Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35897 LG11 7255720 7259053 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 7256576 intron_variant
G/A,* 7256594 intron_variant
A/G 7256878 synonymous_variant p.Leu635Leu
G/T 7256947 synonymous_variant p.Gly612Gly
G/A 7257370 synonymous_variant p.His471His
C/T,* 7258537 synonymous_variant p.Lys82Lys
A/C 7258573 synonymous_variant p.Val70Val
A/G 7258639 synonymous_variant p.Phe48Phe
C/A 7258642 synonymous_variant p.Val47Val
G/A 7258649 missense_variant p.Ser45Phe
A/T 7258666 synonymous_variant p.Gly39Gly
T/C 7258832 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/C 7258849 5_prime_UTR_variant
A/G 7258880 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35897.1
MGHNSCHAKDFFTDPFQVNLSFASYGHRRRNHKGVGGGGFICLASFVFLLQALASVIQPVSGQLWDGVVVTQADFQALRAIKNELIDFKGVLKSWNDSGLGACSGWAGIKCVNGEVIAIQLPWRGLGGRISEKIGQLQSLRKLSLHDNVLAGPVPLSLGLLPNLRGVYLFNNKLSGSIPPSLGNCPMLQSLDISNNSLSGKIPPSLARSTRMLRINLSFNSLSGSIPSSLTMSPSLTILALQHNNLSGSIPDSWGGAGKKKASQLQVLTLDHNLISGIIPVSLGKLALLENVSLSHNLIVGPIPSELGALSRLQILDLSNNAINGSIPASFSNLSSLVSLNLNSNQIANHIPDSLDRLHNLSVLNLKNNKLDGEIPPTIGNISSISQIDFSENKLVGGIPDSFTKLAHLSSFNVSYNNLSGPVPSLLSKRFNASSFVGNLELCGYISSKPCSSPPPHNLPAQSPQSLSKPHHRKLSTKDIILIVAGVLLLILLLLCCFLLCCLIRRRTASSRKSGKAAKAAASARSLEKGASAGGEVEAGGEAGGKLVHFDGPFVFTADDLLCATAEIMGKSAYGTAYKATLEDGNQVAVKRLREKTTKGQKEFETEVAALGKIRHPNLLALRAYYLGPKGEKLLVFDYMTKGSLASFLHARGPEIVIEWPTRMKIMIGVTRGLSYLHSQENIVHGNLTSSNILLDEQTEAHITDFGLSRLMTTSANTNIIATAGSLGYNAPELSKTKKPNTKTDVYSLGVIMLELLTGKPPGEPTNGMDLPQWVASIVKEEWTNEVFDLELMRDAPAIGDELLNTLKLALHCVDPSPAARPEVHLVLQQLEEIKPDLAAGDDGATKVQTTE*


CDS Sequence:
>Vu_35897.1
ATGGGACACAACAGTTGTCATGCCAAAGATTTCTTCACAGACCCTTTTCAGGTTAACCTCTCTTTTGCTTCATATGGTCATAGGAGGAGGAACCACAAAGGTGTTGGGGGTGGTGGTTTTATTTGCTTAGCTTCTTTTGTGTTTCTTTTGCAAGCTTTGGCTTCTGTCATTCAGCCTGTTTCAGGGCAGTTGTGGGATGGGGTGGTTGTTACTCAGGCTGATTTTCAAGCCCTGAGGGCTATTAAGAATGAGCTAATTGACTTCAAAGGGGTTCTCAAGAGCTGGAATGACAGTGGTCTAGGTGCTTGTTCTGGGTGGGCAGGAATCAAGTGTGTGAATGGTGAGGTTATTGCAATTCAGCTTCCTTGGAGAGGGTTAGGTGGCAGGATCTCTGAGAAAATTGGCCAACTTCAGTCTCTTAGGAAGCTCAGTCTTCATGACAATGTTCTTGCTGGTCCAGTTCCTTTGTCACTTGGCCTCCTTCCCAACCTTAGAGGGGTTTATCTCTTCAATAACAAGCTTTCAGGTTCTATCCCTCCTTCCCTTGGCAATTGTCCAATGCTTCAGTCTCTTGATATTAGCAACAATTCCCTCAGTGGTAAAATCCCTCCCAGTTTAGCGAGATCTACTAGGATGCTTCGGATCAATTTGAGCTTCAACTCACTTTCTGGATCCATTCCTAGCAGTTTAACCATGTCTCCTTCTCTAACCATTCTTGCCCTTCAACACAACAACCTCTCTGGCTCTATCCCAGATTCTTGGGGTGGAGCTGGAAAGAAGAAAGCTTCCCAGCTTCAGGTTTTGACCCTTGATCACAATCTCATTTCTGGAATCATCCCAGTTTCTCTAGGCAAGCTAGCTTTACTTGAAAATGTTTCTTTGAGTCATAACCTGATTGTAGGGCCTATTCCAAGTGAACTAGGAGCACTTTCTAGGCTTCAAATTCTTGATCTTTCAAACAATGCCATCAATGGCAGCATTCCTGCTAGCTTCTCTAATCTCTCTTCTCTAGTTTCATTGAACCTAAATAGCAATCAAATTGCAAACCATATTCCCGATTCTTTGGACAGGTTGCACAACCTTTCTGTGCTTAACCTGAAGAACAATAAGCTTGATGGCGAAATCCCACCAACAATAGGGAACATCTCAAGCATTAGCCAAATTGATTTCTCTGAGAACAAATTAGTTGGAGGAATCCCAGATTCCTTTACTAAACTTGCGCATCTCAGTTCATTCAACGTCTCTTACAACAACCTATCTGGTCCTGTCCCATCTCTACTTTCCAAAAGATTCAATGCTAGCTCTTTTGTAGGGAATCTTGAGCTATGTGGGTATATCAGTTCAAAACCATGCTCTTCACCCCCTCCTCATAATCTTCCAGCTCAATCACCACAATCTCTTTCTAAGCCTCACCACCGAAAACTAAGCACCAAGGACATAATCCTCATAGTAGCAGGTGTTCTTCTGTTGATTCTGTTATTACTGTGCTGCTTTTTGTTGTGTTGTTTGATCAGGCGAAGAACTGCTTCAAGCAGAAAGAGTGGCAAAGCTGCTAAGGCTGCAGCATCTGCTAGGAGTCTTGAGAAAGGTGCTTCAGCTGGTGGTGAGGTTGAAGCAGGAGGTGAAGCTGGTGGGAAACTAGTTCACTTTGATGGGCCTTTTGTGTTTACTGCTGATGATCTTTTGTGTGCAACTGCGGAGATAATGGGAAAAAGTGCATATGGAACAGCATACAAAGCAACACTGGAAGATGGTAACCAAGTTGCTGTGAAGAGGTTGAGGGAAAAAACTACTAAAGGGCAGAAGGAGTTTGAAACTGAGGTTGCTGCACTTGGCAAAATCAGACACCCAAATCTCTTAGCACTTAGAGCCTACTATTTAGGACCAAAAGGAGAGAAGCTTCTTGTCTTTGATTACATGACAAAAGGAAGTCTAGCATCATTCCTTCATGCTCGTGGGCCTGAAATTGTTATTGAATGGCCAACAAGGATGAAGATAATGATTGGAGTGACTAGGGGCTTGAGCTACCTCCATAGCCAAGAGAACATTGTTCATGGGAACCTCACATCAAGCAATATACTATTGGATGAGCAAACAGAAGCCCACATAACAGATTTTGGTCTCTCAAGGCTGATGACAACTTCTGCCAACACCAACATCATTGCCACTGCAGGAAGCCTTGGCTACAACGCACCAGAGCTTTCAAAGACCAAGAAGCCTAACACAAAGACTGATGTGTACAGTCTTGGTGTTATCATGTTGGAACTCCTAACTGGAAAGCCACCTGGGGAGCCAACCAATGGCATGGACTTGCCCCAATGGGTTGCCTCCATAGTGAAGGAAGAGTGGACTAATGAAGTGTTTGATTTGGAACTCATGAGGGATGCACCAGCCATAGGGGATGAACTGCTGAACACATTGAAATTAGCACTGCATTGTGTTGATCCATCTCCTGCTGCTAGGCCTGAAGTACACCTAGTTCTGCAGCAACTGGAGGAGATCAAACCAGACTTGGCTGCAGGGGATGATGGAGCTACCAAGGTTCAAACAACTGAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_35897::LG11:7259053-7261053(-)
CTTCTCTCTCTAACAAAGTCTTAGATTCAAAAACCCTTGCTCCCAAATTTCAATTTCCATGTCATTCTAATTTTTGAAATTCTTTTCCACGTGTACCAATCACATTTTGACACGTGGCCCGTGTCAAAATGTTGTCATGTTGATAAAATATCATTTCTTTTTCTTTATCAACAAATCGCATTCCAAAGAAGTTTTAAAGTACCGTTGACTAATTAATGATAATGAATAATTGAAACGTGAAAACCCAATCAACTTCGACTCCTAAAATGGATACTAATTCGTCTCCTCCTCACATAACATCATTGTTTATAATTTAAAAAAATATTTACTTTTTTTCCAACTTATATTAAAAATAACTCAAAGATGAAAGTAAGAAAAGAGGTTTTCCTTTCTTTTTTTTCAATTTTTTAAAACCAGTTTGTCGAAATATAGAAAAATTGTTTAGAAGTAATTATTTTATCAAGAAAATAATTTTTTTCGGATTTTTTTTAAACAAACATAACTATTAGAAGAATTAAAAGTAAAATCTATATATGGGTATCCGATGATTAAGCATGGCCAAAGGTGTTACTAGTCATATTTGCATTTTGACTTGAATTGGAGCAGCGAGTTAATAATTAGAAGAGAAAATTGTTCCTATGACCTTTTTCTTGCATAAGGAAATGGGAAAATTTTCTACCTGAATACCAAAATAGATCACTCTTTTCCTCTAATACTACAAGTTAGTTGACATTTTTTTTAAAGTGAAACTTATTTCCATTTTTACAAGGAAAATAATAGTTAAATATAATAATTGAGATTGACAAATTTTCTCTAATTAAATATTTTAAAATTACTTTTCATCAAATAAATTCAAGCAGATAATGTTCTCAGTTTAGACATGCAATTAATTACTGAAGTAATTTAATTTTAACTGTTACTGCAGTGTCTTTAAGAAATTATTTAACGCGTAGCTTAAAAAATTAATAGATATTTTTTTAACAATGAATATAAATGTAATGTAATGTTGAAGCTATAAACACTATCACTATCTAGCTTTTGCATCTCAAAATTTTGTTTGTTAGTTGAAAAAGTCGAACACAATGCCTTAATCCTCAATTAATCCTCTTAATTCTTGAATTTCTTCTAGTTTACTTCTTCCCCGTGCTGTTTCCAAAACATAATAAAATCAATTCGTTGCAACAAAATAATGAATGTGACACTGACACCCCAATATACTTTTGCCCCAACTAACACAATTTACAACTCTTGTTTGTTTTGTGCTCCACCTTTTCAAGCTAATAATGTGTTCTATACCACAGATCTGTGAATTATGAAAGCATAAGGTGCACAATCTGTCACTTTGATGTCCCTACTCGCAGTACATTACACACCATTGCCAGAAAGATGCCCTAGATAAACACCTTCTTTATGACCCAAAATAATCACAAAGTAAAAGAAGAAAAACATAGTTTCATCTGTTCTCACTTTTGCCCTCAACAAGCTGCATCTTTAGATGGATACTTAAGTTTAGTTCACTTAATTATGTTGTCATAAATGATTTTTAAAATATCTAAAATTTATCATTTTAAACATTTTTTTTAGTTTTTTATTTTATTTTTTGTTAACTGCAGCTTGTGGGTTGTGGGGTTTACAACACTCACTCATGGAAGGGTAGTTTAGGTAATTAAAGTTTTTGTCTTTTGTGACATATTTTCTGAGAATATAATAATGTTGATGATGAGGAGTCACACTGAGGAGTAGAACGAGGAAAAGAATGGGACCCTTAGAAAATGTAATGCATCCAAAACCAAATCCAATGCAATGTAGCCGTTGGAGAAGGAAACCCCATATCACATCTCATCTCTGCTTGGTCTTCTAATGTCCCAACCCAACCCGTTATGCAGCAGCAGTTATGATAATTTAGACAATGAAGTAAAACTAGCCGTTAGGATTAAGAAAATTGCAACCTTTGACTCATTCTACTCATGACCACCACCTCATTTCATTTATCTCTCTTC


Gene Sequence:
>Vu_35897(-)
ATCCTTAAACCCCACCAGCACCTTTCTTCACTCACATGCCTTTTTCAGAACTGTAGTCCCTCTCTTTTTACTCTCCGCTTTCTTGTGTTAGTATTTAGATCTTCCTCGTTGTTCTTCATTGTACTAGTATTATACCACTACTACTGTTATCTGAGCTGAGTCTGTCTGAGAGGTGTGAGCCTAAAGAGAGAGTGAAAGTGGAACCTGTTTGTGTCTGTCTTACTTTCTTTGCTTAGCCATTGTTTGTTCTAAGTTCCCACTTACCACTTTCATGGGACACAACAGTTGTCATGCCAAAGATTTCTTCACAGACCCTTTTCAGGTTAACCTCTCTTTTGCTTCATATGGTCATAGGAGGAGGAACCACAAAGGTGTTGGGGGTGGTGGTTTTATTTGCTTAGCTTCTTTTGTGTTTCTTTTGCAAGCTTTGGCTTCTGTCATTCAGCCTGTTTCAGGGCAGTTGTGGGATGGGGTGGTTGTTACTCAGGCTGATTTTCAAGCCCTGAGGGCTATTAAGAATGAGCTAATTGACTTCAAAGGGGTTCTCAAGAGCTGGAATGACAGTGGTCTAGGTGCTTGTTCTGGGTGGGCAGGAATCAAGTGTGTGAATGGTGAGGTTATTGCAATTCAGCTTCCTTGGAGAGGGTTAGGTGGCAGGATCTCTGAGAAAATTGGCCAACTTCAGTCTCTTAGGAAGCTCAGTCTTCATGACAATGTTCTTGCTGGTCCAGTTCCTTTGTCACTTGGCCTCCTTCCCAACCTTAGAGGGGTTTATCTCTTCAATAACAAGCTTTCAGGTTCTATCCCTCCTTCCCTTGGCAATTGTCCAATGCTTCAGTCTCTTGATATTAGCAACAATTCCCTCAGTGGTAAAATCCCTCCCAGTTTAGCGAGATCTACTAGGATGCTTCGGATCAATTTGAGCTTCAACTCACTTTCTGGATCCATTCCTAGCAGTTTAACCATGTCTCCTTCTCTAACCATTCTTGCCCTTCAACACAACAACCTCTCTGGCTCTATCCCAGATTCTTGGGGTGGAGCTGGAAAGAAGAAAGCTTCCCAGCTTCAGGTTTTGACCCTTGATCACAATCTCATTTCTGGAATCATCCCAGTTTCTCTAGGCAAGCTAGCTTTACTTGAAAATGTTTCTTTGAGTCATAACCTGATTGTAGGGCCTATTCCAAGTGAACTAGGAGCACTTTCTAGGCTTCAAATTCTTGATCTTTCAAACAATGCCATCAATGGCAGCATTCCTGCTAGCTTCTCTAATCTCTCTTCTCTAGTTTCATTGAACCTAAATAGCAATCAAATTGCAAACCATATTCCCGATTCTTTGGACAGGTTGCACAACCTTTCTGTGCTTAACCTGAAGAACAATAAGCTTGATGGCGAAATCCCACCAACAATAGGGAACATCTCAAGCATTAGCCAAATTGATTTCTCTGAGAACAAATTAGTTGGAGGAATCCCAGATTCCTTTACTAAACTTGCGCATCTCAGTTCATTCAACGTCTCTTACAACAACCTATCTGGTCCTGTCCCATCTCTACTTTCCAAAAGATTCAATGCTAGCTCTTTTGTAGGGAATCTTGAGCTATGTGGGTATATCAGTTCAAAACCATGCTCTTCACCCCCTCCTCATAATCTTCCAGCTCAATCACCACAATCTCTTTCTAAGCCTCACCACCGAAAACTAAGCACCAAGGACATAATCCTCATAGTAGCAGGTGTTCTTCTGTTGATTCTGTTATTACTGTGCTGCTTTTTGTTGTGTTGTTTGATCAGGCGAAGAACTGCTTCAAGCAGAAAGAGTGGCAAAGCTGCTAAGGCTGCAGCATCTGCTAGGAGTCTTGAGAAAGGTGCTTCAGCTGGTGGTGAGGTTGAAGCAGGAGGTGAAGCTGGTGGGAAACTAGTTCACTTTGATGGGCCTTTTGTGTTTACTGCTGATGATCTTTTGTGTGCAACTGCGGAGATAATGGGAAAAAGTGCATATGGAACAGCATACAAAGCAACACTGGAAGATGGTAACCAAGTTGCTGTGAAGAGGTTGAGGGAAAAAACTACTAAAGGGCAGAAGGAGTTTGAAACTGAGGTTGCTGCACTTGGCAAAATCAGACACCCAAATCTCTTAGCACTTAGAGCCTACTATTTAGGACCAAAAGGAGAGAAGCTTCTTGTCTTTGATTACATGACAAAAGGAAGTCTAGCATCATTCCTTCATGGTAAGTGTATCTTTAAACTGACTCTGCCTTTGCTTCTGATACTGGTATTTGACATATCTAAACTTTACAACTGTAATTAGAATTTCGTTTCAGTAGAGTTTTTAAATCCTGTAATGTTGTGTCATTTCTTCTGATGCTGATATGATATATTTAAGATATGCATGAATTCTTCATGGTGAGTACTTGACAGTAATTAGAGAATATGTTGTGGCATTGCTTCTGAAATTAATAAATGAACTATTCCGGCATTGTAAGTACTAAAGAGTGATTATATAGTGTTGTGTCATTGCTTCTGATACTGATTGTGTTATGATTTATCTGATTCTAACAAATGCAGCTCGTGGGCCTGAAATTGTTATTGAATGGCCAACAAGGATGAAGATAATGATTGGAGTGACTAGGGGCTTGAGCTACCTCCATAGCCAAGAGAACATTGTTCATGGGAACCTCACATCAAGCAATATACTATTGGATGAGCAAACAGAAGCCCACATAACAGATTTTGGTCTCTCAAGGCTGATGACAACTTCTGCCAACACCAACATCATTGCCACTGCAGGAAGCCTTGGCTACAACGCACCAGAGCTTTCAAAGACCAAGAAGCCTAACACAAAGACTGATGTGTACAGTCTTGGTGTTATCATGTTGGAACTCCTAACTGGAAAGCCACCTGGGGAGCCAACCAATGGCATGGACTTGCCCCAATGGGTTGCCTCCATAGTGAAGGAAGAGTGGACTAATGAAGTGTTTGATTTGGAACTCATGAGGGATGCACCAGCCATAGGGGATGAACTGCTGAACACATTGAAATTAGCACTGCATTGTGTTGATCCATCTCCTGCTGCTAGGCCTGAAGTACACCTAGTTCTGCAGCAACTGGAGGAGATCAAACCAGACTTGGCTGCAGGGGATGATGGAGCTACCAAGGTTCAAACAACTGAGTAAAGGATTACACGTTTTATTCTTTATTTATTTGTTCATTGAGTTTATGTGTATATAGAGTGAGAATTGTTTTACACTAAGTATTCTTTTTAACTTGGAGCAATAATGTATGTTTTGAATATCTATATGACAATTATTTCATTAAATGAAACGATTATGATTTTGATTTT