Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35818 LG11 5794143 5797472 PREDICTED: receptor-like protein 12
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 5794188 missense_variant p.Leu16Val
C/T 5794262 synonymous_variant p.His40His
A/G 5794278 missense_variant p.Ile46Val
T/C 5794294 missense_variant p.Val51Ala
A/T 5794301 missense_variant p.Lys53Asn
A/G 5794328 synonymous_variant p.Glu62Glu
T/A 5794334 stop_gained p.Cys64*
C/A 5794393 missense_variant p.Ala84Glu
C/G 5794638 missense_variant p.Leu166Val
T/A 5795123 missense_variant p.Asn327Lys
T/A 5795190 missense_variant p.Ser350Thr
A/T 5795220 missense_variant p.Met360Leu
A/G 5795307 missense_variant p.Thr389Ala
G/A 5795337 missense_variant p.Val399Ile
A/G 5795352 missense_variant p.Ile404Val
T/C 5795456 synonymous_variant p.Asn438Asn
G/A 5795478 missense_variant p.Val446Met
G/T 5795480 synonymous_variant p.Val446Val
C/A 5795483 synonymous_variant p.Ala447Ala
C/A 5795487 missense_variant p.Pro449Thr
C/G 5795488 missense_variant p.Pro449Arg
G/A 5795492 synonymous_variant p.Leu450Leu
T/C 5795502 missense_variant p.Phe454Leu
T/C 5795525 synonymous_variant p.Phe461Phe
C/A 5795539 missense_variant p.Pro466His
T/C 5795542 missense_variant p.Val467Ala
G/C 5795543 synonymous_variant p.Val467Val
A/C 5795553 missense_variant p.Asn471His
C/T 5795573 synonymous_variant p.Leu477Leu
T/A 5795611 missense_variant p.Leu490Gln
T/A 5795663 synonymous_variant p.Gly507Gly
A/G 5795665 missense_variant p.Asn508Ser
C/G 5795708 synonymous_variant p.Leu522Leu
C/A 5795757 synonymous_variant p.Arg539Arg
A/T 5795792 synonymous_variant p.Thr550Thr
A/C 5796341 intron_variant
A/G 5796348 intron_variant
T/A 5796354 intron_variant
C/A 5796806 missense_variant p.His832Asn
G/T 5796911 stop_gained p.Gly867*
T/C 5797004 intron_variant
A/T 5797101 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35818.1
MRRHTLLLLFLIPFYLINCGVNIFPANGYFLGHQCSVLLHLKTSLIFNPAVSKKLTLWNQSEDCCEWHGVTCNEGRVIALDLSAESISGGFVNSSILFNLQYLQSLNLAFNNLSSVIPSELYKLSDLRYLNLSNAGFEGQIPHEISQLRRLVTLDFSSSFTSSHRLKLEKPNLEMLLLPNLTNITELYLDGVSISVKGHEWSHALSSLHKLRVLSMSSCNLSGPIDSSLSKLQSLTVLNFSHNNMSSTVPESFAKLSKLVRLQLRNCVLNGSFPKDIFQIPTLAILDISDNEGLRGSLPNFRSRGSLYDMNLSNTNFSGLLPCEISNLKQLSRIDLSNCQFNGTLPSSISELTQLVYLDMSYNNFTGSLPSFNMSKNLTYLSLYHNHLTGVLSPNHFEVHKNLISIDLGFNFFSGKLPSSLLKLPCLRELKVPFNQFNGSLDEFVVASPLLEMFDLGNNNFHGTIPVSIFNTTTLRLIQLNGNKLNGTILLDMIRKLSNLTSLGLSGNNLSVDINYRDVHDLSNYPNLRILMLSSCKLRGIPSFLRNQSTLLRLDLADNEIEGSIPHWIWENEYLAHFNLSKNFLTSFEGSFWNLSSNLLLLDLSFNQLQGSIPFIPTLVNCLDYSNNRFNSVIPLDIGNRLPFINLLSFSNNSFQGQIPESFCNASSLHLLDLSHNNFVGTIPECFATMSSLRVLNFGANKLRGYIPNSVPTSWLNKLHGSIGCPRSSADWKMLHIVDLASNNFSGEIPGALLNSWKAMMRDDNGVSEFGHLFIDLYDHYDPKNFQDLLSSVDKSLLARIAKLFTNASRSILDQSSTESYNAVDISRLQNSITITNKGKQMELVRIQKIFTYLDMSSNNFEGPIPKELMQFKALNALNFNDEGTSPETPNAHSHSESSIDWNILSAELGCIFGFGIFILPLIFSRRWKLWYSEHVDEMLHKIIPPLEFMYEHSGGNRYKTLRWKN*


CDS Sequence:
>Vu_35818.1
ATGAGGAGACACACTCTCTTGTTGCTTTTCTTGATACCATTTTACTTAATAAACTGTGGTGTCAACATTTTTCCAGCAAATGGTTATTTTCTTGGCCATCAGTGTTCTGTGTTGCTCCACTTAAAAACTAGCCTTATATTTAACCCTGCAGTATCCAAAAAGCTTACTCTTTGGAACCAAAGTGAAGATTGTTGTGAGTGGCATGGAGTGACATGCAACGAGGGTCGTGTTATAGCCCTTGATCTCAGTGCAGAGTCTATCTCAGGAGGATTTGTTAATTCAAGCATTCTTTTCAACCTTCAATATCTACAAAGCTTGAATTTGGCTTTTAATAACTTAAGTTCAGTGATTCCTTCAGAACTGTACAAGTTAAGTGATTTGAGGTATTTGAACTTGTCTAATGCTGGATTTGAGGGGCAGATTCCACATGAGATTTCTCAACTCAGAAGGTTAGTTACTCTTGATTTTTCTTCCTCATTTACCTCAAGCCACAGGCTAAAACTTGAGAAGCCAAATCTAGAAATGCTTTTACTACCAAACCTTACAAATATCACAGAATTGTATCTTGATGGTGTATCAATATCTGTCAAAGGTCATGAATGGTCCCATGCTTTATCTTCATTGCACAAGCTACGTGTTTTGAGCATGTCATCATGCAATCTCTCTGGACCTATTGATTCATCACTTTCTAAGCTTCAGTCACTCACTGTTCTAAACTTTAGCCACAATAATATGTCAAGCACAGTGCCGGAATCCTTTGCAAAATTGTCTAAGTTAGTCAGATTGCAGCTCAGAAATTGTGTTTTGAATGGCTCATTTCCAAAAGATATCTTCCAAATTCCAACTTTGGCAATCCTTGACATATCAGACAATGAAGGTCTTAGGGGTTCTTTACCAAACTTCCGATCACGTGGTTCTCTTTATGACATGAATCTTAGCAATACAAATTTCTCAGGATTGCTTCCATGTGAGATTTCTAATCTGAAGCAGTTGTCTAGAATTGATTTATCTAACTGCCAATTTAATGGAACACTTCCAAGTTCAATCTCTGAACTCACCCAACTTGTTTATCTAGACATGTCTTACAATAACTTCACAGGTTCACTCCCTTCTTTTAATATGTCCAAGAATCTCACATATTTATCCCTCTATCATAATCATTTGACTGGTGTGTTATCACCCAATCATTTTGAGGTTCATAAAAATCTTATCAGCATTGATTTAGGATTTAACTTTTTCAGTGGGAAACTCCCCTCATCTCTTCTTAAACTCCCGTGTCTGAGAGAACTTAAAGTACCTTTTAATCAATTCAATGGTTCCTTGGATGAGTTTGTTGTGGCCTCCCCTTTGTTAGAGATGTTTGATTTAGGTAACAACAACTTTCATGGTACAATTCCTGTGTCTATTTTTAACACTACAACACTTCGCCTCATCCAACTGAATGGAAATAAGCTCAATGGCACAATACTATTGGACATGATTCGAAAGCTTAGTAACTTAACTTCATTAGGTCTCTCAGGTAACAATTTGTCAGTTGATATAAACTATAGGGATGTTCATGACCTCTCAAACTATCCTAATCTCAGAATTCTGATGTTGTCATCTTGCAAGTTGCGAGGAATCCCCAGTTTCTTAAGAAATCAATCCACACTACTACGTCTTGATCTAGCTGACAACGAGATCGAGGGCTCAATACCACACTGGATCTGGGAAAATGAATATCTTGCTCACTTTAATCTTTCCAAAAATTTTCTGACAAGTTTTGAAGGAAGCTTCTGGAACCTTAGTTCAAACCTTTTGCTCTTGGATCTTAGTTTCAATCAACTACAAGGGTCTATTCCTTTCATTCCAACGTTAGTAAATTGCTTGGACTACTCGAACAATAGATTCAACTCTGTTATTCCACTGGACATTGGAAATCGTCTTCCTTTCATAAATTTGTTGTCTTTTTCAAACAACAGCTTTCAGGGACAAATCCCTGAATCCTTTTGCAATGCTTCAAGTCTTCACCTGCTAGATCTTTCCCACAATAACTTTGTTGGGACGATTCCCGAGTGTTTTGCTACGATGAGTAGTCTAAGGGTGTTGAATTTTGGTGCAAACAAACTCCGTGGCTATATTCCTAATTCAGTGCCAACTTCATGGTTAAACAAACTTCATGGCTCAATTGGATGCCCAAGAAGCAGTGCTGATTGGAAAATGCTCCATATTGTTGATCTAGCCTCCAATAATTTCAGTGGTGAAATACCAGGAGCACTGCTAAACAGTTGGAAAGCAATGATGCGAGATGATAATGGTGTGTCCGAATTTGGCCACTTATTTATTGATCTCTATGATCACTACGACCCCAAGAATTTTCAGGATTTATTGTCAAGTGTGGACAAATCTCTATTAGCAAGAATAGCTAAACTTTTTACAAACGCCTCTCGCTCTATCCTTGACCAGTCATCCACCGAATCTTATAATGCAGTGGATATTTCTCGACTTCAGAATTCCATTACCATTACCAACAAAGGTAAGCAAATGGAGTTGGTCAGAATCCAAAAGATATTCACGTACTTGGATATGTCGAGCAACAATTTTGAGGGTCCAATACCAAAGGAGCTAATGCAGTTCAAGGCCTTGAATGCTCTAAATTTCAATGATGAAGGGACATCACCTGAAACACCAAATGCTCATTCCCACAGTGAGAGTTCAATTGATTGGAATATTTTAAGTGCCGAGTTGGGATGTATTTTTGGCTTTGGAATTTTCATCCTCCCTCTTATTTTCTCGAGGAGATGGAAGTTATGGTATTCCGAACATGTAGATGAGATGCTCCACAAGATCATTCCCCCACTTGAATTTATGTATGAACACAGTGGAGGGAATAGATACAAAACTCTAAGGTGGAAGAACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_35818::LG11:5792143-5794143(+)
TCTCCAGAAACTTCCAGAATTTCCCCTCTTCAACTAGAATTTCCTCCAACTCTCTCCTCTCACAATTTCCCTAGAATTCTGGTGCAAATCTTCATCCTCCCCCCCTTGGCTATTTATAGCCAAAAATTTTTACTATTCATTTTTACTATTCATTTTTACTATTCACTTTTACTATTCATTTTTACTATTCAAAAATTATTTTTTTATTCACCATTCTTATCTCTGAATAAATGATTCTACGTGGAGTGTCCTCTTCCACAATTTATTTTAATATTTTTTTTTAACTATTCACTATTCACTATTCACTATTTACTATTTACTATTTACTATTCATTCATTTTTTTTTTTAACTTTTAAAATAAATTCTCAAATTTTTAAACTCCTTCCTTTGAAATTATTATTATTGTTACCTATCATAAATTTTAATTTTTTTTTTACCATACTTTTATTAACTTTATAAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAAAATAACTATTTATTAAATTTAAATATTTTTTTTTTCATGGGTCTTACACTTAACGCTTGGTATCTTTAGAAGAAAAACTTAATTTTCAAATGTTATCTTAAGGGTAGAAAATAAAAAATCACTTTGTTGTTCTGAGCAAGTATTAAGTGAGATTAAATGCTCACTAATAAGTGAGTCGAATTAGATTGACCCACTAAGTGACCAATCCATGGTGTATCGGACCGGATTACCCGTTTTCACAACACTAACTATAATATTACATTAATTATTATAAAAGACATGGACAATACATTTCACGTATAGCTCCTGGGAGGACAATTTTTATTTGTATATATAAATTTAAATGTGATTCTCTCGACTTCATAAACAGTGCTTTCCACGTTGTCTTCCAAATCTGTTTGCTACTTCCACTTTCTACAAAAATTCTATGTTCCTTCGCAATTGTGGAAAAGACACAACTGATCAAGTCCAACTATTTGACTAACAAAATTGAAAGATGCTTTTGATTTTTCAACGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGACGATGACCTCAAATTTCTAAACAAAACCAAACACCTATTATAAGTGATAGAAGTAACTTTGCACAAAATATATCTTACATTTAAGCAAAGTAAACTGTACAAGCTTCTCAATTCTCTATCACGTATATTTGCCATCTCTTCACATTGTAAGATACAAAATAAATATTGTCTGTTTATTGCAATAAATATAAATGGAAGGTAAAAAATATTTTATTTCAGCTCTGACTGCCGATGCTTCTATTTAAACTTATTTAAATTTTTAATCTTAATTATATTCTGTCAAACAAATATTTAGTAATATTTTATTCCACCATTTTAAAACTTTAATAAAATTCTAAAATATATACACAACTTCGATATGAAAAATATCTGTTTTAAATTTCTTCTTCTGGAATGTGCGAAAAAGACTTCCCATTTCGACCAGCATGATGACTTTAAGGAAGGAATAATTCAAAATGGCACCCAATTATCTCATATCAACAGTATGTTTGAAGAATTCAACACTTCCTACCTTCAATTCACCTACCCCTAGATAACTAGCCACTAAAACAAATTCACATACCAATATCCTTTAAAAAATTAATTATTAATAAAATTTGAAAACTTCAATTTAAAATTTATTGCAACCTTTTATTAAATTTTTTTATGTTATAATCAACGTAGATATTTGAAGGAAAGAAAATGAAACTTTGTTGAATAGAGATTAATTTAAAATAATTTTTTTAACATATTAATATAACTATTAATGTGAACTACATGAAAATGGAAACCTACTGACAATACTTTGATAGTAATGGTTCTTGTGCTTTCCAACTTATGTTAGACTGGTAGACTAACATGACCAATAATGATAGTCTATAAAAGGATAATGATATGTTTTGAAATGATAATATGTCTTTACCATGGTACCATAATTTTTTGTAACACAGAACACCTTCTCAAAGCTTATAA


Gene Sequence:
>Vu_35818(+)
ATGAGGAGACACACTCTCTTGTTGCTTTTCTTGATACCATTTTACTTAATAAACTGTGGTGTCAACATTTTTCCAGCAAATGGTTATTTTCTTGGCCATCAGTGTTCTGTGTTGCTCCACTTAAAAACTAGCCTTATATTTAACCCTGCAGTATCCAAAAAGCTTACTCTTTGGAACCAAAGTGAAGATTGTTGTGAGTGGCATGGAGTGACATGCAACGAGGGTCGTGTTATAGCCCTTGATCTCAGTGCAGAGTCTATCTCAGGAGGATTTGTTAATTCAAGCATTCTTTTCAACCTTCAATATCTACAAAGCTTGAATTTGGCTTTTAATAACTTAAGTTCAGTGATTCCTTCAGAACTGTACAAGTTAAGTGATTTGAGGTATTTGAACTTGTCTAATGCTGGATTTGAGGGGCAGATTCCACATGAGATTTCTCAACTCAGAAGGTTAGTTACTCTTGATTTTTCTTCCTCATTTACCTCAAGCCACAGGCTAAAACTTGAGAAGCCAAATCTAGAAATGCTTTTACTACCAAACCTTACAAATATCACAGAATTGTATCTTGATGGTGTATCAATATCTGTCAAAGGTCATGAATGGTCCCATGCTTTATCTTCATTGCACAAGCTACGTGTTTTGAGCATGTCATCATGCAATCTCTCTGGACCTATTGATTCATCACTTTCTAAGCTTCAGTCACTCACTGTTCTAAACTTTAGCCACAATAATATGTCAAGCACAGTGCCGGAATCCTTTGCAAAATTGTCTAAGTTAGTCAGATTGCAGCTCAGAAATTGTGTTTTGAATGGCTCATTTCCAAAAGATATCTTCCAAATTCCAACTTTGGCAATCCTTGACATATCAGACAATGAAGGTCTTAGGGGTTCTTTACCAAACTTCCGATCACGTGGTTCTCTTTATGACATGAATCTTAGCAATACAAATTTCTCAGGATTGCTTCCATGTGAGATTTCTAATCTGAAGCAGTTGTCTAGAATTGATTTATCTAACTGCCAATTTAATGGAACACTTCCAAGTTCAATCTCTGAACTCACCCAACTTGTTTATCTAGACATGTCTTACAATAACTTCACAGGTTCACTCCCTTCTTTTAATATGTCCAAGAATCTCACATATTTATCCCTCTATCATAATCATTTGACTGGTGTGTTATCACCCAATCATTTTGAGGTTCATAAAAATCTTATCAGCATTGATTTAGGATTTAACTTTTTCAGTGGGAAACTCCCCTCATCTCTTCTTAAACTCCCGTGTCTGAGAGAACTTAAAGTACCTTTTAATCAATTCAATGGTTCCTTGGATGAGTTTGTTGTGGCCTCCCCTTTGTTAGAGATGTTTGATTTAGGTAACAACAACTTTCATGGTACAATTCCTGTGTCTATTTTTAACACTACAACACTTCGCCTCATCCAACTGAATGGAAATAAGCTCAATGGCACAATACTATTGGACATGATTCGAAAGCTTAGTAACTTAACTTCATTAGGTCTCTCAGGTAACAATTTGTCAGTTGATATAAACTATAGGGATGTTCATGACCTCTCAAACTATCCTAATCTCAGAATTCTGATGTTGTCATCTTGCAAGTTGCGAGGAATCCCCAGTTTCTTAAGAAATCAATCCACACTACTACGTCTTGATCTAGCTGACAACGAGATCGAGGGCTCAATACCACACTGGATCTGGGAAAATGAATATCTTGCTCACTTTAATCTTTCCAAAAATTTTCTGACAAGTTTTGAAGGAAGCTTCTGGAACCTTAGTTCAAACCTTTTGCTCTTGGATCTTAGTTTCAATCAACTACAAGGGTCTATTCCTTTCATTCCAACGTTAGTAAATTGCTTGGACTACTCGAACAATAGATTCAACTCTGTTATTCCACTGGACATTGGAAATCGTCTTCCTTTCATAAATTTGTTGTCTTTTTCAAACAACAGCTTTCAGGGACAAATCCCTGAATCCTTTTGCAATGCTTCAAGTCTTCACCTGCTAGATCTTTCCCACAATAACTTTGTTGGGACGATTCCCGAGTGTTTTGCTACGATGAGTAGTCTAAGGGTGTTGAATTTTGGTGCAAACAAACTCCGTGGCTATATTCCTAATTCAGTGCCAACTTCATGTAATCTAAAGTTGTTGGATCTAAATGACAACCTTTTGGAGGGTATCATCCCAAAATCTTTAACTAATTGCCAAAATCTGCAAGTCCTAAACCTTCAAAAAAACTCATTAACTGACAGATTTCCATGCTTCTTAAGTAATATTTCCACCTTGAGAATTATGGATTTAGGGTTAAACAAACTTCATGGCTCAATTGGATGCCCAAGAAGCAGTGCTGATTGGAAAATGCTCCATATTGTTGATCTAGCCTCCAATAATTTCAGTGGTGAAATACCAGGAGCACTGCTAAACAGTTGGAAAGCAATGATGCGAGATGATAATGGTGTGTCCGAATTTGGCCACTTATTTATTGATCTCTATGATCACTACGACCCCAAGAATTTTCAGGATTTATTGTCAAGTGTGGACAAATCTCTATTAGCAAGAATAGCTAAACTTTTTACAAACGCCTCTCGCTCTATCCTTGACCAGTCATCCACCGAATCTTATAATGCAGTGGATATTTCTCGACTTCAGAATTCCATTACCATTACCAACAAAGGTAAGCAAATGGAGTTGGTCAGAATCCAAAAGATATTCACGTACTTGGATATGTCGAGCAACAATTTTGAGGGTCCAATACCAAAGGAGCTAATGCAGTTCAAGGCCTTGAATGCTCTAAATTTGTCAAATAATGCCCTCTCCGGTCACATCCCATCATCTATTGGAAATTTGAAGAATCTTGAGTCTTTAGATTTGTCAGAAAATTCTTTTGATGGGCTAATTCCTACAGAGCTTGCAAGTCTATCTTTCCTTGCATATTTGAATCTCTCATTTAATCAACTAGAGGGAGAAATTCCAAAGGGTACACAAATTCAATCCTTCGATGCAGATTCCTTTGAAGGGAATGAAGAGTTATGTGGAGTTCCTCTGATCCATAGTTGCAGCAATGATGAAGGGACATCACCTGAAACACCAAATGCTCATTCCCACAGTGAGAGTTCAATTGATTGGAATATTTTAAGTGCCGAGTTGGGATGTATTTTTGGCTTTGGAATTTTCATCCTCCCTCTTATTTTCTCGAGGAGATGGAAGTTATGGTATTCCGAACATGTAGATGAGATGCTCCACAAGATCATTCCCCCACTTGAATTTATGTATGAACACAGTGGAGGGAATAGATACAAAACTCTAAGGTGGAAGAACTGA