Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35580 LG11 1779096 1781500 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase S.4-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 1779292 missense_variant p.Ser661Thr
G/C 1779356 missense_variant p.Gln640Glu
T/C 1779399 synonymous_variant p.Glu625Glu
C/T 1779580 missense_variant p.Arg565Lys
G/C 1779927 synonymous_variant p.Val449Val
G/A 1779999 synonymous_variant p.Asn425Asn
T/A 1780267 missense_variant p.Tyr336Phe
C/T 1780275 synonymous_variant p.Arg333Arg
C/T 1780410 synonymous_variant p.Thr288Thr
T/C 1780470 synonymous_variant p.Pro268Pro
C/T 1780572 synonymous_variant p.Ser234Ser
G/C 1780704 synonymous_variant p.Leu190Leu
T/C 1780736 missense_variant p.Thr180Ala
T/C 1780743 synonymous_variant p.Gly177Gly
A/C 1780813 missense_variant p.Met154Arg
T/C 1780814 missense_variant p.Met154Val
C/T 1781050 missense_variant p.Arg75Gln
C/A 1781116 missense_variant p.Gly53Val
T/C 1781144 missense_variant p.Asn44Asp
T/C 1781197 missense_variant p.Asn26Ser
C/T 1781270 missense_variant p.Ala2Thr
G/A 1781279 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/T 1781331 5_prime_UTR_variant
G/C 1781401 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35580.1
MANLKMLLVLLSLLLFLLIPVSSQPNQIFYAGFKGLDSSNMTLNGVAEIEPSGVLKLTNDSSKVMGHAFYPTALRFKNSSDGKAFSFSSSFALAIVPEFPKLGGHGLAFTIATSKDLKALPSQYLGLLNSSSIGNFSNHLFAVEFDTAQDFEFMDINDNHVGIDINSLVSNASAPAGFYTGDHDSDKQNLTLKSGQPILVWVDYDSAQSVVNVTISASSTKPRRSLLSFPVDLSPILRDSMYVGFSASTGLLASSHYILGWSFKINGPATPLDLSSLPQLPGPKRKHTSLIIGVSVSGAVLALFAVLLGFYMYRRYKNADVIEAWELEIGPHRYSYQELKKATKGFKDKELLGQGGFGSVYKGTLPNSNTQVAVKRISHDSKQGLREFVSEIASIGRLRHRNLVQLLGWCRRRGDLLLVYDFMANGSLDKYLFDEPEIILSWEQRFKVVKDVASALLYLHEGYEQVVIHRDVKASNVLLDGELNGRLGDFGLARLYEHGANPSTTRVVGTLGYLAPEVPRTGKATPSSDVFAFGALLLEVACGLRPLDPKAMPEDLVLVDCVWNRYKQGRILDVVDPRLNGAFNEREVLMVLKLGLLCSNGSPTARPSMRQVVRFLEGEVGVPDELRRQGETDSQEGFDQFLHLLHSSSFHQMSRSTYGGSSPSFTDTSLFTPTAKGETM*


CDS Sequence:
>Vu_35580.1
ATGGCCAACCTCAAAATGCTCCTCGTACTCTTGTCTTTGTTGCTGTTCCTTCTGATCCCAGTTTCTTCTCAGCCTAACCAGATCTTCTATGCTGGATTCAAGGGTTTGGATAGCAGCAACATGACCCTTAATGGTGTAGCAGAAATTGAGCCAAGTGGGGTACTGAAACTCACAAATGATTCAAGTAAAGTAATGGGTCATGCTTTTTATCCAACTGCTCTTCGGTTCAAGAACTCAAGTGATGGTAAAGCTTTCTCCTTTTCTTCCTCTTTTGCTTTGGCTATTGTTCCTGAGTTTCCAAAGCTTGGAGGGCATGGCCTTGCTTTTACAATTGCAACTTCCAAGGATCTGAAGGCTCTTCCAAGCCAGTATCTTGGTCTTCTTAACTCAAGTAGCATAGGGAACTTCTCCAACCACCTTTTTGCTGTCGAGTTTGACACAGCCCAAGATTTTGAGTTTATGGACATCAATGATAACCATGTTGGAATTGACATCAATAGCTTGGTATCCAATGCTTCTGCTCCTGCTGGATTCTACACTGGGGATCATGATTCAGACAAACAGAATCTCACTCTCAAAAGTGGGCAACCTATTCTGGTTTGGGTTGATTATGATTCTGCTCAAAGTGTTGTTAATGTCACAATTTCTGCATCTTCTACCAAACCCAGAAGATCACTCTTGTCTTTTCCTGTGGATCTTTCGCCAATCCTTAGGGATTCCATGTATGTAGGGTTCTCTGCATCCACAGGGTTGCTTGCTAGCTCCCATTACATTTTGGGTTGGAGCTTCAAAATCAATGGACCAGCAACACCCCTTGATCTCTCTTCCCTCCCACAGCTTCCAGGGCCAAAGAGGAAACACACGTCTCTGATAATTGGGGTTTCAGTGTCTGGAGCTGTTCTTGCATTGTTTGCTGTCTTACTCGGCTTCTACATGTACAGAAGGTACAAGAATGCCGATGTTATAGAAGCTTGGGAGCTTGAGATTGGACCACACAGGTACTCCTACCAAGAGCTCAAGAAAGCAACAAAAGGTTTCAAGGACAAAGAGCTGCTTGGACAAGGTGGATTTGGGAGTGTCTACAAGGGAACATTGCCAAATTCCAACACCCAAGTTGCTGTCAAGAGAATCTCACATGACTCAAAACAAGGCCTGAGGGAATTTGTGTCAGAAATAGCCAGCATAGGCAGGCTTCGCCACCGGAATCTGGTTCAGCTTCTGGGGTGGTGTCGCCGGCGCGGTGACCTCCTCCTTGTGTATGATTTCATGGCTAACGGGAGCTTAGACAAGTACCTGTTTGATGAACCAGAAATAATCCTGAGTTGGGAGCAAAGGTTTAAGGTGGTCAAGGATGTTGCTTCTGCCCTTTTGTATCTGCATGAGGGCTATGAGCAGGTGGTGATACACAGAGATGTGAAGGCTAGCAATGTGCTGCTAGATGGAGAACTCAATGGAAGACTAGGAGATTTTGGATTAGCAAGGTTGTATGAACATGGTGCTAACCCAAGTACCACAAGGGTAGTGGGGACATTAGGGTATTTGGCACCTGAGGTGCCTAGGACAGGGAAGGCCACACCTAGCTCAGATGTTTTTGCATTTGGTGCACTTTTACTTGAGGTGGCATGTGGGCTGAGGCCACTTGACCCAAAGGCAATGCCAGAAGATTTGGTTTTGGTTGATTGTGTGTGGAACAGGTACAAGCAAGGGAGAATACTTGATGTGGTGGACCCTAGACTGAATGGTGCTTTTAATGAAAGAGAGGTACTGATGGTGTTGAAATTGGGGCTTCTATGTTCAAATGGTTCTCCCACTGCTAGGCCTAGCATGAGACAGGTGGTGAGGTTCTTGGAGGGAGAAGTTGGTGTGCCAGATGAATTGAGAAGGCAAGGAGAGACAGATTCTCAGGAGGGTTTTGATCAGTTCTTGCACTTACTTCACTCTTCTTCTTTTCATCAGATGAGCAGAAGCACTTATGGTGGTAGTTCTCCTTCTTTTACTGATACATCACTCTTTACTCCCACTGCTAAAGGAGAAACAATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_35580::LG11:1781500-1783500(-)
CATATGCTTCCATGCTTGCTAAGTAAGGTTAAATCTAGGCTCTCTAAGGGACTTATAAAATATATCAGCTAACTGGACTAGTTGACAAAACCAATAACAATGTTTATTGTTCTTGACTTGCCCCATATCAAGAGTAGACATTATTGAATGCATTATGCATTCTCATTGTGAAGACTTCATGAAATCTTGGTGATTTTGTTTTCATTTATCACTAGGGATATTATCCCTAAAATCAAAATTATCAAGGTTCGCAGATAATCGATTATCACTTGGGATAATTGATTATCACTAGTAATTGGGAGTTGTCTTTTAAATTTCTAACCTTGCTCGAACCTTGGGCTATAATAGTGTGTTTCAAAGTTCTTTAAGTGTTAGTTAAACTATTACAAAGCAAGAGTATAGTTTGGAAAACTCTAGGTGTTTAAGAAAGCTTGTAGTTTAGGTGCTTGAAGAAGGAAAAGTTGTTACTTAGTGTGTCTAAGTTTTTGGTGCTCTTCTATTAGCATAATCAAGTTGTTCATTCTTTTGTGTGTCAAAAAAAGGTGTTGGTCATCTCTTATCTTTTAAGAGAGGTGTTTTATAATCTCATCTTTATCTTTTTAGCGAGATTAACAATTGGACGAAGAATATTTTGATTTGAACCAGTATAAAAATTACTTATGTAATTTTTCTTTTTTCTTACTTTACTTATTTGCTTTTAATCAATGTAAGTTTTCAATTTTATCAAAAAAAATTTCAAAGCAAAAATCTATTTAAAGGGAAACGATTTTTAACTTGTACTAATTCATCTCCTCTTAGTTTTGTCCTACGTTTAAACTTTTCACTATGATTTTTCTATCGAGATGATACAAAGTAGGTTTCTGTAGTTTGTAGTAGTTATTATAAGAATTTTATAAAAAATTAAATTATCCATGTTTTATATATTTTTTATTTTTAAAATTATTCACTTTTGGAAACAATTATATTAATTATAATATATATATATATATATTTTGTTTTTGAGAGACAGTTTATTTTATTTTATCAATCTTTAAATGTTTTATTTTATTAGTTTTAATCGGTTTTAAACTGCTAAAAATGGAAGCTTACAAATGATATTTAAAATATTTCTATATAAGAGTGTTTTCTCATGTGACAAATGAAATTTTATAGTGTACTAAAATATAACCTTTTATTGAAAATAATGTTTTATATTAATTTTCATGAAATAAAAGTTTAATATTTTATAATTTAGTTTAAAAACTAAACAAAATTTTTCATAATAGTTTAAAAATGAAAAATATCATCGTTATAATAATTTGATATTTGAAAAGTCGAATTTACAACTTTATTTAACTTGATGACCGAAATCTTATCAAAATTCGGTTTTTGGATGATCAAATTTCAGGGATTTTTTTTTGTTATATGGGAGAAGAAAAATGAAAAAAAAATCTAAATCCCCTCCCCATAATTTGGCCACCTGCAAACATAATTTCAATAGAATCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAGAACGAATAAATGCCACACTTTACTAACTTGAAATTTTTTTTATAAATAATAGAGATCCAAAAAAAAAAAATATTACTCAAATGAACTTTAAGAGAATTTATTTTACCAAATAAGAAGGATCATTCTTCAAGATGGGAAAAACGAAATTCAAACTCTATTTAGTTGGACTGGTAGTAAATGAAATATTCGATTTCTAGAAAACTGAATTTCAGAAAAAAAAATTTATAAAAGGAAGAAAAATGAAAAATATAAAAATAATCTAAATCCTCTTCCAAAAGTTCGGTTACCCAAAAATTGAATTTCTATACTTTTTGCTTCCAGTGGAGTGGGGAGTCCAATTCCCACCTTGAAAAATAATCAATGCAATTTGAAGAAACTAAACGCAAACAGATTCAGTGTGAATTTTATTTTATTTTTGAAAACATATTATTCGTGAAAAGAAAAATTCTACTAACTTGCTTCTATAAAAAGTATAAATTAGTTGTTTTCATCTC


Gene Sequence:
>Vu_35580(-)
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