Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35716 LG11 3511960 3515385 PREDICTED: transcription factor AS1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 3512162 5_prime_UTR_variant
C/G 3512163 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/G 3512199 intron_variant
A/G 3512215 intron_variant
T/A 3512538 intron_variant
G/A 3512887 intron_variant
C/A 3513067 intron_variant
C/G 3513136 intron_variant
G/A 3514316 missense_variant p.Glu138Lys
A/T 3514344 missense_variant p.Glu147Val
G/A 3514348 synonymous_variant p.Gln148Gln
T/A 3514435 synonymous_variant p.Pro177Pro
T/A 3514484 missense_variant p.Ser194Thr
G/T 3514494 missense_variant p.Gly197Val
G/A 3514844 missense_variant p.Glu314Lys
T/G 3515215 3_prime_UTR_variant
C/T 3515317 3_prime_UTR_variant
G/C 3515332 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35716.1
MSDLHLEMKERQRWRAEEDALLRSYVKQYGPREWNLVSQRMNTPLNRDAKSCLERWKNYLKPGIKKGSLTEEEQRLVIRLQAKYGNKWKKIAAEVPGRTAKRLGKWWEVFKEKQQREKKELNRIPDPSNNSKYEHILECFAEKLVKEQHPSPSFVMTASDGTFLRTDTPAPASALLPSWLSNSSSAAAAAGPSSLSGTLSLSSATVAAAPFSWLQPDRGPDIAPFALGNIPAFSENMLISQMLEHCKELEEGHRALSAHKKEAVWRLSRVELQLESEKASRRREKMEEFEAKIRVLQEEERAALSRIEAEYRDELAALKRDAENKEQKLAEQWAAKHLQLTRLLEQIGCRAGHLEPNTR*


CDS Sequence:
>Vu_35716.1
ATGTCGGATTTGCATTTGGAAATGAAAGAGAGGCAACGTTGGAGAGCTGAAGAGGATGCTTTATTACGTTCTTATGTCAAACAGTATGGTCCTAGGGAATGGAATCTTGTTTCTCAACGCATGAACACCCCTCTCAACAGGGATGCAAAGTCATGCTTAGAAAGGTGGAAGAACTACCTCAAGCCTGGCATCAAGAAAGGATCTCTCACCGAAGAGGAGCAGCGCCTTGTAATCCGGCTTCAAGCAAAATACGGCAACAAATGGAAGAAAATTGCAGCAGAAGTTCCAGGTAGAACTGCAAAGAGGTTAGGCAAGTGGTGGGAAGTGTTCAAAGAGAAGCAACAAAGAGAGAAGAAGGAGCTCAATAGAATCCCTGACCCCAGTAACAATAGCAAGTACGAGCACATACTTGAGTGTTTTGCAGAAAAACTAGTCAAGGAACAGCATCCTTCACCTTCATTTGTTATGACTGCTTCTGATGGGACATTTCTGCGTACTGATACACCAGCACCTGCATCAGCCTTGCTTCCTTCTTGGCTTTCCAATTCAAGTAGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCAAGTTCCCTTTCTGGGACACTCAGTCTTTCTTCTGCAACAGTGGCTGCAGCTCCATTCTCATGGTTGCAACCTGATAGGGGACCAGACATTGCTCCTTTTGCTTTGGGGAATATACCAGCTTTCAGTGAAAATATGCTGATATCTCAGATGTTGGAGCACTGCAAAGAGCTGGAAGAAGGGCACCGAGCTTTGAGTGCTCACAAGAAGGAGGCAGTTTGGAGGTTAAGCCGAGTGGAGTTGCAGTTGGAGTCAGAGAAGGCGAGCCGAAGACGGGAGAAGATGGAAGAGTTTGAAGCTAAGATTAGGGTTCTTCAAGAAGAGGAGAGAGCTGCTTTGAGCAGAATTGAAGCAGAGTATAGAGACGAGTTAGCTGCATTGAAGAGAGATGCTGAAAACAAGGAACAAAAGTTGGCAGAACAATGGGCTGCAAAGCATTTGCAGCTTACTAGGTTGCTAGAGCAGATAGGATGCAGAGCAGGGCACCTTGAACCAAATACAAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_35716::LG11:3509960-3511960(+)
TCCTACCCATGCTGATTCTTTCATTACCTTTCATCTTCCTTTTATGGGTACACAACTTCTTTAGGAATTTGGCATACTTTGAGATTTGCTTGATGGCATCAATTAGAGGTATGTTCACCTCTACTTTCCTGAATGTTTCCAAGATTTCTTTATCCACCTCTTTCATCTTTTTGCTAGGAATCATTTTGGGAGGGAATGGAAGAGGAATTGGTTGTTGTGGCAACTTAGAAGATGTATTAGTGCTGGTGGAAAAAGAAGAAGATCCACCTGAAGAGGAAGAAGAAGGACCACCTGCCTCAATTGTCCTGCTTGGACCTGCCTGGTCCTCTTTTCTCTGAAATGTAGCAATATCAGGCTGAGGTGAAAGTGTAGGTGCAGGAGGTGGCACAATAGTTATAAATGAAAAGGAGTAACCTTATGTGTGACAGGATGAAACTCATTCGCAATAGTTCTACATAGCAGTAGATGTCACCACAAATGTATACTTCTAGTGAATCTGATGTTAATGCATGTATCTAGATAATTGAGTCTAAAATATCTTGCTTGTGTGCATATCCTTATACATCTATGATTAAATTGTATCAATAACATTACTTATTTGGTATTAGATAACTCTTTGGTACATTAATTTACCCTTTGTTTGTTTATCTCTTTTGCAATGATTATCTACCGGTGTGAGCAGATGAAGAAGTAGGTCACGATGTGCCTTTGAAGAAAGGTAATGATGCTATTGTGCAATTTTCTTAATTTAGAGTGGTTTTGTGTACAGGAGTTTTTGAGAAGCTTTAGACGTATATTTGTATTCTAGTTATGTTTATTCTCTTAGTATATATGTTTTATTATCAATTTTATAATCTTTATTTAATAGTTTTATACTATTATATTAAATGTTTCAATAATCTTCTAATCTTTTGATAAATTTGATAAGAATACTTATTATCTTGAAGTCCTTCAATTGCACAACTAAACGGACTTCACAACTAAACATGTTAGTTGATTCAACTGCACAACTAAACATATTAGTCAATTAATAACATTAACTTTCATAACTTAATAGATTTTGTAATCATCGAAATCACTTAGCAAACTTGTCTAATGGGATATAGTATCGTCCGGTCCTAGCAAACGCAAGTTCCAAAACAATGGTTCCATGACATGAACTTTAAAACAAACCCTCATATATGAAATAAGATACTAACTTTAAAACTATGTACATATCATCTAATCATATAAATGTTTATCAAACATAGAAACAACATATACTAACATGATTTTTTGTCTTTAACAAAACTTTACATGTATAAAGTATAATAATATTTTATTGTTCAACACTTAAACAAACTATGAGAGTTTAACTTTTCCTTAAATAATAATTACAAAATAAAATATCTATTTTTATTAATTAATTGATTTTTCAATAATTTGTGAACTAAAAATATTTTTACATAAAAAACTTTCTAAGATACATAATGAATTGGTGAAGGAAGCTGACATATAATTTATTAAAAGTTTTACATAATAAAATATTGATAAAATGTTTTGAATCATAATCATTTTATCCAAGTATACTTATTAATATTTATCATTATAATATTTATATAATAAGATGAACTACAAATATTTATAAATTTAAAAAATTTATATTATTAATAATTTATTAATATATTTATATAGTCTAATAACATTAAAATAATAAATTAATTATATAAATTTATTAATGAAAATACCTTTTTCCATTTATCGTATTTATTAAACTAAACATAAATTTTGTATTCAATTTCAGCCCTACATCCCTTAATCTAAGAACCTTGGTGAATGGAATCGATTAGTATGGATTAATGAACGGACCACCAATACTAGTCATGGTTCCCTCCCTTATCATTCGCGTGCCATCTTTCTCGCATATTAAGCGCTGAAACCGACGTACACACCTGTCCCCATTTTCTCTCTCTTCCATGTCTTGTCTATTCTCACTTTCTTCCTCTCTTTCTCTCTCTCTC


Gene Sequence:
>Vu_35716(+)
CTGCTCCATTTCAGTGCTGTCTTCTCCCCACCACCCCACTCTCCCTTTCTCTCACACTCATCCTATCATCATCATCATCGTCGTCCTCAACATGCCATCCCTTTTGACCCTCCTTCTTCCCTTCTGTCTCAACGCCGCCGTTTCATTCACCTCAACATGCTGTTGATTATTCATCCTTCCAACTCTCACTTTCCCCACTTCTTCTCCTTTGCCTTCCCCCATCTGGGTATGCCCTACTTTCTGCATCCTTAGAAAAAGATTCATTTTTTTTTACTATCTCCACTGTTCGTTCCTTCGTTCGCTGCTTCACTTTTCAATGCACTCACTGTTCTTTTTATTTTGAAAAGGGCTTCTTATTTTACTTTTAAATAAGCCAAATTGAGCACGCGCTTGATTTAAGTTACTCGATGATATGAATTTAATGGATAAAAAATTGCGACAACGGGGTATATTGTATTAGATAATTCGTTTTTAAAAAAATGGATTTCGGTTGGCTGTTTTCTCATTGTTTTCTGGAATTCTTGATTTCGGAGCTGATACATTTCACCCTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTATTAGTTATTTTCATCTGTGTCCATGTGCAATACAATTGCTGGGGGGCTTACTCTCACTGAATGCTTCTTTTTTTCATGTGTTTTTTTTAAGTTAATTTCACTAAAGTTGGTTCCTGCATTTCTCAGGGCTAATGTTAAACTTCAATGTATGATTATTCATCTAATCACTTGGGTTTTCTAGATGCTTTCAATTATTAGCGGTGGTGATTTTAGTTCATGGTTCTTTATCATGTTGCTATGTTAAACTAATTCAAAATTCTCTATTATTTCAATTGAAACTCTTAGTTTTCAAATTTCCGTAAATTAAACTTCTTGGTAGTGGGAGGTGTTGTTTTTGCATATTGCTGTTTGCTCAATAACAAAGGCTAGAAATTGATTCATGCAGACAACTTAATGTGGTCGTCTTCTTGTTGTCTAATTGCAACTAATGTACTAACTTCTGAGCAAAAAAACTATGATACATTAATACTTTATTGCTTTCGCTAATCTATTTTGGACTATTAGATTTCTACTGGTAAAATATTATAACACTCGCACCTAGGTAGCGATTGTGGTTTCATCTTGGTACTTAGCTAACTGCATTGAAGTTATTCGTTCTCCAGGTTTATATGTTCTTTTCATTTTTCTTCTTTCTTGCTAAATATTTTTCATGCTGGTTAGTTGATTTTATATTTTATACATCCCTGCACATTTAATACTTTATCCCTCAAGTATGTGTAAAGAATGTAAACAAAAAATTTCTGCCATATGTTTGCCATTGCCATATGGACTCTGATTTTTGTAATGTTATGGTCTATTGTTTCGCTGCAATGCCATTGCAATTATAGATTACATTTGTGAGAAAATAATATGATGCCACTGCATCTGGTTGATTTTTTCCTTGCTATTAAATTTGTAAAGGATAAAAAAAACGTGAGTTGCATCGTGAACTGTTATTCTATTGCTACTTGAGGTGGTAATCTAGTGATGTTGTGAGTCGGTTTCTGTTGGTAGATTTTTGTCTTCCTATTAAATTTGTAATGTATGTGTTGAGTTTCATTTTGAAGTTTTATTCTTATTGCTCTTGAGATAATCTGGTACTGTTGTTTGTCAGTTTTTATTCCTGATCCCTACAGGGTTTTTTCTACATAGCTGTGTTTTGATATCACCAAGCTTTAAGTTGATCCAAAGGCATGGTTACTTATATTGGAATCACCCAACAACTGGTGATCTTTTGATTTAGTTGTTGAGTTGAAGTGTGCTTGAAGATTTTATGAAATCGTTTCCTGTTTGGTATTTCTTTATTTCTCACCTAGTTCTTGTGAATTGATGCTATGAGTTGTCACAATTGTTCCAGAGACACGATGAGTTCAAGATTCAAGACATGGGATGTCGGATTTGCATTTGGAAATGAAAGAGAGGCAACGTTGGAGAGCTGAAGAGGATGCTTTATTACGTTCTTATGTCAAACAGTATGGTCCTAGGGAATGGAATCTTGTTTCTCAACGCATGAACACCCCTCTCAACAGGGATGCAAAGTCATGCTTAGAAAGGTGGAAGAACTACCTCAAGCCTGGCATCAAGAAAGGATCTCTCACCGAAGAGGAGCAGCGCCTTGTAATCCGGCTTCAAGCAAAATACGGCAACAAATGGAAGAAAATTGCAGCAGAAGTTCCAGGTAGAACTGCAAAGAGGTTAGGCAAGTGGTGGGAAGTGTTCAAAGAGAAGCAACAAAGAGAGAAGAAGGAGCTCAATAGAATCCCTGACCCCAGTAACAATAGCAAGTACGAGCACATACTTGAGTGTTTTGCAGAAAAACTAGTCAAGGAACAGCATCCTTCACCTTCATTTGTTATGACTGCTTCTGATGGGACATTTCTGCGTACTGATACACCAGCACCTGCATCAGCCTTGCTTCCTTCTTGGCTTTCCAATTCAAGTAGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCAAGTTCCCTTTCTGGGACACTCAGTCTTTCTTCTGCAACAGTGGCTGCAGCTCCATTCTCATGGTTGCAACCTGATAGGGGACCAGACATTGCTCCTTTTGCTTTGGGGAATATACCAGCTTTCAGTGAAAATATGCTGATATCTCAGATGTTGGAGCACTGCAAAGAGCTGGAAGAAGGGCACCGAGCTTTGAGTGCTCACAAGAAGGAGGCAGTTTGGAGGTTAAGCCGAGTGGAGTTGCAGTTGGAGTCAGAGAAGGCGAGCCGAAGACGGGAGAAGATGGAAGAGTTTGAAGCTAAGATTAGGGTTCTTCAAGAAGAGGAGAGAGCTGCTTTGAGCAGAATTGAAGCAGAGTATAGAGACGAGTTAGCTGCATTGAAGAGAGATGCTGAAAACAAGGAACAAAAGTTGGCAGAACAATGGGCTGCAAAGCATTTGCAGCTTACTAGGTTGCTAGAGCAGATAGGATGCAGAGCAGGGCACCTTGAACCAAATACAAGATGAAGATATCTTTTGGAAAAATAGATTTGGTGGTTCTCTTGTGACTTCCACTATATGCAGTTTACAAGATGATGATATTTTTATGGTGAAATGGATATAGGTGTTTTTGTGACTTGAATTATTTCCAGTTTATGCTTGTTGTGATCTTGGTATATTAGTGTTGTAGTTGTGTTATATCTGTTCCTACAACTTGAGTAATTTCCTTAAGCACTTGAATTATAGTATCACTTCCATGTATGTGACTTAGTTATATTGTTCACCATACTTGCCTCCAAATTCTTTTCTTGGAGTGGCATTAGCTGAAAGGTTATATGTAATTGTATCTAATCTTTAGACATGTTTGAAGCTTTGTCACAAACACTCTAGAAAGAGAAAAAAAAAATGAAATGATTTATTCCATTGCA