCTCTCAAAGCTCAATGAACTCCTTCAAGTGCTTCAATCTCAAGTACTGTGACCCTGGCAATGAAGATGGGCATGATCCAACTGCAGTACTACGAGCAGAAGCTCTTTGCTACTCTCCAAAAGGCAACGAAAAGTGCACAAGATTCTGTCCTCGAGAAGAAGTGATGGATGCTGATTGCACCAAACAGTTTTGCAACATGAAAATGGATTCTCACAGGTATCATGGAGTCCAGAGGCTAACCAGGATTCGTTCCTTTGTGGATCTAAGGAGACAACAACTGCAACGATCACTGATGGAAGAGATTCACAAGAGGAGAATCTTCAAGACGGTTGGTGCCATTGAGAACATTGGTTTTCAAAATCCAGAGGGAGCTGCGAGTTTTTTATTTTAATTTGTTCTACTTTCTGGCGTTTGTTGATTATTGCATTGCTTTATGAATCAAAGTGTCCGTGAATATTTGTATACAATACGGACTCATCAGAATATTACAGA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