Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35668 LG11 2807988 2811188 PREDICTED: transcription factor MYB108-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 2808216 missense_variant p.Pro77Thr
C/G 2808324 missense_variant p.Gln113Glu
G/T 2808332 missense_variant p.Leu115Phe
G/A 2808438 missense_variant p.Asp151Asn
G/T 2808473 missense_variant p.Arg162Ser
G/T 2808474 missense_variant p.Asp163Tyr
T/C 2808499 missense_variant p.Val171Ala
G/C 2808525 missense_variant p.Asp180His
C/T 2808580 intron_variant
T/C 2808586 intron_variant
G/T 2808611 intron_variant
T/G 2808637 intron_variant
A/G 2808639 intron_variant
A/T 2808722 intron_variant
T/A 2808897 intron_variant
T/A 2809036 stop_gained p.Leu234*
A/G 2809037 splice_region_variant&synonymous_variant p.Leu234Leu
T/A 2809051 intron_variant
T/C 2809128 intron_variant
G/C 2809129 intron_variant
T/A 2809479 intron_variant
T/G 2809692 intron_variant
T/G 2809840 intron_variant
C/A 2810008 intron_variant
T/G 2810344 intron_variant
A/G 2810371 intron_variant
A/C 2810467 intron_variant
A/T 2810545 intron_variant
A/T 2810668 intron_variant
G/A 2810964 missense_variant p.Val305Ile
C/G 2811005 missense_variant p.Phe318Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35668.1
MEFDPCFQGPQYLSSICPKIPYLNPHAQNMFPSQSSIFIPPSQPIMFNPNHVFHHFQDHIVNVPPFVMDGSNPIVTPMYGNGIPTPSFGDGSFANINSHQPVMLVPKNNSKIQALYDDHKGKVIWDFSQKTMVHPFEASSPNSPSPFCLSDEYGLGMSEFHRDTDRRMVEVENNTHNATDNIIKGQWTPEEDSALVELVNQFGPKKWSEIAKLMCGRVGKQCRERWHNHLRPNIRKESWSLEEDMILIKAHQEFGNRWSEIAKRLPGRTENSIKNHWNGTKRRQSCRTYNGSKKNPYEGSMLRAYVKRVTAMEESTKVFKKATSKKNLLRFDPSTNEMFIGNSSNYAPLQVKNNNIRVSYGAIGTNAINRGMNPISTKY*


CDS Sequence:
>Vu_35668.1
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Promoter Sequence:
>Vu_35668::LG11:2805988-2807988(+)
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Gene Sequence:
>Vu_35668(+)
ATGGAGTTCGATCCGTGCTTTCAAGGGCCACAGTACCTATCTAGTATATGTCCCAAAATCCCCTACTTGAATCCACACGCTCAAAACATGTTTCCATCCCAAAGCTCCATTTTCATTCCTCCATCTCAACCCATCATGTTTAACCCTAACCATGTTTTCCACCATTTTCAAGACCACATCGTGAATGTCCCTCCGTTTGTGATGGACGGTTCCAACCCCATCGTAACCCCCATGTATGGGAACGGGATACCAACCCCTTCTTTCGGTGATGGCTCTTTTGCTAACATTAACAGTCACCAGCCTGTGATGTTAGTACCCAAGAACAACAGCAAAATTCAAGCTTTGTATGATGACCATAAAGGCAAAGTCATATGGGATTTTTCCCAGAAAACCATGGTTCATCCTTTTGAAGCGTCTTCTCCCAACTCACCATCTCCTTTCTGTCTCTCTGATGAGTATGGATTGGGTATGAGTGAATTTCATAGGGACACTGATCGAAGGATGGTAGAGGTGGAAAACAATACCCACAATGCTACTGATAATATAATCAAAGGACAGTGGACTCCCGAAGAAGACAGGTATATAAATAACACCTGTTTTTCCAATCTTTTCTCATTTTCTTTGATTTTTCTCATTTTTCCATCATGAATAATAGAATAATTTAGTAATGAAAACTATTTATCTAGTGGTAATAATATAATGAAAATTATTAAATCATTTAAACAATTATATGTAAAACTTGTCATTTACTTTTATTTTGTTTTTGACGTGTTTTTAATAAAAATAAAGTCAACTAACCGATTGTATTTTAAACTATTCGTGATTTGCTTATATTTTAATTATTGAGAAGTTTTCTTTTCAGTCATCTGCCAATGCTGAAAAAATTATTAATGTTTAATTAAATCGAAATTTCTGGGTTTTGTAGTGCTCTTGTGGAGTTGGTGAATCAATTTGGACCGAAGAAATGGTCAGAAATTGCAAAGTTGATGTGCGGCAGAGTTGGAAAGCAATGTCGAGAAAGATGGCACAATCATCTCCGGCCAAACATTAGGGTTTTTCTTCCTTCCATTCTTGTGAATATAGAACTTTTGGTTATGAGATTGAAGTTTAAACTTATTAAACGAATAACACATAAATTAATGTAATAAATTATACATAAACATGGTGCAGTTAATGATAATCGTTGTAAAAATAAAAATAAAAATTTACTTAATTAAAGTTGCATTTATATAATTTCTTAGTGATTTTTTTAAGAGAATTAATAATTTCTAATAAGTGTCTGTGTTCCGTACCATTTCAGTTTGTTTATAATTAATAAAGGATTTGTCCATCCTAATTTTTAATTTAATTTTTTAATTAATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGCAGGAAATAATATTTAATTGTCCCTTTTTTTAAAGTTTTATAAAATACTTATTTTTTTGATAAATATTTTTCATTGTGAAGTTAAAGAAAATTCTTCTAACTTTAGAGAGAGATATATATTATTTCTTTTACAGACTTTCTTATAGAGATAGTTACTTTTTTCACTTTATAGACCAGATATTTGAATATAATTTATTTCTAATATTATTTTTATTTTCAGGTTTTTTCTCGTTTACTATTTTTATATTTTAAATAATAATTAGTTTTTGATAAATATTTTTCATTGTAAAATAAAGACATTTCTTTTAATTTAAGAGAGATATGTTACTTTTTACGGACTTTAATATTAAGAGAATTGTTTCTTTCTCTTTATAAATCAGATATTTGAATATAATTTATTTCTCATTCATTATTTTTATTTTAAAAAATTTACATTGCAAATTTTTGTTAGCCTGTCTTTTAAACTTGATTATAAATAATATATTATGAAATAATTATTACATTTTAAAAATGTAGTAAGCTAAATTAACAGTACACAATTTGAAATATGCTAACAAATTTACTCTAAATAATTTATATTTTTCCTGATTTTTAGACATTAGCTATAACAATTTAACATGCAGTCGATTAGGTGCATGAGTCCCAATTGGAGAAACAAATTGTATAGTTGAATTACATTAAAGATTTATTATGATTATTTAAATGCATGGAAAACATACTTTTTAATAAAAGATAAGCTTATTTTAATGACATAATTATTTAGATAAGCTAAATAGACATTGATATTTATACACGTCAAGCATTGATTTTTTTTTAATGAAAATTAAACTTATAATTATGATATATGCGAAACTGATGACCTAAATGTGTGATTTTGATTTTTTTTTTCTTAGAATATTTAGTTTATTTTGAATTTATATATAATTTCTCTTTATGATTTAAAAAGTTATTGAAGTTACAAAACCTTTTCAAATGAAATTTTATATATAACAAATCTTGGTTCCGTCATCAATAAGCAAAGTAAATTCATAGAGATCACTTTATTACTGAAACAAAAAACAAATGGTATTACATTCATTTAATTTTATGAATGTTTTCTGATTTATCAATTAATTGTCAAAATCAAATAGTTCATCCTATTTATACTTAACATAAAAATAATCCAACATTTTCTTCATAATTAAATATTACTTAATTATTGATAAATTAGACATCATCTTTAAAAACATATTAATAAATACATTGACCTGAATTTTAATTAAATAAATTGAACATTTAATAAAAAAAAAGTTAATAGGTATTTCACACAATCCATATTTTGGTGTATGAACTAATTTTGCAGAAGGAGTCGTGGAGCCTGGAAGAAGACATGATTCTGATCAAAGCCCACCAGGAATTTGGCAACAGGTGGTCAGAGATTGCTAAGAGGCTACCTGGAAGGACTGAAAATAGTATCAAGAATCATTGGAATGGAACCAAGAGACGCCAGAGTTGCAGGACCTACAACGGGAGTAAGAAAAACCCTTACGAAGGATCAATGCTCCGTGCTTACGTTAAAAGGGTCACTGCTATGGAAGAATCTACAAAAGTGTTCAAGAAAGCTACAAGCAAAAAGAATTTGCTGAGGTTTGATCCATCTACAAACGAAATGTTTATTGGAAATAGCAGCAACTACGCGCCATTGCAAGTTAAAAATAATAATATTAGGGTTTCATATGGTGCAATTGGAACGAATGCAATCAACAGGGGAATGAATCCGATAAGTACAAAATACTGA