Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35780 LG11 4649365 4654712 PREDICTED: BEL1-like homeodomain protein 9
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 4649686 synonymous_variant p.Val598Val
C/T 4650392 synonymous_variant p.Leu428Leu
T/C 4650498 intron_variant
C/T 4650529 intron_variant
T/A 4650573 intron_variant
C/A 4650924 missense_variant p.Arg359Met
C/G 4651034 synonymous_variant p.Pro322Pro
A/T 4651416 intron_variant
A/T 4651555 intron_variant
C/A 4651809 intron_variant
C/A 4651811 intron_variant
A/G 4651812 intron_variant
G/C,* 4651819 intron_variant
G/C,* 4651824 intron_variant
G/C,* 4651825 intron_variant
G/A,* 4651829 intron_variant
T/C,* 4651834 intron_variant
C/T,* 4651839 intron_variant
G/A,* 4651842 intron_variant
C/A,* 4651846 intron_variant
T/G,* 4651858 intron_variant
A/G 4651868 intron_variant
A/G 4651870 intron_variant
C/A 4651874 intron_variant
C/G 4651880 intron_variant
C/G 4651882 intron_variant
G/A 4651883 intron_variant
G/A 4651889 intron_variant
T/A 4651896 intron_variant
G/A 4651900 intron_variant
A/G 4651909 intron_variant
A/T 4651918 intron_variant
T/C 4651933 intron_variant
G/A 4651945 intron_variant
G/A 4651951 intron_variant
A/G 4651953 intron_variant
A/G 4651961 intron_variant
A/G,* 4651979 intron_variant
T/C 4651996 intron_variant
A/T 4652010 intron_variant
A/T 4652094 intron_variant
C/A 4652106 intron_variant
A/T 4652129 intron_variant
C/A 4652131 intron_variant
A/T 4652135 intron_variant
T/A 4652172 intron_variant
A/T 4652192 intron_variant
T/C 4652210 intron_variant
T/C 4652218 intron_variant
A/G 4652243 intron_variant
C/A 4652320 intron_variant
T/C 4652326 intron_variant
T/A 4652423 intron_variant
T/C 4652448 intron_variant
T/G 4652455 intron_variant
A/G 4652500 intron_variant
C/T 4652598 intron_variant
A/T 4652600 intron_variant
G/C 4652605 intron_variant
A/T 4652611 intron_variant
T/A 4652684 intron_variant
C/G 4652689 intron_variant
T/A 4652797 intron_variant
G/A 4652922 intron_variant
A/G 4653156 intron_variant
A/G 4653352 intron_variant
C/A 4653437 intron_variant
A/G 4653481 synonymous_variant p.Thr288Thr
C/T 4653529 synonymous_variant p.Leu272Leu
C/T 4653537 missense_variant p.Asp270Asn
C/T 4653634 synonymous_variant p.Glu237Glu
C/T 4653707 missense_variant p.Gly213Glu
A/T 4653710 missense_variant p.Met212Lys
G/A 4653754 synonymous_variant p.Tyr197Tyr
C/A 4653767 missense_variant p.Gly193Val
T/C 4653789 missense_variant p.Ser186Gly
A/T 4653860 stop_gained p.Leu162*
T/A 4653909 missense_variant p.Asn146Tyr
T/G 4653912 missense_variant p.Asn145His
T/C,* 4653960 missense_variant p.Met129Val
G/T 4653993 missense_variant p.Gln118Lys
A/G 4654015 synonymous_variant p.Pro110Pro
A/T 4654153 stop_gained p.Cys64*
A/G 4654347 5_prime_UTR_variant
T/A 4654380 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35780.1
MAEGFEAYHVPQQSRRDKLRVVVTQNQHGLVEPSTLLPLYDPSSFISSDLLTSFHNSHKHNLGCGVKEERANLMMGFAGRGGEGGGVMNNGSSSSLCCSSNSSSVSYLDPESSLPLNQATIQVINNNNMFLYQAQNLGEFDQGYNNNNGSEIMVFKPEPLSLSLSSHSNGVNLQRYGSVVCGDKVSGVGGGGGCVVYGGSGLNEASRCTVPMGPFTGYASILKGSRFLKPAQQLLEELCDVGGVCAEKMVADASLMEPVPLPPPENSSEDLLGDHGGDHGRKKSRLLTMLDEVYRRYRQYYQQMHAVVTSFEYVSGLRNAAPYASLAIKAMSKHFRCLKNAITDQLQFANKAHFHISNRKDESSRFGNSDRGPYSQRPGFLEHQPVWRPQRGLPERAVSVLRAWLFEHFLHPYPTDTDKLMLAKQTGLSRSQVSNWFINARVRLWKPMVEEIHMLETRQAQNLKNSQKEEHCRNKSSDQLPSDNSIVSENPSGSTEKFQGPPYKRATDELTNIPVRTQEQLNLPCTSNQPGGVEVSMGGSASNSVSLTLGLHQNHGIGLAEPFSLNAAQRFGVALETNNEGYVMSGYESQNRHFGRDVIGGQLVHDFVG*


CDS Sequence:
>Vu_35780.1
ATGGCTGAGGGTTTTGAGGCTTACCATGTGCCACAGCAAAGCAGAAGAGATAAGCTAAGAGTCGTGGTGACACAGAACCAACATGGTCTCGTTGAACCCTCCACTTTGCTTCCTTTGTACGACCCTTCTTCGTTCATATCTTCTGATTTGCTAACGAGCTTCCACAACAGCCACAAACACAACTTGGGTTGTGGCGTGAAGGAAGAACGTGCAAATTTGATGATGGGTTTTGCAGGCAGAGGAGGTGAAGGTGGAGGAGTCATGAACAATGGCTCTTCTTCTTCTTTGTGTTGTTCTTCTAACTCCTCTTCGGTTTCTTATTTGGATCCTGAATCCTCGTTGCCTCTGAACCAAGCTACAATTCAGGTCATTAACAACAACAACATGTTTCTTTACCAAGCACAGAACCTGGGAGAGTTTGACCAGGGTTATAATAATAATAATGGTAGTGAGATCATGGTGTTTAAGCCTGAGCCTTTGTCTTTGTCTCTCTCATCACATAGCAACGGTGTGAATCTTCAGCGATATGGATCTGTGGTTTGTGGTGATAAGGTTAGTGGGGTTGGTGGCGGTGGTGGATGTGTGGTTTACGGTGGTTCTGGATTGAATGAAGCTTCTAGGTGCACGGTGCCTATGGGGCCATTTACTGGTTATGCTTCTATATTGAAGGGATCGAGGTTCCTGAAACCTGCACAGCAATTATTGGAAGAGTTATGTGATGTTGGTGGAGTCTGTGCTGAAAAGATGGTGGCTGATGCATCATTGATGGAACCTGTTCCTCTTCCTCCTCCTGAAAATTCAAGTGAAGATCTACTGGGGGATCACGGGGGTGACCATGGTCGGAAAAAGTCAAGACTGTTAACTATGCTTGACGAGGTTTACAGGAGGTACAGGCAATACTATCAGCAGATGCACGCAGTAGTAACATCATTTGAGTATGTTTCAGGCCTTCGCAATGCAGCTCCGTATGCAAGTTTGGCAATAAAAGCCATGTCCAAACATTTTAGATGCTTGAAGAATGCAATTACTGACCAACTTCAGTTTGCCAATAAAGCTCATTTTCACATCAGCAACAGGAAGGATGAATCTTCAAGGTTTGGCAACAGTGATAGAGGCCCTTACAGCCAAAGGCCAGGGTTTCTTGAGCACCAACCTGTTTGGCGGCCTCAAAGAGGACTCCCCGAGCGTGCTGTGTCTGTTCTCAGAGCATGGTTGTTTGAGCACTTTTTGCATCCTTATCCTACTGATACAGACAAGCTAATGTTGGCTAAACAAACTGGTCTGTCTCGTAGCCAGGTGTCTAATTGGTTCATTAATGCAAGAGTAAGGCTCTGGAAACCAATGGTGGAAGAAATACATATGCTAGAAACACGGCAGGCTCAAAATTTAAAGAATTCACAGAAGGAAGAACATTGCAGGAACAAGTCAAGTGATCAATTACCTTCTGATAACTCCATTGTTTCTGAGAATCCATCTGGCTCAACAGAAAAGTTTCAGGGTCCTCCTTACAAGCGAGCTACAGACGAACTTACCAACATACCAGTTCGGACTCAGGAACAACTGAATCTTCCCTGCACAAGCAATCAGCCAGGGGGTGTTGAAGTGAGCATGGGTGGCAGTGCAAGCAATAGTGTGTCACTCACACTAGGACTTCATCAAAATCATGGCATTGGTTTGGCTGAACCTTTTAGCCTGAATGCAGCACAGCGATTTGGTGTTGCTCTTGAAACCAACAATGAAGGCTATGTGATGAGTGGATATGAGTCACAGAATAGGCATTTTGGAAGAGATGTTATTGGAGGACAACTGGTGCATGATTTTGTTGGCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_35780::LG11:4654712-4656712(-)
ACTGTTCCTTTCTCTCACGTGCGTCATCTCCATCACTGTCGCTATCATTCATCTCATCACACTTTATATATTTTTTAAAATATTTAATTCACTTTTTAGCTCACATTCTACTATGGGTAAGTTTAATAACTAATTATTTGTTTTTAAACTTTTTATGAAAATAACGAAAGCTATAGTTTATCTGAAAATAAATATAATTATTTTATTTATTAAAGCTTCCACAGGAAATTGACGTTTTCTATTCATACTGGGAAAATGACATGACATTACATTATTTGAGCAAAAATTAAATTGGTTAAATCAAATCAGGTTTCTGTTTAAGTAGCTGTTGCCTTTTGTTTTAGATGAAATGTATGTCGATTTTTTTTTGTTATTATTTTTATTAACGGCACAATATTGTTCAACTCAAGTCAAGTTCAGTTACTTTTTAAATTATATATTTCTTACGCTGAAATCATTTTAACTAGTAGTAGATTGGTTGCAAACACAGTATAGATATAAAATTAATATTATATTTTTCAAAACAGTAAACTTGACTTAAACAATGAGATTTGAATATTTTAATTTAAAAGTTTAAAGTATTAATTTTTAAGATGAGTTTTATTATTTCATTATTTCTTTGAAAATAGTTTTTTTCTATAATATTAAAATATTTTATTTATTGAGTCATCTGTTTAAATATTAGAGGGGACAACGTGATTATTGTGACAAGATCTTTTAATCTAGTTAATAAATTTCTTAAAAGAATAAGTTAGGGTTATTCTAGTCTAGAGTAACCTAATTAGAGTAGTATGACTCAAAATTGACAACATATGAATACAGTGAGAGACATATTTATTTATAACCTAAGAGTGTCTCTTAATTTGTAGGAACTAGACGTAAAAACCTTACTTTGAAAGTGTTTGACCAAGAGATAGAGTTTAGACTCTTCTTCTAAATATGACTTCAACTCTTATTTAAAATGTTTGACTATGACTAAAGGATATGTCATCATGAACATTATGAAAATTAAGATATTATATGTTAAGCGAGCTTTTATACATTTGATTTTGATTTATTTTAATTTGTAAGACTAATTTAAACTTTAATAGGATTAAATAAAAGATATATATTTAGAAAAGTTATTATAGTGAGAAATTAGTATAAAATGTTTAATTTAATGAAATAGTTTTTTTTTCTTTCATTTATTTAGACTAATGATGAAGAGAAATTTCATTTTAATTACATTCATCCACATCTTTTATATGGTTAGATTTTTAATTACATTGTTTTTAATATATTTTATAAAGTTTAATAAGATTTTTCATTTTGATATTTATAATAAGTATTTAATGTATTCTTTTTTTTTCTTTTTTATTTAATGATTTATATACTTTTTAAAAGAACAATATATACCTCATTTTATTGGATAACTTTTAAAAAAATAATCACTTACTTTTTTAATGTAGTTATTTGTCTAATTTCAATAATAAAACGAGAAAAATAACATTAACACTTATAAAATATTAAAGAATGGAAAAATCAAACTGAGTTTTCTTAAAAAAATACAAAAAATAAATTAAATAAAAAATATTAAATTATTATAAATATAAATACCAAAAATGTCATTAAACATGTTGTAAAATCATAAATGAAATTGAAATTCGTTTAGACAGGTAAATTTCATCTAAGAAAGTTTTAATGGATAAACCAGAGCATGACAATATAACTTTTGTTGGATAGAAGGAAAGGAATAAAGATAATATTATATATTAAACCATAGTCTTTAATATTTTCTAATGAATTAAAAATAGTAAATAAAAAAAAGTAATGATAAAGCAAGAGGGTTAGGAAAACGACAAAAGCCAGAAGCTGTGTCAGACCTACCTGCAACCCAGGGAGAAAGAATGGAGTAGACACACATAAATACATACACTATACATCAGCCATTACCGGGAATAGCCGGTGGCCATCCCTCTGAAAACCCTATAGGTCTTCGTCCTTATAGTGTTTGCACTTTG


Gene Sequence:
>Vu_35780(-)
TTCCTTGTTTTGAAGGGAGAAGAGAGAATCTGTGTTGTTCACTCTGAGCCATAACACTGTAGCCATAGAGAAACTAAGAAAAGACCAAAGAAGAAATTTGAGTGTTCCTGCTGCGAAAACAAACGCAAAAACCTTAACTTAATTCTCCTTAAAATCAAACATATCCAACAAACTTAGTATATAGTTACATACACAGAAAAAAAAGCTAAATCACTGTCTTTCTCTATCATGCTCCATAATAACATCACAATTATACACACCCTTTCTTTTTTCCTCTCGTTTTATCGTGACTCCACACACTCTTCTCTGCCTAACTTGTGTTGAGGAGCTTCAGTTGTGTTTGTTTGTTTGCTTGGTTTTGTGTTTCTATGGCTGAGGGTTTTGAGGCTTACCATGTGCCACAGCAAAGCAGAAGAGATAAGCTAAGAGTCGTGGTGACACAGAACCAACATGGTCTCGTTGAACCCTCCACTTTGCTTCCTTTGTACGACCCTTCTTCGTTCATATCTTCTGATTTGCTAACGAGCTTCCACAACAGCCACAAACACAACTTGGGTTGTGGCGTGAAGGAAGAACGTGCAAATTTGATGATGGGTTTTGCAGGCAGAGGAGGTGAAGGTGGAGGAGTCATGAACAATGGCTCTTCTTCTTCTTTGTGTTGTTCTTCTAACTCCTCTTCGGTTTCTTATTTGGATCCTGAATCCTCGTTGCCTCTGAACCAAGCTACAATTCAGGTCATTAACAACAACAACATGTTTCTTTACCAAGCACAGAACCTGGGAGAGTTTGACCAGGGTTATAATAATAATAATGGTAGTGAGATCATGGTGTTTAAGCCTGAGCCTTTGTCTTTGTCTCTCTCATCACATAGCAACGGTGTGAATCTTCAGCGATATGGATCTGTGGTTTGTGGTGATAAGGTTAGTGGGGTTGGTGGCGGTGGTGGATGTGTGGTTTACGGTGGTTCTGGATTGAATGAAGCTTCTAGGTGCACGGTGCCTATGGGGCCATTTACTGGTTATGCTTCTATATTGAAGGGATCGAGGTTCCTGAAACCTGCACAGCAATTATTGGAAGAGTTATGTGATGTTGGTGGAGTCTGTGCTGAAAAGATGGTGGCTGATGCATCATTGATGGAACCTGTTCCTCTTCCTCCTCCTGAAAATTCAAGTGAAGATCTACTGGGGGATCACGGGGGTGACCATGGTCGGAAAAAGTCAAGACTGTTAACTATGCTTGACGAGGTTTGTGTCTTTTCTGTAAATCTTTCGGTTTGTGTTGTTGTGAGTTGAAAATTTTGGTGAAGGGGTGTTACTTTTATCTGTTCATGTTTGATGTTCCCGATGATTTCAATTTTAGTTCTGGTTTCACTTATTGTTCTAGTTTAGGTTATGCAGAAGAAAAATGTGTTGTTGAGTTGCAGATTTCTGTAGTTTTCGTAATATCTTTGAGGTTTTTAATGTAAGGCTGGTGATTCCTTCAAAGGGGAAGGTTCTTATTAATTGCATTGAGGAAGTGTGTTGTTATTTTTTGTGATTATGTCATTGTAGTTTATCTTTTTGTGAATGGTGTTTTAACTGTGGAAATGTGTGCATCATCAAGATTCTTGTATTTTCTGTGATGGATGGCCTTGGTGAACTCAATTGTCCTTTTGGAAAAGTTAATGGGAGGGAATATATGCACGAAGATTGGCTTGTAAAGTGTCTGTCAACTATATAAAGATTTGTAATGTGTGACTATGTCACCCAGTTTGGGAGGATAATTTGCATAAAGGTGTTGAAGGAATCCATCGGAAAAGATTTATACTCCTAAAAAGTGTGTGGTGATATGATCATGAGCTTCAAAGGTTAAAGAAACTTACATACTTGGATTGCAAGGTGTTTTACCTTTATGTAAAGTTCTCATTATTTTTTTTAATGATTGTTTTGATAGATGCTCGGAAAATGTTTTTTTTTACAACTTTTTTACAAGTGTGAACCTTATTACTGGTCCTCTCAAGGTGTCATACAAAATCAGGAATAACGATACAATTTAATCTTTTACACTAAATAAGTTTGTTTTTGCAAGAAAGTGATCTCATAATGGGTGGATGTATTGATTCTGTATTCGAATTGGGATATTGATTTTATTTGTTACTATTTTTTATTTCACTACACTAATCATAAATTGTAACAAATATGTGTCATACACATGGTTTGTGATCTTTATACACTAAAGACATGGATATTAATGTTAATTAAGTTTTAAGTATCTTATAAATTTGAATATTTTTAATTGAGTTTTTATTAAATTTTTTTATCTATTCTATTCACTATTTAAAATTTTATATTTTTCATTTTAGTATTTGTTATTTTACTTTTCTGTTAGCTGATTTACCGTAACTGTTATTTTGGGTCTTTGCTTTGATTATTTGTCTCCATTTGTCTATAATGTAAGATTTTGTGGTTATAATCTAAAACGATATTATGATTAATGTTAAATGATAATGACTTGGATAATAAGAAATAATCGTCTTTATCTTTATCAATTGTGGGTCAGAAATACCTTAATTACTATAAGTGATGACATGGAAGTCATTGGAGATCATAACAATTCAATATGTTTTCGATTAAAACAATTAAATTACTTATCGTTTTATATTATCCATAATATTGTTTTATATAACCACCAAATCTTACATTTCTTAACTGAAAATATAAAAATTTGAGTACTCAATATCACTAATATCTGAGCTAATATCTGAGCCAAGTATATATTTATCCAAAATCTTAAGGTTAATAAATTTTTAATCTTTTGTATAATATTATACTTTCTCAATTTTATCCAATGCGAGACTTAGATTTATATTTGGATTATGCAAGACTTAGATTCACGTTTGAATTCCCAACCAGTTCAAGGGATGTGGTTAGTGTAAAAGTCATGACGGTGACCATAAACTTATATGAAATAGTGAAACAGTGAAGTTCAATATTTCTTTTTCTTTGTGTATATTAGATTTCATACGTTTCTCATGGATGAAATTTGTTTCTAATTTCAGTGAGGTAAAGTGGAACTGTTTTATTTTTCTCTCACTTAGCTGTTCTCCCAAACAATTAAAAGATGATCCCTTTCTCTGTTATGTAATTACTCATTTGGAGGATTCGATCAAGTAAATGTGTGGCACTCAGAAAATCTGTCTCTGAAATTCAACGCTATGAATTTATAATGGATGTAGTTTCTTCCAAATTGTTTCTATGATGATGGGAACTTTCTCTATTTAGATTACAATACTCTGCATATTATTTCAATTCTCTATTTGGCCTTTTAGGTTCAAAGTAATTGGATGTAAAGGCTAGGAAATTGACAAGTTTGTGAGATTCAAGTATAGGTTCTGTTTTATGTGGTTTTCATTTAATTTGTTTGCCTTCTTAGATTGTCTTGGTAAATATGTTTATGTAAGATGTGGAGATTAACATGTGAATGACATAGAGCCATGGGTATTTGATAGGGACTTGAGGTATTATGGGGTGCCTAAGTGAGTATAAGATGTTTGTTGGATTGCTTAAGTGTCCTAATTGTGATTTTCATGTTGTTCATTTATCCTGAACAGGTTTACAGGAGGTACAGGCAATACTATCAGCAGATGCACGCAGTAGTAACATCATTTGAGTATGTTTCAGGCCTTCGCAATGCAGCTCCGTATGCAAGTTTGGCAATAAAAGCCATGTCCAAACATTTTAGATGCTTGAAGAATGCAATTACTGACCAACTTCAGTTTGCCAATAAAGCTCATTTTCACATCAGCAACAGGAAGGATGAATCTTCAAGGTTTGGCAACAGTGATAGAGGCCCTTACAGCCAAAGGCCAGGGTTTCTTGAGCACCAACCTGTTTGGCGGCCTCAAAGAGGACTCCCCGAGCGTGCTGTGTCTGTTCTCAGAGCATGGTTGTTTGAGCACTTTTTGCATCCGTAAGTTCCATACTTTTATATGAATCACGAGTAACTTCTTGCTGGATCTAGCTCCTTTAAAGTAAGCCAGCTTGCTTAAGAGGCTAAAGTAATGTTGATGAGAAAATCAACGGTTGATTTTGCGTAAACATGCATAACAACAACCAATGATTTCTCATAACTTACATTACTTGTTTACCCTTTAAGTGAAGACAAATCTGAATGTGCAGGTGACATCATGATCCTTTTGCTCCCCGGCCAAAACCAAGCATTATGCATCTACACACATTTACCTCCTTTATTGTATTGTGTTTTGTTAGCTTAGTTATTCTTTTTCTTTTCCAGTTATCCTACTGATACAGACAAGCTAATGTTGGCTAAACAAACTGGTCTGTCTCGTAGCCAGGTAAATATTATTGATAACCAACATGTAAGCGTCTTTTGGTTTAACTTAGTTTTGAAGAAAATATTCACATGTGTTGCTAGTTTCATGAGTGTATTTCTCAAAAACTTGTCTATACCCAAAATGTAGTTAATCTTTTCATTCTTATCGATCAAGGGGTTTGTTCTTCTAATGTTTGGCAATTCCTATATGTGTGCAGGTGTCTAATTGGTTCATTAATGCAAGAGTAAGGCTCTGGAAACCAATGGTGGAAGAAATACATATGCTAGAAACACGGCAGGCTCAAAATTTAAAGAATTCACAGAAGGAAGAACATTGCAGGAACAAGTCAAGTGATCAATTACCTTCTGATAACTCCATTGTTTCTGAGAATCCATCTGGCTCAACAGAAAAGTTTCAGGGTCCTCCTTACAAGCGAGCTACAGACGAACTTACCAACATACCAGTTCGGACTCAGGAACAACTGAATCTTCCCTGCACAAGCAATCAGCCAGGGGGTGTTGAAGTGAGCATGGGTGGCAGTGCAAGCAATAGTGTGTCACTCACACTAGGACTTCATCAAAATCATGGCATTGGTTTGGCTGAACCTTTTAGCCTGAATGCAGCACAGCGATTTGGTGTTGCTCTTGAAACCAACAATGAAGGCTATGTGATGAGTGGATATGAGTCA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