Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35712 LG11 3410073 3412743 "PREDICTED: protein kinase APK1B, chloroplastic-like "
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 3410195 intron_variant
A/G 3410311 intron_variant
C/T 3410398 intron_variant
G/T 3410493 intron_variant
A/C 3410606 intron_variant
C/T 3410669 synonymous_variant p.Leu28Leu
G/T 3410936 missense_variant p.Val117Phe
G/A 3410960 missense_variant&splice_region_variant p.Ala125Thr
C/A 3411052 intron_variant
T/A 3411115 intron_variant
G/A 3411433 intron_variant
C/T 3411659 stop_gained p.Gln201*
A/C 3411728 intron_variant
T/A 3411729 intron_variant
G/A 3411927 missense_variant&splice_region_variant p.Ala258Thr
A/G 3412047 intron_variant
A/T 3412347 stop_gained p.Arg283*
A/C 3412357 stop_lost p.Ter286Serext*?
G/T 3412368 stop_gained p.Gly290*
C/A 3412461 missense_variant p.Pro321Thr
T/G 3412491 missense_variant p.Phe331Val
A/C 3412650 missense_variant p.Lys384Gln
G/T 3412704 missense_variant p.Gly402Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35712.1
MGACWSSGTKAVSPSSAGFTSRSVSREGYDIHSSSRNSSASIPMTPRSEGEILQSSNLKSYSYNDLRIATKHFSPDNVLGEGGFGSVFKGWIDEHSLSVTKPGIGMVVAVKKLNQEGFQGHKEWLAEINYLGQLQHPNLVKLIGYCLEDQHRLLVYEYMPKGSVENHLFRRGSHFQQLSWTLRLKISLGAARGLAFLHNSETKVIYRDFKTSNILLDTNYNARLSDFGLARDGPTGDKSHVSTRVMGTHGYAAPEYLATGHLTAKSDVYSFGVVLLEMLSGRRAIDKNRPSGEQCLVEWAKPYLANKRRVFRVMDSRLEGQYSLNQAQRAATLSFQCLSVEPKYRPNMDEVVRVLEQIRDSNDQVKNGDHNKKRRLSGSASGHGHPNGLPASASTGSSDAPKKLAYPRPSASFLYA*


CDS Sequence:
>Vu_35712.1
ATGGGTGCTTGTTGGAGCAGTGGGACGAAGGCTGTGAGCCCTTCCAGTGCAGGGTTCACTTCTAGAAGTGTGAGCAGAGAGGGCTATGACATCCATTCAAGTAGCAGGAACTCATCAGCCTCCATACCCATGACCCCTCGGAGTGAGGGTGAGATCTTACAATCTTCAAATTTGAAAAGCTACAGCTACAATGACCTAAGAATAGCAACAAAACATTTCAGCCCAGACAATGTCTTAGGGGAAGGTGGATTTGGTTCAGTTTTTAAGGGTTGGATTGATGAACATTCGCTTTCTGTTACCAAGCCTGGTATAGGCATGGTTGTTGCTGTGAAGAAACTTAACCAAGAGGGGTTCCAGGGTCACAAGGAATGGTTGGCTGAAATCAACTATCTCGGGCAACTGCAGCATCCTAATCTTGTCAAGTTGATAGGCTACTGCTTAGAGGATCAGCACAGGCTTCTAGTTTATGAATATATGCCAAAGGGCAGTGTGGAGAATCATCTATTCAGGAGGGGGTCTCATTTTCAGCAGCTTTCTTGGACATTAAGATTGAAAATATCCCTTGGGGCTGCTAGGGGTCTTGCTTTTCTCCATAACTCAGAAACCAAAGTCATATACAGAGACTTTAAGACTTCTAATATCCTGCTTGATACGAACTATAATGCCAGACTTTCTGATTTTGGGCTGGCCAGAGATGGACCCACTGGTGATAAGAGCCATGTTTCTACAAGGGTCATGGGAACACATGGATATGCAGCACCAGAGTATCTAGCAACAGGTCACCTCACTGCCAAGAGTGATGTGTATAGTTTTGGAGTAGTACTTTTGGAAATGTTATCAGGAAGACGTGCCATAGACAAGAATAGGCCATCTGGGGAACAGTGCTTAGTTGAATGGGCAAAACCTTACCTTGCTAACAAAAGAAGGGTTTTTCGTGTAATGGATAGTCGTCTAGAAGGTCAGTATTCCCTTAACCAAGCTCAAAGAGCAGCCACTCTTTCTTTTCAGTGTCTTTCTGTAGAGCCCAAATACAGGCCAAACATGGATGAGGTGGTGAGAGTATTGGAGCAAATACGTGACTCAAATGATCAAGTGAAAAATGGTGATCATAATAAAAAGCGTCGACTAAGTGGCTCTGCCTCTGGCCATGGCCACCCAAATGGACTCCCTGCATCTGCTAGCACAGGAAGTTCTGATGCTCCAAAAAAGTTGGCTTATCCAAGGCCTTCTGCTTCTTTTCTGTATGCTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_35712::LG11:3408073-3410073(+)
ATAGTCTGAAATCATTTTTGCCTTTTATACCTCTGAAAAGGATAAAGGAAGAAATCATGAGGTTTAAGAATAAATAATGACGTCATGTGAAAAGTAAAGCAAGCATTCTTCATGCATGAAAGTAATTGAAAATTTTATGACTCTTTCTTGTTTTTTCTTCTTGTCTTTTTGGTAGGTTTCAATTTCTCGTTTGACATGGTTTGACGCGCTTCCAAATGAACACTATCACATTTCAATTAATTTTCTTTTTTATTTTTAAAATTAACTTTATTTGCAATAAATAATGATGAGAAATTTAACTTGTTATCAAGATCTATTAAAAATGTTAGCAAGTTGAATATATCATTATATTTCTATACTTCTAGACCTATTGATTAAGATAATCTATGTGAAAAACTCTCAAATCATTTAAAACTCAAAGTCAATACTAATTTATATACAATTCATTAACTTTAATGAAATTAAATTAAAACATATATAATTTATTGGGATAAATAGTAAATTAAAGTCACTCTTGCTCTATTGATATAATTTATTGGGATAAAAAGTAGAGTTTAATGTCAATCTTGCTCTTTATTAATTGTTTCACTAAAAAAATCAAATTTTTAGGAATTAAAGTGAAAAGTAATTTATATTTATCATATTTTCCATGAATTAATATGTCTTTCGGAGGAAAATTAAAAGCGGATAAAAGATTAAAATCCAAAACTGAAAAACATTTTGAATGTAAAAATTGACCTAAAATTGTTATCCTACCCTAGAACATATATTAATACTAATATCATACTTATATGTATTTATATTGTAAAATTAAATTTATCATTATAATTAAGATATATTTGATAATATATTTCAATATATGCAAGAGCAATATATATACGATAAAGGAATTTTACATTTTTTTGTCTACATACATTAATTCTTGCCAAATTTATTACTGAAATGATCGTTTTTTAAACTTGATTACTTTTATTTATTTTGACCATTTTTTAAACTAAAATAACTATTTATAAAGAAGAGCTACAAAATGAAAAGAAAATTATATATAACAAAATTAAAAAATAATTTTATTAACTTGTTCATAATTATAGATAATAGTTCTATATATATTATAGCATTTGTTCCACTAGTTATTTTGAACCTGAGTTAGGAAAAACATGATTGGAACGTGTTCTTAACATTCATAGGATATAATCTCTGTCCCTAGCCAAACCAAGTTAACTTATCGTTGTAACATGTGAATAGATTGAATCAGATAATGAACACCCATTTGTTCTACCATTTTAATTCAGAAAAAACTAATCGTAGATGACTTAAAAGTTGTATTATTAGTGATGCCAGATGCTTAAGCTCATGGCCCTATCAAATGAATGGACAGATTATCATGCATGACAGCTTGGTAACTTGAAAGAGCATGACCATAGACCATAACACGGCATCAATCAAAAATAACGAAGTGGATTATCACTGGATTGGCTTTAATAATAAGATCAAACAAAGCTGTCACCGATCAATAAAACCAGTAGATAGGTTTTGATATCCGCATTTATTTTTCACCTACCCCTTCTTTTTAAAATGTGAGAGGAATAAATTAGCTAATAAATTCTCATGTTCGTATGCGTTTGGTAGTTAGTATAGACAAAGTTGATGGAAAAAGTAAAGTCAACCAACTAATTCTCTGAATAGTCAAGTGGCTCCATTTACAAAGTCTAACTTTTTATCCTTGTACTTTTTGCTTTATCATTCTTCTATTCTTAACCAAAATCATTTCATCTTGAAAAGTTTATGAAATCTCAGCTACTCAGTGAGCAATCACTAGCATCACCCAAAAGGCCTAGTGTCTTATCTTTCTCCTGTTTTGGGTATTTCCTTTTGCTTTTTCATTTGGGGTTGCAACTTTTGTACACTCCTAGATTTTGGAGTTGTTTGTTTGCATGCTTGTCTGGTTGTGTTTGAAAGATATAACAGAAGCCTTTTAGTATTGGGGTGATTTTAGTTGA


Gene Sequence:
>Vu_35712(+)
ATGGGTGCTTGTTGGAGCAGTGGGACGAAGGCTGTGAGCCCTTCCAGTGCAGGTAAGCTGCTTATTGAATTGCATGTTACATCATTTTGTTTCCTCTTGATATCTGAATACGCTAAATTACTGGTCAAGATTTAGTTTTTGGAGTTGGGGTTTGATTCTCTTAATCTTGAAGTTGTCAAGTTGATGAAGATTTGGACTGCCATAGACATGCATGCTATACTTCAGATCCGTGCAATATAAGACTGCTATGTCTTATCTTATGGGGTGATCCTTGTTTCTTCATAGTTGAGGAATCTCACTGAATGCCTAAATTCTAGATTTGTGCCTTAGTCTAAATTTTCGATGTTTTTACCCCGTGTGGTGATCACTGTGGTGAATCCTGTTGGAAAAAACTGTGATTTGAGGTTGAGAGAAAATTTAGTCAGCAACATAGGGATAATCTGTGGCCGTAGCTGGAATCCATGTAAATTTGGTTGTAAAGAGTGATGATAACCTTGTTTATTTTGTTTGTTACAAGGTACTGTGGTTACTGAATTTTTGATCATTTGTTTTGGTACGTTGACAGGGTTCACTTCTAGAAGTGTGAGCAGAGAGGGCTATGACATCCATTCAAGTAGCAGGAACTCATCAGCCTCCATACCCATGACCCCTCGGAGTGAGGGTGAGATCTTACAATCTTCAAATTTGAAAAGCTACAGCTACAATGACCTAAGAATAGCAACAAAACATTTCAGCCCAGACAATGTCTTAGGGGAAGGTGGATTTGGTTCAGTTTTTAAGGGTTGGATTGATGAACATTCGCTTTCTGTTACCAAGCCTGGTATAGGCATGGTTGTTGCTGTGAAGAAACTTAACCAAGAGGGGTTCCAGGGTCACAAGGAATGGTTGGTAAGTATCAATTATTTTCTAAACACATTTCTGTTTCCTCATTTGATGAAGATTCTGGCTTTAAGTGGTTTTACATTAACAAGATTCTAGGCAGCTCCAAGCTTTTCTGGTCCTGTTTCACGGATTTCTGTTTAACTTAAACGGCTTCTTCTTTTTGATTTTATTGTCATTACTTTACTAAACACTTTTTTGATAACTTTCTTCTTGTTTTTACACTGTAACTTGCAGGCTGAAATCAACTATCTCGGGCAACTGCAGCATCCTAATCTTGTCAAGTTGATAGGCTACTGCTTAGAGGATCAGCACAGGCTTCTAGTTTATGAATATATGCCAAAGGGCAGTGTGGAGAATCATCTATTCAGGAGTCAGTACCATGTAGTTTATACGAATACATTTAGGGTATCCTAGAATATCTCAGCATATTGTTGAATCAATTAATTGTGTAATTTCGAAGCAATCTTAGGAGTTGTTTGCTATATTGCCATATTTCTTTCCATATAGGCTTTGTACTAGCTGTGCTATTCCTCTTTCAAAAGAGATTGTAATTTTTGCTTAATCTCCCAATGTTTCAGTACTAACGTTGAAGATATCATCATTAATGCAGGGGGGTCTCATTTTCAGCAGCTTTCTTGGACATTAAGATTGAAAATATCCCTTGGGGCTGCTAGGGGTCTTGCTTTTCTCCATAACTCAGAAACCAAAGTCATATACAGAGACTTTAAGACTTCTAATATCCTGCTTGATACGGTATGTACTGAAAAATTGGTATTGTCTTTGTATGGTTTAATATGATGGATTTTATGATTCCATAACTAAGCTAGTTAATTGACGAATGTTTTGCAGAACTATAATGCCAGACTTTCTGATTTTGGGCTGGCCAGAGATGGACCCACTGGTGATAAGAGCCATGTTTCTACAAGGGTCATGGGAACACATGGATATGCAGCACCAGAGTATCTAGCAACAGGTACAAGAACCATGTTTCCGTACTAGCTTTTTTACCTTTCCATGCCACAATTTTCCCTAAAATAGTATACTTTGTTGATGGACCATATAGATCAAAGTCAGGTCATTTTCTCTGTTTAGACTATTCTCATTAGTGGCTCCACACATTATTGCTTACATAGCAATGGTTACAGACCGGCACCATTTTCTTGAGATGTAATATAATATCCTATACACTACTATGCATGGATTATTGGAACCACATGTATATGTTGTATGCTTATTTTTAAAATATAAAATATGATTAGATATTTATCGGAACCTTTATATGTAACTATTTTATTTTATTTTTCCATGTTTACTAGGTCACCTCACTGCCAAGAGTGATGTGTATAGTTTTGGAGTAGTACTTTTGGAAATGTTATCAGGAAGACGTGCCATAGACAAGAATAGGCCATCTGGGGAACAGTGCTTAGTTGAATGGGCAAAACCTTACCTTGCTAACAAAAGAAGGGTTTTTCGTGTAATGGATAGTCGTCTAGAAGGTCAGTATTCCCTTAACCAAGCTCAAAGAGCAGCCACTCTTTCTTTTCAGTGTCTTTCTGTAGAGCCCAAATACAGGCCAAACATGGATGAGGTGGTGAGAGTATTGGAGCAAATACGTGACTCAAATGATCAAGTGAAAAATGGTGATCATAATAAAAAGCGTCGACTAAGTGGCTCTGCCTCTGGCCATGGCCACCCAAATGGACTCCCTGCATCTGCTAGCACAGGAAGTTCTGATGCTCCAAAAAAGTTGGCTTATCCAAGGCCTTCTGCTTCTTTTCTGTATGCTTAG